Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A15 F73 I1 R1
|
29 |
140.0 |
4785556 |
99.3% |
4752057 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,223,159 |
G→T |
R176L (CGC→CTC) |
ebgA → |
evolved beta‑D‑galactosidase subunit alpha |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,223,159 | 0 | G | T | 100.0%
| 390.8
/ NA
| 109 | R176L (CGC→CTC) | ebgA | evolved beta‑D‑galactosidase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (55/54); total (55/54) |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TAAATTTGACGGCGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGAC > NC_000913/3223022‑3223295
|
tAAATTTGACGGCGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGctcg > 1:1018315/1‑140 (MQ=255)
aCGGCGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAg > 2:1272642/1‑140 (MQ=255)
aCGGCGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAg > 2:1656606/1‑140 (MQ=255)
aCGGCGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAg > 1:526096/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTggg > 2:649758/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTggg > 1:672930/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTggg > 1:1551547/1‑140 (MQ=255)
cGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTggg < 2:636580/140‑1 (MQ=255)
cGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTACTCGTGATGCAGTggg < 1:593873/140‑1 (MQ=255)
gTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGc < 1:385259/140‑1 (MQ=255)
tCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCg < 1:237340/140‑1 (MQ=255)
tCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCg < 1:2351207/140‑1 (MQ=255)
tCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCg < 2:244137/140‑1 (MQ=255)
ttttGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTggg < 2:24616/128‑1 (MQ=255)
ttttGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTggg > 1:24616/1‑128 (MQ=255)
ttttGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTctacct < 2:1884884/140‑1 (MQ=255)
tttGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTctaccta < 2:123558/140‑1 (MQ=255)
aGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTgg < 1:1541007/140‑1 (MQ=255)
gTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGGTGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGa > 2:209813/1‑140 (MQ=255)
gTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGa > 2:415303/1‑140 (MQ=255)
gTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGa > 2:1116550/1‑140 (MQ=255)
tCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGaa > 2:567813/1‑140 (MQ=255)
cTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAg < 1:754188/140‑1 (MQ=255)
tGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGAcc > 2:1220166/1‑140 (MQ=255)
tAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAgg < 1:762233/140‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGat < 1:544500/140‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGat < 1:649758/140‑1 (MQ=255)
cGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGata > 2:1492663/1‑140 (MQ=255)
cAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGAcc < 2:724295/130‑1 (MQ=255)
cAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGAcc > 1:724295/1‑130 (MQ=255)
cAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATAtgtg > 2:485611/1‑140 (MQ=255)
cAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATAtgtg > 2:1086098/1‑140 (MQ=255)
cAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGT‑‑TGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATgtggt > 1:2285310/1‑140 (MQ=255)
gTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATgtggt > 2:3402/1‑140 (MQ=255)
gTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATgtggt > 2:1400714/1‑140 (MQ=255)
tATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATgtggtg < 2:611530/140‑1 (MQ=255)
gggTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAg < 2:2346048/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGc > 2:1975203/1‑140 (MQ=255)
tttCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgg > 2:602955/1‑140 (MQ=255)
tttCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgg > 1:537513/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCggg < 2:1800604/140‑1 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 2:1742045/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 2:1177508/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 2:1427816/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 1:690106/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 1:1178589/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 1:1798732/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 1:424597/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 2:2087226/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 2:658625/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCgggg > 2:1803177/1‑140 (MQ=255)
aGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGAt > 1:94250/1‑140 (MQ=255)
gCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATc < 2:483720/140‑1 (MQ=255)
gggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTcc > 1:1166538/1‑140 (MQ=255)
ggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcg < 1:3402/140‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcg < 2:2204306/140‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcg < 2:243843/140‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcg < 2:1551547/140‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcg < 1:833122/140‑1 (MQ=255)
ggCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcg < 2:424597/140‑1 (MQ=255)
cAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcgcg < 2:1785175/140‑1 (MQ=255)
cAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcgcg < 1:1086098/140‑1 (MQ=255)
cAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcgcg < 2:1161338/140‑1 (MQ=255)
cAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCcgcg < 1:1927970/140‑1 (MQ=255)
aatccgcTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGa < 1:2132041/134‑1 (MQ=255)
aGTCGCCTGACCGCAGAGGTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGa > 1:852073/1‑140 (MQ=255)
gTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGAt > 2:1540832/1‑140 (MQ=255)
tCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATg > 1:781091/1‑140 (MQ=255)
tGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTAt > 2:2185916/1‑140 (MQ=255)
cGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTgg < 2:1533188/140‑1 (MQ=255)
cGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTgg > 2:834082/1‑140 (MQ=255)
cGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTgg < 2:781091/140‑1 (MQ=255)
cAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTc > 1:2139747/1‑140 (MQ=255)
ttGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGaaaa < 1:485611/140‑1 (MQ=255)
ttGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGaaaa < 2:537513/140‑1 (MQ=255)
cATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACAcc < 1:1742045/140‑1 (MQ=255)
gcgcGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACg > 2:2369841/1‑140 (MQ=255)
gcgcGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACg < 1:567813/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGc < 1:602955/140‑1 (MQ=255)
tGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAACCACCTAACGCATAtt > 1:1133790/1‑140 (MQ=255)
tGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATAtt < 2:2139747/140‑1 (MQ=255)
tGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATAtt < 2:1178589/140‑1 (MQ=255)
tGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATAtt < 1:1400714/140‑1 (MQ=255)
tGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATAtt < 1:1492663/140‑1 (MQ=255)
ttAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATAtt > 2:761851/1‑137 (MQ=255)
ttAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATAtt < 1:761851/137‑1 (MQ=255)
aaaaCCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGa < 2:1018315/140‑1 (MQ=255)
ccGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTc < 1:1177508/140‑1 (MQ=255)
cGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCa < 1:2185916/140‑1 (MQ=255)
cGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCa < 2:1347054/140‑1 (MQ=255)
gCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAATGATTTCACt > 1:1106829/1‑140 (MQ=255)
gCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACt > 1:1764013/1‑140 (MQ=255)
gCGACAACCTGTTGTGTGTGCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACt > 1:2079155/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTg > 2:1085652/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTg > 1:1878975/1‑140 (MQ=255)
tgtgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTg > 1:1141962/1‑140 (MQ=255)
tgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTGCCGACTTTGAc < 2:852073/140‑1 (MQ=255)
tgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGAc < 1:634470/140‑1 (MQ=255)
tgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGAc < 1:415303/140‑1 (MQ=255)
tgCTCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGAc > 1:1107946/1‑140 (MQ=255)
|
TAAATTTGACGGCGTCGAAACCTATTTTGAAGTCTATGTTAACGGTCAGTATGTGGGTTTCAGCAAGGGCAGTCGCCTGACCGCAGAGTTTGACATCAGCGCGATGGTTAAAACCGGCGACAACCTGTTGTGTGTGCGCGTGATGCAGTGGGCGGACTCTACCTACGTGGAAGACCAGGATATGTGGTGGTCAGCGGGGATCTTCCGCGATGTTTATCTGGTCGGAAAACACCTAACGCATATTAACGATTTCACTGTGCGTACCGACTTTGAC > NC_000913/3223022‑3223295
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
