Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F73 I1 R1
|
27 |
139.9 |
4778260 |
99.2% |
4740033 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,353,097 |
A→G |
intergenic (‑72/+24) |
arcB ← / ← yhcC |
sensory histidine kinase ArcB/radical SAM family oxidoreductase YhcC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,353,097 | 0 | A | G | 98.7%
| 565.1
/ ‑2.9
| 149 | intergenic (‑72/+24) | arcB/yhcC | sensory histidine kinase ArcB/radical SAM family oxidoreductase YhcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (81/66); total (81/68) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CGCACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGAAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACCACAGCG > NC_000913/3352961‑3353233
|
cgcACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAAt > 1:1892797/1‑140 (MQ=255)
gcACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATg > 1:1216946/1‑140 (MQ=255)
aGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAGATTGTGTGAGGAATGCGGaa < 1:1396387/140‑1 (MQ=255)
ttCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCa > 1:771431/1‑140 (MQ=255)
ttCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCa < 2:527000/140‑1 (MQ=255)
ttCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCC‑ATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCaa < 1:206474/140‑1 (MQ=255)
tcatcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCaa < 2:2144064/140‑1 (MQ=255)
catcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAAc > 1:271905/1‑140 (MQ=255)
catcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAAc > 2:1198566/1‑140 (MQ=255)
tcatcaGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGa > 2:2191547/1‑140 (MQ=255)
caGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTa < 2:271905/140‑1 (MQ=255)
ggTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt < 2:1631715/140‑1 (MQ=255)
ggTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt > 2:1018286/1‑140 (MQ=255)
gTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTc > 2:1761693/1‑140 (MQ=255)
tCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTcc > 2:678288/1‑140 (MQ=255)
tCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTcc > 1:1548507/1‑140 (MQ=255)
cAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCg < 2:1298255/140‑1 (MQ=255)
aaCATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGt < 1:487745/140‑1 (MQ=255)
aataCTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:678288/140‑1 (MQ=255)
taCTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGt > 2:1227669/1‑140 (MQ=255)
taCTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGt > 2:478145/1‑140 (MQ=255)
tGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg > 2:672619/1‑135 (MQ=255)
tGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:672619/135‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGAAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGc < 1:1603289/140‑1 (MQ=255)
gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg > 2:1892671/1‑134 (MQ=255)
gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:1892671/134‑1 (MQ=255)
gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGcc < 1:913694/140‑1 (MQ=255)
gcgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGcc < 2:376339/140‑1 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt > 1:1102934/1‑124 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACt < 2:1102934/124‑1 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:1202579/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:2211637/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:1755175/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:1986089/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:93321/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:2024642/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:2097698/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:752631/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:420698/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 2:843541/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCa > 1:2343630/1‑140 (MQ=255)
gcCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg < 1:343100/132‑1 (MQ=255)
agcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa < 1:752631/140‑1 (MQ=255)
agcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa < 1:471072/140‑1 (MQ=255)
gcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa < 2:625420/139‑1 (MQ=255)
gcagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGa > 1:625420/1‑139 (MQ=255)
cagACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACg > 2:1306260/1‑140 (MQ=255)
gACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAg > 1:960116/1‑125 (MQ=255)
aCGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTcc < 1:981425/140‑1 (MQ=255)
aCGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTcc < 1:554308/140‑1 (MQ=255)
ttGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAgcgc < 1:327173/140‑1 (MQ=255)
cTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGa > 2:1440249/1‑140 (MQ=255)
ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGcc < 1:921634/137‑1 (MQ=255)
ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGcc > 2:921634/1‑137 (MQ=255)
ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 2:1468120/140‑1 (MQ=255)
ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 1:2278620/140‑1 (MQ=255)
ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 2:420698/140‑1 (MQ=255)
ttCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 2:339350/140‑1 (MQ=255)
ttAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCt > 2:2306082/1‑140 (MQ=255)
tAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTg > 1:1767815/1‑140 (MQ=255)
ggAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTAc > 2:1277305/1‑140 (MQ=255)
gAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACg < 2:326895/140‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGc < 1:1986089/140‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGc < 2:1892797/140‑1 (MQ=255)
aaTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGc < 1:1306260/140‑1 (MQ=255)
aTTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGcc < 1:886272/140‑1 (MQ=255)
tCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGAt < 1:2149576/127‑1 (MQ=255)
cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATg < 1:1060922/139‑1 (MQ=255)
cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATg > 2:1060922/1‑139 (MQ=255)
cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGt > 1:1733401/1‑140 (MQ=255)
cTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGt > 1:254730/1‑140 (MQ=255)
aCGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGttcat < 2:254730/140‑1 (MQ=255)
aCAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGttcattca < 1:1045451/140‑1 (MQ=255)
aCAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGttcattca < 1:1761693/140‑1 (MQ=255)
cAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAg > 2:1060659/1‑140 (MQ=255)
aaCCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGa > 2:710823/1‑140 (MQ=255)
ataataCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATa > 2:832459/1‑131 (MQ=255)
ataataCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAg > 2:809723/1‑140 (MQ=255)
taataCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGc < 1:1071448/140‑1 (MQ=255)
aCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGa > 1:442890/1‑140 (MQ=255)
aCCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGa > 1:394419/1‑140 (MQ=255)
cccAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGAc < 1:1198566/140‑1 (MQ=255)
cccAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGAc > 1:2146209/1‑140 (MQ=255)
aaTTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATc > 2:648602/1‑128 (MQ=255)
aaTTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCAt > 2:895773/1‑140 (MQ=255)
ttCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTc > 1:1673218/1‑140 (MQ=255)
ttCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTc > 2:378206/1‑140 (MQ=255)
ttCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTc > 1:850274/1‑140 (MQ=255)
gTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCAt > 1:589202/1‑140 (MQ=255)
gTTACGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCAt > 1:801971/1‑140 (MQ=255)
cGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGAt < 1:2306082/140‑1 (MQ=255)
cGTTATAAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGAt < 2:801971/140‑1 (MQ=255)
taAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCg > 1:1333864/1‑140 (MQ=255)
taAATTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCg < 1:809723/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGc > 1:1466454/1‑140 (MQ=255)
aTTGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGcac < 2:394419/140‑1 (MQ=255)
ttGTGTGAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGcacc < 2:963169/140‑1 (MQ=255)
tgtgAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACcaca < 2:850274/140‑1 (MQ=255)
tgtgAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACcaca > 2:1111826/1‑140 (MQ=255)
tgAGGAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACCACAGc > 2:1740104/1‑140 (MQ=255)
|
CGCACCAGACCTAACTTCATCATCAGGTCAACATAATACTGCGCCAGCAGACGAATTTGCTTCATTAGGGAATTCCTTCACGACAACCTGCCCCAATAATACCCAATTCTGACAGTTACGTTATAAATTGTGTGAGAAATGCGGAATTCCCCTCAACGACCTACTCCGTTGGAGGTAGCCACGGACGTCCCAGCGCCGATCCCTGTACGCCATGTTCATTCAGATAGCGATCCAGCTCGACCATTCCCGTCCATCGATTTTCGCACCACAGCG > NC_000913/3352961‑3353233
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
