Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,041,927 |
A→G |
Y50C (TAC→TGC) |
b3861 → |
putative GTP‑binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,041,927 | 0 | A | G | 100.0%
| 950.3
/ NA
| 296 | Y50C (TAC→TGC) | b3861 | putative GTP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (158/138); total (158/138) |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
GCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCC > NC_000913/4041837‑4042015
|
gCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCg > 2:4689213/1‑93 (MQ=255)
caTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGata > 2:6068647/1‑93 (MQ=255)
aTGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGatat < 1:1190355/93‑1 (MQ=255)
tGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGCAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGACAGGTGAACATGCCTGCGATATg > 2:7786791/1‑93 (MQ=255)
tGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATg > 2:371567/1‑93 (MQ=255)
ggTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGa < 2:5759107/93‑1 (MQ=255)
gTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGAc < 1:2102464/93‑1 (MQ=255)
gTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGAc > 2:3833787/1‑93 (MQ=255)
acacAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGt < 1:7366024/93‑1 (MQ=255)
cacaGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGtt < 1:269038/93‑1 (MQ=255)
cacaGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGtt < 1:2940298/93‑1 (MQ=255)
acaGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTa > 1:3966604/1‑93 (MQ=255)
caGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTaa > 2:1231172/1‑93 (MQ=255)
caGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTaa < 1:3526430/93‑1 (MQ=255)
tACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTGTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGGACATGCCGGCGATATGACGTTAAGTTa < 1:6678420/93‑1 (MQ=255)
aCGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTAt < 1:1886492/93‑1 (MQ=255)
cAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaa > 2:7271447/1‑93 (MQ=255)
aagctCAGCCTGGTGTCGAAGAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTATTAAGAAAGGCGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaaa > 2:5119798/5‑93 (MQ=255)
aaTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCaaaa < 2:7604906/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAt < 2:2130944/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAtt > 1:1512493/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAtttt > 2:3058757/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAtttt < 1:5616586/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTg > 1:835572/1‑93 (MQ=255)
aGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTCAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTg > 1:4630525/1‑93 (MQ=255)
gCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACTATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGa < 2:6575174/93‑1 (MQ=255)
gCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGa > 1:6758998/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACa < 1:3779721/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACa > 1:3634528/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACa > 1:279070/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaa > 1:6946327/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaa > 2:344211/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaa > 1:4303721/1‑93 (MQ=255)
tGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaa < 2:6377473/93‑1 (MQ=255)
ggTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaaa < 2:4153758/93‑1 (MQ=255)
ggTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACaaa > 2:536623/1‑93 (MQ=255)
gtgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAg < 1:1662246/93‑1 (MQ=255)
gtgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAg < 1:134906/93‑1 (MQ=255)
gtgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAg > 1:6837184/1‑93 (MQ=255)
tgtCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAgg > 2:6897836/1‑93 (MQ=255)
tCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCt > 2:4633096/1‑93 (MQ=255)
gAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCttt > 2:1436315/1‑93 (MQ=255)
aaaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttt < 1:484018/93‑1 (MQ=255)
aaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCttttt > 2:900834/1‑93 (MQ=255)
aaaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCttttt > 1:129909/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttt > 2:107187/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGACATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCtttttt > 1:2578265/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTa > 1:2230064/1‑93 (MQ=255)
aTTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTaa < 1:1271032/93‑1 (MQ=255)
tttATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAAt > 2:6170948/1‑93 (MQ=255)
tttATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAAt > 2:1624137/1‑93 (MQ=255)
ttattaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAAtt > 1:978062/1‑93 (MQ=255)
attaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTcc < 1:4752350/93‑1 (MQ=255)
attaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTcc > 1:951824/1‑93 (MQ=255)
ttaAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTccc > 1:5413345/1‑93 (MQ=255)
aaaGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGt > 2:4251966/1‑93 (MQ=255)
aGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGttt > 2:2918507/1‑93 (MQ=255)
gATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGtttt > 1:6444786/1‑93 (MQ=255)
ttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaa < 1:6547717/93‑1 (MQ=255)
ttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaa < 1:4071267/93‑1 (MQ=255)
ttAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaa < 2:2081608/93‑1 (MQ=255)
tAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaat > 2:558387/1‑93 (MQ=255)
aCGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgc < 2:1513138/93‑1 (MQ=255)
aCGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgc > 2:6742332/1‑93 (MQ=255)
cGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgca < 2:5946961/93‑1 (MQ=255)
cGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgca > 1:418324/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaa < 1:6086587/93‑1 (MQ=255)
aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaa < 1:5191322/93‑1 (MQ=255)
aTGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaa < 2:816597/93‑1 (MQ=255)
tGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTcaaatgcaaat > 1:7207754/1‑93 (MQ=255)
cTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGa < 2:2881074/93‑1 (MQ=255)
cTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGa < 2:2512264/93‑1 (MQ=255)
tAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAc > 1:2320847/1‑93 (MQ=255)
tAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAc < 2:1889642/93‑1 (MQ=255)
tAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAc > 2:739236/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACa < 2:3013154/93‑1 (MQ=255)
aaaaGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAt < 2:4389638/93‑1 (MQ=255)
aaaaGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAt > 1:5874623/1‑93 (MQ=255)
aaagaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAtt > 1:750504/1‑93 (MQ=255)
aagaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTc > 1:5575144/1‑93 (MQ=255)
gaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGa > 1:706/1‑93 (MQ=255)
gaaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGa > 1:2215502/1‑93 (MQ=255)
aaagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAt < 2:6302665/93‑1 (MQ=255)
aagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATa > 2:2249626/1‑93 (MQ=255)
aagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATa > 1:782896/1‑93 (MQ=255)
aagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATa > 2:1338233/1‑93 (MQ=255)
aagGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATa < 1:3394537/93‑1 (MQ=255)
agGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATaa > 2:7435252/1‑93 (MQ=255)
ggTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAc > 1:1222372/1‑93 (MQ=255)
tGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACgg > 2:172594/1‑93 (MQ=255)
gAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGt < 1:3274132/93‑1 (MQ=255)
aCATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGc < 2:4772981/93‑1 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTACGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 2:7771632/1‑93 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 1:5315834/1‑93 (MQ=255)
cATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCa > 1:7601099/1‑93 (MQ=255)
aTGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAc > 1:6471113/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAcc < 1:4521957/93‑1 (MQ=255)
tGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAcc > 1:5220228/1‑93 (MQ=255)
tGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTGTTTTATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATGCGATAACGGTGCAcc > 2:7029638/1‑93 (MQ=255)
gCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAccc < 2:4890128/93‑1 (MQ=255)
|
GCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCC > NC_000913/4041837‑4042015
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCT > NC_000913/4041834‑4042020
|
GTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTG > SRR4302543.7607710/1‑94 (MQ=60)
GTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTG < SRR4302543.6790546/94‑1 (MQ=60)
CACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGAT < SRR4302543.4307749/94‑1 (MQ=60)
ACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATA > SRR4302543.7490246/1‑94 (MQ=60)
CATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATAT < SRR4302543.5427647/94‑1 (MQ=60)
ATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATG < SRR4302543.1201089/94‑1 (MQ=60)
ATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGCCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATG < SRR4302543.6893720/94‑1 (MQ=60)
GGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGAC < SRR4302543.1573378/94‑1 (MQ=60)
GTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACG < SRR4302543.2121283/94‑1 (MQ=60)
ACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTT < SRR4302543.7436854/94‑1 (MQ=60)
CACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTA < SRR4302543.2966996/94‑1 (MQ=60)
CACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTA < SRR4302543.271400/94‑1 (MQ=60)
CACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTA > SRR4302543.4001748/1‑94 (MQ=60)
ACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAA > SRR4302543.5527329/1‑94 (MQ=60)
ACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAA < SRR4302543.3096437/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCCGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAACATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAG < SRR4302543.6072942/94‑1 (MQ=60)
CAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAG < SRR4302543.3557864/94‑1 (MQ=60)
CAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAG > SRR4302543.5576356/1‑94 (MQ=60)
AGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGT > SRR4302543.7322740/1‑94 (MQ=60)
AGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGT > SRR4302543.2072465/1‑94 (MQ=60)
AGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGT > SRR4302543.2286801/1‑94 (MQ=60)
GGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTT < SRR4302543.7336622/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTT < SRR4302543.6763159/94‑1 (MQ=60)
TACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGGACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTAT < SRR4302543.6741465/94‑1 (MQ=60)
TACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTGTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGGACATGCCGGCGATATGACGTTAAGTTAT < SRR4302543.6741464/94‑1 (MQ=60)
ACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATC < SRR4302543.5255325/94‑1 (MQ=60)
ACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATC < SRR4302543.1903447/94‑1 (MQ=60)
CGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCA < SRR4302543.3466654/94‑1 (MQ=60)
CAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAA > SRR4302543.7941614/1‑94 (MQ=60)
CAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAA > SRR4302543.1276645/1‑94 (MQ=60)
AAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAA < SRR4302543.5351599/94‑1 (MQ=60)
AAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAA > SRR4302543.3919832/1‑94 (MQ=60)
AATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAAT < SRR4302543.583279/94‑1 (MQ=60)
aatgaaccgGGTGTCGACAAATTTATTAAAGATTTGAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTGATCAAAATT < SRR4302543.4084845/85‑1 (MQ=60)
ATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATT > SRR4302543.1526077/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATT > SRR4302543.3583995/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTG < SRR4302543.5667768/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTG > SRR4302543.842949/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTG > SRR4302543.3583334/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTCAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTG > SRR4302543.4672611/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGA > SRR4302543.6822836/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACA > SRR4302543.3666517/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACA > SRR4302543.281541/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAA > SRR4302543.992230/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAA > SRR4302543.7573306/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAA < SRR4302543.3813009/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAA > SRR4302543.7011682/1‑94 (MQ=60)
CTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAA > SRR4302543.4342818/1‑94 (MQ=60)
GGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAG > SRR4302543.6693180/1‑94 (MQ=60)
GGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAG > SRR4302543.6901722/1‑94 (MQ=60)
GGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAG < SRR4302543.6351987/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGG < SRR4302543.1677135/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGG < SRR4302543.961213/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGG > SRR4302543.2797641/1‑94 (MQ=60)
GTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGG < SRR4302543.136102/94‑1 (MQ=60)
TGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGT > SRR4302543.6732549/1‑94 (MQ=60)
TGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC > SRR4302543.1417300/1‑94 (MQ=60)
TGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGC < SRR4302543.2619832/94‑1 (MQ=60)
GTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCT > SRR4302543.6941374/1‑94 (MQ=60)
TCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTT < SRR4302543.5659109/94‑1 (MQ=60)
GAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTT < SRR4302543.5859218/94‑1 (MQ=60)
AAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTT > SRR4302543.131072/1‑94 (MQ=60)
AAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTT < SRR4302543.488493/94‑1 (MQ=60)
AAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTT < SRR4302543.384859/94‑1 (MQ=60)
AAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTT < SRR4302543.760929/94‑1 (MQ=60)
AAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTT > SRR4302543.3393304/1‑94 (MQ=60)
AAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGACATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTT > SRR4302543.2601751/1‑94 (MQ=60)
AAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTA > SRR4302543.2250209/1‑94 (MQ=60)
AAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTA > SRR4302543.2250210/1‑94 (MQ=60)
AAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTA < SRR4302543.5243775/94‑1 (MQ=60)
AAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTA < SRR4302543.4411705/94‑1 (MQ=60)
AATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAA > SRR4302543.5019779/1‑94 (MQ=60)
ATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAAT < SRR4302543.1282384/94‑1 (MQ=60)
ATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAAT > SRR4302543.4767718/1‑94 (MQ=60)
TTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATT > SRR4302543.986696/1‑94 (MQ=60)
TTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATT < SRR4302543.2203682/94‑1 (MQ=60)
TTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATT < SRR4302543.4046994/94‑1 (MQ=60)
TTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTC < SRR4302543.3387445/94‑1 (MQ=60)
TATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCC > SRR4302543.5648035/1‑94 (MQ=60)
TATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCC > SRR4302543.960141/1‑94 (MQ=60)
ATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCC > SRR4302543.5462588/1‑94 (MQ=60)
ATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCC < SRR4302543.4795786/94‑1 (MQ=60)
ATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCC > SRR4302543.7103929/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGGCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCG > SRR4302543.3116750/1‑94 (MQ=60)
TTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCG > SRR4302543.6945075/1‑94 (MQ=60)
TAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGT > SRR4302543.3798875/1‑94 (MQ=60)
AAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTT > SRR4302543.3801291/1‑94 (MQ=60)
AAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTT > SRR4302543.6872686/1‑94 (MQ=60)
AGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTT < SRR4302543.2359883/94‑1 (MQ=60)
AGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTT > SRR4302543.6505500/1‑94 (MQ=60)
GATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTC > SRR4302543.7215151/1‑94 (MQ=60)
ATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCA < SRR4302543.7084259/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAA > SRR4302543.722917/1‑94 (MQ=60)
TTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAA > SRR4302543.416220/1‑94 (MQ=60)
TTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAAT < SRR4302543.4107738/94‑1 (MQ=60)
TTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAAT < SRR4302543.2317010/94‑1 (MQ=60)
TTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAAT < SRR4302543.6609344/94‑1 (MQ=60)
TTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAAT < SRR4302543.4644743/94‑1 (MQ=60)
TAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATG > SRR4302543.918044/1‑94 (MQ=60)
TAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATG < SRR4302543.1467617/94‑1 (MQ=60)
ACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCA > SRR4302543.422232/1‑94 (MQ=60)
ACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCA < SRR4302543.4438448/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAA < SRR4302543.425622/94‑1 (MQ=60)
ATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAAT < SRR4302543.6144275/94‑1 (MQ=60)
ATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAAT < SRR4302543.6052255/94‑1 (MQ=60)
ATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAAT > SRR4302543.2573658/1‑94 (MQ=60)
ATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAAT < SRR4302543.5238135/94‑1 (MQ=60)
ATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAAT > SRR4302543.7277631/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATG > SRR4302543.2246466/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATG > SRR4302543.1314728/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGA > SRR4302543.1903152/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGA > SRR4302543.6511534/1‑94 (MQ=60)
GCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGA > SRR4302543.2861434/1‑94 (MQ=60)
CTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAC > SRR4302543.4073391/1‑94 (MQ=60)
CTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAC < SRR4302543.7940251/94‑1 (MQ=60)
CTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGAC > SRR4302543.2341942/1‑94 (MQ=60)
TAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGTTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACA < SRR4302543.4220550/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACA > SRR4302543.7595247/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAT > SRR4302543.5928142/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACAT < SRR4302543.5378003/94‑1 (MQ=60)
AAAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATT > SRR4302543.757164/1‑94 (MQ=60)
AAAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTC > SRR4302543.5625886/1‑94 (MQ=60)
AAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCG < SRR4302543.4823583/94‑1 (MQ=60)
AAGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCG < SRR4302543.2200470/94‑1 (MQ=60)
AGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGA > SRR4302543.718/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGA > SRR4302543.7823558/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGA > SRR4302543.1211215/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGA > SRR4302543.4838904/1‑94 (MQ=60)
AGAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGA > SRR4302543.2235472/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGAT < SRR4302543.971137/94‑1 (MQ=60)
AAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATA < SRR4302543.4741168/94‑1 (MQ=60)
AAAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATA > SRR4302543.789784/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAA < SRR4302543.3424971/94‑1 (MQ=60)
AAGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAA < SRR4302543.1261607/94‑1 (MQ=60)
AGGTGAACATGCCTGCGATATTACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAC < SRR4302543.1652924/94‑1 (MQ=60)
AGGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAAC > SRR4302543.1233359/1‑94 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302543.1284116/94‑1 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302543.268807/94‑1 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302543.5082479/94‑1 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302543.5302287/94‑1 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302543.3535054/94‑1 (MQ=60)
GGTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACG < SRR4302543.6561259/94‑1 (MQ=60)
GTGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGG > SRR4302543.7846984/1‑94 (MQ=60)
TGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGT < SRR4302543.2821990/94‑1 (MQ=60)
TGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGT > SRR4302543.1918002/1‑94 (MQ=60)
TGAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGT > SRR4302543.6516390/1‑94 (MQ=60)
GAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTG < SRR4302543.3303709/94‑1 (MQ=60)
GAACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTG < SRR4302543.6342285/94‑1 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA < SRR4302543.6587064/94‑1 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA > SRR4302543.7673290/1‑94 (MQ=60)
ACATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCA > SRR4302543.5363860/1‑94 (MQ=60)
CATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCAC > SRR4302543.6532078/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACC < SRR4302543.1288650/94‑1 (MQ=60)
ATGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACC > SRR4302543.5267245/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCC > SRR4302543.2754008/1‑94 (MQ=60)
TGCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCC < SRR4302543.4563087/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCG < SRR4302543.1330878/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCG < SRR4302543.1860997/94‑1 (MQ=60)
CCTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGA > SRR4302543.3972081/1‑94 (MQ=60)
CTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAT > SRR4302543.5049361/1‑94 (MQ=60)
CTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAT > SRR4302543.7391317/1‑94 (MQ=60)
CTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAT > SRR4302543.3378312/1‑94 (MQ=60)
CTGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGAC > SRR4302543.2672304/1‑94 (MQ=60)
TGCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATC < SRR4302543.392324/94‑1 (MQ=60)
GCGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCT < SRR4302543.4654711/94‑1 (MQ=60)
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GTGGCACATGGTACACAGGTACGCAAATTCAGCCTGGTGTCGAAAAATTTATTAAAGATTTTAACGATGCTAAAAAGAAAGGTGAACATGCCTACGATATGACGTTAAGTTATCAAAATTTTGACAAAGGCTTTTTTAATTCCCGTTTTCAAATGCAAATGACATTCGATAACGGTGCACCCGATCT > NC_000913/4041834‑4042020
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
