Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I3 R1
|
168 |
141.0 |
4346284 |
99.6% |
4328898 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,941,604 |
G→A |
A11V (GCG→GTG) |
mepM ← |
murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase, septation protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,941,604 | 0 | G | A | 99.3%
| 560.4
/ NA
| 143 | A11V (GCG→GTG) | mepM | murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase, septation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (70/72); minor base T (0/1); total (70/73) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCC > NC_000913/1941456‑1941750
|
acgaaTTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACAcc > 1:181877/1‑151 (MQ=255)
cgaaTTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCa < 1:10/151‑1 (MQ=255)
cgaaTTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCa < 1:644100/151‑1 (MQ=255)
aaTGTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAgg < 2:1787799/151‑1 (MQ=255)
aTTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAggg > 2:479251/1‑151 (MQ=255)
aTTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAggg > 1:326041/1‑151 (MQ=255)
gTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACaga < 2:1863485/148‑1 (MQ=255)
tCCAGCTCAATTGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCgg < 2:1583650/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCggg > 2:347433/1‑151 (MQ=255)
tCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCggg > 1:706179/1‑151 (MQ=255)
ccAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCggg < 2:967659/150‑1 (MQ=255)
aGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCt > 1:1757724/1‑150 (MQ=255)
aGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTa < 1:542449/151‑1 (MQ=255)
aGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTa < 1:1643663/151‑1 (MQ=255)
gCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTAt < 1:1011698/151‑1 (MQ=255)
gCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTAt < 1:590023/151‑1 (MQ=255)
tCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCt > 1:1837706/1‑151 (MQ=255)
cAATGGTTTTGACAATTTGCGTGGCATCACTGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAATAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAACCTCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCt < 2:1078200/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGt > 2:1834052/1‑151 (MQ=255)
aTGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGtt < 1:1031689/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGc < 2:1498632/151‑1 (MQ=255)
ttttGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCAc > 2:542482/1‑151 (MQ=255)
tttGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCAc < 1:1015068/150‑1 (MQ=255)
aCAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAAt < 1:2023887/151‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATc > 1:1095448/1‑150 (MQ=255)
aaTTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATc > 1:721740/1‑150 (MQ=255)
aaTTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCa < 2:1426476/151‑1 (MQ=255)
aaTTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCa < 1:320272/151‑1 (MQ=255)
aTTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCAc > 1:903081/1‑151 (MQ=255)
aTTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGGAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCAc > 2:1484995/1‑151 (MQ=255)
gCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTcc > 1:1121529/1‑151 (MQ=255)
gTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTc > 1:423273/1‑151 (MQ=255)
gCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCAtt < 1:1717358/151‑1 (MQ=255)
cATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCAtt > 1:1414710/1‑150 (MQ=255)
cATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTa < 1:96848/151‑1 (MQ=255)
aTCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTaa < 2:1205567/151‑1 (MQ=255)
aTCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTa > 1:36506/1‑150 (MQ=255)
tCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAAt > 1:423845/1‑151 (MQ=255)
aCGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGTACGTAATCACTTCCTCATTAAtct < 1:1605375/151‑1 (MQ=255)
aCGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAAtct < 2:221494/151‑1 (MQ=255)
gATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCttt < 2:2114319/151‑1 (MQ=255)
aTAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTc < 1:1594911/151‑1 (MQ=255)
tAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTc > 2:251042/1‑150 (MQ=255)
aCATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGc > 2:1754598/1‑151 (MQ=255)
aTAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCt < 2:1413097/142‑1 (MQ=255)
aTAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGc > 2:1043690/1‑149 (MQ=255)
tAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGc > 2:771546/1‑151 (MQ=255)
aGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTc < 2:1032957/151‑1 (MQ=255)
aGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTc > 2:1363476/1‑151 (MQ=255)
ggCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCg < 1:1915719/151‑1 (MQ=255)
gccAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCGGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCAt > 1:1445648/1‑150 (MQ=255)
gccAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATa < 1:1994868/151‑1 (MQ=255)
ccAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATAc > 2:215753/1‑151 (MQ=255)
aGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTg > 1:1891589/1‑151 (MQ=255)
gACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTgg < 2:18973/151‑1 (MQ=255)
cAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGtt > 1:463344/1‑151 (MQ=255)
cAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGtt < 1:254979/151‑1 (MQ=255)
cAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGtt > 2:1299581/1‑151 (MQ=255)
gCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTgg < 1:828379/151‑1 (MQ=255)
cGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGc > 2:1536904/1‑151 (MQ=255)
gACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCt < 2:1752623/151‑1 (MQ=255)
gACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCt > 1:2165195/1‑151 (MQ=255)
aCGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTa < 2:619495/151‑1 (MQ=255)
ccAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTg < 1:20081/151‑1 (MQ=255)
cAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTg > 1:1340146/1‑150 (MQ=255)
gagTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACt > 1:1887250/1‑151 (MQ=255)
gTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCa < 1:1890451/151‑1 (MQ=255)
aGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGa < 1:1556794/151‑1 (MQ=255)
gAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGa > 2:829857/1‑150 (MQ=255)
gTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTg < 2:896142/151‑1 (MQ=255)
gTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTg > 2:282844/1‑151 (MQ=255)
gAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGaa < 1:1904184/151‑1 (MQ=255)
aGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAAt < 2:462736/151‑1 (MQ=255)
gACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGc > 1:1595238/1‑151 (MQ=255)
gACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGc > 1:1203124/1‑151 (MQ=255)
aCCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCt < 2:966342/151‑1 (MQ=255)
aCCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCt > 2:2050737/1‑151 (MQ=255)
cccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTg < 1:1054025/151‑1 (MQ=255)
ccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGGATAGCTTGt < 1:811974/151‑1 (MQ=255)
ccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGt > 1:1146480/1‑151 (MQ=255)
cAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGtt < 1:262723/151‑1 (MQ=255)
aCATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGtttt < 2:1990971/151‑1 (MQ=255)
tAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTAcc > 2:1804449/1‑151 (MQ=255)
aCGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTAccc > 2:1318833/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGt > 1:1780323/1‑151 (MQ=255)
gtgGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGat < 1:1651657/151‑1 (MQ=255)
gtgGTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGa < 1:1099358/150‑1 (MQ=255)
ggTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGatat > 2:171239/1‑151 (MQ=255)
ggTCGCGGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGata < 1:190762/150‑1 (MQ=255)
cgcgGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCg < 2:348091/151‑1 (MQ=255)
gcgGTAAATTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGt > 1:896467/1‑151 (MQ=255)
aaaTTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTcccc > 1:630087/1‑150 (MQ=255)
aaaTTATTAAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTcccc > 1:1690316/1‑150 (MQ=255)
ttattaAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAggg > 1:1913143/1‑151 (MQ=255)
tattaAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAgggg > 2:1367331/1‑151 (MQ=255)
tattaAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAggg < 1:1299602/150‑1 (MQ=255)
attaAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAgggg < 1:1858242/150‑1 (MQ=255)
attaAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAgggg < 2:1092440/150‑1 (MQ=255)
taAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGAt < 1:1619676/150‑1 (MQ=255)
taAACACCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATc > 1:240220/1‑151 (MQ=255)
|
ACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCC > NC_000913/1941456‑1941750
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
