Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F46 I0 R1
|
97 |
59.2 |
2066676 |
97.0% |
2004675 |
148.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,406,129 |
T→C |
100% |
intergenic (+144/‑61) |
purA → / → nsrR |
adenylosuccinate synthetase/nitric oxide‑sensitive repressor for NO regulon |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,406,129 | 0 | T | C | 100.0%
| 292.2
/ ‑6.7
| 109 | intergenic (+144/‑61) | purA/nsrR | adenylosuccinate synthetase/nitric oxide‑sensitive repressor for NO regulon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (49/59); minor base A (1/0); total (50/59) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TAATTCTGGTACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTA > NC_000913/4405983‑4406271
|
tAATTCTGGTACGCCTGGCAGATATTTTGCATGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCtg > 1:681781/1‑149 (MQ=255)
aaTTCTGGTACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCtgt > 1:301093/1‑149 (MQ=255)
aaTTCTGGTACGCCTGGCAGATATTTAGACTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTCAAATAAATTAGCGACACAGCCtgt < 2:88382/149‑1 (MQ=255)
tCTGGTACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGATCAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGTAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGc < 2:403215/149‑1 (MQ=255)
tGGTACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTg < 2:1000917/149‑1 (MQ=255)
ggTACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTgg < 2:384426/149‑1 (MQ=255)
tACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAGATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGtt < 2:408791/149‑1 (MQ=255)
tACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGtt > 1:442971/1‑149 (MQ=255)
cGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTa > 1:269808/1‑149 (MQ=255)
gCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTat > 2:508766/1‑149 (MQ=255)
gCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTat < 1:855057/149‑1 (MQ=255)
ccTGGCATATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTTAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTatc < 1:365072/149‑1 (MQ=255)
ccTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTatc < 2:711850/149‑1 (MQ=255)
tGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTatcat > 1:486169/1‑149 (MQ=255)
aGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAat < 1:552583/149‑1 (MQ=255)
atatTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGTCACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAatat < 2:972242/149‑1 (MQ=255)
atTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATaa < 1:1007599/149‑1 (MQ=255)
ttttGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATaaa < 2:486169/149‑1 (MQ=255)
ttttGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATaaa > 2:726068/1‑149 (MQ=255)
ttttGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCATCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATaaa < 1:506884/149‑1 (MQ=255)
tttGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAAt < 1:508766/149‑1 (MQ=255)
ctggCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGCAACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTAtttttt < 1:1010623/147‑1 (MQ=255)
cGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTAtttttt > 1:678482/1‑149 (MQ=255)
gggCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTc < 1:540784/149‑1 (MQ=255)
ggCGTACAGTGTGATACATTGCTGTGGCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTGGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTcc < 1:814534/149‑1 (MQ=255)
ggCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTcc < 2:874629/149‑1 (MQ=255)
aaCAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATTTAATTTTTCACGAt > 1:427751/1‑149 (MQ=255)
tgtgATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTccc < 2:305588/149‑1 (MQ=255)
aCATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGa > 1:837204/1‑149 (MQ=255)
aCATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGa > 1:458902/1‑149 (MQ=255)
cATTGCTGAGGCGTGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAACTCCTCGCTTCTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGCCACAGCCTGTGGCTGGTTTATCCTCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAg < 2:574185/149‑1 (MQ=255)
aaagCTGTGTCGGCTAACCCATTCCTCTAACCTATACATAGTTAACACCTCTCTTTTATCATACCCCGAACTCTAATAAAATAGCCACACAGCCTGTGGCTGGTGTATCCTCAATATAAATGTATTTTTTCCCTATTTCCCTTTTGatg < 2:662987/146‑3 (MQ=255)
cTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGa > 2:239547/1‑149 (MQ=255)
tgtCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGAtgt < 1:982196/149‑1 (MQ=255)
tgtCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAAAAAATTAGCGACACAGCCTGAGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGAtgt > 2:843742/1‑149 (MQ=255)
gtCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGAtgtg < 2:681781/149‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGc > 1:510288/1‑149 (MQ=255)
cGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCa < 1:354426/149‑1 (MQ=255)
gTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGtt < 2:726160/149‑1 (MQ=255)
tAAGCCATTACGCTATGCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGATATAAATTAGCGACACAGGCTGTGGCGGGTTTATCTTCAGTATAATTGTATTTTTTCCCGATTTCCCTGTTGAGGTTGATGTGCAggtg > 2:483944/1‑146 (MQ=255)
tAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTTCAGTTa > 2:782388/1‑149 (MQ=255)
aGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAAc < 1:1029594/149‑1 (MQ=255)
aGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAAc < 1:482959/149‑1 (MQ=255)
cATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAg > 1:1005945/1‑149 (MQ=255)
cATTACGCTATCCGACACAGTGTGAACTCCTCGCTTTTTTCCGTCCCCGAACTGAAATAACTTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAAGATAAATGTATTTTTTACCGATTTCCCTGTTGAGGTTGATGGGCAGTGAACGAg > 2:797679/1‑149 (MQ=255)
aTTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGt < 1:910239/149‑1 (MQ=255)
tACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTATTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGttt < 2:492896/149‑1 (MQ=255)
cGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGtt > 2:5002/1‑127 (MQ=255)
cTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGGTCATGTGCAGTTAACGAGTTTCACt < 1:900051/149‑1 (MQ=255)
tcagACACAGTGTTAAATCCTCGATTTTTTCCTTCCCAGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGAGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTTAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgat < 1:904977/146‑1 (MQ=255)
cGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta < 1:678289/149‑1 (MQ=255)
gACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCGGTGGCTGGTTTATCATCAATATAACTGTATTTTTTCCCTCTTTCCCTTTTGAGGGTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTcaatac > 2:181865/1‑149 (MQ=255)
acacAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgattacg < 2:347155/149‑1 (MQ=255)
aGTGTTAACTCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCTAACTGAAATAAATTAGCGACACCGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATACATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGTTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgattacggatt < 2:319635/149‑1 (MQ=255)
aGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCATTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTAACTgattacggatt > 1:562835/1‑149 (MQ=255)
aGTGTGAAATCCTCGCTGTTTTCCTACCCCGAACTGAAATAAAATATCGACACAGCCTCTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgattacggatt < 2:315673/149‑1 (MQ=255)
ttAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 1:383332/1‑149 (MQ=255)
taTCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTATCGAAACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGAGTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTACCGAGTTTCACTTATTACGGATTACGTgcg > 1:77623/2‑149 (MQ=255)
aTCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTACCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcgc < 2:54140/149‑1 (MQ=255)
cTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGa < 1:704450/149‑1 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGAt < 2:242815/149‑1 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGAt > 2:1016708/1‑149 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGAt > 1:250813/1‑149 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGAt > 1:254671/1‑149 (MQ=255)
acGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCTACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCTATTTACCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTCATTACGAATTACGTGCCATGAt > 2:356370/2‑149 (MQ=255)
cGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATc < 2:800121/149‑1 (MQ=255)
gCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCAGCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCt > 1:269149/1‑149 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTa < 2:639890/149‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCAGATTTCCCTATTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTAATTACGGATTACGTGCGCTGATCTa > 2:504992/1‑149 (MQ=255)
ttttatCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTAGTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCTGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTAc > 2:614562/1‑149 (MQ=255)
ttttCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACAt > 1:866024/1‑149 (MQ=255)
tttCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATg < 2:471099/149‑1 (MQ=255)
tttCCTTCCACGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGTAATACGTGAGCTGATCTACATg > 2:570886/1‑149 (MQ=255)
tccttccCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCATTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGc > 2:767626/1‑149 (MQ=255)
tccttccCAGAACTGAATTAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCGTTTGAGGTTGATGTGCAGGTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGGGCGCTGATCTACATGGc < 1:583603/149‑1 (MQ=255)
ccccGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCAt > 1:150909/1‑149 (MQ=255)
cccGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATGATCAATATAATTGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCAtt < 1:104609/149‑1 (MQ=255)
cccGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAACTGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCAtt < 2:228621/149‑1 (MQ=255)
ccGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGAATGTGGCTGGTTTATCATAAATATAAATGTATTTTTTCCCGAGTTCCAGTTTGATGTTGATGTGCAGTTAACTAGTTTCACTGATTACTGCTTACGAGAGCTGATCTACATGGCTTCATTg > 2:67415/1‑149 (MQ=255)
cGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGc < 2:250813/149‑1 (MQ=255)
cGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGc < 2:254671/149‑1 (MQ=255)
cGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGc < 1:980337/149‑1 (MQ=255)
cGAACTGAAATAAAGTAGCGACACAGCCTGTCGCTGGTTTATCATCAATATAACTGTATTTTTTCCCGAATTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTAAACGAGTTGCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGc < 1:566414/149‑1 (MQ=255)
aaCTGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCa < 2:1005945/149‑1 (MQ=255)
tGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGaa < 1:317324/149‑1 (MQ=255)
tGAAATAAATTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGaa > 1:618931/1‑149 (MQ=255)
aaataaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATTAATGTATTTTTTCCCGATTTCCATTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGATGATATACATGTCGTCATTGCCAGaatg > 1:676956/1‑147 (MQ=255)
aaataaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAgg > 1:521066/1‑149 (MQ=255)
aataaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGAGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAggg > 1:625951/1‑149 (MQ=255)
ataaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGc < 1:1016708/149‑1 (MQ=255)
ataaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGc > 2:14798/1‑149 (MQ=255)
ataaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTATCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGTATTACTTGCCCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGc > 1:758529/1‑149 (MQ=255)
taaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTATGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCg < 1:239547/149‑1 (MQ=255)
taaatTAGCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGAATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCg > 2:501461/1‑149 (MQ=255)
gCGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAGTATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGAcc > 1:299271/1‑149 (MQ=255)
cGACACAGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCCCTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGACAGAAGGGCGGATGACCa > 1:770798/1‑149 (MQ=255)
cGACACAGACTGTGGCTTGTTTATCAACAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCa < 2:562835/149‑1 (MQ=255)
actcaGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCGCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGTTCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGt < 2:355724/146‑1 (MQ=255)
aataaGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGt < 2:668952/145‑1 (MQ=255)
cacaGCCTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTGGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGATGATCTACATTGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTa > 2:638149/1‑149 (MQ=255)
|
TAATTCTGGTACGCCTGGCAGATATTTTGCCTGCCGGGCGAACAGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTA > NC_000913/4405983‑4406271
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
