Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F73 I1 R1
|
26 |
114.7 |
3982346 |
99.4% |
3958451 |
139.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,430,255 |
C→A |
P131H (CCC→CAC) |
cycA → |
serine/alanine/glycine/cycloserine:H(+)symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,430,255 | 0 | C | A | 97.3%
| 244.7
/ ‑0.8
| 74 | P131H (CCC→CAC) | cycA | serine/alanine/glycine/cycloserine:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (39/33); total (40/34) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
TCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCT > NC_000913/4430119‑4430387
|
tCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGa < 1:1223022/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGAtctc < 1:62151/140‑1 (MQ=255)
tAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGAtctct > 1:622499/1‑140 (MQ=255)
gACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGa < 1:1638382/140‑1 (MQ=255)
ttCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTg > 1:267267/1‑140 (MQ=255)
ttCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTg > 1:1708173/1‑140 (MQ=255)
cGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTggg > 1:764175/1‑140 (MQ=255)
tCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGTGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGc < 2:257754/140‑1 (MQ=255)
aTTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCg < 1:893376/140‑1 (MQ=255)
ttACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCt < 2:267267/140‑1 (MQ=255)
aCTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTgg < 1:749884/140‑1 (MQ=255)
cTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGc < 1:488905/140‑1 (MQ=255)
tCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCg < 1:748171/140‑1 (MQ=255)
ggCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTg > 1:545671/1‑140 (MQ=255)
gCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGa > 1:1917905/1‑140 (MQ=255)
tGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGt < 1:688270/140‑1 (MQ=255)
gggCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtg > 1:1963063/1‑140 (MQ=255)
ggCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgc > 2:770967/1‑140 (MQ=255)
cAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctg < 1:1420571/140‑1 (MQ=255)
cAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctg < 1:396807/140‑1 (MQ=255)
ggATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctgct > 1:1704974/1‑140 (MQ=255)
ggATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctgct > 1:468442/1‑140 (MQ=255)
tatTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTgctgctgct < 1:195790/140‑1 (MQ=255)
ttCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGAc > 1:679265/1‑140 (MQ=255)
ttCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGAc > 2:977384/1‑140 (MQ=255)
tCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACg < 1:844839/140‑1 (MQ=255)
cGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCa > 2:1937481/1‑140 (MQ=255)
cGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCa > 2:775016/1‑140 (MQ=255)
cGGCTGGA‑TTACTGGTTCTGCTGGGGTGTAACCGGGATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCaa > 1:417218/1‑140 (MQ=255)
ttACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCa < 1:770967/140‑1 (MQ=255)
tGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGt > 2:265387/1‑140 (MQ=255)
tCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGaaa > 1:1530861/1‑140 (MQ=255)
tCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGaaa > 1:1901501/1‑140 (MQ=255)
gctgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATg < 2:1509679/140‑1 (MQ=255)
ctgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGt > 1:1618422/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGtt < 2:677887/140‑1 (MQ=255)
ggTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACAGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCg < 2:420246/140‑1 (MQ=255)
gTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCgg < 1:775016/140‑1 (MQ=255)
ttGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGt > 2:674455/1‑140 (MQ=255)
tGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTg < 2:1705048/140‑1 (MQ=255)
tGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCCCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTg < 2:1122569/140‑1 (MQ=255)
aCCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGAt > 1:169484/1‑140 (MQ=255)
aCCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGAt > 1:1924976/1‑140 (MQ=255)
ggTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATggg > 1:841833/1‑139 (MQ=255)
tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGGTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTTGGTGGGGTGGAGt > 2:567120/1‑140 (MQ=255)
tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGt > 1:672236/1‑140 (MQ=255)
tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGt > 2:1879426/1‑140 (MQ=255)
aTGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt < 1:977384/140‑1 (MQ=255)
aTGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt < 2:1901501/140‑1 (MQ=255)
ggCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCAGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCt > 1:411395/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt < 2:1198744/132‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt > 1:1198744/1‑132 (MQ=255)
tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 2:679265/140‑1 (MQ=255)
tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 2:1149967/140‑1 (MQ=255)
tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 2:969813/140‑1 (MQ=255)
tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 1:1834277/140‑1 (MQ=255)
gtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCACCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgat > 1:1108754/1‑140 (MQ=255)
gtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAAACTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgat > 1:856513/1‑140 (MQ=255)
ggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgatga > 1:1924810/1‑140 (MQ=255)
aTCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCaa > 2:1375427/1‑140 (MQ=255)
aTCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCaa > 1:178910/1‑140 (MQ=255)
ggCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcg > 1:653577/1‑140 (MQ=255)
ggCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcg < 2:653577/140‑1 (MQ=255)
gCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgt < 1:674455/140‑1 (MQ=255)
gCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgt < 1:1879426/140‑1 (MQ=255)
cTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgtc > 2:1782617/1‑140 (MQ=255)
ttATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgtcg < 2:764175/140‑1 (MQ=255)
tGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCa > 2:753328/1‑140 (MQ=255)
tGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCa < 1:1375427/140‑1 (MQ=255)
gTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTgtgt > 1:1903615/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTgtgt > 1:428981/1‑140 (MQ=255)
gTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGGCGCCATTgtgt > 2:596164/1‑140 (MQ=255)
tCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCg < 2:178910/140‑1 (MQ=255)
tGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCt > 1:158377/1‑140 (MQ=255)
|
TCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCT > NC_000913/4430119‑4430387
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
