Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F1 I2 R1
|
772 |
77.0 |
3769570 |
91.6% |
3452926 |
105.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
522,463 |
T→C |
V683A (GTG→GCG) |
ybbP → |
putative ABC transporter permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 522,463 | 0 | T | C | 98.7%
| 271.3
/ ‑5.1
| 76 | V683A (GTG→GCG) | ybbP | putative ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (35/40); minor base G (0/1); total (35/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGT > NC_000913/522329‑522597
|
tttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtg < 2:1139110/139‑1 (MQ=255)
ttCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtgg < 2:317903/139‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtggt > 1:1001903/1‑139 (MQ=255)
gaATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTc < 2:278050/139‑1 (MQ=255)
gaaaagTTGACACAACTCAACCGGCAGGTCCCGACTATTAGCCTGTTAGGTATTGGGACAATTTTAAAACAGGTGGGTCAGGTGCTGAAGCAGATAAGTCTTGCGCTAGAAGGGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTTCg < 1:1649996/134‑1 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtgg < 1:1284571/103‑1 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtgg > 2:1284571/1‑103 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTAtgttgctgttgc > 1:32388/1‑139 (MQ=255)
cTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTAtgttgctgttgc > 1:496737/1‑139 (MQ=255)
tCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATgttgctgttgct < 2:1001903/139‑1 (MQ=255)
aaCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAt < 2:261660/98‑1 (MQ=255)
aaCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAt > 1:261660/1‑98 (MQ=255)
aCCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGc < 2:1342378/139‑1 (MQ=255)
ccGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca > 1:105790/1‑139 (MQ=255)
gCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGcaca < 1:286157/139‑1 (MQ=255)
gTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 2:32388/139‑1 (MQ=255)
ttCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgc < 1:761638/139‑1 (MQ=255)
aTTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGaa < 2:496737/139‑1 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGc > 1:474679/1‑97 (MQ=255)
ttAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGc < 2:474679/97‑1 (MQ=255)
tAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATg > 1:96102/1‑139 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTgg > 2:1866909/1‑102 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTgg < 1:1866909/102‑1 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGcac < 1:1236006/105‑1 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGcac > 2:1236006/1‑105 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtc > 2:683625/1‑126 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtc < 1:683625/126‑1 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGa > 1:521108/1‑139 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGa > 2:772667/1‑139 (MQ=255)
gcgcGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGa > 2:541784/1‑139 (MQ=255)
cgATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgca < 2:1804452/109‑1 (MQ=255)
cgATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtgca > 1:1804452/1‑109 (MQ=255)
cgATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCt > 2:1452957/1‑139 (MQ=255)
gATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtgg < 1:374489/59‑1 (MQ=255)
gATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGAtgg > 2:374489/1‑59 (MQ=255)
aTTTTAAAACAGGTCGGTCAGGCGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCACCCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCtg > 1:784459/1‑139 (MQ=255)
ttAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCACCCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCtggtg < 2:784459/139‑1 (MQ=255)
tAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTggtggt < 2:1432260/139‑1 (MQ=255)
aaaaCAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg < 1:772667/139‑1 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGc > 1:754850/1‑63 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGc < 2:754850/63‑1 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 2:21234/88‑1 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca > 1:21234/1‑88 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg > 1:834593/1‑94 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggtg < 2:834593/94‑1 (MQ=255)
ggtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGgcgc > 1:622971/1‑139 (MQ=255)
gtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 2:515392/1‑139 (MQ=255)
gtcggtcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGca > 1:8970/1‑139 (MQ=255)
tcAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTc > 2:972353/1‑139 (MQ=255)
ggTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGt < 2:105790/139‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGc < 2:96809/52‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGc > 1:96809/1‑52 (MQ=255)
tGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCt < 2:673793/54‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCt > 1:673793/1‑54 (MQ=255)
gaggagGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggt > 1:1208604/1‑77 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCAcaggt < 2:1208604/77‑1 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg < 2:1306336/117‑1 (MQ=255)
gAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGgtggtg > 1:1306336/1‑117 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcgtc > 2:1632013/1‑95 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATgcgtcagcgtc < 1:1632013/95‑1 (MQ=255)
ggTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGaaaaaa < 2:1756962/139‑1 (MQ=255)
gTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAg < 1:1814775/99‑1 (MQ=255)
gTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAg > 2:1814775/1‑99 (MQ=255)
gTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 1:1286917/1‑139 (MQ=255)
gTAAGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAAc > 2:1622826/1‑139 (MQ=255)
aaGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAActg < 2:96102/139‑1 (MQ=255)
aGTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAActgc < 1:1622826/139‑1 (MQ=255)
gTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAActgct < 1:541784/139‑1 (MQ=255)
gTCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAActgct < 2:1286917/139‑1 (MQ=255)
tCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca > 1:287726/1‑61 (MQ=255)
tCGGGCGCTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGca < 2:287726/61‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTa < 1:373362/139‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTa < 1:153089/139‑1 (MQ=255)
cgcTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTc > 1:967885/1‑113 (MQ=255)
cgcTGGAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTc < 2:967885/113‑1 (MQ=255)
gAAGCGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGt < 2:521108/139‑1 (MQ=255)
|
TTTCCGCTGGGAGAATGGCAACGGCATGTTGACACAACTCAACCGCCAGTTCCCGACCATTAGCCTGTTAGATATTGGCGCGATTTTAAAACAGGTCGGTCAGGTGCTGGAGCAGGTAAGTCGGGCGCTGGAAGTGATGGTGGTACTGGTCA‑CCGCCTGCGGTATGTTGCTGTTGCTGGCACAGGTGCAGGTGGGAATGCGTCAGCGTCATCAGGAGCTGGTGGTGTGGCGCACACTCGGTGCGGGGAAAAAACTGCTGCGTACCACGT > NC_000913/522329‑522597
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
