Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,973,993 |
T→C |
E96G (GAA→GGA) |
motB ← |
MotB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,973,993 | 0 | T | C | 98.9%
| 563.7
/ ‑3.1
| 183 | E96G (GAA→GGA) | motB | MotB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (98/83); total (99/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGC > NC_000913/1973903‑1974081
|
aTCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTccc > 1:1489802/1‑93 (MQ=255)
tCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccc > 2:7790548/1‑93 (MQ=255)
tCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccc > 1:725384/1‑93 (MQ=255)
aCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCt > 2:7468488/1‑93 (MQ=255)
tccagaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCTGCTGCTTATTCACTCCCCGCTGGCtt > 1:6737945/4‑93 (MQ=255)
tCGAGATCTGCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCGCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCtt < 1:2107344/93‑1 (MQ=255)
gagaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTg > 2:7059588/1‑93 (MQ=255)
gaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTggg > 1:4425150/1‑93 (MQ=255)
tCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTgggcg > 1:3782476/1‑91 (MQ=255)
ccccGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTaa < 1:289067/93‑1 (MQ=255)
cccGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAat > 1:3054225/1‑93 (MQ=255)
cGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatca > 1:2407939/1‑93 (MQ=255)
cGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatca > 1:6480252/1‑93 (MQ=255)
cGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatca > 2:6358568/1‑93 (MQ=255)
cAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatcatc < 2:4324911/93‑1 (MQ=255)
cAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatcatc < 1:3641829/93‑1 (MQ=255)
cAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatcatc < 1:6501946/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAAtcatca < 2:2672198/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAAtcatca < 2:1659250/93‑1 (MQ=255)
tCCGGAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGGTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTGTGGGTGTAATCATcaccac < 1:4894864/93‑1 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCGTTGGGTGTAATCATcaccac < 1:4894866/93‑1 (MQ=255)
ccGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCaccacc > 1:7732602/1‑93 (MQ=255)
cGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccg > 1:5798005/1‑93 (MQ=255)
aTCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCgg < 2:5707160/93‑1 (MQ=255)
tCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCggg > 1:1732342/1‑93 (MQ=255)
cGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGa < 2:1568140/93‑1 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa > 2:4096641/1‑93 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa > 2:1277694/1‑93 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa > 2:3891967/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAtt > 1:3424015/1‑93 (MQ=255)
cTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAtt > 1:2589240/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg < 1:4731372/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg < 2:2331850/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg < 2:6100658/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg > 2:7133708/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg < 1:4028231/93‑1 (MQ=255)
tcTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc < 2:6539542/92‑1 (MQ=255)
gCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc < 1:5953446/93‑1 (MQ=255)
cTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCt > 1:2982075/1‑93 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc < 2:5143256/93‑1 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc > 1:5479388/1‑93 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCACCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAACTAGGCTTTc > 2:1069735/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAGTTGGGCTTTcc > 1:6080184/1‑92 (MQ=255)
aTGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCa > 1:6080183/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCa > 2:6706958/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc > 1:5976167/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc > 1:2549272/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc < 1:3443289/93‑1 (MQ=255)
cGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTa < 1:3918931/93‑1 (MQ=255)
ttttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAtt > 2:4027159/1‑93 (MQ=255)
tttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTa < 1:7880275/93‑1 (MQ=255)
tttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTa < 1:1122429/93‑1 (MQ=255)
ttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAg > 2:824481/1‑93 (MQ=255)
ttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAg > 1:6290909/1‑93 (MQ=255)
tttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGa > 2:1478873/1‑93 (MQ=255)
ttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGaa < 2:4667860/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGaa < 1:4832975/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGaaa < 1:5671967/93‑1 (MQ=255)
tCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGaaa > 2:2003176/1‑93 (MQ=255)
cAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAt < 1:4150246/93‑1 (MQ=255)
aGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCGCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATg < 2:3238686/93‑1 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc < 1:2795020/93‑1 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc > 2:5161471/1‑93 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc < 1:6115132/93‑1 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc < 2:6858524/93‑1 (MQ=255)
ctctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCg > 2:5783969/1‑93 (MQ=255)
ctctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCg > 2:7386594/1‑93 (MQ=255)
ctctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGCGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCg < 2:3782475/93‑1 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa > 1:2236636/1‑93 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa > 2:4933818/1‑93 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa > 1:158354/1‑93 (MQ=255)
tctTCGATGTTAGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa > 2:4567598/1‑93 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt > 1:7391524/1‑93 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt > 1:2866457/1‑93 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt < 2:4236034/93‑1 (MQ=255)
ttCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAGTTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATc > 2:5933070/1‑93 (MQ=255)
ttCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATc > 2:1138581/1‑93 (MQ=255)
tCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcg < 2:6746544/93‑1 (MQ=255)
cGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgc < 1:2296842/93‑1 (MQ=255)
gATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgcc < 2:3374892/93‑1 (MQ=255)
gATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgcc < 2:531498/93‑1 (MQ=255)
tGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccgc < 2:2168601/93‑1 (MQ=255)
tGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccgc < 1:3195794/93‑1 (MQ=255)
tGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccgc > 1:2445788/1‑93 (MQ=255)
gTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCgccgcc > 1:6514466/1‑93 (MQ=255)
ttCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGccc > 1:6379303/1‑93 (MQ=255)
cGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGt > 1:2959238/1‑93 (MQ=255)
ggCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTa > 1:4143930/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:3641495/1‑93 (MQ=255)
gctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCg > 1:836923/1‑93 (MQ=255)
ttATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCa > 2:6486903/1‑93 (MQ=255)
ttATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCa > 1:538441/1‑93 (MQ=255)
ttATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCa > 2:10713/1‑93 (MQ=255)
ttATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACAACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACAGCa > 2:1825853/1‑93 (MQ=255)
tATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAg > 1:1651799/1‑93 (MQ=255)
tttCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt < 2:6769200/92‑1 (MQ=255)
aTTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt < 1:3375333/93‑1 (MQ=255)
ttCACCCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTc < 1:1808135/93‑1 (MQ=255)
tCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCg < 1:7468489/93‑1 (MQ=255)
cACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGc < 1:5185173/93‑1 (MQ=255)
|
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGC > NC_000913/1973903‑1974081
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGTG > NC_000913/1973901‑1974086
|
tgtttaacttgtcgagagccaccccaAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCC < SRR4302543.6689254/68‑1 (MQ=60)
CTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCC < SRR4302543.6689255/94‑1 (MQ=60)
TATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCC > SRR4302543.1503209/1‑94 (MQ=60)
TATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCC < SRR4302543.6449250/94‑1 (MQ=60)
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCC > SRR4302543.731910/1‑94 (MQ=60)
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCC > SRR4302543.5272041/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGG < SRR4302543.6369168/94‑1 (MQ=60)
TGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGC > SRR4302543.4259892/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACCCCCCCCTGGC < SRR4302543.2995374/94‑1 (MQ=60)
GGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCT < SRR4302543.490713/94‑1 (MQ=60)
GTCCAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCTGCTGCTTATTCACTCCCCGCTGGCTT > SRR4302543.6801583/1‑94 (MQ=60)
TCGAGATCTGCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCGCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTT < SRR4302543.2126203/94‑1 (MQ=60)
GAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGG > SRR4302543.2376053/1‑94 (MQ=60)
AGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGG > SRR4302543.4465248/1‑94 (MQ=60)
ATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGCG > SRR4302543.3815797/1‑94 (MQ=60)
CACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTA > SRR4302543.2878271/1‑94 (MQ=60)
CCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAAT < SRR4302543.291648/94‑1 (MQ=60)
CCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAAT > SRR4302543.3081730/1‑94 (MQ=60)
CCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAAT < SRR4302543.5941229/94‑1 (MQ=60)
CCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCACCCCTGGCTTTGGGTGTAAT < SRR4302543.4008642/94‑1 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA > SRR4302543.2429705/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA > SRR4302543.6541311/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA > SRR4302543.6541309/1‑94 (MQ=60)
CGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCAT < SRR4302543.3722077/94‑1 (MQ=60)
CAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCA > SRR4302543.1559390/1‑94 (MQ=60)
CAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCA < SRR4302543.6563195/94‑1 (MQ=60)
CAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCA < SRR4302543.3673866/94‑1 (MQ=60)
CAAGTTCCTCAATCGACGTTGCTCCCTGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCCCCCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCA < SRR4302543.3673865/94‑1 (MQ=60)
AATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCAC < SRR4302543.1601677/94‑1 (MQ=60)
AATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCAC > SRR4302543.3669958/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACC > SRR4302543.959337/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACC < SRR4302543.7389796/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACC > SRR4302543.7554866/1‑94 (MQ=60)
TTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCC > SRR4302543.7973903/1‑94 (MQ=60)
TCCGGAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGGTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTGTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302543.4939480/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302543.4939481/94‑1 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC > SRR4302543.7805673/1‑94 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCGTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302543.4939482/94‑1 (MQ=60)
CCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCG > SRR4302543.7906958/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCG > SRR4302543.5850745/1‑94 (MQ=60)
GCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCG > SRR4302543.216828/1‑94 (MQ=60)
CAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCG > SRR4302543.3424160/1‑94 (MQ=60)
ATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGG > SRR4302543.1747785/1‑94 (MQ=60)
CGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAA > SRR4302543.6500452/1‑94 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT > SRR4302543.503240/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATT > SRR4302543.2612782/1‑94 (MQ=60)
ACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATT > SRR4302543.3454652/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGG < SRR4302543.4774596/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGG < SRR4302543.4064235/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGG < SRR4302543.7470015/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT > SRR4302543.3009152/1‑94 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT < SRR4302543.6007934/94‑1 (MQ=60)
CTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTT > SRR4302543.628812/1‑94 (MQ=60)
CCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTC > SRR4302543.5529050/1‑94 (MQ=60)
CATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAGTTGGGCTTTCC > SRR4302543.6137803/1‑94 (MQ=60)
CATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCA > SRR4302543.6137802/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAC > SRR4302543.5485875/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAC > SRR4302543.6030905/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAC > SRR4302543.2572547/1‑94 (MQ=60)
TGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACT < SRR4302543.3474118/94‑1 (MQ=60)
GCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTA < SRR4302543.4136070/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAT > SRR4302543.6926518/1‑94 (MQ=60)
CGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAT < SRR4302543.3953516/94‑1 (MQ=60)
GTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATT > SRR4302543.6695963/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATT < SRR4302543.3058004/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTA > SRR4302543.3455877/1‑94 (MQ=60)
TTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTA < SRR4302543.2984576/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG < SRR4302543.1132614/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG < SRR4302543.7954437/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG > SRR4302543.6350143/1‑94 (MQ=60)
TTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAA < SRR4302543.4877061/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT < SRR4302543.4844448/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT < SRR4302543.5723736/94‑1 (MQ=60)
CAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATG < SRR4302543.603298/94‑1 (MQ=60)
CAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATG < SRR4302543.4187766/94‑1 (MQ=60)
GCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCG > SRR4302543.6139736/1‑94 (MQ=60)
GCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCG < SRR4302543.6173063/94‑1 (MQ=60)
GCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCG < SRR4302543.2820560/94‑1 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA > SRR4302543.2256881/1‑94 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA > SRR4302543.2256879/1‑94 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA > SRR4302543.159711/1‑94 (MQ=60)
TCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAT < SRR4302543.1725569/94‑1 (MQ=60)
TCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAT > SRR4302543.2892581/1‑94 (MQ=60)
TCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAT > SRR4302543.7462524/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATC < SRR4302543.2607224/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC < SRR4302543.2317788/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302543.5696152/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302543.5789704/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG > SRR4302543.4715764/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG < SRR4302543.2041400/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGC > SRR4302543.2467833/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCC > SRR4302543.6575826/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCC > SRR4302543.6575824/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCC < SRR4302543.3224607/94‑1 (MQ=60)
GTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCC > SRR4302543.6439328/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGT > SRR4302543.2986106/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGGGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGT > SRR4302543.1785610/1‑94 (MQ=60)
CGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTA > SRR4302543.4181364/1‑94 (MQ=60)
GGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAC > SRR4302543.2443286/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACC > SRR4302543.3673532/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCG > SRR4302543.3361671/1‑94 (MQ=60)
TGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCG > SRR4302543.844308/1‑94 (MQ=60)
CTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCA > SRR4302543.543430/1‑94 (MQ=60)
CTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCA > SRR4302543.2468529/1‑94 (MQ=60)
TTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAG > SRR4302543.1666575/1‑94 (MQ=60)
TATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGT < SRR4302543.3115729/94‑1 (MQ=60)
ATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTC < SRR4302543.3405632/94‑1 (MQ=60)
ATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTC > SRR4302543.6008599/1‑94 (MQ=60)
TTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCG < SRR4302543.3920350/94‑1 (MQ=60)
TTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCG > SRR4302543.2619201/1‑94 (MQ=60)
TTCACCCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCG < SRR4302543.1824322/94‑1 (MQ=60)
TCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGC < SRR4302543.7540014/94‑1 (MQ=60)
CACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCC < SRR4302543.5231955/94‑1 (MQ=60)
ACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCA > SRR4302543.6733771/1‑94 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCCCCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG < SRR4302543.4005064/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG < SRR4302543.7203031/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG > SRR4302543.4987028/1‑94 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG < SRR4302543.4430803/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG < SRR4302543.4144779/94‑1 (MQ=60)
CTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAG > SRR4302543.3753882/1‑94 (MQ=60)
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CTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGTG > NC_000913/1973901‑1974086
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
