Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
182 |
57.1 |
1926220 |
99.1% |
1908884 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,506,416 |
C→T |
intergenic (+11/‑32) |
yjhC → / → ythA |
KpLE2 phage‑like element; putative oxidoreductase YjhC/KpLE2 phage‑like element; uncharacterized protein YthA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,506,416 | 0 | C | T | 100.0%
| 251.2
/ NA
| 70 | intergenic (+11/‑32) | yjhC/ythA | KpLE2 phage‑like element; putative oxidoreductase YjhC/KpLE2 phage‑like element; uncharacterized protein YthA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/30); total (40/30) |
TGACCTTCTCAATGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGCCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCCTCTGTG > NC_000913/4506282‑4506547
|
tGACCTTCTCAATGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCtt > 2:711809/1‑140 (MQ=255)
aCCTTCTCAATGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGa > 1:776974/1‑140 (MQ=255)
aCCTTCTCAATGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGa > 1:383676/1‑140 (MQ=255)
cTTCTCAATGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGAtt > 2:779360/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCag < 1:266171/140‑1 (MQ=255)
gTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCagga < 1:588651/140‑1 (MQ=255)
tGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCaggag < 2:79142/140‑1 (MQ=255)
aGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCagga > 1:911203/1‑137 (MQ=255)
aGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCagga < 2:911203/137‑1 (MQ=255)
aGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGc > 2:198896/1‑140 (MQ=255)
cggcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCtt < 1:438572/140‑1 (MQ=255)
cggcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCtt > 2:772405/1‑140 (MQ=255)
cggcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCtt < 2:957687/140‑1 (MQ=255)
cggcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCtt < 1:565075/140‑1 (MQ=255)
cggcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCtt < 1:883310/140‑1 (MQ=255)
cggcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCtt < 1:78263/140‑1 (MQ=255)
gcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGc > 1:914676/1‑135 (MQ=255)
gcCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGc < 2:914676/135‑1 (MQ=255)
tCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTtatgtat > 2:542830/1‑140 (MQ=255)
cGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTtatgtatg > 1:839677/1‑140 (MQ=255)
aTGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTc > 2:354278/1‑140 (MQ=255)
gctgcCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGa > 1:785693/1‑140 (MQ=255)
tgcCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATa < 1:533408/140‑1 (MQ=255)
ctctTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAAtctc < 1:711809/140‑1 (MQ=255)
tttCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCAt < 1:672394/139‑1 (MQ=255)
tttCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCAt > 2:672394/1‑139 (MQ=255)
aaGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAAttt > 1:497675/1‑140 (MQ=255)
aaGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAAttt < 1:117828/140‑1 (MQ=255)
aTCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAg < 2:931808/140‑1 (MQ=255)
tCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAg < 2:406254/139‑1 (MQ=255)
tCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAg > 1:406254/1‑139 (MQ=255)
gCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCAt > 2:891975/1‑129 (MQ=255)
gCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCAt < 1:891975/129‑1 (MQ=255)
gCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAg > 2:823179/1‑140 (MQ=255)
caggacaggaAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGt > 2:244865/1‑140 (MQ=255)
caggacaggaAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGt > 1:7792/1‑140 (MQ=255)
caggaAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCAt < 1:772405/140‑1 (MQ=255)
aggaAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCAtt > 2:276810/1‑140 (MQ=255)
ggaAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCAttt < 1:542830/140‑1 (MQ=255)
gaAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTa > 2:490819/1‑140 (MQ=255)
tGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATa > 2:696258/1‑140 (MQ=255)
tGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATa > 1:667505/1‑140 (MQ=255)
aTCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAAc > 1:883296/1‑140 (MQ=255)
tCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACa < 2:193515/140‑1 (MQ=255)
tCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACa < 2:883296/140‑1 (MQ=255)
aGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATc < 1:244865/140‑1 (MQ=255)
tGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATccc > 2:847717/1‑140 (MQ=255)
cATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTaaaa > 1:98662/1‑140 (MQ=255)
tAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAAc > 1:145684/1‑138 (MQ=255)
tAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAAc < 2:145684/138‑1 (MQ=255)
acatCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTTATAATTTTACCAGCGCCAGTTATGATAAAAACATCCGTTAACCCCaatccaac < 2:839677/140‑2 (MQ=255)
catCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCaatctaatc > 2:632563/1‑140 (MQ=255)
catCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCaatctaatc > 1:84086/1‑140 (MQ=255)
catCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCaatctaatc > 1:835006/1‑140 (MQ=255)
atCAGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCaatctaatct > 2:372568/1‑140 (MQ=255)
aGTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCtttt < 1:198896/140‑1 (MQ=255)
gTAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCttttt > 1:767188/1‑140 (MQ=255)
tAATGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttc < 2:98662/140‑1 (MQ=255)
aTGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttctt > 2:687766/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttcttc < 2:785693/140‑1 (MQ=255)
tGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttcttc > 1:683577/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttcttc > 1:3010/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttcttc > 2:936681/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttcttc > 2:37321/1‑140 (MQ=255)
tGTAAAAACTATACGTATCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTttcttc > 1:210328/1‑140 (MQ=255)
tAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCct < 1:847717/140‑1 (MQ=255)
tAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCct > 1:56311/1‑140 (MQ=255)
tAAAAACTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCct > 2:417908/1‑140 (MQ=255)
aaCTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCCTCtgt < 1:310407/140‑1 (MQ=255)
aCTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCCTCtgtg < 1:810969/140‑1 (MQ=255)
aCTATACGTCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCCTCtgtg < 2:835006/140‑1 (MQ=255)
|
TGACCTTCTCAATGGTGAGGCGGCCATGTCGGCGATTGCTACTGCTGATGCTGCCACTCTTTCAAGATCGCAGGACAGGAAAGTGAAAATCAGTGAGATCATTAAACATACATCAGTAATGTAAAAACTATACGCCTCTTGATTTAATTCAGGAGGCCTTTTATGTATGATCAAGAATTTTATCTTCGATAATCTCATAATTTTAGCAGTGCCATTTATGATAAAAACATCCCTTAAAACCAATCTAATCTTTTTCTTCCTCTGTG > NC_000913/4506282‑4506547
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
