Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F1 I1 R1
|
81 |
47.9 |
2225048 |
94.8% |
2109345 |
113.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,066,288 |
T→C |
T296A (ACG→GCG) |
ygfI ← |
putative DNA‑binding transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,066,288 | 0 | T | C | 97.9%
| 356.9
/ ‑0.4
| 96 | coding (886/897 nt) | ygfI | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (45/49); minor base . (1/1); total (46/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.41e-01 |
CCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCC > NC_000913/3066155‑3066412
|
ccTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGt > 1:388975/1‑139 (MQ=255)
aTGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCAc > 1:943544/1‑139 (MQ=255)
tGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg > 2:493790/1‑139 (MQ=255)
tCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCt > 1:591058/1‑139 (MQ=255)
gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 2:333012/1‑139 (MQ=255)
gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 1:53922/1‑139 (MQ=255)
gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 2:686667/1‑139 (MQ=255)
gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATATAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 1:1091111/1‑139 (MQ=255)
ggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCa > 2:825887/1‑139 (MQ=255)
ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg < 1:176858/129‑1 (MQ=255)
ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg > 2:176858/1‑129 (MQ=255)
ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCa < 2:713879/139‑1 (MQ=255)
tATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa < 2:628743/139‑1 (MQ=255)
aTCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa > 1:735668/1‑138 (MQ=255)
aTCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa < 2:735668/138‑1 (MQ=255)
cTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACTTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAg < 2:963310/138‑1 (MQ=255)
cTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAg > 1:963310/1‑138 (MQ=255)
gAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:37690/139‑1 (MQ=255)
gAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:256251/139‑1 (MQ=255)
gAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:333012/139‑1 (MQ=255)
aaaTGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGTTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCg > 2:995142/1‑139 (MQ=255)
aaTGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCgg < 2:1043205/139‑1 (MQ=255)
gcgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtat > 2:976809/1‑139 (MQ=255)
cgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 1:799480/1‑132 (MQ=255)
cgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:799480/132‑1 (MQ=255)
tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga < 2:1091111/139‑1 (MQ=255)
tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga < 1:825887/139‑1 (MQ=255)
tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga > 2:314405/1‑139 (MQ=255)
ggACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACgatgat < 1:893427/139‑1 (MQ=255)
atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGa < 1:157064/139‑1 (MQ=255)
atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGa < 1:686667/139‑1 (MQ=255)
tCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGAtt > 1:575285/1‑139 (MQ=255)
caccacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTg > 2:897285/1‑139 (MQ=255)
cacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 2:575285/139‑1 (MQ=255)
cacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 1:976809/139‑1 (MQ=255)
cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaa > 2:110210/1‑139 (MQ=255)
cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCG‑CCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaaa > 2:414408/1‑139 (MQ=255)
tCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa < 1:249123/139‑1 (MQ=255)
ttAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata < 1:314405/139‑1 (MQ=255)
ttAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCCTAGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata > 1:751069/1‑139 (MQ=255)
tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa < 2:547787/136‑1 (MQ=255)
tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa > 1:547787/1‑136 (MQ=255)
tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCG‑CCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt < 1:414408/139‑1 (MQ=255)
aGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt < 2:592906/139‑1 (MQ=255)
aGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt < 2:890801/139‑1 (MQ=255)
gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGTTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:591770/102‑1 (MQ=255)
gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGTTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:591770/1‑102 (MQ=255)
gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc < 2:388975/139‑1 (MQ=255)
gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc > 1:951671/1‑139 (MQ=255)
gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc < 1:493790/139‑1 (MQ=255)
ccACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTcc < 1:897285/139‑1 (MQ=255)
cGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTc < 2:633900/116‑1 (MQ=255)
cGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTc > 1:633900/1‑116 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGTAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:428337/1‑97 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGTAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:428337/97‑1 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata > 2:638517/1‑104 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata < 1:638517/104‑1 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGATTAAAGATATTCCTGCa > 2:753264/1‑139 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTcc > 2:771853/1‑135 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTcc < 1:771853/135‑1 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa > 2:100035/1‑139 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa > 1:166933/1‑139 (MQ=255)
gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa > 1:221385/1‑139 (MQ=255)
tCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCat < 2:221385/139‑1 (MQ=255)
tCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCat < 1:753264/139‑1 (MQ=255)
cTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGt > 1:597652/1‑93 (MQ=255)
cTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGt < 2:597652/93‑1 (MQ=255)
gACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACa < 2:380736/139‑1 (MQ=255)
cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:131220/85‑1 (MQ=255)
cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:131220/1‑85 (MQ=255)
gTAATTTAATTGCAACCGGTTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCtgtg < 1:995142/139‑1 (MQ=255)
taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa < 2:264088/62‑1 (MQ=255)
taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa > 1:264088/1‑62 (MQ=255)
taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:747124/80‑1 (MQ=255)
taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 1:747124/1‑80 (MQ=255)
taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTg > 1:924202/1‑79 (MQ=255)
taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTg < 2:924202/79‑1 (MQ=255)
aatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:945591/79‑1 (MQ=255)
aatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:945591/1‑79 (MQ=255)
atttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCgg < 1:110210/139‑1 (MQ=255)
aattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata > 2:828817/1‑81 (MQ=255)
aattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata < 1:828817/81‑1 (MQ=255)
attGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCAt < 2:951671/139‑1 (MQ=255)
ttGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATc > 2:355818/1‑139 (MQ=255)
aCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg < 2:142936/38‑1 (MQ=255)
aCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg > 1:142936/1‑38 (MQ=255)
ggCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata < 1:937906/98‑1 (MQ=255)
ggCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata > 2:937906/1‑98 (MQ=255)
cGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAg < 2:751069/139‑1 (MQ=255)
gggTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGcc > 1:630735/1‑139 (MQ=255)
ggTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt < 2:715481/91‑1 (MQ=255)
ggTAAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt > 1:715481/1‑91 (MQ=255)
aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 1:38026/1‑47 (MQ=255)
aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:38026/47‑1 (MQ=255)
aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 1:514355/74‑1 (MQ=255)
aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt > 2:514355/1‑74 (MQ=255)
|
CCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCC > NC_000913/3066155‑3066412
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
