Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,381,510 |
T→C |
Y46H (TAC→CAC) |
yjeM → |
putative transport |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,381,510 | 0 | T | C | 100.0%
| 1387.7
/ NA
| 431 | Y46H (TAC→CAC) | yjeM | putative transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (183/248); total (183/248) |
Only 100 of 442 total aligned reads displayed.
CCTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATTACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGA > NC_000913/4381420‑4381599
|
ccTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCAc > 2:5681448/1‑93 (MQ=255)
tCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACtt > 2:2483592/1‑93 (MQ=255)
tCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACtt > 1:5024911/1‑93 (MQ=255)
cacGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAAt > 2:4384399/1‑93 (MQ=255)
acGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATg < 1:998442/93‑1 (MQ=255)
cGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATgg < 1:1560568/93‑1 (MQ=255)
aTAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGt > 1:3933907/1‑93 (MQ=255)
tAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGtt > 2:5073342/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTtat < 1:128736/93‑1 (MQ=255)
aaaaGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTtata < 1:3242169/93‑1 (MQ=255)
aaaGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAAGGGGTTATAg < 2:195439/93‑1 (MQ=255)
aGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTg < 2:1114395/93‑1 (MQ=255)
gATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGc > 2:2438390/1‑93 (MQ=255)
aaTGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGc < 1:5351616/92‑1 (MQ=255)
aTGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCg > 2:3224437/1‑93 (MQ=255)
ttattCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGa < 1:1231081/89‑1 (MQ=255)
gTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTc > 2:1264904/1‑93 (MQ=255)
gTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTc < 2:2857625/93‑1 (MQ=255)
tCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTcc < 2:1658622/93‑1 (MQ=255)
tCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTcc > 1:7055615/1‑93 (MQ=255)
cTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTccc > 1:3519997/1‑93 (MQ=255)
tGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCt > 2:7356071/1‑93 (MQ=255)
aTAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCttt < 1:412188/93‑1 (MQ=255)
aTAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCttt > 2:4009983/1‑93 (MQ=255)
aTAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCttt > 1:2779162/1‑93 (MQ=255)
tAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCtttt < 1:2168988/93‑1 (MQ=255)
aGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTta < 1:6198040/93‑1 (MQ=255)
ggACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtat > 2:5943567/1‑93 (MQ=255)
ggACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtat < 1:3054506/93‑1 (MQ=255)
gACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCTCTTTtata < 2:721814/93‑1 (MQ=255)
gACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtata < 1:3663958/93‑1 (MQ=255)
gACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtata > 2:2169350/1‑93 (MQ=255)
gACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtata < 1:445293/93‑1 (MQ=255)
aCTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtatat < 1:6858403/93‑1 (MQ=255)
cTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTtatata < 2:1549858/93‑1 (MQ=255)
tCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTatatat < 2:6984893/93‑1 (MQ=255)
tatTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATAtttt > 1:4395091/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATAtttt > 2:6950087/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATAtttt < 1:4716992/93‑1 (MQ=255)
tatTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATAtttt > 2:2660810/1‑93 (MQ=255)
tatTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATAtttt > 2:522828/1‑93 (MQ=255)
tgatgaTCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTg > 2:6332538/1‑93 (MQ=255)
gatgatCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGc > 1:5534479/1‑93 (MQ=255)
gtgatCTTTTCTTCCGTATTTGGATTTGCCAATTGCCCAACGGCTTAACACTTAATGGGTTATAGGGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGcc < 2:1431367/92‑2 (MQ=255)
atgatCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCa < 2:4634575/93‑1 (MQ=255)
atgatCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCa > 1:6505652/1‑93 (MQ=255)
tgatCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCAt < 1:4580129/93‑1 (MQ=255)
gatCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCAtt > 2:629974/1‑93 (MQ=255)
gatCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCAtt < 1:6096164/93‑1 (MQ=255)
atCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTg > 2:3063649/1‑93 (MQ=255)
atCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTg > 1:828065/1‑93 (MQ=255)
tCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGt < 1:6961081/93‑1 (MQ=255)
tCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGt > 2:3801552/1‑93 (MQ=255)
tCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGt < 1:1806800/93‑1 (MQ=255)
tCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGt < 2:6145399/93‑1 (MQ=255)
cTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGtt > 1:5585461/1‑93 (MQ=255)
cTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGtt > 2:4242100/1‑93 (MQ=255)
tttACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTa > 2:7832781/1‑93 (MQ=255)
tttACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTa < 1:3438596/93‑1 (MQ=255)
tttACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTa < 1:4838645/93‑1 (MQ=255)
ttACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTAt < 1:2330668/93‑1 (MQ=255)
tACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTAtt < 1:5750638/93‑1 (MQ=255)
tcTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTc < 1:5943416/92‑1 (MQ=255)
aCTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTAttt > 1:2510546/1‑92 (MQ=255)
aCTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTc < 1:7511096/93‑1 (MQ=255)
cTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCt > 1:2486895/1‑93 (MQ=255)
cTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCt < 1:3644843/93‑1 (MQ=255)
ttCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCtt > 2:2237122/1‑93 (MQ=255)
tCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCttt < 2:274127/93‑1 (MQ=255)
cGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTAt < 1:1028122/93‑1 (MQ=255)
gTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTAtt < 2:623090/93‑1 (MQ=255)
tATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTc > 2:3704623/1‑93 (MQ=255)
tATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTc < 2:6584082/93‑1 (MQ=255)
tATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTc > 2:4805273/1‑93 (MQ=255)
tATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTACGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTc < 2:7496964/93‑1 (MQ=255)
aTTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGG‑TATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCa > 1:2638890/1‑93 (MQ=255)
tttGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCa < 2:6725527/93‑1 (MQ=255)
tGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCAtt < 2:3375688/93‑1 (MQ=255)
tGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCAtt < 1:6568512/93‑1 (MQ=255)
ggATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTc < 2:1911064/93‑1 (MQ=255)
gATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCg > 1:7659242/1‑93 (MQ=255)
gATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCg > 1:1687957/1‑93 (MQ=255)
aTTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGATATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCTTTGTTATTCTTTATTCCATTCGc > 1:4076833/1‑93 (MQ=255)
ttGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCt < 2:5411845/93‑1 (MQ=255)
tGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCtt < 1:7820722/93‑1 (MQ=255)
gCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTa < 1:515509/93‑1 (MQ=255)
ccAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTaa < 1:6743066/93‑1 (MQ=255)
ccAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTaa < 2:7689358/93‑1 (MQ=255)
cAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAat < 2:3565690/93‑1 (MQ=255)
tAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAatgat < 1:6432836/93‑1 (MQ=255)
aGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAatgatg < 1:904914/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTg > 1:2973206/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGa > 1:7228769/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGaaa < 2:4875451/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGaaa < 1:3691676/93‑1 (MQ=255)
cGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGaaa < 2:4491891/93‑1 (MQ=255)
gCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATg < 2:6656533/93‑1 (MQ=255)
gCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATg < 2:6492751/93‑1 (MQ=255)
gCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATg < 1:976895/93‑1 (MQ=255)
tatcaCTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGa > 1:4217971/1‑93 (MQ=255)
|
CCTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATTACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGA > NC_000913/4381420‑4381599
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 241 total aligned reads displayed.
ATGCCTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATTACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGCTG > NC_000913/4381417‑4381603
|
ATGCCTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATC > SRR4302543.802130/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATC > SRR4302543.1287840/1‑94 (MQ=60)
CTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTT > SRR4302543.4163344/1‑94 (MQ=60)
CTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTT > SRR4302543.5871902/1‑94 (MQ=60)
CTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTT > SRR4302543.4649325/1‑94 (MQ=60)
CTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTT > SRR4302543.4649326/1‑94 (MQ=60)
CTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTT < SRR4302543.4858098/94‑1 (MQ=60)
CTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTT > SRR4302543.5070640/1‑94 (MQ=60)
ACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAAT < SRR4302543.3583191/94‑1 (MQ=60)
ACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAAT > SRR4302543.6162595/1‑94 (MQ=60)
CACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATG < SRR4302543.7658356/94‑1 (MQ=60)
CACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATG > SRR4302543.4527801/1‑94 (MQ=60)
ACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGG < SRR4302543.1007264/94‑1 (MQ=60)
ACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGG < SRR4302543.1551622/94‑1 (MQ=60)
CGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGG < SRR4302543.1574503/94‑1 (MQ=60)
CGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGG < SRR4302543.3035500/94‑1 (MQ=60)
GATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGT > SRR4302543.7258457/1‑94 (MQ=60)
GATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGT > SRR4302543.3968659/1‑94 (MQ=60)
GATAAAAAAGATAAGTCTGATAGGACTCATATTAATGATCTTTACTTCCGTATTTGGACTTGCCAATAGCCCAGCGCCTTATCACTTAATagta > SRR4302543.2499142/1‑90 (MQ=60)
TAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTA < SRR4302543.3305184/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTA < SRR4302543.3305186/94‑1 (MQ=60)
AAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTAT < SRR4302543.2513940/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATA > SRR4302543.7022632/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATA < SRR4302543.5851578/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATA < SRR4302543.129888/94‑1 (MQ=60)
AAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATA > SRR4302543.881867/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAG > SRR4302543.3795303/1‑94 (MQ=60)
AAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAG < SRR4302543.2222163/94‑1 (MQ=60)
AAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAG < SRR4302543.5357324/94‑1 (MQ=60)
AAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAG < SRR4302543.3271492/94‑1 (MQ=60)
AAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGT < SRR4302543.3004133/94‑1 (MQ=60)
AAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGT < SRR4302543.7851131/94‑1 (MQ=60)
AAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTG < SRR4302543.4145924/94‑1 (MQ=60)
AAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTG < SRR4302543.1790650/94‑1 (MQ=60)
AAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTG < SRR4302543.347387/94‑1 (MQ=60)
AGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGC > SRR4302543.3947045/1‑94 (MQ=60)
GATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCG < SRR4302543.6020422/94‑1 (MQ=60)
AATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCG < SRR4302543.5400050/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGA < SRR4302543.6106275/94‑1 (MQ=60)
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GAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATT < SRR4302543.1067973/94‑1 (MQ=60)
GAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATT < SRR4302543.1067972/94‑1 (MQ=60)
GAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATT < SRR4302543.6519428/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTC < SRR4302543.1973686/94‑1 (MQ=60)
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CTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCT < SRR4302543.4489499/94‑1 (MQ=60)
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ATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCT > SRR4302543.1283078/1‑94 (MQ=60)
ATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCT > SRR4302543.3615762/1‑94 (MQ=60)
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ACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCT > SRR4302543.2509424/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCT < SRR4302543.2669924/94‑1 (MQ=60)
CTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTT < SRR4302543.3676894/94‑1 (MQ=60)
TTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTT > SRR4302543.2984339/1‑94 (MQ=60)
TTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTT < SRR4302543.4417370/94‑1 (MQ=60)
TCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTA < SRR4302543.4770238/94‑1 (MQ=60)
CCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTAT > SRR4302543.6599294/1‑94 (MQ=60)
CCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTAT < SRR4302543.510642/94‑1 (MQ=60)
CCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTAT > SRR4302543.5596186/1‑94 (MQ=60)
CCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTAT > SRR4302543.5596187/1‑94 (MQ=60)
CGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATT < SRR4302543.1037231/94‑1 (MQ=60)
CGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATT > SRR4302543.6116034/1‑94 (MQ=60)
CGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATT > SRR4302543.848897/1‑94 (MQ=60)
CGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATT < SRR4302543.7843006/94‑1 (MQ=60)
GTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTC < SRR4302543.2582071/94‑1 (MQ=60)
GTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTC > SRR4302543.787089/1‑94 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCC < SRR4302543.7060670/94‑1 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCC > SRR4302543.5078721/1‑94 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCC < SRR4302543.653343/94‑1 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCC > SRR4302543.7427862/1‑94 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGG‑TATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCA > SRR4302543.2662789/1‑94 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAAGGGGTTATAGTGCGGTTCCCTTTGATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTGTTCC > SRR4302543.2662788/1‑94 (MQ=60)
TATTTGGATTTGCCAATAGCCCAGCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCC > SRR4302543.1418674/1‑94 (MQ=60)
ATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCA < SRR4302543.540740/94‑1 (MQ=60)
ATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCA < SRR4302543.267468/94‑1 (MQ=60)
TTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCAT < SRR4302543.4540220/94‑1 (MQ=60)
TTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATT < SRR4302543.1678263/94‑1 (MQ=60)
TGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTC < SRR4302543.6630345/94‑1 (MQ=60)
TGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTC < SRR4302543.309657/94‑1 (MQ=60)
GGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCG > SRR4302543.1703115/1‑94 (MQ=60)
GGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCG < SRR4302543.4053511/94‑1 (MQ=60)
GGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCG > SRR4302543.7028211/1‑94 (MQ=60)
GATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGATATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCTTTGTTATTCTTTATTCCATTCGC > SRR4302543.4113378/1‑94 (MQ=60)
TTGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTT > SRR4302543.911629/1‑94 (MQ=60)
TGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTA < SRR4302543.7894400/94‑1 (MQ=60)
TGCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTA < SRR4302543.6851765/94‑1 (MQ=60)
GCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAA < SRR4302543.4096054/94‑1 (MQ=60)
GCCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAA < SRR4302543.520299/94‑1 (MQ=60)
CCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAAT < SRR4302543.6806744/94‑1 (MQ=60)
CCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAAT > SRR4302543.7579688/1‑94 (MQ=60)
CCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAAT < SRR4302543.3547047/94‑1 (MQ=60)
CCAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAAT < SRR4302543.3547176/94‑1 (MQ=60)
CAATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATG < SRR4302543.959795/94‑1 (MQ=60)
AATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGA > SRR4302543.6526278/1‑94 (MQ=60)
AATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGA < SRR4302543.4958603/94‑1 (MQ=60)
ATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGAT < SRR4302543.98660/94‑1 (MQ=60)
ATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGAT < SRR4302543.2804986/94‑1 (MQ=60)
ATAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGAT < SRR4302543.6809526/94‑1 (MQ=60)
TAGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATG < SRR4302543.6493450/94‑1 (MQ=60)
AGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGG < SRR4302543.912883/94‑1 (MQ=60)
AGCCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGG > SRR4302543.667702/1‑94 (MQ=60)
CCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCT < SRR4302543.1212789/94‑1 (MQ=60)
CCCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCT < SRR4302543.6159080/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTG > SRR4302543.4458474/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTG < SRR4302543.2483800/94‑1 (MQ=60)
CCATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTG > SRR4302543.3694283/1‑94 (MQ=60)
CATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGA > SRR4302543.7298788/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAA > SRR4302543.7014830/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAA > SRR4302543.7014831/1‑94 (MQ=60)
CGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAAT < SRR4302543.3724115/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAAT < SRR4302543.3724119/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAAT < SRR4302543.4653230/94‑1 (MQ=60)
GGCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATG < SRR4302543.5412968/94‑1 (MQ=60)
GCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGG < SRR4302543.985513/94‑1 (MQ=60)
GCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGG < SRR4302543.6962592/94‑1 (MQ=60)
GCTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGG < SRR4302543.985514/94‑1 (MQ=60)
CTTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTGTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGG > SRR4302543.7101623/1‑94 (MQ=60)
CTGATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTGTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTGTATTCCATGCGCCCTAATGATGGCTGAAATGGG > SRR4302543.7109536/1‑94 (MQ=60)
TTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGA > SRR4302543.1547088/1‑94 (MQ=60)
TTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGA > SRR4302543.4256210/1‑94 (MQ=60)
TTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGA < SRR4302543.7627176/94‑1 (MQ=60)
TTATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGA > SRR4302543.2899665/1‑94 (MQ=60)
TATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAG > SRR4302543.4247199/1‑94 (MQ=60)
ATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGC > SRR4302543.1651148/1‑94 (MQ=60)
ATCACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGC > SRR4302543.678702/1‑94 (MQ=60)
CACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGCTG > SRR4302543.1849858/1‑94 (MQ=60)
CACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGCTG > SRR4302543.910590/1‑94 (MQ=60)
CACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGCTG > SRR4302543.6204763/1‑94 (MQ=60)
|
ATGCCTCACACGATAAAAAAGATGAGTCTGATAGGACTCATATTGATGATCTTTACTTCCGTATTTGGATTTGCCAATAGCCCATCGGCTTATTACTTAATGGGTTATAGTGCGATTCCCTTTTATATATTTTCTGCATTGTTATTCTTTATTCCATTCGCCTTAATGATGGCTGAAATGGGAGCTG > NC_000913/4381417‑4381603
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
