Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,078,882 |
T→G |
M1M (ATG→CTG) † |
putA ← |
fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,078,882 | 0 | T | G | 98.7%
| 806.8
/ ‑4.0
| 226 | M1M (ATG→CTG) † | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (113/110); total (115/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
ATTAACCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCATGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATGC > NC_000913/1078785‑1078978
|
attaaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGc < 1:3391763/100‑1 (MQ=255)
attaaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGc < 2:4158074/100‑1 (MQ=255)
attaaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGc > 2:1506182/1‑100 (MQ=255)
ttaaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGcc < 2:227797/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCAt > 1:1162298/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCAt < 2:1805757/100‑1 (MQ=255)
ccAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTa > 1:1429007/1‑100 (MQ=255)
cAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAc < 1:3360559/100‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAc < 2:362187/100‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAc < 2:2189996/100‑1 (MQ=255)
atctgtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAc < 2:2581500/97‑1 (MQ=255)
gtgtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTc > 1:745542/1‑100 (MQ=255)
tgtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTcc < 2:4954280/100‑1 (MQ=255)
tgtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTcc < 1:2788156/100‑1 (MQ=255)
tgtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTcc < 1:783606/100‑1 (MQ=255)
tgtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTcc < 2:2931619/100‑1 (MQ=255)
gtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAcagat > 1:2606989/1‑96 (MQ=255)
gtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCt > 1:1478474/1‑100 (MQ=255)
tggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtg < 2:4795943/100‑1 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCATGCCATTACTCCttt > 2:4107356/1‑98 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt > 2:4339445/1‑100 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 1:113866/100‑1 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 1:1461939/100‑1 (MQ=255)
tgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgttg < 1:1525377/100‑1 (MQ=255)
gtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgttgt > 1:812333/1‑100 (MQ=255)
tgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTgttgtt > 1:1853550/1‑100 (MQ=255)
gCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTc < 1:1392540/100‑1 (MQ=255)
gCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTAGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTc > 1:4827373/1‑100 (MQ=255)
cgatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCa < 1:5473361/100‑1 (MQ=255)
cgatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCa < 2:3799241/100‑1 (MQ=255)
cgatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCa > 1:2556849/1‑100 (MQ=255)
gatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTccg > 1:1622715/1‑98 (MQ=255)
gatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAg > 1:4324634/1‑100 (MQ=255)
gatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAg < 2:4442032/100‑1 (MQ=255)
gatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAg > 1:3881449/1‑100 (MQ=255)
gatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAg < 2:878049/100‑1 (MQ=255)
atACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAgg < 1:1585736/100‑1 (MQ=255)
atACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAgg < 1:3476879/100‑1 (MQ=255)
cGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGc > 1:3724896/1‑100 (MQ=255)
cGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGc < 2:736068/100‑1 (MQ=255)
gtgtCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCa < 2:1663109/100‑1 (MQ=255)
gtCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAAc < 1:1741053/100‑1 (MQ=255)
cgcgGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACtt < 2:1954043/100‑1 (MQ=255)
cgcgGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACtt > 2:1678244/1‑100 (MQ=255)
gcgGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTa > 1:5428341/1‑100 (MQ=255)
gCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCTTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACg < 1:5084137/100‑1 (MQ=255)
cAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGt > 2:2371467/1‑100 (MQ=255)
cTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTTTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATc > 2:1538944/1‑100 (MQ=255)
cTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATc > 2:5316855/1‑100 (MQ=255)
ttAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGCAAGGTGCAACTTAACGTTATCg > 2:2377994/1‑100 (MQ=255)
tAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGt > 1:2906427/1‑100 (MQ=255)
tACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGaa < 2:323239/100‑1 (MQ=255)
cTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCCGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAatat > 2:5026922/1‑100 (MQ=255)
cACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATcc > 1:1690421/1‑100 (MQ=255)
gcgtcgcgtcGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCatg < 2:1310215/100‑1 (MQ=255)
gcgtcgcgtcGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCatg < 1:2202566/100‑1 (MQ=255)
gtcgcgtcgTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCatgat > 1:1539190/1‑100 (MQ=255)
cgtcgtCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTg > 2:2724581/1‑100 (MQ=255)
gtcgtgCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTCGTTCAGACAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGc < 1:5282552/100‑1 (MQ=255)
tcgtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCa < 1:3789937/100‑1 (MQ=255)
cgtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCaa < 2:4498211/100‑1 (MQ=255)
cgtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCaa > 2:2430801/1‑100 (MQ=255)
gtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAAc > 2:4715224/1‑100 (MQ=255)
gtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAAc > 1:2955892/1‑100 (MQ=255)
tcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACt > 2:2089592/1‑100 (MQ=255)
tcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACt > 1:4127891/1‑100 (MQ=255)
aGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtg < 1:866942/100‑1 (MQ=255)
aGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtg > 2:164714/1‑100 (MQ=255)
aGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtg < 2:4059931/100‑1 (MQ=255)
cTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtgtg < 2:4432024/100‑1 (MQ=255)
ttAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGc > 1:4564068/1‑100 (MQ=255)
tAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAACGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATCTCCCTGATGTTGCAACTTTGTGCa < 2:5237019/100‑1 (MQ=255)
tAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCa > 1:245010/1‑100 (MQ=255)
taaccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCaa > 2:3717079/4‑100 (MQ=255)
aCCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAc < 2:3433337/100‑1 (MQ=255)
cccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAcc > 1:5113107/1‑100 (MQ=255)
cccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAcc > 1:3748839/1‑100 (MQ=255)
ccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCa > 2:4325251/1‑100 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCAt < 1:2111851/100‑1 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCAt < 2:4179731/100‑1 (MQ=255)
tggtggtggTTCCCATGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTa < 2:3918158/100‑1 (MQ=255)
gtggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTaaa < 1:1533209/100‑1 (MQ=255)
tggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAt < 2:2878977/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtg > 1:3139038/1‑100 (MQ=255)
ggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtg > 1:4407026/1‑100 (MQ=255)
gtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtgt < 1:2159742/100‑1 (MQ=255)
tggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtgtg < 1:3654231/100‑1 (MQ=255)
tggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtgtg < 1:5567640/100‑1 (MQ=255)
ggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGa < 2:2795792/100‑1 (MQ=255)
ggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGa > 1:2155106/1‑100 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 1:2395484/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc > 1:395880/1‑100 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 1:1001254/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 2:4633941/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTACAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 1:4072009/100‑1 (MQ=255)
ttCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACa > 2:3163672/1‑100 (MQ=255)
ttCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGAAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACa < 2:2253065/100‑1 (MQ=255)
cccAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATg > 2:4990941/1‑100 (MQ=255)
cccAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATg < 1:4594794/100‑1 (MQ=255)
ccAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATGc > 1:1240973/1‑100 (MQ=255)
|
ATTAACCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCATGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATGC > NC_000913/1078785‑1078978
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
