Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A32 F90 I2 R1
|
29 |
376.5 |
16112962 |
96.0% |
15468443 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947 |
1,828,233 |
A→C |
V671G (GTG→GGG) |
mutS ← |
DNA mismatch repair protein MutS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947 | 1,828,233 | 0 | A | C | 99.7%
| 1372.7
/ NA
| 373 | V671G (GTG→GGG) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (184/188); total (185/188) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 375 total aligned reads displayed.
AGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTGGCGCAT > NC_002947/1828087‑1828378
|
aGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTccccc < 2:2481746/149‑1 (MQ=255)
cACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATg > 2:2083487/1‑149 (MQ=255)
aCGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGa < 2:1204813/149‑1 (MQ=255)
aCGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGa > 1:5452151/1‑149 (MQ=255)
cGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGaa > 1:1001893/1‑149 (MQ=255)
cGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGaa > 2:3412838/1‑149 (MQ=255)
cGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGaa > 2:1467475/1‑149 (MQ=255)
cAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAgg > 2:3795796/1‑149 (MQ=255)
ggCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAgc > 1:2168270/1‑149 (MQ=255)
ccAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCATGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAgcgc > 1:3980142/1‑149 (MQ=255)
cAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGcgcc > 1:4059140/1‑149 (MQ=255)
aGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGcgccc > 1:1791512/1‑149 (MQ=255)
gcgcTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGcgcccgc > 1:6838885/1‑149 (MQ=255)
cgcTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGcgcccgcc > 2:2897585/1‑149 (MQ=255)
cgcTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGcgcccgcc > 2:1750574/1‑149 (MQ=255)
cTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCgg > 1:3294484/1‑149 (MQ=255)
cTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCgg < 1:3987173/149‑1 (MQ=255)
tCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGc < 1:7553082/149‑1 (MQ=255)
cAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGcc > 2:7941803/1‑149 (MQ=255)
aGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGTAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCa < 2:6055705/149‑1 (MQ=255)
gCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAg > 1:7942262/1‑149 (MQ=255)
gCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAg < 1:6039610/149‑1 (MQ=255)
ggCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGgt < 2:7857403/149‑1 (MQ=255)
cAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGgtcg > 2:466076/1‑149 (MQ=255)
ccAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCAc < 1:1381713/149‑1 (MQ=255)
cAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACt > 1:5551102/1‑149 (MQ=255)
ccAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAg < 1:6322654/149‑1 (MQ=255)
cAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGc < 2:112445/149‑1 (MQ=255)
gCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCg < 1:7656435/149‑1 (MQ=255)
gCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCg < 1:5845821/149‑1 (MQ=255)
aCAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATg > 2:3607036/1‑149 (MQ=255)
cAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGc < 1:1488914/149‑1 (MQ=255)
aGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCg < 2:4417094/149‑1 (MQ=255)
ggCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCgg < 1:2052889/149‑1 (MQ=255)
ccGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGt > 1:865431/1‑149 (MQ=255)
ccGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGt < 2:279343/149‑1 (MQ=255)
ccGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGt > 1:6601375/1‑149 (MQ=255)
ccGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACAACGTCCATCAGCACCAGGCGGCGGTCGCTCTCATTGTGCAGGATGATGGCGGTTACGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGt > 2:4165280/1‑149 (MQ=255)
ccGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCAAATTCGTCCATCAGCACCAGGATGCGGACTGTGGCATTGTGCAGGATCTTGCCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGACGAGCACCCGCAGGCCAGGACTTCACAGGAGCCGATTCGGGt > 1:3533069/1‑149 (MQ=255)
cGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTg > 2:6230442/1‑149 (MQ=255)
gTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGa < 1:3090759/149‑1 (MQ=255)
gTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGa < 1:2603413/149‑1 (MQ=255)
tCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGaa > 2:456994/1‑149 (MQ=255)
tCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGaa < 2:5112600/149‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCg < 2:8025000/149‑1 (MQ=255)
tGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCgg > 2:1418978/1‑149 (MQ=255)
tGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCgg > 2:1845250/1‑149 (MQ=255)
cTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTc < 2:6661992/149‑1 (MQ=255)
cTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTc > 2:3993936/1‑149 (MQ=255)
ggTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGa > 1:7805256/1‑149 (MQ=255)
gTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGAc < 2:2252208/149‑1 (MQ=255)
tACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGAcc > 2:202057/1‑149 (MQ=255)
ccGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAg < 1:3168379/149‑1 (MQ=255)
ccGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAg < 1:7234987/149‑1 (MQ=255)
ccGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAg < 2:5241747/149‑1 (MQ=255)
gcgGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCg > 2:3081421/1‑149 (MQ=255)
gcgGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCg > 1:2328525/1‑149 (MQ=255)
gcgGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCg > 2:7480816/1‑149 (MQ=255)
cgGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGa < 2:5690441/149‑1 (MQ=255)
ccACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaac > 2:7780709/1‑149 (MQ=255)
cTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcg < 1:6966317/149‑1 (MQ=255)
cTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcg < 1:4678531/149‑1 (MQ=255)
ttCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcgc < 1:4298827/149‑1 (MQ=255)
tCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcgca < 2:5513548/149‑1 (MQ=255)
tCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcgca < 2:865431/149‑1 (MQ=255)
tCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcgcaact < 2:7721006/149‑1 (MQ=255)
cATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGAcaactcgcaactcg > 2:3149301/1‑149 (MQ=255)
tCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTcgcc > 2:7260719/1‑149 (MQ=255)
tCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTcgcc > 1:3755108/1‑149 (MQ=255)
cAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTcgccg > 2:4271746/1‑149 (MQ=255)
gCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCCTGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACGGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCa < 2:3221253/149‑1 (MQ=255)
cACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAg > 1:3740148/1‑149 (MQ=255)
ccAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAggg < 2:6197749/149‑1 (MQ=255)
aGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGAc > 1:4211078/1‑149 (MQ=255)
ggCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACg < 2:6294374/149‑1 (MQ=255)
cTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGaa < 1:1045935/149‑1 (MQ=255)
gCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGc < 2:5652938/149‑1 (MQ=255)
cggtcggtGGCATTGTGCAGGCTGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCt < 1:1623287/149‑1 (MQ=255)
tcggtGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGcc > 2:4895982/1‑149 (MQ=255)
tGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGAtg < 1:2973228/149‑1 (MQ=255)
tGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGAtg > 1:4892334/1‑149 (MQ=255)
tGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGAtg < 2:5850548/149‑1 (MQ=255)
tgtgCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGcc < 2:2158693/149‑1 (MQ=255)
gCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCcagc > 1:5283576/1‑149 (MQ=255)
ggATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCagcagc > 1:5765667/1‑149 (MQ=255)
ggATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCagcagc < 2:6791096/149‑1 (MQ=255)
gATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAgcagca < 1:1111338/149‑1 (MQ=255)
aTGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCAc > 2:2367048/1‑149 (MQ=255)
gCGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAg > 1:5006182/1‑149 (MQ=255)
cGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCATCTCGCCGCAGGGACGAATCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGTTCAgg < 2:5814080/149‑1 (MQ=255)
cGGTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAgg < 2:7481900/149‑1 (MQ=255)
gTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGc < 2:7004858/149‑1 (MQ=255)
gTTTCGCTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGc < 2:2605796/149‑1 (MQ=255)
cTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTg > 1:6095827/1‑149 (MQ=255)
cTCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTg > 2:2056008/1‑149 (MQ=255)
tCATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTgg < 1:815461/149‑1 (MQ=255)
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cATCTCCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTGgc > 1:3885619/1‑149 (MQ=255)
tctcCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTGgcgc < 2:3767924/149‑1 (MQ=255)
tctcCCCCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTGgcgc < 2:5786296/149‑1 (MQ=255)
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AGGCACGCAGCTGGGCCAGGCGCTCAGCGGCAGCCCAGGCCAGCGACAGGCCGTCGAAGGTGCTGGTACCGCGGCCCACTTCGTCCATCAGCACCAGGCTGCGGTCGGTGGCATTGTGCAGGATGTTGGCGGTTTCGCTCATCTCCACCATGAAGGTCGAGCGCCCGCCGGCCAGGTCGTCACTGGAGCCGATGCGGGTGAAGATGCGGTCGACCAGCGACAACTCGCAACTCGCCGCAGGGACGAAGCTGCCGATGTGCGCCAGCAGCACGATCAGGGCGGTCTGGCGCAT > NC_002947/1828087‑1828378
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
