Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A32 F90 I2 R1
|
29 |
376.5 |
16112962 |
96.0% |
15468443 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947 |
2,673,491 |
C→T |
N117N (AAC→AAT) |
prpD → |
2‑methylcitrate dehydratase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947 | 2,673,491 | 0 | C | T | 99.7%
| 1227.1
/ NA
| 330 | N117N (AAC→AAT) | prpD | 2‑methylcitrate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (164/164); total (165/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
ACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCTTCA > NC_002947/2673345‑2673636
|
cGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCtt > 1:3137907/1‑149 (MQ=255)
cGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCtt > 2:4193980/1‑149 (MQ=255)
cGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCtt > 1:2364993/1‑149 (MQ=255)
gCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTg > 2:3202027/1‑149 (MQ=255)
cTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTgg < 2:574118/149‑1 (MQ=255)
tGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggc < 1:6485799/149‑1 (MQ=255)
ggTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggcg > 2:7892912/1‑149 (MQ=255)
tCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggcggc > 2:3081528/1‑149 (MQ=255)
tCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggcggc > 2:6762638/1‑149 (MQ=255)
cGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATc > 1:288436/1‑149 (MQ=255)
aaTGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCt < 1:2239185/149‑1 (MQ=255)
aTGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTg > 2:4972711/1‑149 (MQ=255)
tGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAg < 1:1703647/149‑1 (MQ=255)
gCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGt < 1:7688093/149‑1 (MQ=255)
cTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTg < 1:3942949/149‑1 (MQ=255)
tCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTgg > 2:2195436/1‑149 (MQ=255)
gcgTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCt > 2:453108/1‑149 (MQ=255)
ccGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGaccac > 2:6222805/1‑149 (MQ=255)
cGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGaccacc > 1:4250071/1‑149 (MQ=255)
gCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTg < 2:6980061/149‑1 (MQ=255)
tcctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTcaca < 2:2934700/149‑1 (MQ=255)
cctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAg > 2:1733781/1‑149 (MQ=255)
cctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAg > 1:252681/1‑149 (MQ=255)
cctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAg < 1:4928940/149‑1 (MQ=255)
aggcagCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGa > 2:7647141/6‑149 (MQ=255)
ggcagCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGaa > 1:5376517/5‑149 (MQ=255)
cagCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAAc > 1:7592685/3‑149 (MQ=255)
cGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACg < 2:87890/149‑1 (MQ=255)
gCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACgg > 2:2299391/1‑149 (MQ=255)
ccTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACggg > 1:1229240/1‑149 (MQ=255)
tCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGtt < 2:2135176/149‑1 (MQ=255)
cccGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcg > 2:2836038/1‑149 (MQ=255)
cGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcgcg < 1:1033009/149‑1 (MQ=255)
cGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcgcg > 2:5844305/1‑149 (MQ=255)
gTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCggg < 2:5939700/149‑1 (MQ=255)
cAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTg > 2:1304053/1‑149 (MQ=255)
aGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGaa < 1:6660016/149‑1 (MQ=255)
cTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAg > 2:3763348/1‑149 (MQ=255)
ggACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc < 2:7176832/149‑1 (MQ=255)
ggACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc > 1:2776348/1‑149 (MQ=255)
ggACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc > 1:934513/1‑149 (MQ=255)
aCATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgctg < 2:4860927/149‑1 (MQ=255)
cATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGa < 1:990700/149‑1 (MQ=255)
cATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGa < 1:4834564/149‑1 (MQ=255)
ttGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATg < 1:4677702/149‑1 (MQ=255)
tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc < 1:5719755/149‑1 (MQ=255)
tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc > 1:21351/1‑149 (MQ=255)
tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc > 2:6339522/1‑149 (MQ=255)
tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc > 2:5337219/1‑149 (MQ=255)
ggCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCg < 1:8047689/149‑1 (MQ=255)
ggCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCg < 1:5189358/149‑1 (MQ=255)
gCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGt < 2:3137907/149‑1 (MQ=255)
gCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGAt > 1:5860733/1‑149 (MQ=255)
aCGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGAtgt < 2:4782348/149‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGAtgtg < 2:3910667/149‑1 (MQ=255)
gTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCt < 1:7106588/149‑1 (MQ=255)
gTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCt < 1:6937956/149‑1 (MQ=255)
tGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTc > 2:2602103/1‑149 (MQ=255)
cgcTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGa < 1:615571/149‑1 (MQ=255)
gctggctgGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAg < 1:7188650/149‑1 (MQ=255)
ctggctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAgg < 2:5479002/149‑1 (MQ=255)
ctggctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAgg > 2:1963431/1‑149 (MQ=255)
ctggctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAgg > 2:5628537/1‑149 (MQ=255)
tggctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGc > 2:3384487/1‑149 (MQ=255)
ctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGAt > 2:8003807/1‑149 (MQ=255)
ctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACCGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGag > 2:5979884/1‑148 (MQ=255)
gACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGt < 2:2707557/149‑1 (MQ=255)
cTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCa > 1:675390/1‑149 (MQ=255)
aCAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATg > 2:6911778/1‑149 (MQ=255)
aaCGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGgc > 1:3438215/1‑149 (MQ=255)
aaCGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGgc > 1:365949/1‑149 (MQ=255)
cGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGTTGGTCATGgcgc > 2:7375199/1‑149 (MQ=255)
cGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGgcgc > 2:3486795/1‑149 (MQ=255)
cGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGgcgc < 2:4356210/149‑1 (MQ=255)
gACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCa < 1:2834872/149‑1 (MQ=255)
gACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCa > 2:1790581/1‑149 (MQ=255)
cacCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATg > 1:3047914/1‑149 (MQ=255)
ccTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATgag > 1:5595686/1‑149 (MQ=255)
tggctggcCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGAt > 1:3728596/1‑149 (MQ=255)
tggcCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAg < 2:4303637/149‑1 (MQ=255)
ggcCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAgg > 1:4601660/1‑149 (MQ=255)
ccgccgAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGc > 2:3956805/1‑149 (MQ=255)
cgAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGc > 2:7691160/1‑149 (MQ=255)
cgAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGGTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGc > 2:6562076/1‑149 (MQ=255)
ggCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGgcgc < 1:3181924/149‑1 (MQ=255)
ggCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGgcgc < 1:5013665/149‑1 (MQ=255)
cTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTg < 2:2364993/149‑1 (MQ=255)
cTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTg > 1:7416274/1‑149 (MQ=255)
cATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGa < 1:138891/149‑1 (MQ=255)
cATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGa > 1:7482358/1‑149 (MQ=255)
cATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGa < 1:6002034/149‑1 (MQ=255)
tCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGaaa < 1:1768813/149‑1 (MQ=255)
tCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGaaa > 2:354964/1‑149 (MQ=255)
cccTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGaaaa < 2:1395899/149‑1 (MQ=255)
cTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACg > 2:7144147/1‑149 (MQ=255)
cTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACg < 1:1257525/149‑1 (MQ=255)
cTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACg < 2:1612502/149‑1 (MQ=255)
tCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGc > 1:1849824/1‑149 (MQ=255)
gACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCtt < 2:5196807/149‑1 (MQ=255)
cAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCTTCa > 2:662472/1‑149 (MQ=255)
|
ACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCTTCA > NC_002947/2673345‑2673636
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
