Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,827,834 |
C→T |
G421G (GGC→GGT) |
yicE → |
putative transport protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,827,834 | 0 | C | T | 98.7%
| 1304.4
/ NA
| 399 | G421G (GGC→GGT) | yicE | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); major base T (202/189); minor base G (5/0); total (209/190) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > NC_000913/3827744‑3827923
|
cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt < 1:7155624/93‑1 (MQ=255)
gccgccTCCTGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGtgtg < 1:7899998/93‑1 (MQ=255)
gccgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGtgtg > 1:5034785/1‑93 (MQ=255)
gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct > 1:7528090/1‑93 (MQ=255)
gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct > 1:5885858/1‑93 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc > 2:3784011/1‑93 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc < 1:1951046/93‑1 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc > 2:542330/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 1:4611840/1‑93 (MQ=255)
ccGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagc > 1:3305121/1‑93 (MQ=255)
cGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagca < 2:6084075/93‑1 (MQ=255)
cGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagca > 1:2340031/1‑93 (MQ=255)
cGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagca < 2:4420955/93‑1 (MQ=255)
gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc < 2:6372779/93‑1 (MQ=255)
tgtgCGTATCTTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTC‑GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCg < 1:5293925/93‑1 (MQ=255)
tgtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGGGTCTCAGCAGcc > 2:7040764/1‑93 (MQ=255)
gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCg > 2:3536572/1‑93 (MQ=255)
tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc > 2:2200684/1‑93 (MQ=255)
gCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCt < 2:169519/93‑1 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa > 1:6371310/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa > 1:4128738/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa > 2:697366/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGCCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa > 1:5408946/1‑93 (MQ=255)
aTCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGCtt > 2:807320/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 1:4315883/1‑93 (MQ=255)
ttttcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCa < 1:4273002/90‑1 (MQ=255)
tctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAg > 2:2248022/1‑93 (MQ=255)
tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt > 2:3192459/1‑93 (MQ=255)
gTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTg < 1:2635955/93‑1 (MQ=255)
gTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTg > 2:4870504/1‑93 (MQ=255)
tGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGc < 1:7350758/93‑1 (MQ=255)
ggCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGccc < 1:2246001/92‑1 (MQ=255)
ccGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCt < 2:3101869/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTAGCGCGCTGGCGCTGGCGGTTGGTCTGGTTGTCTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCt < 2:1005330/93‑1 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa < 1:2949116/93‑1 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGCTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 2:1093069/93‑1 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 2:5823542/93‑1 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 1:897799/93‑1 (MQ=255)
tGAGCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 1:3144734/93‑1 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 1:4444926/93‑1 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:1374631/93‑1 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 1:4682828/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATgg < 2:7705957/93‑1 (MQ=255)
aCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGc < 2:1211277/93‑1 (MQ=255)
cGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGACCCTACATGGCTg > 2:193299/1‑93 (MQ=255)
tCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaa > 1:120281/1‑93 (MQ=255)
tCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaa > 2:3303513/1‑93 (MQ=255)
cGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaa < 2:2118922/93‑1 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa < 2:2077001/93‑1 (MQ=255)
gCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAc > 2:343244/1‑93 (MQ=255)
cGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAccc < 2:7411539/93‑1 (MQ=255)
cGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAcc < 1:1120164/93‑1 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt < 2:7884450/93‑1 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 2:3056759/1‑93 (MQ=255)
ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc < 2:142475/93‑1 (MQ=255)
ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc < 1:4172668/93‑1 (MQ=255)
tCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGct < 1:7114419/93‑1 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 1:2895905/93‑1 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 2:6310370/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 1:1606816/1‑93 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct < 2:2979710/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTATCAGCAGCCGCTGCTTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 1:3657721/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCtctc > 1:4868345/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGATGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAACCGCTGATTTTTCAGTTTGCCACTGAATGGCTGAACAACCTGCtctc > 1:5231848/1‑93 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc > 2:644353/1‑93 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc < 2:6527733/93‑1 (MQ=255)
aTCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCtcctcc > 1:5598498/1‑93 (MQ=255)
tCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAACTGCTCTCCTCCg > 2:5283990/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCggg > 1:6692283/1‑93 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTGTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa < 1:1850289/93‑1 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCTCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa > 1:7613064/1‑93 (MQ=255)
tcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt < 2:2635076/92‑1 (MQ=255)
gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAGCTGCTCTCCTCCGGGAt > 2:4600974/1‑93 (MQ=255)
gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt < 1:5708280/93‑1 (MQ=255)
gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt > 2:4660487/1‑93 (MQ=255)
cTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATc > 2:4164075/1‑93 (MQ=255)
cTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATc > 1:4078682/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg > 2:1858751/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgc > 1:6485527/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccgc > 2:5216454/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCcgcg > 1:6006777/1‑93 (MQ=255)
cGGTTGGGCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggcg < 1:1425567/93‑1 (MQ=255)
ggTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcgggcgg > 2:1725132/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 2:5960452/1‑93 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:2812598/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAt < 1:6293419/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAtt > 1:3864989/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 2:4825193/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa > 2:5617008/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa < 1:7071599/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:2452489/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 1:7756812/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:7178286/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:2341805/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:6696202/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 1:2717405/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:1547107/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACt < 1:354494/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 2:3927623/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg < 1:6328352/93‑1 (MQ=255)
|
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > NC_000913/3827744‑3827923
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 224 total aligned reads displayed.
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827742‑3827927
|
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG < SRR4302543.3247858/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG > SRR4302543.3509930/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG > SRR4302543.5540927/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG < SRR4302543.4498315/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302543.7493983/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302543.5428575/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG > SRR4302543.5080585/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302543.7225171/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302543.7880582/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCTCCTGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGT < SRR4302543.7974261/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGT < SRR4302543.6541024/94‑1 (MQ=60)
CGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCT > SRR4302543.5939504/1‑94 (MQ=60)
CGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCT > SRR4302543.7599904/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTC > SRR4302543.1925981/1‑94 (MQ=60)
CCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTC < SRR4302543.2553273/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302543.1968543/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302543.5326945/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG < SRR4302543.6382695/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302543.4325125/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302543.2405158/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302543.4741240/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302543.3577537/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG < SRR4302543.6382696/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302543.4653734/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302543.836529/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGGGCGTATCGTTTCTCGGTAGCCGCTGAACCGTCCGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG < SRR4302543.6382694/94‑1 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC > SRR4302543.3334941/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGC > SRR4302543.1968382/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCA > SRR4302543.3955754/1‑94 (MQ=60)
CCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCA > SRR4302543.2361259/1‑94 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG < SRR4302543.423028/94‑1 (MQ=60)
GTCTGCGTAGCGTTTCTCTTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCC < SRR4302543.2460415/94‑1 (MQ=60)
TTTGCGTAGCTTTTCTGGTGAGCCGCTGAGCCGGCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCG < SRR4302543.4673872/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTATCTTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTC‑GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGC < SRR4302543.5341730/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCG < SRR4302543.4160455/94‑1 (MQ=60)
TGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCG > SRR4302543.7801712/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCG < SRR4302543.6448502/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGC < SRR4302543.5341731/94‑1 (MQ=60)
TGTGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCT < SRR4302543.1165425/94‑1 (MQ=60)
TGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCT < SRR4302543.3875135/94‑1 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302543.1997908/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302543.6431240/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302543.7145819/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302543.6392057/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302543.4165981/1‑94 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGCCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302543.5458123/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302543.4543061/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302543.1523945/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302543.6885673/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGAGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302543.597767/1‑94 (MQ=60)
GATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT < SRR4302543.2709698/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT > SRR4302543.4686308/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT > SRR4302543.7523710/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT > SRR4302543.1497745/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT < SRR4302543.2775994/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT < SRR4302543.514406/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT > SRR4302543.1821704/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG > SRR4302543.4355086/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG < SRR4302543.5741984/94‑1 (MQ=60)
TTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCA > SRR4302543.3021261/1‑94 (MQ=60)
TTTTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302543.4311836/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302543.4311837/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG < SRR4302543.4878255/94‑1 (MQ=60)
TTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTGTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAG > SRR4302543.1870569/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302543.5310241/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302543.880264/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGAGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTT > SRR4302543.523386/1‑94 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302543.3487453/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302543.852983/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302543.3211231/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG < SRR4302543.7801340/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG > SRR4302543.2024987/1‑94 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG < SRR4302543.2724762/94‑1 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG < SRR4302543.5692962/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC < SRR4302543.2659823/94‑1 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302543.3445565/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302543.2789772/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302543.4630353/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCC < SRR4302543.7421464/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC < SRR4302543.2266385/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC < SRR4302543.2290602/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC > SRR4302543.151499/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC > SRR4302543.5516717/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGAACCGTGGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCT < SRR4302543.4365487/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCT > SRR4302543.6347366/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCT < SRR4302543.4176769/94‑1 (MQ=60)
CGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGA > SRR4302543.1649567/1‑94 (MQ=60)
CGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGA > SRR4302543.7354589/1‑94 (MQ=60)
CGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGA > SRR4302543.3622807/1‑94 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA < SRR4302543.3053634/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA < SRR4302543.7719896/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA < SRR4302543.2975888/94‑1 (MQ=60)
cgtaacctcaGGGCGATTCCGATTATCGCGTTGTTGCTGGCGGTTCGTCTGGGTGGGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302543.3344625/84‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTGGGGCGATTCTGATTAGCCCGCTGTAGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302543.4209001/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302543.4208999/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302543.905725/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302543.5159746/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302543.4609899/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302543.3173019/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302543.4485180/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302543.2689894/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302543.4725536/94‑1 (MQ=60)
GAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGG < SRR4302543.7876107/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAA > SRR4302543.121365/1‑94 (MQ=60)
TCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAA > SRR4302543.7031593/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCTCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCTCCTGAATGGCTGAAAA > SRR4302543.7116522/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC < SRR4302543.3807722/94‑1 (MQ=60)
GCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACC < SRR4302543.7614985/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302543.4096808/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302543.1130318/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302543.2311919/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302543.5746323/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302543.5636555/94‑1 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG > SRR4302543.7364483/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGC > SRR4302543.1169046/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT > SRR4302543.684951/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT < SRR4302543.6661381/94‑1 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT < SRR4302543.4210451/94‑1 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGTCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC < SRR4302543.7183532/94‑1 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC < SRR4302543.7183533/94‑1 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC > SRR4302543.6023696/1‑94 (MQ=60)
TCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTC < SRR4302543.3938779/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302543.1621146/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302543.2922232/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302543.7667805/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302543.1294922/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTATCAGCAGCCGCTGCTTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302543.3689845/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTATCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302543.7477453/94‑1 (MQ=60)
TGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTC > SRR4302543.4912727/1‑94 (MQ=60)
TGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGATGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAACCGCTGATTTTTCAGTTTGCCACTGAATGGCTGAACAACCTGCTCTC > SRR4302543.5278982/1‑94 (MQ=60)
GATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTTTTTCTTAGCAGCCGCTGATTTTGCAGGTTTCCCCTGATTGTCTGAAAAAtcttttcctc > SRR4302543.7060784/1‑84 (MQ=46)
GATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCC < SRR4302543.909369/94‑1 (MQ=60)
GATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCC < SRR4302543.4116337/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT < SRR4302543.4969298/94‑1 (MQ=60)
ATTATCCCGCTGTCGCTTGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTCCTCTCCT > SRR4302543.2215305/1‑94 (MQ=60)
TTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTC < SRR4302543.4812254/94‑1 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC > SRR4302543.5649497/1‑94 (MQ=60)
TATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC > SRR4302543.4142208/1‑94 (MQ=60)
TAGCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCC < SRR4302543.6488303/94‑1 (MQ=60)
ATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCG < SRR4302543.949930/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG > SRR4302543.6755452/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG < SRR4302543.6368033/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCTCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGA > SRR4302543.7685349/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTGTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT < SRR4302543.1866933/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT > SRR4302543.4437437/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAT > SRR4302543.4319737/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302543.5760357/94‑1 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC < SRR4302543.7207834/94‑1 (MQ=60)
CTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCG > SRR4302543.6575910/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC > SRR4302543.6546633/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC > SRR4302543.6546632/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC > SRR4302543.3220417/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCGCACCAGCAGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC < SRR4302543.3743950/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCC > SRR4302543.2963635/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCC > SRR4302543.5038441/1‑94 (MQ=60)
GTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCC > SRR4302543.6024149/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302543.1150466/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG < SRR4302543.2297497/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302543.2232443/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302543.1216567/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302543.6062072/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302543.5700031/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGTAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGG > SRR4302543.6131547/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGG > SRR4302543.1644965/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGG < SRR4302543.2964932/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG < SRR4302543.4250600/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG < SRR4302543.5269686/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGC < SRR4302543.5889100/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGG > SRR4302543.1335871/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGG < SRR4302543.359210/94‑1 (MQ=60)
CGGTTGGGCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGG < SRR4302543.1438468/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302543.7191005/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTCGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302543.294224/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTA > SRR4302543.7215646/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTA > SRR4302543.7586157/1‑94 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302543.5355247/94‑1 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302543.5837170/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTGGGTGTGTGTCTGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302543.1501658/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT > SRR4302543.2979776/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302543.6352665/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT > SRR4302543.3899128/1‑94 (MQ=60)
TGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGGTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302543.4288701/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302543.7140262/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT < SRR4302543.883433/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT < SRR4302543.2742098/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT < SRR4302543.7830026/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG < SRR4302543.357766/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC > SRR4302543.3175124/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC < SRR4302543.6387872/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGC < SRR4302543.6387871/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC > SRR4302543.5337196/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC > SRR4302543.4211711/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC < SRR4302543.4680755/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCC > SRR4302543.7398935/1‑94 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT < SRR4302543.7555240/94‑1 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT > SRR4302543.3744877/1‑94 (MQ=60)
GTGTGTCCCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT < SRR4302543.2353540/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC < SRR4302543.3345412/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > SRR4302543.1308432/1‑94 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > SRR4302543.5151526/1‑94 (MQ=60)
|
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827742‑3827927
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |