Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,162,333 |
A→G |
Y553H (TAT→CAT) |
parC ← |
DNA topoisomerase IV subunit A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,162,333 | 0 | A | G | 100.0%
| 468.5
/ NA
| 148 | Y553H (TAT→CAT) | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/116); total (32/116) |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
AACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCA > NC_000913/3162244‑3162422
|
aaCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCt < 1:1202075/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGCt > 2:1041946/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCCCGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGGATGGCTa > 2:3205424/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTa < 1:4111909/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCCGGCCCCGCTCCGACGGCGGCGCCATCGGGGCAATGGCATGGCTa > 2:2229609/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTAc < 1:1389043/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGa < 1:2939959/93‑1 (MQ=255)
gTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGa < 1:2783549/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGAc < 1:4458814/93‑1 (MQ=255)
cGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGACGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGAcc > 1:4430140/1‑93 (MQ=255)
gCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCCCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCCGAATCCGGTCCATTGCATGGCTACGGCCg > 2:205005/1‑93 (MQ=255)
ccccAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCgg < 1:2382304/93‑1 (MQ=255)
ccccAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGACGACGGCCGCGTCATCGGGGCAATGGCATGGCTACGAcacg > 1:28633/1‑90 (MQ=255)
cccATGCGCCAGCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGt < 1:2607591/93‑1 (MQ=255)
cccAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCggg > 1:1039838/1‑92 (MQ=255)
cAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCCGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATAGGGGCAATGGCACGGCTACGCCCGGTgg > 2:4363119/1‑93 (MQ=255)
gcggcAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAAt < 1:968601/93‑1 (MQ=255)
cggcAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATc < 1:1382938/93‑1 (MQ=255)
ggcAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACCGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGCCCCGGGGGATca > 1:4271012/1‑93 (MQ=255)
gcAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGCATcaa > 1:1668125/1‑93 (MQ=255)
gcAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCCCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGGATcca > 1:1509781/1‑91 (MQ=255)
cAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCGCGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATcaac < 1:2315927/93‑1 (MQ=255)
cAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCATCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATcaac < 1:2512530/93‑1 (MQ=255)
cAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATcaac > 2:4045279/1‑93 (MQ=255)
cAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGTTACGACCGGTGGTATcaaa > 2:2661940/1‑92 (MQ=255)
aaCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATcaaca < 2:3535189/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCCGTGGGATcaaca > 1:48697/1‑93 (MQ=255)
aCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGGATcaacaa > 1:4363133/1‑93 (MQ=255)
aCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACCACCGGGGGAATcaacaa > 2:2817263/1‑93 (MQ=255)
ttAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCaacaaaca < 1:3210969/93‑1 (MQ=255)
tAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAacac < 1:2623222/93‑1 (MQ=255)
tAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAacac < 2:1282196/93‑1 (MQ=255)
tAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAacac < 1:757326/93‑1 (MQ=255)
atgtGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTa < 1:1835932/90‑1 (MQ=255)
tttGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTAc < 2:4646438/93‑1 (MQ=255)
tttGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTAc < 1:1432840/93‑1 (MQ=255)
tttGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTAc < 2:1631244/93‑1 (MQ=255)
tttGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAAACGGGGCAATGGCATGGCTAAGAGCCGGGGGATCAACAAACACTAc > 2:2519458/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCg < 2:2374570/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGAGCTGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggt < 2:4076698/93‑1 (MQ=255)
ccGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGTCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggt < 1:1447447/93‑1 (MQ=255)
cGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggtt < 1:1914997/93‑1 (MQ=255)
gTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGGATCAACAAAAACTACCcgtttg > 2:1700921/1‑91 (MQ=255)
tGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttggt < 1:1099679/93‑1 (MQ=255)
tGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttggt < 2:1558313/93‑1 (MQ=255)
gAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCggttggtt > 1:3737029/1‑93 (MQ=255)
gCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGc < 1:4534034/93‑1 (MQ=255)
gCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGc < 1:4175421/93‑1 (MQ=255)
ggCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGctc > 2:3297303/1‑93 (MQ=255)
ggCTCGCCCGGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGctc < 2:2598156/93‑1 (MQ=255)
gCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGctct < 2:3935331/93‑1 (MQ=255)
gCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTAcc < 2:3895036/93‑1 (MQ=255)
gCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTAcc > 1:1275022/1‑93 (MQ=255)
ccTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCtt < 2:1919042/93‑1 (MQ=255)
ccTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGAAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCtt < 1:2449894/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCttt > 1:4578225/1‑93 (MQ=255)
cTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCttt > 2:4231370/1‑93 (MQ=255)
cTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCttt < 2:3065140/93‑1 (MQ=255)
gACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCa > 1:2296755/1‑93 (MQ=255)
gACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCa < 2:4201187/93‑1 (MQ=255)
aCCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAc < 2:3868612/93‑1 (MQ=255)
ccACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAcc < 2:3708448/93‑1 (MQ=255)
aCGCGCCGCCGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAccgc < 2:123558/93‑1 (MQ=255)
cgcCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACcgccgc < 2:2005973/93‑1 (MQ=255)
gcCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCt < 1:1721045/93‑1 (MQ=255)
ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt < 1:1999794/93‑1 (MQ=255)
ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt < 1:3332424/93‑1 (MQ=255)
ccGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCtt < 1:4205308/93‑1 (MQ=255)
cGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCttt < 1:778018/93‑1 (MQ=255)
cGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCttt < 2:4505471/93‑1 (MQ=255)
gACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTg > 2:1075572/1‑93 (MQ=255)
gACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTg < 2:2423430/93‑1 (MQ=255)
aCGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGa < 2:2493311/93‑1 (MQ=255)
aCGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGa < 2:575401/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGaa < 2:2306732/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGaa < 2:1932167/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAg > 1:2665342/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGc < 1:3498057/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGc < 2:189376/93‑1 (MQ=255)
gCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGc < 2:3556649/93‑1 (MQ=255)
aGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTa > 2:1165703/1‑93 (MQ=255)
aGCGTAATCGGGTCAAGGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTa < 1:986913/93‑1 (MQ=255)
gCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTAt < 2:1774321/93‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATc < 2:884458/93‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATc < 1:1086858/93‑1 (MQ=255)
tAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCAc > 1:3844850/1‑93 (MQ=255)
aaTCGGGTCAATGGCATGGCTACGATCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCAcc < 1:4527777/93‑1 (MQ=255)
ggTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCtt < 2:3818028/93‑1 (MQ=255)
gTCAATGTCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCttt < 2:2752490/93‑1 (MQ=255)
gTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCttt < 1:893867/93‑1 (MQ=255)
gTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCttt < 1:3592445/93‑1 (MQ=255)
tCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTta < 1:4601733/93‑1 (MQ=255)
tCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTta < 1:3354770/93‑1 (MQ=255)
tCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTta < 1:2388737/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTtata < 2:393398/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTtata < 2:2184554/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTtata > 1:1365362/1‑93 (MQ=255)
ggCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAAtt > 1:3984269/1‑93 (MQ=255)
cATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCa > 2:3732912/1‑93 (MQ=255)
cATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCa < 2:4419530/93‑1 (MQ=255)
|
AACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCA > NC_000913/3162244‑3162422
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC > NC_000913/3162240‑3162426
|
GGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATG < SRR4302535.3377834/94‑1 (MQ=60)
CAGCGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCT < SRR4302535.4626227/94‑1 (MQ=60)
CAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCCATGGCATGGCT > SRR4302535.264905/1‑94 (MQ=60)
AACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTA < SRR4302535.1210703/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTAC < SRR4302535.4140052/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACG < SRR4302535.449665/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACG < SRR4302535.1398957/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGAC < SRR4302535.2803356/94‑1 (MQ=60)
GTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGAC < SRR4302535.2960634/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACC < SRR4302535.4489394/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACC < SRR4302535.2564880/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACC < SRR4302535.1095549/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGACGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACC > SRR4302535.4460495/1‑94 (MQ=60)
GCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGACGACGGCCGCGTCATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACacg > SRR4302535.28856/1‑91 (MQ=60)
CCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGT < SRR4302535.1384751/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGT < SRR4302535.2399411/94‑1 (MQ=60)
CCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGG > SRR4302535.1047216/1‑94 (MQ=60)
CCCATGCGCCAGCGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTG < SRR4302535.2626300/94‑1 (MQ=60)
CCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCCGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCcgggg > SRR4302535.4186009/1‑89 (MQ=60)
CCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGG > SRR4302535.776789/1‑94 (MQ=60)
AGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACCGCAGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGAA > SRR4302535.4313833/1‑94 (MQ=60)
GCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGCCGGCAGCGGAATCGGGTCAAAGGCATGGCTACGACCGGGGGCATC > SRR4302535.389862/1‑94 (MQ=60)
GCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATC < SRR4302535.975483/94‑1 (MQ=60)
CGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCA < SRR4302535.1392802/94‑1 (MQ=60)
CGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACCGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGccccgggggatca > SRR4302535.4300249/1‑81 (MQ=60)
GGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGCATCAA > SRR4302535.1680196/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCCCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGggggatcca > SRR4302535.1520661/1‑85 (MQ=60)
GCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAAC < SRR4302535.2753642/94‑1 (MQ=60)
GCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGGATCAAC > SRR4302535.332540/1‑94 (MQ=60)
GCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCCGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGGATCAAC > SRR4302535.843119/1‑94 (MQ=60)
CAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCGCGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACA < SRR4302535.2332498/94‑1 (MQ=60)
CAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCCCGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACA > SRR4302535.1241204/1‑94 (MQ=60)
CAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCATCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACA < SRR4302535.2530643/94‑1 (MQ=60)
CAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCCGTGGGATCAACA > SRR4302535.49066/1‑94 (MQ=60)
AACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAA < SRR4302535.3632479/94‑1 (MQ=60)
AACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGGATCAACAA > SRR4302535.4392991/1‑94 (MQ=60)
GTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCCCGCGCCGACGGCCGCGTAATCGGGGCAATGGCATGGCTAGCACCGGTGGAATCAAaacaac > SRR4302535.3005613/1‑88 (MQ=60)
GTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACA < SRR4302535.1453337/94‑1 (MQ=60)
GTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACA < SRR4302535.3232386/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACAC < SRR4302535.4478880/94‑1 (MQ=60)
TTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACAC < SRR4302535.3233209/94‑1 (MQ=60)
TAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACT < SRR4302535.2642021/94‑1 (MQ=60)
TAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACT < SRR4302535.762655/94‑1 (MQ=60)
TAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGGCAATGGCATGGCTACGACCGGGGGGATCAACAAAaacc > SRR4302535.1737383/1‑90 (MQ=60)
AATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACCACCGGCGGAATCAACAAACAATA > SRR4302535.513163/1‑94 (MQ=60)
ATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAAAACTAC > SRR4302535.2398075/1‑94 (MQ=60)
ATGTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTAC < SRR4302535.1849175/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACC < SRR4302535.1443069/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACC < SRR4302535.1439080/94‑1 (MQ=60)
CCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGTCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTT < SRR4302535.1457797/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTG < SRR4302535.209235/94‑1 (MQ=60)
CGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTG < SRR4302535.1928796/94‑1 (MQ=60)
GGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATTAAAAAACACTACCGGTTGG > SRR4302535.4420830/1‑94 (MQ=60)
TGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTT < SRR4302535.1107534/94‑1 (MQ=60)
TGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTT > SRR4302535.3762893/1‑94 (MQ=60)
GAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTG < SRR4302535.2637121/94‑1 (MQ=60)
GAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTG < SRR4302535.2490332/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCT < SRR4302535.4565063/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCT < SRR4302535.4203998/94‑1 (MQ=60)
GCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTT < SRR4302535.2324843/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTA < SRR4302535.4588260/94‑1 (MQ=60)
TCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTAC < SRR4302535.2934212/94‑1 (MQ=60)
CGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACC > SRR4302535.1284127/1‑94 (MQ=60)
GCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCT < SRR4302535.1709245/94‑1 (MQ=60)
CCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTT > SRR4302535.4609413/1‑94 (MQ=60)
CCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGGAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGAAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTT < SRR4302535.2467549/94‑1 (MQ=60)
TGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCA > SRR4302535.2313194/1‑94 (MQ=60)
GACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCAC < SRR4302535.1256136/94‑1 (MQ=60)
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GACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCAGGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCCCCGCCGCTTTGA < SRR4302535.4418158/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAG > SRR4302535.2684426/1‑94 (MQ=60)
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AGCGTAATCGGGTCAAGGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTAT < SRR4302535.993926/94‑1 (MQ=60)
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CGTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCA < SRR4302535.1094584/94‑1 (MQ=60)
GTAATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCAC > SRR4302535.3871327/1‑94 (MQ=60)
AATCGGGTCAATGGCATGGCTACGATCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCC < SRR4302535.4558787/94‑1 (MQ=60)
AATCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCC < SRR4302535.1297894/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGC < SRR4302535.790509/94‑1 (MQ=60)
TCGGGTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGC < SRR4302535.4289687/94‑1 (MQ=60)
GTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTA < SRR4302535.981831/94‑1 (MQ=60)
GTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTA < SRR4302535.900204/94‑1 (MQ=60)
GTCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTA < SRR4302535.3617361/94‑1 (MQ=60)
TCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTAT < SRR4302535.4633029/94‑1 (MQ=60)
TCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTAT < SRR4302535.2405909/94‑1 (MQ=60)
TCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTAT < SRR4302535.3378131/94‑1 (MQ=60)
TCAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTAT < SRR4302535.4057331/94‑1 (MQ=60)
CAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATA > SRR4302535.4165387/1‑94 (MQ=60)
CAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATA < SRR4302535.3377808/94‑1 (MQ=60)
CAATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATA > SRR4302535.1375125/1‑94 (MQ=60)
AATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAA > SRR4302535.1191630/1‑94 (MQ=60)
ATGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAAT > SRR4302535.4407183/1‑94 (MQ=60)
TGGCATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATT > SRR4302535.4011493/1‑94 (MQ=60)
CATGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAG < SRR4302535.2413651/94‑1 (MQ=60)
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TGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGC > SRR4302535.2702267/1‑94 (MQ=60)
TGGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGC < SRR4302535.1431788/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACTCTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC < SRR4302535.3051600/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACGCTCCCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC < SRR4302535.1503779/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC > SRR4302535.645740/1‑94 (MQ=60)
GGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC > SRR4302535.224794/1‑94 (MQ=60)
GGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC < SRR4302535.4526953/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGACCGGTGAAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC < SRR4302535.1970378/94‑1 (MQ=60)
|
GGTCAACGGTCGCCCCAGGCGGCAACGTTAATTTGCCGGTGAGCGGCTCGCCCTGACCACGCGCCGACGGCAGCGTAATCGGGTCAATGGCATAGCTACGACCGGTGGAATCAACAAACACTACCGGTTGGTTGCTCTTACCTTTCACCGCCGCTTTGAAGCTATCACCCGCTTTATAATTCAGGCC > NC_000913/3162240‑3162426
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
