Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,827,834 |
C→T |
G421G (GGC→GGT) |
yicE → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,827,834 | 0 | C | T | 98.3%
| 812.3
/ NA
| 240 | G421G (GGC→GGT) | yicE | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (107/127); minor base G (3/1); total (112/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG > NC_000913/3827744‑3827922
|
cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt > 1:2266128/1‑93 (MQ=255)
cgccgcCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGACTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgt < 2:3204801/93‑1 (MQ=255)
ccgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGgtgtgt > 2:2753023/1‑93 (MQ=255)
cgccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtc < 2:1960179/93‑1 (MQ=255)
gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct > 2:3464577/1‑93 (MQ=255)
gccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtct < 2:3756396/93‑1 (MQ=255)
ccTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGtctc < 1:3539778/93‑1 (MQ=255)
cTCGGGTGTGCGTATTGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCTCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 1:755408/93‑1 (MQ=255)
cTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTca < 2:3288850/93‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 2:18878/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag > 1:1890054/1‑93 (MQ=255)
tCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcag < 1:2815860/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagc > 1:2979996/1‑93 (MQ=255)
cGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTcagca > 2:1716390/1‑93 (MQ=255)
gtgtGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCagcagc > 1:660446/1‑93 (MQ=255)
tgtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGcc < 2:1342768/93‑1 (MQ=255)
gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGGCg > 1:3936039/1‑93 (MQ=255)
gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCg > 1:3233804/1‑93 (MQ=255)
gtgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCg > 2:4070466/1‑93 (MQ=255)
tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc < 1:4460616/93‑1 (MQ=255)
tgCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGc < 2:3789801/93‑1 (MQ=255)
cGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTg < 2:4339792/93‑1 (MQ=255)
gTATCGTTTCTCGTGCGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGa < 1:2363661/93‑1 (MQ=255)
tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt > 1:4371890/1‑93 (MQ=255)
tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt > 2:264548/1‑93 (MQ=255)
tATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAt < 1:417610/93‑1 (MQ=255)
tCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGGCGCTGCttt > 2:3132695/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 1:3282708/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg < 1:2872432/93‑1 (MQ=255)
gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 1:2684793/1‑93 (MQ=255)
gTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGGCTCAGCAGCCGCTGATTTTg > 2:731877/1‑93 (MQ=255)
tttCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGc < 2:80560/93‑1 (MQ=255)
ctcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGt < 2:1266228/93‑1 (MQ=255)
tcGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGtt > 2:104896/1‑93 (MQ=255)
tGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGc < 1:1476101/93‑1 (MQ=255)
gCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGcccc > 1:1533349/1‑93 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa > 2:1511903/1‑93 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa < 1:249524/93‑1 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa < 2:3325893/93‑1 (MQ=255)
gCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGACGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGa > 2:886514/1‑93 (MQ=255)
cTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGaa < 1:1846361/93‑1 (MQ=255)
tGAGCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:4492961/93‑1 (MQ=255)
tGAATCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:2915753/93‑1 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt > 2:760626/1‑93 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt > 2:505886/1‑93 (MQ=255)
tGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAt < 2:3871037/93‑1 (MQ=255)
gAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATg < 1:3405669/93‑1 (MQ=255)
gAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATg < 2:1097586/93‑1 (MQ=255)
aCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGc < 1:2105484/93‑1 (MQ=255)
ccGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCt > 2:4039316/1‑93 (MQ=255)
cGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTg < 1:2090755/93‑1 (MQ=255)
tCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaa > 2:3515235/1‑93 (MQ=255)
gggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaa < 2:589780/93‑1 (MQ=255)
ggCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGaaaaa > 1:2283943/1‑93 (MQ=255)
gCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAc < 1:3582811/93‑1 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 1:1423532/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 1:2991290/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCt > 1:1955553/1‑93 (MQ=255)
gATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGCATGGCTGAAAAAACt > 2:2593459/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTg > 2:934532/1‑93 (MQ=255)
ttCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGc > 1:4591879/1‑93 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 1:3868305/93‑1 (MQ=255)
cTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCCGAATGGCTGAAAAACCTGctc < 2:2986493/93‑1 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 2:270099/1‑93 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 1:881765/1‑93 (MQ=255)
tGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGctct > 2:1293145/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGCTCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCtctc < 2:1000711/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc < 2:2271368/93‑1 (MQ=255)
aTTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcc < 2:3965903/93‑1 (MQ=255)
ttATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcct < 2:1386740/93‑1 (MQ=255)
tATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTctcctc > 2:3718925/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCggg > 1:1092064/1‑93 (MQ=255)
gcgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCggg > 1:370122/1‑93 (MQ=255)
cgcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGa < 2:1658602/93‑1 (MQ=255)
gcTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGAt < 2:1179790/93‑1 (MQ=255)
tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg > 1:559450/1‑93 (MQ=255)
tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg < 1:3453765/93‑1 (MQ=255)
tGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcg > 2:3239382/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAATCTGCTCTCCTCCGGGATcgc > 1:2708116/1‑93 (MQ=255)
gTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgc < 1:3823615/93‑1 (MQ=255)
tCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgcc > 2:2530599/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATcgccg < 1:2147814/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcggg < 1:3838239/93‑1 (MQ=255)
ggCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCACTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCgcggg > 1:4290367/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 2:1900064/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 1:1144932/1‑93 (MQ=255)
gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt < 2:1770533/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGt > 2:1359259/1‑93 (MQ=255)
ttGTTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:2427429/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 1:3367957/93‑1 (MQ=255)
ttGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCCCCGGGATCGCCGCGGGCGGTa < 2:2042610/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAt < 2:1450066/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa < 1:1623743/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTa < 2:1430289/93‑1 (MQ=255)
tCTGTGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:1913236/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAATCCTGCTCGCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:4534729/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:1800513/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGTGTGCCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAc < 2:647269/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 2:4403506/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTg > 1:447317/1‑93 (MQ=255)
|
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG > NC_000913/3827744‑3827922
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827742‑3827927
|
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGAGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTG < SRR4302535.2530746/94‑1 (MQ=60)
TCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGT > SRR4302535.2282277/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTG < SRR4302535.2814491/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGGCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGT < SRR4302535.3163701/94‑1 (MQ=60)
CCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATAGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTC > SRR4302535.3904399/1‑94 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302535.2976776/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302535.3564375/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCA < SRR4302535.1719216/94‑1 (MQ=60)
CTCGGGTGTGCGTATTGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCTCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG < SRR4302535.760728/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302535.834067/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302535.4611181/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302535.1903667/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGGCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302535.229230/1‑94 (MQ=60)
CTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGTGTGTCTCAG > SRR4302535.1991755/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC > SRR4302535.3000904/1‑94 (MQ=60)
TCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGC < SRR4302535.2835862/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCA < SRR4302535.2133469/94‑1 (MQ=60)
CGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAG < SRR4302535.3823997/94‑1 (MQ=60)
GGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGC > SRR4302535.665055/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGGCG > SRR4302535.3962891/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCG > SRR4302535.3256244/1‑94 (MQ=60)
TGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCT < SRR4302535.4491210/94‑1 (MQ=60)
CGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGA > SRR4302535.1895203/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGCGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT < SRR4302535.2380635/94‑1 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCTTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302535.3517967/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGAT > SRR4302535.4401805/1‑94 (MQ=60)
TATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT < SRR4302535.420537/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT < SRR4302535.3621132/94‑1 (MQ=60)
TATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATT > SRR4302535.4288030/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGCTTT > SRR4302535.3295047/1‑94 (MQ=60)
ATCGTTCCTCGTGAGCCGCTGACCCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTT < SRR4302535.2022138/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG > SRR4302535.2703988/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTG > SRR4302535.3305508/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGC < SRR4302535.2892788/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGC < SRR4302535.2562294/94‑1 (MQ=60)
GTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGC > SRR4302535.4429463/1‑94 (MQ=60)
GTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGC > SRR4302535.164652/1‑94 (MQ=60)
TCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGT > SRR4302535.3036895/1‑94 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT < SRR4302535.3577870/94‑1 (MQ=60)
TCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTT > SRR4302535.2656034/1‑94 (MQ=60)
CGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTG > SRR4302535.3274306/1‑94 (MQ=60)
GTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGC > SRR4302535.4500034/1‑94 (MQ=60)
TGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCC < SRR4302535.1486667/94‑1 (MQ=60)
GAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCC > SRR4302535.3847611/1‑94 (MQ=60)
GAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCC > SRR4302535.1908569/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC > SRR4302535.1544398/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCC > SRR4302535.2971380/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCT < SRR4302535.2162078/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA < SRR4302535.251244/94‑1 (MQ=60)
GCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAA < SRR4302535.543588/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302535.3851112/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT < SRR4302535.1859668/94‑1 (MQ=60)
CTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAAT > SRR4302535.3715122/1‑94 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302535.928611/94‑1 (MQ=60)
TGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATG < SRR4302535.3002657/94‑1 (MQ=60)
GAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGG < SRR4302535.3429371/94‑1 (MQ=60)
AACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGC < SRR4302535.2715454/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302535.4564508/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302535.927903/94‑1 (MQ=60)
ACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCT < SRR4302535.2120673/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGA > SRR4302535.1588055/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGA < SRR4302535.2105821/94‑1 (MQ=60)
TCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAA > SRR4302535.4431428/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAA > SRR4302535.1465667/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302535.2300262/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAA > SRR4302535.1509650/1‑94 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC < SRR4302535.4389329/94‑1 (MQ=60)
GGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAAC > SRR4302535.2299636/1‑94 (MQ=60)
GCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACC < SRR4302535.1500487/94‑1 (MQ=60)
GCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACC < SRR4302535.3607663/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302535.1969631/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302535.1433697/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302535.3012266/1‑94 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT < SRR4302535.2426021/94‑1 (MQ=60)
CGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCT > SRR4302535.1134/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG > SRR4302535.4188520/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG > SRR4302535.4329981/1‑94 (MQ=60)
GATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTG < SRR4302535.636676/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGC > SRR4302535.4623138/1‑94 (MQ=60)
TTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCT < SRR4302535.2378040/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302535.3414717/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302535.888007/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302535.620608/1‑94 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302535.286514/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCT < SRR4302535.3894897/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGAGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGTATGGCTGAAAAACCTGCTCT > SRR4302535.341601/1‑94 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT < SRR4302535.704224/94‑1 (MQ=60)
ATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCT < SRR4302535.2789768/94‑1 (MQ=60)
TTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTC > SRR4302535.2112769/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG > SRR4302535.1099844/1‑94 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG < SRR4302535.4099066/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGG > SRR4302535.372681/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGA > SRR4302535.1396709/1‑94 (MQ=60)
GCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATC > SRR4302535.2198327/1‑94 (MQ=60)
CTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCG > SRR4302535.563362/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAATCTGCTCTCCTCCGGGATCGC > SRR4302535.2727468/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGC < SRR4302535.3477774/94‑1 (MQ=60)
GTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCC < SRR4302535.3849988/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGC < SRR4302535.2163260/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCG > SRR4302535.3307764/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCACTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGG > SRR4302535.4319712/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGC < SRR4302535.3864697/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTGGTCTGGGGGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAGCCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGC < SRR4302535.3444608/94‑1 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302535.3875161/1‑94 (MQ=60)
GGTTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGT > SRR4302535.1153092/1‑94 (MQ=60)
TTGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTAT < SRR4302535.3391392/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302535.2422774/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT < SRR4302535.878986/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATT > SRR4302535.3503284/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302535.1635467/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC < SRR4302535.1904323/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACT < SRR4302535.131510/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG > SRR4302535.450451/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTG < SRR4302535.3887703/94‑1 (MQ=60)
GTGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCAT < SRR4302535.3681576/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC < SRR4302535.1598807/94‑1 (MQ=60)
TGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC < SRR4302535.3389257/94‑1 (MQ=60)
|
ATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTACTGCCATC > NC_000913/3827742‑3827927
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
