Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,363,501 |
A→G |
I284T (ATC→ACC) |
dcuA ← |
anaerobic dicarboxylate transport |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,363,501 | 0 | A | G | 99.5%
| 1174.5
/ ‑3.9
| 374 | I284T (ATC→ACC) | dcuA | anaerobic dicarboxylate transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (191/181); total (192/182) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.78e-01 |
Only 100 of 386 total aligned reads displayed.
TTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGC > NC_000913/4363411‑4363590
|
ttgttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGtg < 2:1695292/93‑1 (MQ=255)
tgttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGgtgt < 1:3179874/93‑1 (MQ=255)
tgttgGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGgtgt < 1:310914/93‑1 (MQ=255)
ggAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTc < 1:2815796/93‑1 (MQ=255)
cGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTAt < 1:1468136/93‑1 (MQ=255)
aaaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCg > 2:4478009/1‑93 (MQ=255)
aaaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGGGTTGTCGGGATCg > 2:2783903/1‑93 (MQ=255)
aaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGa < 1:3920780/93‑1 (MQ=255)
aaGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGa < 2:2036152/93‑1 (MQ=255)
gcaTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACt > 1:3783160/3‑93 (MQ=255)
gcaTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACt > 1:4624610/3‑93 (MQ=255)
gcaTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACt > 1:5828628/3‑93 (MQ=255)
acaTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACt < 1:1848477/91‑1 (MQ=255)
aTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACttt > 2:1145357/1‑93 (MQ=255)
aTCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACttt < 1:3291793/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTa < 2:3537551/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTATTGTCGGTATCGACTTTa > 2:6591517/1‑93 (MQ=255)
gCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACa < 1:4222486/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGa < 2:5715509/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGa > 1:4039495/1‑93 (MQ=255)
cAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAt > 1:2490545/1‑93 (MQ=255)
cAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAt < 1:1946254/93‑1 (MQ=255)
aGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATa > 1:5775610/1‑93 (MQ=255)
aGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATa > 2:5897219/1‑93 (MQ=255)
gCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATaa < 1:4903116/93‑1 (MQ=255)
gCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATaa < 2:3988252/93‑1 (MQ=255)
gCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATaa < 2:1789401/93‑1 (MQ=255)
gCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATaa > 1:1357621/1‑93 (MQ=255)
gCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATaa > 2:1079296/1‑93 (MQ=255)
cACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACg < 2:5161371/93‑1 (MQ=255)
aaCACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACggtggt < 2:2933578/93‑1 (MQ=255)
acacCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGGGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAAATAACgggggta > 2:5683392/1‑92 (MQ=255)
cacCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCa > 1:6027437/1‑93 (MQ=255)
ccccAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCag < 1:2568669/92‑1 (MQ=255)
acCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCag > 1:4972295/1‑93 (MQ=255)
acCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCag > 2:6783984/1‑93 (MQ=255)
acCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCag > 2:3051546/1‑93 (MQ=255)
cccAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCaga < 1:544056/93‑1 (MQ=255)
cccAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCaga < 1:3608119/93‑1 (MQ=255)
cccAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCaga < 2:1913375/93‑1 (MQ=255)
cAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGt > 1:1252969/1‑93 (MQ=255)
cAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGt > 2:5117105/1‑93 (MQ=255)
cAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGt < 2:5820046/93‑1 (MQ=255)
aGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGtt > 2:316315/1‑93 (MQ=255)
ggATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTg > 2:825866/1‑93 (MQ=255)
ggATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTg > 2:4188033/1‑93 (MQ=255)
aTACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGGGGTCAGAGTTGCa > 1:1556577/1‑93 (MQ=255)
aCAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAAc < 2:4383649/93‑1 (MQ=255)
cAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACg > 2:2115366/1‑93 (MQ=255)
cAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACg > 1:984913/1‑93 (MQ=255)
aaaTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGc < 1:5170402/93‑1 (MQ=255)
aaTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCt > 2:6484308/1‑93 (MQ=255)
aaTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGGTGCAACGCt > 2:7224872/1‑93 (MQ=255)
aTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTg < 2:1293892/93‑1 (MQ=255)
tgcAGGCGCTCATTCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGCCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGa < 1:4525253/91‑1 (MQ=255)
tACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGa < 2:4847548/93‑1 (MQ=255)
aCAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAg < 1:7903937/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCa < 2:2681131/93‑1 (MQ=255)
aGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCa > 1:6876352/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCat < 1:6791718/93‑1 (MQ=255)
gcTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTTAGCatgat < 2:7882933/93‑1 (MQ=255)
gcTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCatgat > 2:6079093/1‑93 (MQ=255)
cTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCatgatg > 2:3608782/1‑93 (MQ=255)
tCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCAtgatga > 2:7055229/1‑93 (MQ=255)
tCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCAtgatga < 2:7700816/93‑1 (MQ=255)
tCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCAtgatga < 1:5100782/93‑1 (MQ=255)
tACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATcg > 1:5253102/1‑92 (MQ=255)
tACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCa < 1:489648/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTATACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAg < 1:101898/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAgg > 1:6250657/1‑93 (MQ=255)
cTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGa < 2:7610349/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAt > 2:6695418/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAt > 1:3071781/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAtt > 2:124535/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAtt < 2:3835684/93‑1 (MQ=255)
tttGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGc > 1:4729283/1‑93 (MQ=255)
ttGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCg < 2:5579299/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGtt > 1:4340389/1‑93 (MQ=255)
aaGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtg > 2:1952593/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggt < 2:3320855/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggt < 2:4079526/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtg > 1:6110890/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtg > 2:6130994/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtg < 1:7280605/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtgg < 2:7109820/93‑1 (MQ=255)
gCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTggtggt > 1:6346296/1‑93 (MQ=255)
gCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTggtggt < 1:1684210/93‑1 (MQ=255)
cTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGgtggtg > 1:7833652/1‑93 (MQ=255)
cTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGgtggtg > 1:669178/1‑93 (MQ=255)
cTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGgtggtg < 1:6483366/93‑1 (MQ=255)
aGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtca < 2:2369993/93‑1 (MQ=255)
aGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtca < 1:3379244/93‑1 (MQ=255)
aGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtca < 1:2387229/93‑1 (MQ=255)
gTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcat > 2:5235840/1‑93 (MQ=255)
gTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcat > 1:7089986/1‑93 (MQ=255)
gTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcat > 1:2217766/1‑93 (MQ=255)
ttGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcatc < 1:6561341/93‑1 (MQ=255)
gAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAg < 2:7444524/93‑1 (MQ=255)
gAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAg > 1:1105787/1‑93 (MQ=255)
aGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGc > 2:5414595/1‑93 (MQ=255)
|
TTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGC > NC_000913/4363411‑4363590
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 208 total aligned reads displayed.
ATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGT > NC_000913/4363408‑4363593
|
ATGTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGG > SRR4302543.7946544/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGG > SRR4302543.1263102/1‑94 (MQ=60)
ATGTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGAATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGG > SRR4302543.4974588/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGT < SRR4302543.2876575/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGT < SRR4302543.1570483/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGT < SRR4302543.3911824/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTG < SRR4302543.1503320/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTG < SRR4302543.7318111/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGT < SRR4302543.5150473/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGT < SRR4302543.1567127/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTT < SRR4302543.3208543/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTT < SRR4302543.313716/94‑1 (MQ=60)
GTTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTTCTTTGTATGTGCTGGTGTTGAGGGTGTTG > SRR4302543.812563/1‑94 (MQ=60)
GGTGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTG < SRR4302543.2406570/94‑1 (MQ=60)
TGGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTC < SRR4302543.4356359/94‑1 (MQ=60)
GGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCG < SRR4302543.2500188/94‑1 (MQ=60)
GGAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCG < SRR4302543.2841582/94‑1 (MQ=60)
GAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGG < SRR4302543.5499775/94‑1 (MQ=60)
GAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGG > SRR4302543.5450495/1‑94 (MQ=60)
GAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGG < SRR4302543.3359767/94‑1 (MQ=60)
GAAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGG > SRR4302543.1335485/1‑94 (MQ=60)
AAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGT > SRR4302543.3656173/1‑94 (MQ=60)
AAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGT > SRR4302543.1767574/1‑94 (MQ=60)
AAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGT < SRR4302543.3743971/94‑1 (MQ=60)
AAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGT < SRR4302543.2789450/94‑1 (MQ=60)
AAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGT > SRR4302543.4443434/1‑94 (MQ=60)
AAACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGT < SRR4302543.7048787/94‑1 (MQ=60)
ACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTAT > SRR4302543.2931418/1‑94 (MQ=60)
ACGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTAT > SRR4302543.3403190/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATC > SRR4302543.1874857/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATC > SRR4302543.4436697/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATC > SRR4302543.4824777/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATC < SRR4302543.1481362/94‑1 (MQ=60)
GAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATTCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGAGTGTTGTCGGTATCG < SRR4302543.4932764/94‑1 (MQ=60)
GAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCG > SRR4302543.975676/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCG > SRR4302543.7925549/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCG > SRR4302543.2548851/1‑94 (MQ=60)
AAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGAC < SRR4302543.3955382/94‑1 (MQ=60)
AAGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGAC > SRR4302543.1318536/1‑94 (MQ=60)
AGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACT > SRR4302543.4666625/1‑94 (MQ=60)
AGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACT < SRR4302543.312207/94‑1 (MQ=60)
AGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACT > SRR4302543.5881636/1‑94 (MQ=60)
AGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACT > SRR4302543.3816487/1‑94 (MQ=60)
AGCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACT > SRR4302543.4666626/1‑94 (MQ=60)
acATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTT < SRR4302543.1865100/92‑1 (MQ=60)
GCATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTT < SRR4302543.1661013/94‑1 (MQ=60)
CATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTT < SRR4302543.7979605/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTA < SRR4302543.3321501/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTA < SRR4302543.5277486/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTA > SRR4302543.2255784/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTA > SRR4302543.7913163/1‑94 (MQ=60)
CGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACA > SRR4302543.4569695/1‑94 (MQ=60)
GCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAG < SRR4302543.1241715/94‑1 (MQ=60)
GCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAG < SRR4302543.4260774/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGA > SRR4302543.5209222/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGA > SRR4302543.4075648/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATGCCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAT < SRR4302543.4967907/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAT < SRR4302543.2204867/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAT < SRR4302543.3885539/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAT < SRR4302543.6139962/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAT > SRR4302543.2513114/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGAT < SRR4302543.1400400/94‑1 (MQ=60)
CAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATA < SRR4302543.6598471/94‑1 (MQ=60)
CAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATA < SRR4302543.1963728/94‑1 (MQ=60)
CAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATA > SRR4302543.5828184/1‑94 (MQ=60)
CGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAA < SRR4302543.3151467/94‑1 (MQ=60)
AGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAA > SRR4302543.4358595/1‑94 (MQ=60)
AGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAA > SRR4302543.6111049/1‑94 (MQ=60)
AGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAA > SRR4302543.1369770/1‑94 (MQ=60)
AGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAA > SRR4302543.6162333/1‑94 (MQ=60)
GCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAAC < SRR4302543.1514927/94‑1 (MQ=60)
GCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAAC < SRR4302543.4947808/94‑1 (MQ=60)
GCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAAC < SRR4302543.2113268/94‑1 (MQ=60)
GCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTGGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAAC < SRR4302543.3291327/94‑1 (MQ=60)
CCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACG > SRR4302543.5567249/1‑94 (MQ=60)
CACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGG < SRR4302543.6874214/94‑1 (MQ=60)
CACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGG > SRR4302543.927143/1‑94 (MQ=60)
CACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGG < SRR4302543.7940266/94‑1 (MQ=60)
CACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGG < SRR4302543.3378950/94‑1 (MQ=60)
CACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGG > SRR4302543.6550546/1‑94 (MQ=60)
ACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGT > SRR4302543.5844177/1‑94 (MQ=60)
CGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTG > SRR4302543.6904290/1‑94 (MQ=60)
CGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTG > SRR4302543.197496/1‑94 (MQ=60)
CGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTG < SRR4302543.4946141/94‑1 (MQ=60)
CGCAACACACAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTG < SRR4302543.5052133/94‑1 (MQ=60)
GCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGG > SRR4302543.1794878/1‑94 (MQ=60)
GCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGG > SRR4302543.109341/1‑94 (MQ=60)
AACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTC > SRR4302543.6891486/1‑94 (MQ=60)
AACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTC > SRR4302543.6654766/1‑94 (MQ=60)
AACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTC < SRR4302543.4240245/94‑1 (MQ=60)
ACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCA > SRR4302543.6083653/1‑94 (MQ=60)
CACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAG < SRR4302543.6082313/94‑1 (MQ=60)
CACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAG < SRR4302543.591243/94‑1 (MQ=60)
CACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAG > SRR4302543.5017554/1‑94 (MQ=60)
CACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGCGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAG < SRR4302543.6612559/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGA < SRR4302543.2592117/94‑1 (MQ=60)
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CCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAG < SRR4302543.1259813/94‑1 (MQ=60)
CCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAG < SRR4302543.6341248/94‑1 (MQ=60)
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CCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAG < SRR4302543.549079/94‑1 (MQ=60)
CCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGT > SRR4302543.1264205/1‑94 (MQ=60)
CCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGT < SRR4302543.4966320/94‑1 (MQ=60)
CAGGATACAAGTACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTT > SRR4302543.6990166/1‑94 (MQ=60)
CAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTT > SRR4302543.7376211/1‑94 (MQ=60)
AGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTG > SRR4302543.1465730/1‑94 (MQ=60)
GATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGGGGTCAGAGTTGCA > SRR4302543.1570489/1‑94 (MQ=60)
ATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAA > SRR4302543.5017158/1‑94 (MQ=60)
ATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAA > SRR4302543.676080/1‑94 (MQ=60)
TACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAAC < SRR4302543.1272849/94‑1 (MQ=60)
TACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAAC < SRR4302543.331819/94‑1 (MQ=60)
ACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGCGGTGAGGGCGTTGTCGTTATCGACTTTACAGACAACGGTGGacagccatgccacc > SRR4302543.7942473/1‑80 (MQ=60)
ACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACG < SRR4302543.671567/94‑1 (MQ=60)
ACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACG > SRR4302543.1093276/1‑94 (MQ=60)
CAGATACGGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGATGGTGTTGGTGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGC < SRR4302543.5429370/94‑1 (MQ=60)
CAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGC > SRR4302543.4679222/1‑94 (MQ=60)
AAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCT < SRR4302543.5217105/94‑1 (MQ=60)
ATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGA > SRR4302543.16135/1‑94 (MQ=60)
TACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAG > SRR4302543.653319/1‑94 (MQ=60)
AACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAG < SRR4302543.457496/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGC < SRR4302543.7978218/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGC < SRR4302543.7535868/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCAT < SRR4302543.4515899/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCAT < SRR4302543.3805399/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATG < SRR4302543.6855850/94‑1 (MQ=60)
CGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGAT > SRR4302543.2792694/1‑94 (MQ=60)
CGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGAT < SRR4302543.6764513/94‑1 (MQ=60)
GCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATG < SRR4302543.4162731/94‑1 (MQ=60)
GCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATG > SRR4302543.5263294/1‑94 (MQ=60)
TCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGAT < SRR4302543.4945453/94‑1 (MQ=60)
TCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGAT < SRR4302543.5146963/94‑1 (MQ=60)
TCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGAT < SRR4302543.1168183/94‑1 (MQ=60)
TCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGAT > SRR4302543.3415641/1‑94 (MQ=60)
CATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATC < SRR4302543.3845705/94‑1 (MQ=60)
CATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATC > SRR4302543.7216074/1‑94 (MQ=60)
ATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCG > SRR4302543.5300475/1‑94 (MQ=60)
ATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCA > SRR4302543.6345066/1‑94 (MQ=60)
ATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCA < SRR4302543.1547535/94‑1 (MQ=60)
ATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCA > SRR4302543.5933609/1‑94 (MQ=60)
TACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAG < SRR4302543.494169/94‑1 (MQ=60)
ACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGG > SRR4302543.2666168/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGG > SRR4302543.6309621/1‑94 (MQ=60)
ACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTATACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGG < SRR4302543.102839/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTTGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGA < SRR4302543.6824703/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGA > SRR4302543.7281365/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTGAGAGTTGTAACGCTGCGCATGATGATGAGGAT > SRR4302543.3099411/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT < SRR4302543.6300316/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT < SRR4302543.3191485/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT < SRR4302543.3191484/94‑1 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT > SRR4302543.7749984/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT > SRR4302543.633952/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT > SRR4302543.3099410/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAAAGGAGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAT > SRR4302543.5047959/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGCTT > SRR4302543.4716264/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATT < SRR4302543.2548699/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATT > SRR4302543.5866056/1‑94 (MQ=60)
GCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTG > SRR4302543.5077120/1‑94 (MQ=60)
CTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGC > SRR4302543.4772489/1‑94 (MQ=60)
TTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGT > SRR4302543.3983741/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTT > SRR4302543.4379761/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTT > SRR4302543.3255827/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTT > SRR4302543.4254879/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTG > SRR4302543.1896158/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTG > SRR4302543.4596044/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTG > SRR4302543.1803620/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTG > SRR4302543.3997198/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTG > SRR4302543.6290975/1‑94 (MQ=60)
AAGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGG < SRR4302543.4794525/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGT > SRR4302543.3023661/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGT > SRR4302543.309943/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTG > SRR4302543.6168777/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGG < SRR4302543.6434386/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGG < SRR4302543.7350920/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGT < SRR4302543.3854748/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGT > SRR4302543.6405968/1‑94 (MQ=60)
GCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTG < SRR4302543.1699337/94‑1 (MQ=60)
GCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTG > SRR4302543.675344/1‑94 (MQ=60)
GCTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTG > SRR4302543.7907403/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGT > SRR4302543.2428237/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGT < SRR4302543.6544455/94‑1 (MQ=60)
GAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCA < SRR4302543.5286183/94‑1 (MQ=60)
GAGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCA < SRR4302543.138876/94‑1 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT < SRR4302543.4267146/94‑1 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT < SRR4302543.6427899/94‑1 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT > SRR4302543.7327495/1‑94 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT > SRR4302543.7158836/1‑94 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT < SRR4302543.2408841/94‑1 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT < SRR4302543.3409570/94‑1 (MQ=60)
AGTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCAT > SRR4302543.2237772/1‑94 (MQ=60)
GTTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATC < SRR4302543.3462613/94‑1 (MQ=60)
TTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCA < SRR4302543.2578293/94‑1 (MQ=60)
TTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCA < SRR4302543.5452326/94‑1 (MQ=60)
TTGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCA < SRR4302543.6623079/94‑1 (MQ=60)
TGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAG > SRR4302543.5496157/1‑94 (MQ=60)
TGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAG > SRR4302543.1115759/1‑94 (MQ=60)
TGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAG > SRR4302543.2275764/1‑94 (MQ=60)
GAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGC > SRR4302543.7118270/1‑94 (MQ=60)
AGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCG > SRR4302543.3764261/1‑94 (MQ=60)
GGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGG > SRR4302543.7149636/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGT < SRR4302543.7671913/94‑1 (MQ=60)
|
ATGTTGTTGGAAACGAAAGTATCGCCCAGCCACGCAACACCCAGGATACAAATACAGGCGCTCATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGT > NC_000913/4363408‑4363593
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
