Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,915,434 |
G→A |
A385T (GCT→ACT) |
b1833 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,915,434 | 0 | G | A | 99.6%
| 844.0
/ ‑6.0
| 244 | A385T (GCT→ACT) | b1833 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (124/119); total (124/120) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
CGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTT > NC_000913/1915344‑1915523
|
cGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACt < 2:7244454/93‑1 (MQ=255)
gATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACttt > 1:2182692/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTa > 2:2191302/1‑93 (MQ=255)
tGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTa < 2:3537592/93‑1 (MQ=255)
aCCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATg < 2:4658142/93‑1 (MQ=255)
ccTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATgg < 2:3243971/93‑1 (MQ=255)
ccTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATgg > 1:1815924/1‑93 (MQ=255)
cTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATggg > 1:343481/1‑93 (MQ=255)
cTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATggg > 2:4901022/1‑93 (MQ=255)
cTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATggg > 2:6098290/1‑93 (MQ=255)
ggATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGAc < 1:1041590/93‑1 (MQ=255)
ggATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGAc < 1:6142051/93‑1 (MQ=255)
ggATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGAc > 2:2965924/1‑93 (MQ=255)
gATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGAcc < 1:5914107/93‑1 (MQ=255)
gATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGAcc > 2:4374198/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCg > 2:5853111/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCg > 2:6892025/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCg > 1:3544558/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATACTCACTTTTACTATGGGACCGGCTg > 1:6389971/1‑93 (MQ=255)
tCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGc < 1:697603/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGtt < 1:7520724/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGtt > 2:7135801/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGttt > 2:458654/1‑93 (MQ=255)
gTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTa < 1:2678836/93‑1 (MQ=255)
gTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTa < 1:1487422/93‑1 (MQ=255)
cGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTAtt < 1:4551308/93‑1 (MQ=255)
gATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGatttattt > 1:2617893/1‑93 (MQ=255)
gATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTAttt < 2:5819815/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTc < 1:1977608/93‑1 (MQ=255)
tGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCg < 1:5668820/93‑1 (MQ=255)
gCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCgg > 2:6011357/1‑93 (MQ=255)
gCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCgg < 1:1339215/93‑1 (MQ=255)
cTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGgc < 2:6372283/93‑1 (MQ=255)
ggccTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCa < 2:7575932/91‑1 (MQ=255)
gACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCa < 2:5021738/93‑1 (MQ=255)
gACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCa < 1:5511470/93‑1 (MQ=255)
gACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCa < 1:3993828/93‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGc < 1:4336542/93‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATGAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGc < 1:7639401/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCg > 1:3337833/1‑93 (MQ=255)
cTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCg > 2:1543516/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGt > 2:4104076/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGt > 2:3636692/1‑93 (MQ=255)
gTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGt < 2:3165308/93‑1 (MQ=255)
gTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGt < 1:1932376/93‑1 (MQ=255)
ttGTCATATCTTTAACTATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTGTATGTCTGCGCATCGGTaa > 2:7033052/1‑93 (MQ=255)
ttGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTaa > 1:5232958/1‑93 (MQ=255)
ttGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTaa < 2:891073/93‑1 (MQ=255)
tGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAAt > 2:7898362/1‑93 (MQ=255)
tCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAAttt < 1:3939080/93‑1 (MQ=255)
tCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAAttt < 1:4823332/93‑1 (MQ=255)
cATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAAtttt > 1:1544431/1‑93 (MQ=255)
cATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAAtttt > 2:4806919/1‑93 (MQ=255)
atatCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGAGCAGCGGTAATTTTg > 2:6816022/1‑93 (MQ=255)
tatCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGa < 2:4439190/93‑1 (MQ=255)
tatCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGa < 1:7174797/93‑1 (MQ=255)
atCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGAc > 1:5757835/1‑93 (MQ=255)
tttAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAt > 1:2452021/1‑93 (MQ=255)
tttAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAt > 2:1623683/1‑93 (MQ=255)
tttAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAt < 1:7742448/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAtt > 2:7715920/1‑93 (MQ=255)
tAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTc < 2:1204708/93‑1 (MQ=255)
tAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTc < 1:6961627/93‑1 (MQ=255)
aaCCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCt < 1:6502858/93‑1 (MQ=255)
aCCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCtt < 2:5674723/93‑1 (MQ=255)
aCCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCtt > 2:1171216/1‑93 (MQ=255)
aCCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCtt > 2:3921510/1‑93 (MQ=255)
cATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGc > 1:5984474/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCt > 1:1203946/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCt > 2:1443775/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCt > 2:2564062/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGGAGTTGTGACTTTTCCTGCt > 2:5062957/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTCTGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCtg > 1:5034968/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCtg > 2:6274417/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCtg > 1:5088137/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCtg > 1:6856707/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCtgt < 2:149847/93‑1 (MQ=255)
cTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGaa < 1:7608379/93‑1 (MQ=255)
tGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAAt < 2:7304461/93‑1 (MQ=255)
tGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAAt > 1:2896871/1‑93 (MQ=255)
gATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATg > 2:7196769/1‑93 (MQ=255)
gATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATg < 2:5367846/93‑1 (MQ=255)
gATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATg > 2:3113559/1‑93 (MQ=255)
gATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATg < 1:2962093/93‑1 (MQ=255)
aTTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATgg < 2:4084900/93‑1 (MQ=255)
aaTCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTg < 2:551852/93‑1 (MQ=255)
tCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGa < 2:1815924/93‑1 (MQ=255)
cgcgATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGAc < 2:2122516/93‑1 (MQ=255)
cgcgATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGAc < 2:3848463/93‑1 (MQ=255)
gATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCCGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTAGACAga > 2:4842922/1‑92 (MQ=255)
gATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGc > 1:874675/1‑93 (MQ=255)
gATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGc > 1:3246416/1‑93 (MQ=255)
gATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGc < 1:7246816/93‑1 (MQ=255)
aTCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGcc < 2:34782/93‑1 (MQ=255)
tCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCg > 2:2659969/1‑93 (MQ=255)
gATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCtt > 1:4679724/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTa < 1:7429646/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTa < 2:874288/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGGTTTATTTTGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTa > 2:3580715/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTAc > 1:2083954/1‑93 (MQ=255)
|
CGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTT > NC_000913/1915344‑1915523
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTG > NC_000913/1915341‑1915525
|
CTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCA > SRR4302543.7206085/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCAATCAGATCCTCC > SRR4302543.926816/1‑94 (MQ=60)
TGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCAC > SRR4302543.4430516/1‑94 (MQ=60)
CGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTT > SRR4302543.1783066/1‑94 (MQ=60)
GGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTT > SRR4302543.2202258/1‑94 (MQ=60)
GGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTT < SRR4302543.3570170/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTT > SRR4302543.1729355/1‑94 (MQ=60)
TGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGCTCCTCACTTTTAT > SRR4302543.4623140/1‑94 (MQ=60)
TGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTAC > SRR4302543.4623137/1‑94 (MQ=60)
AGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATTCTCTACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACT < SRR4302543.7875851/94‑1 (MQ=60)
TGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTAT < SRR4302543.2183866/94‑1 (MQ=60)
TGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTAT > SRR4302543.7755537/1‑94 (MQ=60)
TGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTAT < SRR4302543.7164073/94‑1 (MQ=60)
GACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATG > SRR4302543.2752578/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATG < SRR4302543.2580906/94‑1 (MQ=60)
ACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGG > SRR4302543.1832215/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGG < SRR4302543.7460934/94‑1 (MQ=60)
CCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGG < SRR4302543.7533196/94‑1 (MQ=60)
CCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGG > SRR4302543.346652/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGA > SRR4302543.567690/1‑94 (MQ=60)
GGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACC > SRR4302543.2948204/1‑94 (MQ=60)
GGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACC < SRR4302543.6200226/94‑1 (MQ=60)
GGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACC < SRR4302543.1050872/94‑1 (MQ=60)
GATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCG < SRR4302543.5968113/94‑1 (MQ=60)
GATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCG > SRR4302543.3576040/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTG > SRR4302543.6450121/1‑94 (MQ=60)
GGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTG < SRR4302543.4258299/94‑1 (MQ=60)
GGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATACTCACTTTTACTATGGGACCGGCTG > SRR4302543.6450120/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGC < SRR4302543.2536765/94‑1 (MQ=60)
TCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCG < SRR4302543.703987/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGT < SRR4302543.1260709/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTT < SRR4302543.7592505/94‑1 (MQ=60)
GTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTAT < SRR4302543.1500804/94‑1 (MQ=60)
GTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTAT < SRR4302543.2703119/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTT > SRR4302543.2641629/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTT < SRR4302543.4592757/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGATTTATTT > SRR4302543.2641627/1‑94 (MQ=60)
GATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTC < SRR4302543.2169208/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCG < SRR4302543.1995339/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGG < SRR4302543.5720552/94‑1 (MQ=60)
TGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGG < SRR4302543.5720553/94‑1 (MQ=60)
GCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGC < SRR4302543.5283858/94‑1 (MQ=60)
GCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGC < SRR4302543.1351170/94‑1 (MQ=60)
GACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAG > SRR4302543.3425631/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAG < SRR4302543.4855521/94‑1 (MQ=60)
GACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAG > SRR4302543.771497/1‑94 (MQ=60)
GACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAG < SRR4302543.5561514/94‑1 (MQ=60)
GACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAG < SRR4302543.4029385/94‑1 (MQ=60)
ACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGC < SRR4302543.3305245/94‑1 (MQ=60)
CCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCG < SRR4302543.4375872/94‑1 (MQ=60)
CCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCG > SRR4302543.10787/1‑94 (MQ=60)
CCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCG > SRR4302543.3367904/1‑94 (MQ=60)
CCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCG < SRR4302543.7711870/94‑1 (MQ=60)
CCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATGAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCG < SRR4302543.7711871/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGG > SRR4302543.395368/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGG > SRR4302543.4468173/1‑94 (MQ=60)
GTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTA < SRR4302543.1949758/94‑1 (MQ=60)
GTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGATTTATTTCGGCGCAGCGGTA > SRR4302543.2395790/1‑94 (MQ=60)
TTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAA > SRR4302543.5280105/1‑94 (MQ=60)
TTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAAT < SRR4302543.513530/94‑1 (MQ=60)
GTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTT > SRR4302543.1976400/1‑94 (MQ=60)
GTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTT < SRR4302543.2777783/94‑1 (MQ=60)
GTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTT > SRR4302543.5968591/1‑94 (MQ=60)
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TCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTT < SRR4302543.4867353/94‑1 (MQ=60)
TCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTT < SRR4302543.4867354/94‑1 (MQ=60)
TCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTT > SRR4302543.1558260/1‑94 (MQ=60)
TCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTT < SRR4302543.3973901/94‑1 (MQ=60)
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CATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTG > SRR4302543.5156004/1‑94 (MQ=60)
ATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGA > SRR4302543.3376638/1‑94 (MQ=60)
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CTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAT > SRR4302543.2474145/1‑94 (MQ=60)
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CTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTAT < SRR4302543.3040722/94‑1 (MQ=60)
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TTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTC > SRR4302543.4029245/1‑94 (MQ=60)
TAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCT < SRR4302543.7027131/94‑1 (MQ=60)
AACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTT > SRR4302543.5214052/1‑94 (MQ=60)
AACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTT < SRR4302543.6564115/94‑1 (MQ=60)
ACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTG > SRR4302543.5863221/1‑94 (MQ=60)
ACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTG > SRR4302543.5768190/1‑94 (MQ=60)
ACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTG > SRR4302543.7662572/1‑94 (MQ=60)
CCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGC > SRR4302543.6039311/1‑94 (MQ=60)
CATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCT > SRR4302543.1214785/1‑94 (MQ=60)
CATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCT < SRR4302543.1961159/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTCTGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTG > SRR4302543.5080769/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTG > SRR4302543.5134254/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTG < SRR4302543.2993077/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTG > SRR4302543.6921354/1‑94 (MQ=60)
TCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGG < SRR4302543.6830947/94‑1 (MQ=60)
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CTGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAAT > SRR4302543.2923207/1‑94 (MQ=60)
TGATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATG > SRR4302543.1419968/1‑94 (MQ=60)
GATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGG < SRR4302543.1875753/94‑1 (MQ=60)
GATTAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGG < SRR4302543.2988987/94‑1 (MQ=60)
TAATCGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTG < SRR4302543.7031385/94‑1 (MQ=60)
AATCGCGATCAGATCCTCACTTTTGCTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGG < SRR4302543.6140850/94‑1 (MQ=60)
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CGCGATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACA < SRR4302543.7455702/94‑1 (MQ=60)
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GATCAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCC > SRR4302543.7676262/1‑94 (MQ=60)
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CAGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCT > SRR4302543.3806934/1‑94 (MQ=60)
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AGATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTT > SRR4302543.4722395/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTAC < SRR4302543.7500884/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTAC > SRR4302543.2102560/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACT > SRR4302543.2066665/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACT > SRR4302543.1508493/1‑94 (MQ=60)
CTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTT < SRR4302543.6533378/94‑1 (MQ=60)
CTCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTT > SRR4302543.4638923/1‑94 (MQ=60)
TCACTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTG < SRR4302543.2437170/94‑1 (MQ=60)
|
CTGCGGATGGTGACCTGGATTGGTCGCTGGTCGATGCTCGACCTGTTTGTCATATCTTTAACCATGTCGCTGATTAATCGCGATCAGATCCTCGCTTTTACTATGGGACCGGCTGCGTTTTATTTCGGCGCAGCGGTAATTTTGACTATTCTTGCTGTGGAATGGCTGGACAGCCGCTTACTTTG > NC_000913/1915341‑1915525
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
