Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,078,882 |
T→G |
M1M (ATG→CTG) † |
putA ← |
fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,078,882 | 0 | T | G | 99.3%
| 479.2
/ ‑4.2
| 140 | M1M (ATG→CTG) † | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (69/70); total (69/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TTAACCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCATGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATGC > NC_000913/1078786‑1078978
|
ttaaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGcc < 1:683088/100‑1 (MQ=255)
ttaaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGcc < 1:1186859/100‑1 (MQ=255)
taaCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCa < 2:677015/100‑1 (MQ=255)
aCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCAtt > 2:1499231/1‑100 (MQ=255)
aCCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCAtt < 2:760943/100‑1 (MQ=255)
ccAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTa > 1:603719/1‑100 (MQ=255)
ccAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTa > 1:2852187/1‑100 (MQ=255)
ccAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTa > 1:2008316/1‑100 (MQ=255)
taGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAc < 1:1974319/99‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTAc < 1:2117779/100‑1 (MQ=255)
tgtggtgtgCGATCGATACTTTTCGCTGGAGACTTAATACGCTGACGCATCTCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATTGTGGTGGCTCCCAGGCCAGTACTcg < 2:385938/100‑2 (MQ=255)
gtggtgtgCGATCGATACGTGTCGCCGCCGACTTAATACGATCCCGCGTCGGCTCGTCAAGCTTAACCACCTTTGTAATGGTACCCAGTCCTTTACTCCt < 2:1621858/100‑1 (MQ=255)
ctggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCt > 2:2629459/2‑100 (MQ=255)
tggtgtgCGATCGATACGCGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtg < 2:490481/100‑1 (MQ=255)
tggtctgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtg > 2:3404286/1‑100 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 2:37111/100‑1 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 2:37092/100‑1 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 1:1496701/100‑1 (MQ=255)
ggtgtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTAACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGGGGTTCCCAGGCCATTACTTCtgt > 2:3207786/1‑100 (MQ=255)
ggtgggCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 1:1007892/100‑1 (MQ=255)
ggtgggCGACCGATACGTGCCGCGGCGGACTTAATACGCTCACGCGGCGCGGCGTCCAGCGTACCCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgt < 2:206543/100‑1 (MQ=255)
gtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgttgt > 1:449240/1‑100 (MQ=255)
gtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgttgt > 1:2662411/1‑100 (MQ=255)
gtgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCtgttgt > 2:2040687/1‑100 (MQ=255)
tgCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTgttgtt > 1:1003230/1‑100 (MQ=255)
gCGATCGATCCGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTGCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTc < 2:104893/100‑1 (MQ=255)
gCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTc > 2:1904525/1‑100 (MQ=255)
cgatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCa < 1:2332696/100‑1 (MQ=255)
gttcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGGTCACGCGTCGCGTCGTCCGGCTTAACCCACATGGTTGTGGGTCCTAGGCCCTTCCTCCTGTTGTTCAg > 2:1414195/3‑100 (MQ=255)
gatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAg < 2:2104279/100‑1 (MQ=255)
gatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAg > 2:3005951/1‑100 (MQ=255)
gatcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAg > 1:1010948/1‑100 (MQ=255)
atcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGa > 1:3116711/1‑100 (MQ=255)
tcgatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCATGCCATTACTCCTGTTGTTCAGaa < 1:982696/100‑1 (MQ=255)
gatACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAg < 1:3487137/100‑1 (MQ=255)
atACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAgg > 2:1800625/1‑100 (MQ=255)
tACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGt < 2:2747710/100‑1 (MQ=255)
aCGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTg < 2:3477638/100‑1 (MQ=255)
cGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGc > 1:2104085/1‑100 (MQ=255)
gtCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAAc > 1:2235396/1‑100 (MQ=255)
gtCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAAc < 2:332468/100‑1 (MQ=255)
cgcgGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACtt < 1:3687116/100‑1 (MQ=255)
cgGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTaa < 2:788447/100‑1 (MQ=255)
gtcAGACTTCATACGCTCACGCGTCGCGTCTTCCTGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAAc < 2:1812394/98‑1 (MQ=255)
aGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGtt > 1:767209/1‑100 (MQ=255)
gACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTa > 1:761220/1‑100 (MQ=255)
gACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTa > 1:289947/1‑100 (MQ=255)
aCTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTAt < 1:637637/100‑1 (MQ=255)
cTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCAAGGCCATTAATCCTGTTGTTCAGAACGGTGCAACTTAACGtcctc > 1:2032970/1‑96 (MQ=255)
ttAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGGCATTACTCCTGTTGTTCAGACATGTGCAACTTAACGTTATCg < 1:3476408/100‑1 (MQ=255)
aaTACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTg < 2:1198583/100‑1 (MQ=255)
aTACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGa < 2:2233323/100‑1 (MQ=255)
aTACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGa > 2:1071561/1‑100 (MQ=255)
tACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGaa < 1:3934827/100‑1 (MQ=255)
tACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGaa < 2:3626372/100‑1 (MQ=255)
cTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAatat > 1:4013849/1‑100 (MQ=255)
cACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATcc > 2:3545787/1‑100 (MQ=255)
cACGCGTCGCGTCGTCCAGCTAAACTCCCATGGTGGCGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATcc < 2:3785530/100‑1 (MQ=255)
cgcgtcgcgtCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCat > 2:1275032/1‑100 (MQ=255)
cgcgtcgcgtCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCat > 2:706161/1‑100 (MQ=255)
cgcgtcgcgtCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACATTATCGTGAAATATCCat > 1:3825561/1‑100 (MQ=255)
gcgtcgcgtcGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCatg < 1:2501258/100‑1 (MQ=255)
cgtcgcgtcgTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCatga > 1:1180608/1‑100 (MQ=255)
gcgtcgTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGtt < 2:670853/100‑1 (MQ=255)
gcgtcgTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGtt > 2:2943807/1‑100 (MQ=255)
cgtcgtCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTg < 1:1527774/100‑1 (MQ=255)
tcgtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCa < 1:255563/100‑1 (MQ=255)
gtcCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAAc > 1:462087/1‑100 (MQ=255)
ccAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACtt > 2:2326981/1‑100 (MQ=255)
cAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACttt > 2:2655251/1‑100 (MQ=255)
gCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtgt > 2:2215584/1‑100 (MQ=255)
cTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtgtg > 2:2121285/1‑100 (MQ=255)
cTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTtgtg < 2:483051/100‑1 (MQ=255)
ttAAGCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGc > 2:3403549/1‑100 (MQ=255)
ttAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGc < 2:3512883/100‑1 (MQ=255)
aCCCCCATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAc < 1:2978655/100‑1 (MQ=255)
cccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAcc > 2:1164869/1‑100 (MQ=255)
cccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAcc > 2:2170857/1‑100 (MQ=255)
cccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAcc > 1:2431811/1‑100 (MQ=255)
cccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAAcc > 1:2264763/1‑100 (MQ=255)
ccccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCa < 1:256432/100‑1 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAACTATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCAt < 1:3272775/100‑1 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCAt < 2:3225810/100‑1 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCAt > 1:1773983/1‑100 (MQ=255)
cccATGGTGGTGGGTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTAATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCAt > 2:1342508/1‑100 (MQ=255)
ccATGGTGGCGGTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATg < 2:3456656/100‑1 (MQ=255)
tggtggtggTTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTa < 1:1669133/100‑1 (MQ=255)
gtggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTaaa > 2:1903782/1‑100 (MQ=255)
gtggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTaaa < 1:961247/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtg < 2:1992830/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtg > 1:3043644/1‑100 (MQ=255)
gtggtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAAtgt > 1:3707613/1‑100 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 2:3904780/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 1:2043191/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 2:2764972/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 2:2273023/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 1:2288990/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 2:2642653/100‑1 (MQ=255)
gtTCCCAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGAc < 1:2756639/100‑1 (MQ=255)
cccAGGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATg < 2:2955303/100‑1 (MQ=255)
|
TTAACCAGTGTGGTGTGCGATCGATACGTGTCGCGGCAGACTTAATACGCTCACGCGTCGCGTCGTCCAGCTTAACCCCCATGGTGGTGGTTCCCATGCCATTACTCCTGTTGTTCAGAAAGGTGCAACTTAACGTTATCGTGAAATATCCATGATGTTGCAACTTTGTGCAACCATGTTAAATGTGACATGC > NC_000913/1078786‑1078978
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
