Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F18 I0 R1
|
150 |
105.7 |
2655328 |
79.3% |
2105675 |
226.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,295,700 |
T→G |
16.3% |
V407G (GTG→GGG) |
gltP → |
glutamate/aspartate:proton symporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,295,700 | 0 | T | G | 16.3%
| 222.1
/ 3.4
| 97 | V407G (GTG→GGG) | gltP | glutamate/aspartate:proton symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/53); new base G (18/2); total (42/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.45e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCA > NC_000913/4295478‑4295935
|
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGCAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGGGTTGACCGGATCCTCGCCATGGCCCGGACTGTGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGGGGGG‑GGGGG‑GG‑TTGCCAAGggggga > 2:1201021/1‑237 (MQ=255)
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CCGGG‑GA‑TTGCCCAGggggg > 1:86933/1‑237 (MQ=255)
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGGG‑CTGGG‑GA‑TTGCCAAGTgggg > 1:453865/1‑237 (MQ=255)
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGGAATGCGCTGGCGGGG‑CTGGG‑GA‑GTGCCCAGggggg > 1:1232552/1‑237 (MQ=255)
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTGATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGGACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATACCGTGGGGGGG‑CGTGG‑GA‑TTTGCAAGTgggga > 1:733083/1‑237 (MQ=255)
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGACAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGACTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGGG‑CTGGG‑GC‑TTGCCCAGGGGGaa > 1:101786/1‑239 (MQ=255)
ttGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCCGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGGGCGGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTCGT‑GA‑TTGCCAAGCgggga > 2:708556/1‑237 (MQ=255)
aCCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGCGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGCCTGCGGTTTATTTCTGTGGTTGACCGTTCTCTCGAAATGACGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAAAGCGCTGGCGGTG‑GTGGG‑GA‑TGTCCAAGgggggcaaa > 2:659100/1‑234 (MQ=255)
tCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTTCCCAGTGGGAACACaaaat > 1:1116352/1‑237 (MQ=255)
tCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGCGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGGAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGGCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTTACCGTATCCTCGACATGGCGAGCACTGCGCTGACCTGGGTGGGAAATGCGCTGGCGGTG‑TTGGG‑GAGTTGCAAAG‑GGGAACAGaaaat > 2:1067498/1‑237 (MQ=255)
cTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACCCAAATTTGA‑cc > 1:576068/1‑239 (MQ=255)
cTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTGCCCAGTGGGAACACAAATTTGA‑cc > 1:1006103/1‑239 (MQ=255)
aGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTTGTTTGTGGTGTTGCTGGTAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGGAAg > 1:469036/1‑239 (MQ=255)
gAAATCATTCTGGGGCTTACGCTGATTGTGACCCTGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGGGGTGTTGCTGGCAACGTTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGa < 1:962043/238‑1 (MQ=255)
ttgaTTTTGGTGTTGACGCTTGTGGTGCCCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgc < 2:1254159/236‑1 (MQ=255)
aTCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTGGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgc < 1:525002/239‑1 (MQ=255)
aTCATTCGGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgc < 1:1201021/239‑1 (MQ=255)
tcttttgggTGCTGAAGCTGATGGGGACCTCGAAAGGGATTGCCGGCGTGCCTTGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTTGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgcg < 1:615679/232‑1 (MQ=255)
ctgtCTGGTGCTGGCGTTGAGGGTGCCGTGGAAAGGGTGTGCGGGGGGGCCTGGCGGTTGGTTTGTGGTGGTGGTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgcgc < 2:899347/236‑1 (MQ=255)
cATTCTGGTGCTGGCGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCGGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgcgc < 1:732043/239‑1 (MQ=255)
cATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgcgc < 1:874153/239‑1 (MQ=255)
cATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgcgc < 1:396501/239‑1 (MQ=255)
cATTCTGGTGCTGAAGCTGATGGTGACCTGGAAAGGGATTGCGGGGCGGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgcgc < 1:366224/239‑1 (MQ=255)
ggTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGGG‑ATGGT‑GA‑TTGCCCAATGGGAACCCAAATTTTA‑CCCTAGGAAAGCGCTGGGtt > 1:1063141/1‑239 (MQ=255)
gTGCTGACGCTGATGGGGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTa < 1:616195/239‑1 (MQ=255)
tGACGGTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGa < 1:244403/238‑1 (MQ=255)
aCGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGGATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGGGGGTAATGCGCTGGCGGGGACTGG‑‑GA‑TTGGCCAGGGGGGACCCAAAATTAG‑CCGTAAGAAAACGCGGGCTTTTggggg > 2:1209945/1‑235 (MQ=255)
ggtggtGGTGTCTTCGGAAGGGGTTTCGGGGGTGCCGGGGGTGTTGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCGCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTg < 2:1063141/234‑1 (MQ=255)
gCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTg < 1:1162072/239‑1 (MQ=255)
gCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTg < 1:478450/239‑1 (MQ=255)
gggtgccgtagAAAGGGTTTGGGGGCGTGGCGGGGGTGGTGTTTGGGGTTGTGGTGGCAACGGTGGGTAGCGTAGGTTTTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGGTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGGGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTg < 2:101786/229‑1 (MQ=255)
aCCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCCAATGGGAACACAAATTTTG‑ACGTAAGAAAGCGCTGGCTTTTGGGCGTGAAGGGCTggg > 1:1211621/1‑239 (MQ=255)
ccgcGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTggg < 1:914110/235‑1 (MQ=255)
ccTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGAGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGTTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTGGACCGTATCCTCGACATGCCGCGTACTGGTCTGGAGGCGGGGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑GCGGTGGG‑TGGCCAAG‑GGGGACAACAATTTGACCCGAAAAAAAGC‑CCGGCTTAAAAGAGTGAAgatcatggc > 2:960852/1‑231 (MQ=255)
cGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTGCCAAGTGGGGACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAACGCTGGTGTATGAGCGCGAGTTGGTGGGCaaa > 1:845445/1‑239 (MQ=255)
cGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGGG‑CTGGT‑GA‑TTGGCCAGGGGGGACACAAATTTGA‑CCGTTAGAAAGCGCTGGCGTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCaaa > 1:94888/1‑239 (MQ=255)
aaaGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGCGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GT‑GTTGCAAGTGGGAGAACAAAATTGC‑CGGTCAGGAAGAGGTGGCTTTTGACCGGGAAGAGCggggggaaat > 2:565668/1‑233 (MQ=255)
gCTTGCGTGCCGGGGGTGTCGTGTGGGGTGTTGCTGGGAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGATGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAAc < 1:842539/239‑1 (MQ=255)
aggTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGc < 1:429399/236‑1 (MQ=255)
gTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCgg < 1:1238792/238‑1 (MQ=255)
gTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAAGGGGGACACAAATTTTA‑CCGGAAGAAAGGGCTGGCTTTTGAGCGTGGAGGGCTggg > 1:68513/1‑218 (MQ=255)
gTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TGTCCAAGTGGGAAAACAAAATTGA‑ACGTAAGAAAACCATTGGTTAAGGGCGGGAAGTGCTGGGCAAAATTGATAAAAcctcgg > 1:816071/1‑233 (MQ=255)
tctggatgttCGGTTGGGGGGTTGGTGGCTACGCTGGGTAGGGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑Tc < 1:235987/229‑1 (MQ=255)
cTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGGTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGGTGGAAGGTCTGGCTTTTATTGCTGGTGTTGACCGTAGCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCaa < 1:960852/239‑1 (MQ=255)
gCGTGTCTTTTGGGGTTTTGCGGGCAACCGTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCaataa < 1:354933/239‑1 (MQ=255)
cGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GG‑TTGCCAAGTGGGAACCCAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATTAGCGTGGAGGGCTGGGCAAATTTGATAAAACTTGGGA‑TCAATAAtttg > 1:488950/1‑235 (MQ=255)
gTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGGGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAAAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑TAAGa > 1:923316/1‑239 (MQ=255)
ttggtgTTGCTGGCACCGGTGGGTTGGGGAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTTGCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGc < 2:1116352/238‑1 (MQ=255)
gtggtgTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGGAAGAAAGCGCTGGCTTATGGGGGTGAAGCGCTGGGCAAATTTTATAAAAACGCGGA‑TCAAAAATT‑GGAGATTGc > 1:1202936/1‑239 (MQ=255)
tGGTAACGGTGGGTAGGGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGatat < 1:783869/238‑1 (MQ=255)
ggCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTGCCAAGTGGGGACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATTAGCGTGAAGGGCTTGGCAAATTTGTTTAAAATGCGGG‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATc > 1:420286/1‑238 (MQ=255)
aCGTTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCAcc < 1:149881/238‑1 (MQ=255)
cGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAgc < 1:504917/157‑1 (MQ=255)
gtggggTTGCGTTGGTTGTCCGCTGGAAGGTTTGGTGTTTATTGGGGGTGTTGCCCGGTTCCGCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCgg < 2:104302/236‑1 (MQ=255)
tggggaggttAGGTAATGCGCTGGAAGGTAGGGCGTTTATTGATGGTGTTGCCCGTAGCCTCGACATGGCGCGTGCTGCGCTTAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCTCCCGGCa < 1:808643/230‑1 (MQ=255)
gTAGGTATTCCGGTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAAtgtgtg < 1:215826/238‑1 (MQ=255)
gTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTGCCCAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGGTTTATCGAGGGAAAGGCTGGGGCAATTTTATAAAACTGCGGG‑TCAAAAATT‑GGAAATTTCCGGGGGATATCACCCCGGaaagggtgaagaa > 2:381474/1‑229 (MQ=255)
gTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGGT‑CTGGG‑GA‑TTGCCCTGTGGGAACCCAAATTTGA‑CCGGAAGAAAGCGCTGGCTTTTTGGGTTGGAGATATGGGGCAATTGTTTAAAACTGAGGT‑TCAAAAATT‑GAGAATTTCC‑GGGGGAATCACCCCGGaaagtgggtaaatc > 2:660620/1‑228 (MQ=255)
aTTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGGGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGGGGGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑GCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCCCCCGGCCATGTGTGaaatcct > 1:14983/1‑234 (MQ=255)
gAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGGG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGGGGGGACACAAATTTGG‑CCGGAAGAAAGGCCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGGTGGGCAAAATTGATTAAACTGCGGATTCAAT‑ATT‑GAAGATTTGC‑CGGGATAGTCACCCGGCAATGTGGTAATGCCTgtatggaa > 2:73805/1‑231 (MQ=255)
tgtGGGGTTTTTTGCTGGTTTTGCGCGTCTACTCGAAATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGc < 2:86933/237‑1 (MQ=255)
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tGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGGACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGGGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGGTAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAAATTGCC‑GGGGATATACACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGaacctttacg > 1:213151/1‑230 (MQ=255)
gTTTTTTTCGGGGGTTGACCGTATCCTGCGCATGGCGCGTAGTGCGGGTAACGTGGTGGGTAATGCGCGGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGt < 2:51517/238‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTA‑CTGGT‑GA‑CTGGCACGTGGGAACCAAAAATTTA‑CCGTAAGGAAAGGCCGGGTTAGTAGCGTGAAGGGATAGGCAAAATTGATAAAAATGCGGA‑GCAATAATTAGAAG‑TTACC‑TGGGATATGCACCCCGCAAAGTGGTGATAGCGGAAGCGACGCTGGCCGCGGCTTAt > 2:1123642/1‑239 (MQ=255)
cTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTTCCAAGTGGGGACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCAACCGGCAATGTGTGAATGCCTTATTCGGCGCTTGCcccggcctactag > 1:701579/1‑229 (MQ=255)
tGGTTTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGc < 1:1129879/239‑1 (MQ=255)
tGGTGTTGACCGTTTCCCCGACAGGGTGCGTACTGCGCAGAAGGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGc < 2:845445/239‑1 (MQ=255)
tGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGc < 1:1306294/239‑1 (MQ=255)
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tATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGAGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATTGTTGAATGCCTGATGCGCCGCTTGCCGGGTCTTTTCAGGCCTACGCC‑AGACa > 1:923233/1‑239 (MQ=255)
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aCATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGatat > 1:925690/1‑166 (MQ=255)
aCATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGatat < 2:925690/166‑1 (MQ=255)
cgcgTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGG‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATACACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATTCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCCACGCC‑AGACAGCGCACTAGCCTGa > 1:1093112/1‑239 (MQ=255)
tctgcggttgaCGTGGTGGGTAATGGTGTGGGGGTG‑GTGGG‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACCAAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGTTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAGCTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAg < 2:51937/229‑1 (MQ=38)
tGCGTTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTGGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCg < 1:1271752/239‑1 (MQ=255)
tGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGGTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGTGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGAGAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCg < 1:395442/239‑1 (MQ=255)
ttgggggTAAAGCGCGGGCGGGT‑TTGGG‑GA‑TTGCAAAGTGGGAACTCAAATTAGA‑CTGTAAGAAAGCGCTGGCTTAGGAGCGGTAAGTTCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGTCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGTCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAg < 2:459183/235‑1 (MQ=37)
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gtggGTAATGCGCTGGCGGTT‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACCCAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGt < 1:108046/239‑1 (MQ=255)
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aTGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACCCAAATTGTA‑CCGGAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATaa < 1:1166896/239‑1 (MQ=255)
aTGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATaa < 1:614235/239‑1 (MQ=255)
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|
TTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTG‑CTGGT‑GA‑TTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGA‑CCGTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGA‑TCAATAATT‑GAAGATTGCC‑GGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCC‑AGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTATGCCGCA > NC_000913/4295478‑4295935
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A