Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,031,772 |
C→T |
C346C (TGC→TGT) |
trkH → |
TrkH |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,031,772 | 0 | C | T | 99.7%
| 1158.8
/ ‑6.2
| 334 | C346C (TGC→TGT) | trkH | TrkH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (134/198); total (135/199) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
GACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCC > NC_000913/4031682‑4031861
|
gACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTgtgc < 2:4683657/93‑1 (MQ=255)
gACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTgtgc < 1:5718838/93‑1 (MQ=255)
aCCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCggg < 1:4738737/93‑1 (MQ=255)
cccgGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCa < 1:4222231/92‑1 (MQ=255)
ccgGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCaa < 1:2199054/93‑1 (MQ=255)
gggTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGGTGTGCCGGGGCAACg > 2:2114/1‑93 (MQ=255)
ggTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACgg < 1:3679838/93‑1 (MQ=255)
gTTTACAACTGAGAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACggg < 2:3449860/93‑1 (MQ=255)
gTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACggg > 1:4630862/1‑93 (MQ=255)
tttACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGc < 2:6164857/93‑1 (MQ=255)
ttACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCg > 1:1152562/1‑93 (MQ=255)
ttACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCg > 1:7583809/1‑93 (MQ=255)
tACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCgg < 2:4170383/93‑1 (MQ=255)
tcAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGt < 1:4501163/92‑1 (MQ=255)
aCAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGt < 2:3132650/93‑1 (MQ=255)
cAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTg < 1:6729000/93‑1 (MQ=255)
aCTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGc < 1:3109151/93‑1 (MQ=255)
tGACAGCATTGCCCGCTGGCTGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCt < 2:5466488/93‑1 (MQ=255)
aCAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGa < 2:5998809/93‑1 (MQ=255)
cAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGaa < 2:3098728/93‑1 (MQ=255)
aGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAg < 1:3257514/93‑1 (MQ=255)
aGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGGGGCCTGAAg > 1:1982919/1‑93 (MQ=255)
gCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGGTGTCCCGGGTCCACGGGCGGGGGCCTGAAgg > 1:2623929/1‑93 (MQ=255)
cATTGCCTGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTAGGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGt < 1:3558820/93‑1 (MQ=255)
cATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGCCCTGAAGGt < 2:5238906/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGa > 1:5597231/1‑93 (MQ=255)
ttGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGGTGTGTCGGGGCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGa > 2:751174/1‑93 (MQ=255)
gCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATc < 2:5108879/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCg > 1:7760920/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGc < 2:4468334/93‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGc > 1:7908816/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCa > 1:1037662/1‑93 (MQ=255)
ccGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctg > 2:2258858/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCTTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgc < 2:6576327/93‑1 (MQ=255)
cGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgc < 1:6350801/93‑1 (MQ=255)
cGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgc > 1:656274/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgc > 1:1579762/1‑93 (MQ=255)
cGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgc > 1:5430339/1‑93 (MQ=255)
gCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgct > 1:7110895/1‑93 (MQ=255)
gCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGGGATCCGCATCctgct > 2:2561689/1‑93 (MQ=255)
tctTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgctgc < 1:5932332/93‑1 (MQ=255)
tctTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgctgc > 1:3977246/1‑93 (MQ=255)
ctTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgctgct > 2:3192245/1‑93 (MQ=255)
tttttGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCctgctgctg > 1:5284013/1‑93 (MQ=255)
tttttGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGGCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGGGATCCGCATCctgctgctg > 2:2907312/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGttt < 2:1061095/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTa < 2:6721786/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTa < 2:5510489/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTaa < 2:741714/93‑1 (MQ=255)
cGGTACTGCTTTTATGTTTAGCCTTTATCGGCGGATTTGCCGGGTCAACGGGCGGTTGCCTTAAGGGGATCCGGCTCCTGCTTCTGTTTAAGc > 2:3708925/1‑93 (MQ=255)
gTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAg > 2:1331151/1‑93 (MQ=255)
gTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGGGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAg > 1:4009289/1‑93 (MQ=255)
tACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAgg > 1:6101462/1‑93 (MQ=255)
tACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAgg < 2:2936989/93‑1 (MQ=255)
tACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAgg < 1:7327874/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTTGCGGGTCAACGGGCGGGGGCCTGAAGGTGATTCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAggg > 2:7108590/1‑93 (MQ=255)
cTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAgggg > 1:512338/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGa < 1:2408346/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGa > 1:1520305/1‑93 (MQ=255)
gCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTTAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGaa < 2:4423478/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGaa < 1:1287883/93‑1 (MQ=255)
cTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAc < 2:5360399/93‑1 (MQ=255)
cTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAc < 2:791517/93‑1 (MQ=255)
ttttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAcc < 1:7537120/93‑1 (MQ=255)
ttttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAcc > 1:1686518/1‑93 (MQ=255)
ttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGt < 2:1248726/93‑1 (MQ=255)
ttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGt < 1:4968091/93‑1 (MQ=255)
ttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGt < 1:3809213/93‑1 (MQ=255)
ttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGGGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGt > 2:7711706/1‑93 (MQ=255)
ttATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAAAGGGCGGTGGCCTGAAGGGGCATCGCCTCCTGCTGCTGTTTTAGCAGGGGGAACGt > 2:1441348/1‑93 (MQ=255)
aTGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTgg > 2:5728082/1‑92 (MQ=255)
aTGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGa < 2:4138837/93‑1 (MQ=255)
tGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTggg > 2:5789699/1‑91 (MQ=255)
gatCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGc < 2:4615770/91‑1 (MQ=255)
gTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGc < 2:3981598/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCt < 2:4900897/93‑1 (MQ=255)
tCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGGGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTg > 1:2849476/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGa < 1:2546731/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGaaa > 1:6979486/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGaaa < 2:2307467/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGaaa < 1:7644443/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGaaa < 2:1865534/93‑1 (MQ=255)
ccTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAGCGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAc < 2:4244157/93‑1 (MQ=255)
ccTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAc < 2:92385/93‑1 (MQ=255)
ccTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAc > 2:4786331/1‑93 (MQ=255)
cTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACg < 2:1764019/93‑1 (MQ=255)
tttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAGCCGTGAGCTGAAACGa > 1:7837490/1‑93 (MQ=255)
tttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGa < 1:4804095/93‑1 (MQ=255)
tttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGa < 1:390350/93‑1 (MQ=255)
tttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGGGAGCTTAAAAGa > 2:6053032/1‑93 (MQ=255)
ttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGAc < 2:6805888/93‑1 (MQ=255)
ttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGAc < 2:7605690/93‑1 (MQ=255)
ttATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGAc < 2:3361269/93‑1 (MQ=255)
aTCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTg < 2:192214/93‑1 (MQ=255)
tCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTgg < 2:2708883/93‑1 (MQ=255)
tCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTgg < 2:6624206/93‑1 (MQ=255)
gcggTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGc > 1:5335569/1‑93 (MQ=255)
gcggTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGc > 2:3631866/1‑93 (MQ=255)
gTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATc > 1:3536353/1‑93 (MQ=255)
gTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGCGATCCGCATCCTGCTGCTGATTTAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACCGGCGCATc > 2:6997582/1‑93 (MQ=255)
|
GACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCC > NC_000913/4031682‑4031861
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 202 total aligned reads displayed.
GGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAAC > NC_000913/4031679‑4031865
|
GGCGACAACCGCCGGGTTTATAACTGACAGCATGGCCCGCTGGCCGCTTTTTGTGCCGGTACTGCGTTTTGGTTCAGCCTGTATCGGCGGTTGT > SRR4302543.7094728/1‑94 (MQ=60)
GGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGT < SRR4302543.156552/94‑1 (MQ=60)
GGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGT > SRR4302543.7863362/1‑94 (MQ=60)
GGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGT < SRR4302543.5795003/94‑1 (MQ=60)
GCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTG < SRR4302543.809060/94‑1 (MQ=60)
GCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTG < SRR4302543.623471/94‑1 (MQ=60)
GCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTG < SRR4302543.7511970/94‑1 (MQ=60)
CGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTTCTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGC < SRR4302543.2610221/94‑1 (MQ=60)
GACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCC < SRR4302543.5771020/94‑1 (MQ=60)
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TACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGG < SRR4302543.7398415/94‑1 (MQ=60)
ACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGTTTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGG > SRR4302543.7684238/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGG > SRR4302543.517105/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGA > SRR4302543.1533957/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAA < SRR4302543.2430115/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAC < SRR4302543.2754187/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAC < SRR4302543.4271664/94‑1 (MQ=60)
GCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAC < SRR4302543.1299359/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGGGGTGGCCCGAAGGTGATACGCAGCCCGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACC > SRR4302543.2271549/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGGAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAAAC > SRR4302543.2995675/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGCACC > SRR4302543.6021243/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACC > SRR4302543.4094/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACC > SRR4302543.1701662/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGGCAACGGGCGGTGGCCCGAAGGTGATTCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGTAGGGGAACC > SRR4302543.3280037/1‑94 (MQ=60)
TTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGTCGGGTGAACGGGCGGTGGCCTGAAGGAGATCCGCATCCTGCTTCCGTTTAAGCAGGGGGACCG > SRR4302543.7841735/1‑94 (MQ=60)
TTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCG < SRR4302543.7608978/94‑1 (MQ=60)
TTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTG < SRR4302543.3842794/94‑1 (MQ=60)
TTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTG < SRR4302543.5013310/94‑1 (MQ=60)
TATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCCGGGGGACCGTGG > SRR4302543.3471199/1‑94 (MQ=60)
TATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGA > SRR4302543.2899601/1‑94 (MQ=60)
TATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGA < SRR4302543.4842340/94‑1 (MQ=60)
TATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTCCCGGGTCAAAGGGCGGTGGCCTGAAGGCGATCCGCATCCTCCGTCTGCTTAAGCAGGGGAACCGTGA > SRR4302543.7427152/1‑94 (MQ=60)
tttTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCTACGGGCGGTTGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAG < SRR4302543.1578793/91‑1 (MQ=60)
TTGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTTCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAG < SRR4302543.5275481/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAG < SRR4302543.7380096/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAG > SRR4302543.1218550/1‑94 (MQ=60)
TGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGC < SRR4302543.3421864/94‑1 (MQ=60)
GTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCT < SRR4302543.6475836/94‑1 (MQ=60)
TTCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGGGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTG > SRR4302543.2875489/1‑94 (MQ=60)
TCAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGA > SRR4302543.907423/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAA < SRR4302543.934881/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAA < SRR4302543.7623310/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAA < SRR4302543.2569965/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAA > SRR4302543.463784/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAA > SRR4302543.542929/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGGACCGTGAGCTGAAA > SRR4302543.3267481/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAA > SRR4302543.7045171/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAC < SRR4302543.7716940/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAC < SRR4302543.3685035/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAC < SRR4302543.7000161/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAC < SRR4302543.5694339/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAC < SRR4302543.7779495/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTATCGGCGGTGGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAC < SRR4302543.7863659/94‑1 (MQ=60)
CCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACG < SRR4302543.4970393/94‑1 (MQ=60)
CCTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACG > SRR4302543.13/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGACGGGGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGGACCGTGAGCTGAAACGA > SRR4302543.3332614/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAGCCGTGAGCTGAAACGA > SRR4302543.7911255/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGA > SRR4302543.3861890/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGA > SRR4302543.7203642/1‑94 (MQ=60)
CTTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGA > SRR4302543.2606202/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGAC < SRR4302543.393954/94‑1 (MQ=60)
TTTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGAC < SRR4302543.4847988/94‑1 (MQ=60)
TTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAGCGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACT < SRR4302543.6600726/94‑1 (MQ=60)
TTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACT < SRR4302543.7920886/94‑1 (MQ=60)
TTATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACT < SRR4302543.4926306/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTG < SRR4302543.4917313/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTG < SRR4302543.5191962/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGG > SRR4302543.2455286/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGG > SRR4302543.2079743/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAAAGACTGG > SRR4302543.7569175/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTG < SRR4302543.7598265/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGC < SRR4302543.2335983/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGC > SRR4302543.5369820/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGC > SRR4302543.5383822/1‑94 (MQ=60)
CGGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCAT > SRR4302543.1233406/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATC > SRR4302543.3960968/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATC > SRR4302543.3614366/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATC > SRR4302543.3567811/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATC > SRR4302543.2112185/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATC > SRR4302543.1798955/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCC > SRR4302543.3203490/1‑94 (MQ=60)
TGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGA < SRR4302543.6632435/94‑1 (MQ=60)
TGTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGA < SRR4302543.4983785/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAC > SRR4302543.1377507/1‑94 (MQ=60)
GTGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAA > SRR4302543.4828435/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAAC > SRR4302543.4444651/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAAC < SRR4302543.4650350/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAAC < SRR4302543.115778/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAAC < SRR4302543.1619362/94‑1 (MQ=60)
|
GGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTATCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAAC > NC_000913/4031679‑4031865
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |