Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,941,713 |
T→C |
S92S (AGT→AGC) |
yebI → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,941,713 | 0 | T | C | 100.0%
| 654.4
/ NA
| 209 | S92S (AGT→AGC) | yebI | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (103/106); total (103/106) |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG > NC_000913/1941624‑1941801
|
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc > 2:5978330/1‑93 (MQ=255)
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc < 1:3833671/93‑1 (MQ=255)
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc > 1:5830234/1‑93 (MQ=255)
gTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGcc < 1:7654502/93‑1 (MQ=255)
ttACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGccc < 2:5239776/93‑1 (MQ=255)
ttACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGccc < 2:3889832/93‑1 (MQ=255)
gctgctgctGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTc > 1:2925268/1‑93 (MQ=255)
ctgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCg > 2:4437184/1‑93 (MQ=255)
tgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGc < 1:4633196/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGc > 1:5689770/1‑93 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCt < 1:2442512/93‑1 (MQ=255)
gctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCt > 1:2636010/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTg < 1:1464789/93‑1 (MQ=255)
tgctgGCGGTCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTgg < 1:5398711/93‑1 (MQ=255)
tgctgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTgg < 1:3033748/93‑1 (MQ=255)
tgGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGcc < 2:3266954/93‑1 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCt < 2:1083173/93‑1 (MQ=255)
ggcgggcgGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCt > 1:3999776/1‑93 (MQ=255)
gggcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCtggg > 1:2851538/1‑92 (MQ=255)
gTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCg > 1:2726636/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGt < 1:7921539/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGt > 1:7527927/1‑93 (MQ=255)
tGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGa < 2:5403312/93‑1 (MQ=255)
ggTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTTGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCACTGGGCCTGGTGGGCGTGat > 2:4829953/1‑92 (MQ=255)
ggTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAg > 2:862965/1‑93 (MQ=255)
tATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTc < 1:1373116/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCt < 2:1274864/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCt < 1:2330225/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCt < 2:4627107/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTg > 2:6629494/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTg > 1:3309652/1‑93 (MQ=255)
tGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGt > 1:5530126/1‑93 (MQ=255)
ggAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTc > 1:7492877/1‑93 (MQ=255)
agaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTa > 1:7745068/1‑93 (MQ=255)
gaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTaa > 1:4814251/1‑93 (MQ=255)
aaaGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGCCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTaa < 1:6842295/92‑1 (MQ=255)
cGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAtt < 1:7061543/93‑1 (MQ=255)
gTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTc > 2:4988261/1‑93 (MQ=255)
tCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCg > 1:2162711/1‑93 (MQ=255)
tCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCg > 2:163961/1‑93 (MQ=255)
tCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCg > 2:2232175/1‑93 (MQ=255)
acaGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCgtgt > 2:7765516/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg > 2:6492956/1‑93 (MQ=255)
aGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttg < 2:5385938/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat < 2:4727824/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat < 1:1261131/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgat > 2:1453401/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt > 2:3164110/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt < 2:3973178/93‑1 (MQ=255)
cggCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatt < 2:7120119/92‑1 (MQ=255)
ggCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt > 1:1966310/1‑93 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat < 2:253342/93‑1 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat > 2:1152156/1‑93 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat > 1:5332350/1‑93 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat > 1:7729244/1‑93 (MQ=255)
gATCGACACGTTATTAGAGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGCCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgatttgat < 2:3430553/93‑1 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 2:3677608/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 1:5007340/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 2:1603810/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg > 1:4726151/1‑93 (MQ=255)
aTCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATg < 2:1810691/93‑1 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc > 2:2613708/1‑93 (MQ=255)
cGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCATGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGc > 1:4269138/1‑93 (MQ=255)
gACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCt > 1:4530963/1‑93 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 2:3890972/1‑93 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 1:1585479/1‑93 (MQ=255)
acacGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCtt > 2:4864148/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAcc < 2:7551627/93‑1 (MQ=255)
ttattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTg < 1:632029/93‑1 (MQ=255)
ttattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTg < 1:1570027/93‑1 (MQ=255)
tattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGt < 2:435314/93‑1 (MQ=255)
tattaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGt < 1:7171439/93‑1 (MQ=255)
attaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGtt > 1:3503585/1‑93 (MQ=255)
attaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGtt < 2:7449421/93‑1 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc < 2:5837183/93‑1 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 2:7911559/1‑93 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 2:7293019/1‑93 (MQ=255)
ttaGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGGTGATTTGATGGCTTACCTGTTc > 1:4876178/1‑93 (MQ=255)
taGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCg > 2:6894779/1‑93 (MQ=255)
gggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCggg > 2:1969402/1‑92 (MQ=255)
gggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGt < 1:2222285/93‑1 (MQ=255)
ggATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTg < 2:5588003/93‑1 (MQ=255)
gATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGa < 1:577393/93‑1 (MQ=255)
aTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt > 2:2053299/1‑93 (MQ=255)
aTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAt < 2:2491233/93‑1 (MQ=255)
ttATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAtt > 2:3001154/1‑93 (MQ=255)
ttATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAtt > 1:3940856/1‑93 (MQ=255)
tATTGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTTGTTGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt < 1:2601653/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt < 1:7588849/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt < 2:6754335/93‑1 (MQ=255)
tATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAttt < 2:1099511/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTg > 1:1829540/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTg > 2:103455/1‑93 (MQ=255)
tGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGc > 2:6926226/1‑93 (MQ=255)
cgcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTgg > 2:7726862/1‑93 (MQ=255)
gcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGc < 2:6094853/93‑1 (MQ=255)
gcACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGc > 1:6401577/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 1:1989770/1‑93 (MQ=255)
cacaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCa > 1:1047128/1‑93 (MQ=255)
acaGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAg < 2:6324486/93‑1 (MQ=255)
|
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG > NC_000913/1941624‑1941801
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG > NC_000913/1941621‑1941806
|
GCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCCCAGCG > SRR4302543.2511971/1‑94 (MQ=60)
GCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCG < SRR4302543.6388351/94‑1 (MQ=60)
CGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCC > SRR4302543.5883259/1‑94 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC < SRR4302543.3867497/94‑1 (MQ=60)
GTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCC < SRR4302543.7727072/94‑1 (MQ=60)
TTACGCTGGTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCT < SRR4302543.5665821/94‑1 (MQ=60)
TACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTG < SRR4302543.7943200/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTC > SRR4302543.2951841/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTC < SRR4302543.6745075/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGC > SRR4302543.5741695/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCT < SRR4302543.4675320/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCT > SRR4302543.2659880/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTG < SRR4302543.2464532/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGG < SRR4302543.2307563/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGATAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGG < SRR4302543.5513495/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGG < SRR4302543.1477991/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGGTCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGG < SRR4302543.5447806/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGG < SRR4302543.3061136/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGC > SRR4302543.2219435/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCC < SRR4302543.401990/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCT > SRR4302543.4035446/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCT < SRR4302543.4922823/94‑1 (MQ=60)
GGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTG < SRR4302543.3065660/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGG > SRR4302543.2877562/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGTCACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTG < SRR4302543.4716971/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGG < SRR4302543.7040112/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGG < SRR4302543.2614844/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTGGTATAGCTGGAGAAGCGTCCACTGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTC < SRR4302543.5443314/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCG > SRR4302543.2751442/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGGGGCCG > SRR4302543.1596993/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGGCGCTGGGCCTGGTGGTCG > SRR4302543.575336/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGT > SRR4302543.7599739/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTG < SRR4302543.7995946/94‑1 (MQ=60)
CTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGA > SRR4302543.2434270/1‑94 (MQ=60)
GGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGT > SRR4302543.2968401/1‑94 (MQ=60)
GGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGT < SRR4302543.4915543/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCT < SRR4302543.2714613/94‑1 (MQ=60)
TATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCT < SRR4302543.1385453/94‑1 (MQ=60)
GATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCT < SRR4302543.5863083/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTG < SRR4302543.2351378/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTG > SRR4302543.3339523/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGT > SRR4302543.5580368/1‑94 (MQ=60)
TGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTC > SRR4302543.7564557/1‑94 (MQ=60)
GGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTAGGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCT < SRR4302543.2934026/94‑1 (MQ=60)
GAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTA > SRR4302543.7818223/1‑94 (MQ=60)
AGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAA > SRR4302543.4858216/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAAT > SRR4302543.7993434/1‑94 (MQ=60)
AAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGCCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAAT < SRR4302543.6906869/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302543.2001501/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302543.7792578/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302543.4761127/94‑1 (MQ=60)
AGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATAT < SRR4302543.893649/94‑1 (MQ=60)
GCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATT < SRR4302543.2856693/94‑1 (MQ=60)
CGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTC < SRR4302543.7130083/94‑1 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG > SRR4302543.2182094/1‑94 (MQ=60)
GTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCG < SRR4302543.2280660/94‑1 (MQ=60)
CCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTG > SRR4302543.7813042/1‑94 (MQ=60)
ACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTT > SRR4302543.7398311/1‑94 (MQ=60)
CAGCTGGCGGTCGACACGTTATTAGGTGTTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGATTCTGATGTCTAATAATCGTGTTG < SRR4302543.1348368/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTG < SRR4302543.3516107/94‑1 (MQ=60)
CAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTG < SRR4302543.1348367/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGAT < SRR4302543.721597/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGAT < SRR4302543.4608339/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT > SRR4302543.7589207/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT < SRR4302543.1272413/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATT < SRR4302543.3610473/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTT > SRR4302543.1983937/1‑94 (MQ=60)
GCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGT > SRR4302543.1242281/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302543.7802298/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302543.7720284/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302543.2848225/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAT > SRR4302543.5380573/1‑94 (MQ=60)
CGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGAG > SRR4302543.5380574/1‑94 (MQ=60)
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GATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATG > SRR4302543.5052912/1‑94 (MQ=60)
TCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGC < SRR4302543.7642088/94‑1 (MQ=60)
TCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCATGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGC > SRR4302543.4307928/1‑94 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT > SRR4302543.4572197/1‑94 (MQ=60)
CGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCT > SRR4302543.1550466/1‑94 (MQ=60)
GACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTT > SRR4302543.1599636/1‑94 (MQ=60)
ACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTA > SRR4302543.3946165/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGGACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC > SRR4302543.4285212/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC > SRR4302543.2647642/1‑94 (MQ=60)
CACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTAC > SRR4302543.4285211/1‑94 (MQ=60)
CGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCT < SRR4302543.6432863/94‑1 (MQ=60)
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GTTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTAGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTG > SRR4302543.511144/1‑94 (MQ=60)
TTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGT < SRR4302543.1584043/94‑1 (MQ=60)
TTATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGT < SRR4302543.637804/94‑1 (MQ=60)
TATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTT > SRR4302543.3534910/1‑94 (MQ=60)
TATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTT < SRR4302543.7241071/94‑1 (MQ=60)
ATTAGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGGTGATTTGATGGCTTACCTGTTC > SRR4302543.4920622/1‑94 (MQ=60)
AGGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGG > SRR4302543.1710195/1‑94 (MQ=60)
GGGATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTG < SRR4302543.2242340/94‑1 (MQ=60)
GATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGAT < SRR4302543.582673/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATT > SRR4302543.3975698/1‑94 (MQ=60)
TATTGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTTGTTGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTG < SRR4302543.2625283/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGTCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTG < SRR4302543.7660962/94‑1 (MQ=60)
TATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTG > SRR4302543.1845971/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGC > SRR4302543.1945511/1‑94 (MQ=60)
TGGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCT > SRR4302543.5914653/1‑94 (MQ=60)
GGCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTG > SRR4302543.4839034/1‑94 (MQ=60)
GCGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGG < SRR4302543.6253965/94‑1 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC > SRR4302543.1440830/1‑94 (MQ=60)
CGCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGC > SRR4302543.6461848/1‑94 (MQ=60)
GCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCA > SRR4302543.1056505/1‑94 (MQ=60)
GCACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCA > SRR4302543.2007604/1‑94 (MQ=60)
CACAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAG < SRR4302543.7574958/94‑1 (MQ=60)
CAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGTTTTGCTGGCAGTG > SRR4302543.2822649/1‑94 (MQ=60)
CAGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTG > SRR4302543.2270847/1‑94 (MQ=60)
AGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGA < SRR4302543.160468/94‑1 (MQ=60)
AGCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGA > SRR4302543.5155040/1‑94 (MQ=60)
GCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC < SRR4302543.3402603/94‑1 (MQ=60)
GCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC < SRR4302543.5829639/94‑1 (MQ=60)
GCGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGAC < SRR4302543.1323793/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG < SRR4302543.6386193/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG > SRR4302543.5261766/1‑94 (MQ=60)
|
GCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACG > NC_000913/1941621‑1941806
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
