Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
921,236 |
A→C |
K297T (AAA→ACA) |
macB → |
macrolide ABC transporter peremase/ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 921,236 | 0 | A | C | 99.5%
| 710.8
/ NA
| 198 | K297T (AAA→ACA) | macB | macrolide ABC transporter peremase/ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base C (98/98); minor base T (0/1); total (98/100) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CTGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCAAACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATCAGC > NC_000913/921139‑921331
|
cgggCCGCGAATAGAATGCGGACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGGATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCcacac < 2:2161123/98‑1 (MQ=255)
tGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCcacaca > 1:1279515/1‑100 (MQ=255)
tGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCcacaca < 1:2129496/100‑1 (MQ=255)
cAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAAt > 1:4408921/1‑100 (MQ=255)
gCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATgg > 1:3240615/1‑100 (MQ=255)
gCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATgg < 2:1151435/100‑1 (MQ=255)
cGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGt > 2:543451/1‑100 (MQ=255)
aaTAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGc < 1:4071309/100‑1 (MQ=255)
aaaaTGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGCGACGCCGCCACACAAATGGTGCTgg > 2:3007288/1‑100 (MQ=255)
aaTGAGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCg > 2:4679222/1‑100 (MQ=255)
aTGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCgg > 1:796516/1‑100 (MQ=255)
tGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGa < 1:3746089/100‑1 (MQ=255)
gTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGatat > 2:1158362/1‑100 (MQ=255)
aCTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTc > 1:3430069/1‑100 (MQ=255)
cTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCg > 1:338917/1‑100 (MQ=255)
ttACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGtt > 2:3052739/1‑100 (MQ=255)
ttACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGtt > 1:1166352/1‑100 (MQ=255)
tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc > 2:877947/1‑100 (MQ=255)
tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc < 1:4887692/100‑1 (MQ=255)
tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc < 2:4027585/100‑1 (MQ=255)
tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc < 2:4643214/100‑1 (MQ=255)
aCTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCt > 2:3565694/1‑100 (MQ=255)
aCTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCt < 1:1522802/100‑1 (MQ=255)
cTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTa < 1:4926638/100‑1 (MQ=255)
gACCATTCTGGCGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAAGGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTAtt < 2:4381375/100‑1 (MQ=255)
gACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTAtt > 2:2675644/1‑100 (MQ=255)
gACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTAtt < 1:157848/100‑1 (MQ=255)
aCCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTg < 2:2187739/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa > 1:2017789/1‑100 (MQ=255)
aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa < 2:5218498/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa < 1:1677166/100‑1 (MQ=255)
aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa < 2:3907854/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTAc < 1:3176712/100‑1 (MQ=255)
gCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACg > 1:865906/1‑100 (MQ=255)
gCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACg > 1:3530046/1‑100 (MQ=255)
cTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGa > 2:2547663/1‑100 (MQ=255)
tGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGaa > 2:1943154/1‑100 (MQ=255)
gggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATa > 2:4772063/1‑100 (MQ=255)
gggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATa < 2:3091571/100‑1 (MQ=255)
ggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATAc < 1:5251989/100‑1 (MQ=255)
ggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATAc > 2:2088715/1‑100 (MQ=255)
gATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACt < 2:2765015/100‑1 (MQ=255)
gATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAAGACt > 1:4727511/1‑100 (MQ=255)
attattATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTa > 2:4824934/1‑100 (MQ=255)
ttattaTCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTAt > 2:759966/1‑100 (MQ=255)
attatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg > 1:5096669/1‑100 (MQ=255)
attatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg > 2:3162803/1‑100 (MQ=255)
attatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGGGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg < 2:1687316/100‑1 (MQ=255)
attatCGGTATTGCGTAAGTGGATTACAATGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg < 2:2712619/100‑1 (MQ=255)
ttatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTCACGCCGCCATACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGa < 2:5377485/100‑1 (MQ=255)
tatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGAt > 1:1169950/1‑100 (MQ=255)
atCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATg > 2:1795927/1‑100 (MQ=255)
atCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATg > 1:3160840/1‑100 (MQ=255)
tCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGt > 1:1071539/1‑100 (MQ=255)
tCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGt > 2:3230132/1‑100 (MQ=255)
cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:685114/100‑1 (MQ=255)
cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:2969531/100‑1 (MQ=255)
cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:397284/100‑1 (MQ=255)
cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:4243056/100‑1 (MQ=255)
ggTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCt > 1:758131/1‑100 (MQ=255)
ggTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCt > 2:4602580/1‑100 (MQ=255)
gTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTa < 2:243481/100‑1 (MQ=255)
aTTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATc > 1:5124681/1‑100 (MQ=255)
tGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATccc > 2:3652016/1‑100 (MQ=255)
gTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCggg < 1:4713440/100‑1 (MQ=255)
cGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGan < 1:2701700/100‑2 (MQ=255)
cGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaa < 1:3199603/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGTGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaaa > 2:63719/1‑100 (MQ=255)
ggtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaan < 1:4604130/100‑2 (MQ=255)
ggtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGCACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaaa < 1:242669/100‑1 (MQ=255)
gtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAg < 2:3210433/100‑1 (MQ=255)
gtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAtt > 1:4317614/1‑100 (MQ=255)
tttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAttt < 1:1707948/100‑1 (MQ=255)
tttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAttt > 2:1385707/1‑100 (MQ=255)
tttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAttt < 2:3398184/100‑1 (MQ=255)
ttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGCTGTCTATCCCGGGAAAGAtttt < 1:3342147/100‑1 (MQ=255)
ttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAtttt > 2:324173/1‑100 (MQ=255)
tCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTg < 1:1867547/100‑1 (MQ=255)
ccATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTgg < 1:2862498/100‑1 (MQ=255)
ccATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTgg > 1:3073742/1‑100 (MQ=255)
ccATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTgg < 1:4569689/100‑1 (MQ=255)
cATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGc < 1:3276896/100‑1 (MQ=255)
cATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGc > 1:4024307/1‑100 (MQ=255)
aTTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCg < 2:3679666/100‑1 (MQ=255)
aTTGTAGGGGTGGGGGTGGCGGCGACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTTTATTGGTACGAATACTATTGATGTATATCCCGGGAAAGATTTTgggg < 2:599459/100‑3 (MQ=255)
tGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGAt > 1:4776094/1‑100 (MQ=255)
gTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATg > 1:555304/1‑100 (MQ=255)
gTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATg > 1:3683802/1‑100 (MQ=255)
gTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATg < 1:1926538/100‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGAc < 1:614116/100‑1 (MQ=255)
cGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGAc < 2:712377/100‑1 (MQ=255)
tggtggGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGa > 1:1309540/1‑100 (MQ=255)
gtgggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATc > 2:4873519/1‑100 (MQ=255)
gtgggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATc > 1:4195661/1‑100 (MQ=255)
gggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCg > 1:5383674/1‑100 (MQ=255)
gggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCg > 1:1780825/1‑100 (MQ=255)
gtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCa > 2:1061804/1‑100 (MQ=255)
acaccgccACACAAATGGTGATGGCGGATATTCGTTCTATTGGGACGAATACTATTGATGACTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCTGCAata < 2:3357596/97‑1 (MQ=255)
gccgccACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATc < 1:4173211/100‑1 (MQ=255)
ccgccACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATca < 2:4475613/100‑1 (MQ=255)
|
CTGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCAAACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATCAGC > NC_000913/921139‑921331
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
