Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F1 I1 R1
|
83 |
73.5 |
3575638 |
92.3% |
3300313 |
107.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,490,935 |
A→G |
L69L (TTG→CTG) |
idnR ← |
transcriptional repressor, 5‑gluconate‑binding |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,490,935 | 0 | A | G | 100.0%
| 379.0
/ NA
| 99 | L69L (TTG→CTG) | idnR | transcriptional repressor, 5‑gluconate‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (44/55); total (44/55) |
ATCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAAGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCTTTTTCGGCGAG > NC_000913/4490802‑4491059
|
aTCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAc > 2:1435964/1‑139 (MQ=255)
tCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:872339/139‑1 (MQ=255)
aCCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa < 2:317771/139‑1 (MQ=255)
aCCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa < 2:1025214/139‑1 (MQ=255)
aCCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa < 2:321182/139‑1 (MQ=255)
aCTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGt > 1:891637/1‑139 (MQ=255)
ttcttcGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAGTTATGCCCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGACGAGTTGAGTTTGACATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATaa > 1:240337/1‑139 (MQ=255)
tcttcGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAAc > 2:1430626/1‑139 (MQ=255)
cttcGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACt < 2:891637/139‑1 (MQ=255)
ggAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgt < 2:1573248/139‑1 (MQ=255)
aTCGCGATCGTCATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCa < 2:1158893/139‑1 (MQ=255)
tCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGGATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCAt > 1:1707557/1‑139 (MQ=255)
tCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc > 2:414157/1‑119 (MQ=255)
tCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:414157/119‑1 (MQ=255)
cGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTcaacaa < 1:335890/139‑1 (MQ=255)
cGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTcaacaa < 1:1140101/139‑1 (MQ=255)
aattAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCggg > 2:195025/1‑139 (MQ=255)
ttAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCGGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg < 1:1540089/139‑1 (MQ=255)
aGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:11618/99‑1 (MQ=255)
aGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc > 2:11618/1‑99 (MQ=255)
aGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAgcg < 2:758957/139‑1 (MQ=255)
aGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAgcg > 1:115574/1‑139 (MQ=255)
tAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTcaacaa > 2:961272/1‑121 (MQ=255)
tAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTcaacaa < 1:961272/121‑1 (MQ=255)
tAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt < 2:1758902/139‑1 (MQ=255)
tAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt < 1:1430626/139‑1 (MQ=255)
tAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt < 1:100060/139‑1 (MQ=255)
gTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 2:232921/139‑1 (MQ=255)
gTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 2:143198/139‑1 (MQ=255)
gTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 2:1004854/139‑1 (MQ=255)
gTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 2:115574/139‑1 (MQ=255)
tCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa > 1:1078934/1‑138 (MQ=255)
tCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 2:1078934/138‑1 (MQ=255)
cTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgtg < 1:1302329/104‑1 (MQ=255)
cTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgtg > 2:1302329/1‑104 (MQ=255)
tGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt > 2:821008/1‑131 (MQ=255)
tGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt < 1:821008/131‑1 (MQ=255)
tGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGatat > 1:1069543/1‑139 (MQ=255)
tGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGatat > 1:460711/1‑139 (MQ=255)
aTAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:1645034/84‑1 (MQ=255)
aTAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc > 2:1645034/1‑84 (MQ=255)
aTAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt < 1:1067787/129‑1 (MQ=255)
aTAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt > 2:1067787/1‑129 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc > 1:1674617/1‑79 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 2:1674617/79‑1 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa < 1:1392859/81‑1 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa > 2:1392859/1‑81 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg < 1:71314/117‑1 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg > 2:71314/1‑117 (MQ=255)
tATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGAt < 1:943033/139‑1 (MQ=255)
aTGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 1:695366/128‑1 (MQ=255)
aTGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa > 2:695366/1‑128 (MQ=255)
cTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGta < 2:1447151/82‑1 (MQ=255)
cTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGta > 1:1447151/1‑82 (MQ=255)
tCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 1:1767192/124‑1 (MQ=255)
tCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa > 2:1767192/1‑124 (MQ=255)
agagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACttt < 1:660467/86‑1 (MQ=255)
agagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACttt > 2:660467/1‑86 (MQ=255)
agagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt < 1:306179/117‑1 (MQ=255)
agagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGAtt > 2:306179/1‑117 (MQ=255)
agagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTcc > 2:990761/1‑139 (MQ=255)
agagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTcc > 1:515135/1‑139 (MQ=255)
gagGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCa < 1:1496845/139‑1 (MQ=255)
agGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCAt > 2:1203425/1‑139 (MQ=255)
agGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCAt > 2:1362957/1‑139 (MQ=255)
tGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCAtt < 2:569485/88‑1 (MQ=255)
tGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCAtt > 1:569485/1‑88 (MQ=255)
tGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAAt > 1:1571410/1‑139 (MQ=255)
aCGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg < 2:989723/103‑1 (MQ=255)
aCGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg > 1:989723/1‑103 (MQ=255)
aCGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAAttt < 1:1736557/139‑1 (MQ=255)
ttCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg < 2:1328262/98‑1 (MQ=255)
ttCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAg > 1:1328262/1‑98 (MQ=255)
ttCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGAtct > 2:352979/1‑122 (MQ=255)
ttCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGAtct < 1:352979/122‑1 (MQ=255)
ttCTATTCCCACGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa > 2:817668/1‑62 (MQ=255)
ttCTATTCCCACGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa < 1:817668/62‑1 (MQ=255)
cTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGAt > 1:1776444/1‑139 (MQ=255)
ttCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTcaac > 1:1169868/1‑80 (MQ=255)
ttCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTcaac < 2:1169868/80‑1 (MQ=255)
ttCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTg > 1:511/1‑113 (MQ=255)
ttCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTg < 2:511/113‑1 (MQ=255)
ccGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa > 1:1019185/1‑54 (MQ=255)
ccGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGa < 2:1019185/54‑1 (MQ=255)
cgcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa > 2:1593089/1‑101 (MQ=255)
cgcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGa < 1:1593089/101‑1 (MQ=255)
gcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCg > 2:339088/1‑139 (MQ=255)
gcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgtg > 2:1195831/1‑67 (MQ=255)
gcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgtg < 1:1195831/67‑1 (MQ=255)
gcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGc < 2:460711/139‑1 (MQ=255)
gcgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGc < 2:1069543/139‑1 (MQ=255)
cgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCg > 1:910746/1‑128 (MQ=255)
cgAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCg < 2:910746/128‑1 (MQ=255)
gTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgtg < 2:1014973/59‑1 (MQ=255)
gTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTtgtg > 1:1014973/1‑59 (MQ=255)
ttGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCttt > 1:1256690/1‑139 (MQ=255)
tGAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGACTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTAGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGGCACCTTTTTCGGCg < 2:1086593/139‑1 (MQ=255)
gAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCTTTTTCGGCGa < 1:563144/139‑1 (MQ=255)
gAAATGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCTTTTTCGGCGa < 1:1203425/139‑1 (MQ=255)
aaaTGACGGAATCAGGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCTTTTTCGGCGAg < 2:1571410/139‑1 (MQ=255)
|
ATCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAAGATACCGA‑GGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCTTTTTCGGCGAG > NC_000913/4490802‑4491059
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
