Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
144 |
141.8 |
4677362 |
93.6% |
4378010 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,630,461 |
A→G |
N151N (AAT→AAC) |
ydfI ← |
putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,630,461 | 0 | A | G | 100.0%
| 412.1
/ NA
| 110 | N151N (AAT→AAC) | ydfI | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (53/57); total (53/57) |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CGTAGGAAGTGACAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGATTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCTAAGCCATC > NC_000913/1630316‑1630607
|
cGTAGGAAGTGACAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGtttt > 2:236945/1‑150 (MQ=255)
gTGACAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCgg < 3:365643/151‑1 (MQ=255)
tGACAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGc > 4:146927/1‑151 (MQ=255)
gACAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGc > 2:1300392/1‑150 (MQ=255)
cAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGTGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGc < 2:1485646/151‑1 (MQ=255)
cGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTAc > 2:1371455/1‑151 (MQ=255)
aCGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATc < 2:1226943/151‑1 (MQ=255)
cATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCggg > 1:1616564/1‑151 (MQ=255)
cATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGGTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCggg > 1:955499/1‑151 (MQ=255)
aTAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGt < 1:1283468/151‑1 (MQ=255)
aTAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGt > 1:238486/1‑151 (MQ=255)
aaCATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGa < 2:1736215/151‑1 (MQ=255)
gACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGa < 2:1314475/150‑1 (MQ=255)
gACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCGTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGa < 1:465357/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCAt > 2:769448/1‑151 (MQ=255)
gTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTTAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCAtt > 2:41131/1‑151 (MQ=255)
gTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCAtt > 1:382471/1‑151 (MQ=255)
ttttCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCAtt > 1:863298/1‑150 (MQ=255)
tttCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTa > 1:880879/1‑150 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAAc < 3:525170/150‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACt > 1:226800/1‑151 (MQ=255)
cTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACt > 1:1461342/1‑150 (MQ=255)
ggCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGt < 1:613782/150‑1 (MQ=255)
ggCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTc > 3:424805/1‑151 (MQ=255)
aTGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCgg < 1:1441239/151‑1 (MQ=255)
ttgtCACATGACCTGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCg > 3:218608/1‑151 (MQ=255)
tgtCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGc > 1:677255/1‑151 (MQ=255)
cacaTGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCgg > 2:52335/1‑151 (MQ=255)
catgacatgaCGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGga < 1:37188/150‑1 (MQ=255)
atgacatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCgg > 1:440773/1‑148 (MQ=255)
tgacatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGgag > 2:60917/1‑149 (MQ=255)
gacatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGagag < 1:1732700/150‑1 (MQ=255)
gacatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGagag < 2:1657680/150‑1 (MQ=255)
gacatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGt < 2:1097375/151‑1 (MQ=255)
gacatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGt < 4:13380/151‑1 (MQ=255)
acatgacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTg > 1:1599300/1‑151 (MQ=255)
catgacGGTAAACGCGCGAAGCCCTGCCGCTTTACCGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGGCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGGGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTgg < 1:1589998/151‑1 (MQ=255)
gacGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGaa < 3:368727/150‑1 (MQ=255)
acGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAAt < 3:338095/151‑1 (MQ=255)
acGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAAt < 1:1253646/151‑1 (MQ=255)
cGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATa < 2:1456136/151‑1 (MQ=255)
ggTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATAc > 2:1240472/1‑151 (MQ=255)
gTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATAcc < 2:819679/151‑1 (MQ=255)
tAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATAcc < 2:238485/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCt > 4:346465/1‑151 (MQ=255)
aaaTGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCt > 1:1433381/1‑151 (MQ=255)
gCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCttttt < 1:1446335/151‑1 (MQ=255)
gCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCttttt > 1:830198/1‑151 (MQ=255)
gCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCtttt < 1:715235/150‑1 (MQ=255)
gggAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCg < 4:471011/151‑1 (MQ=255)
ggAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCgg < 3:191774/151‑1 (MQ=255)
ggAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCgg > 1:158612/1‑151 (MQ=255)
ggAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCgg < 2:1670324/151‑1 (MQ=255)
ggAAGTACTGCCGATTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTGCCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTACGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCgg > 1:298037/1‑151 (MQ=255)
gAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGt < 2:1270034/151‑1 (MQ=255)
tCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGAtt > 1:1499770/1‑151 (MQ=255)
cTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGt > 3:540819/1‑151 (MQ=255)
cTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGt > 2:406681/1‑151 (MQ=255)
tGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTc > 1:1680296/1‑151 (MQ=255)
gCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATTCCCTTTTTCGGTGACTGTc < 1:1695778/150‑1 (MQ=255)
ccGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCag < 4:218590/151‑1 (MQ=255)
gCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGGTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCag > 2:847894/1‑149 (MQ=255)
ttACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCagaga < 2:1307467/149‑1 (MQ=255)
tACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAgagaga > 1:104942/1‑150 (MQ=255)
tACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGCTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAgagaga < 1:1275689/150‑1 (MQ=255)
gAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATcgc > 1:250242/1‑151 (MQ=255)
gAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATcgc > 1:1362629/1‑151 (MQ=255)
gAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGAGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCCCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGTGAGACAATc > 4:236974/1‑149 (MQ=255)
aGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGTCAATcgcg < 1:355638/151‑1 (MQ=255)
aGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATcgcg < 2:774474/151‑1 (MQ=255)
ccAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGAt < 1:236905/151‑1 (MQ=255)
ccAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGAt < 1:1546414/151‑1 (MQ=255)
cAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCttttt < 1:1310596/122‑1 (MQ=255)
cAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCttttt > 2:1310744/1‑122 (MQ=255)
cAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGAtt < 3:344274/151‑1 (MQ=255)
cAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGAtt > 3:149381/1‑151 (MQ=255)
cgcCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGCGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTg > 1:1416987/1‑150 (MQ=255)
ctacaaTCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAATTGTCCGGTCGCCGGAGTGTGGAAATACCCTTTTTCTGTGATTGTCAGAGACACAATCGCGATTTGCGGTTc > 1:892760/3‑151 (MQ=255)
caacaaTCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGtt > 1:382905/1‑150 (MQ=255)
caacaaTCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGtt < 4:119938/150‑1 (MQ=255)
acaaTCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGGGACAATCGCGATTTGCGGTTcac < 2:1090363/151‑1 (MQ=255)
aaTCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTcacac > 3:343550/1‑151 (MQ=255)
cACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACAt < 3:463272/150‑1 (MQ=255)
cACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATc > 2:1672321/1‑151 (MQ=255)
cTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGc > 4:143132/1‑151 (MQ=255)
tGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGcc > 1:869319/1‑151 (MQ=255)
cTGTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAacac > 1:1405622/1‑151 (MQ=255)
gTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACgg > 1:1365115/1‑151 (MQ=255)
gTTTTCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACgg < 2:1696886/151‑1 (MQ=255)
ttttCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACgg < 2:1616727/150‑1 (MQ=255)
tttCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGt < 2:812154/150‑1 (MQ=255)
ttCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGtt < 1:1132150/150‑1 (MQ=255)
ttCGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGtt < 2:112569/150‑1 (MQ=255)
cGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTc < 1:1127351/150‑1 (MQ=255)
cGGCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCt < 2:1401870/151‑1 (MQ=255)
ggCTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATAACCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGATACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTc < 1:110627/149‑1 (MQ=255)
cTGGTGGGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCTa > 2:1559043/1‑149 (MQ=255)
ggtggGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCTAAGcc < 2:440845/151‑1 (MQ=255)
ggtggGGGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCTAAGcc < 2:1278357/151‑1 (MQ=255)
ggggGTTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCTAAGCCatc < 1:1645368/151‑1 (MQ=255)
|
CGTAGGAAGTGACAACGTCACGCATAACATGACCGTTTTCTGGCATGTTGTCACATGACATGACGGTAAATGCGGGAAGTCCTGCCGCTTTACGGCGAGCCAGCGCCTCAACAATCACCCCTGTTGCTGTTTTCGGCTGGTGGGGATTTTGCACGTCGGCAGCTACCATCGGGTGATCGAGCATTAACTGTCCGGTCGCCGGAGAGTGGAAATACCCTTTTTCGGTGATTGTCAGAGAGACAATCGCGATTTGCGGTTCACACATCGCTGCCAACACGGTTTCTAAGCCATC > NC_000913/1630316‑1630607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
