Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,787,906 |
A→G |
intergenic (‑198/+41) |
yibD ← / ← tdh |
putative regulator/threonine dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,787,906 | 0 | A | G | 99.2%
| 839.5
/ ‑3.4
| 264 | intergenic (‑198/+41) | yibD/tdh | putative regulator/threonine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (151/111); total (152/112) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.26e-01 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCG > NC_000913/3787816‑3787995
|
gagagaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTc < 2:4061848/93‑1 (MQ=255)
gagaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAg > 2:1387920/1‑93 (MQ=255)
gagaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAg > 1:2434925/1‑93 (MQ=255)
gagaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAg > 1:2901607/1‑93 (MQ=255)
agaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGa < 1:3999161/93‑1 (MQ=255)
agaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGa > 1:1578659/1‑93 (MQ=255)
agaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGa < 1:2522816/93‑1 (MQ=255)
gaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGAt > 2:81640/1‑93 (MQ=255)
gaTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGAt < 2:4191389/93‑1 (MQ=255)
aTAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATa < 1:4301855/93‑1 (MQ=255)
tAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATaa > 2:411094/1‑93 (MQ=255)
aTGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATaaaa > 2:3260889/1‑93 (MQ=255)
aTGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATaaaa > 1:759289/1‑93 (MQ=255)
aTGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATaaaa < 1:948686/93‑1 (MQ=255)
aTGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATaaaa > 2:4363575/1‑93 (MQ=255)
gagaGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAGCTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAgg < 2:3536962/93‑1 (MQ=255)
gagaGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAgg < 2:38778/93‑1 (MQ=255)
agagCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAggg < 2:1148686/93‑1 (MQ=255)
agagCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAggg < 1:4416337/93‑1 (MQ=255)
gcagcTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTg > 2:2271262/1‑93 (MQ=255)
gcagcTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTAAACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAATGCTg > 2:3165995/1‑93 (MQ=255)
cagcTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTgg > 1:2769003/1‑93 (MQ=255)
gcTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGaa > 1:172037/1‑93 (MQ=255)
cTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAAt > 2:945847/1‑93 (MQ=255)
cTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAAt < 2:2397885/93‑1 (MQ=255)
tatataAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATa > 2:1474946/1‑93 (MQ=255)
tatataAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATa < 1:1337497/93‑1 (MQ=255)
atataAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATAc < 1:4078395/93‑1 (MQ=255)
ataAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCa < 2:2082073/93‑1 (MQ=255)
taAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAg > 2:1031082/1‑93 (MQ=255)
aaGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGc < 1:4671692/93‑1 (MQ=255)
agagATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGcc < 2:1937719/93‑1 (MQ=255)
agagATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGcc > 1:742436/1‑93 (MQ=255)
agagATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGcc > 1:4498690/1‑93 (MQ=255)
gaTCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCtt > 1:572632/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCACAATTACGAACTCTTTATTAGACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATAGCAGCCCTTg > 1:1846342/1‑93 (MQ=255)
aTCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTg > 2:1085177/1‑93 (MQ=255)
tCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGt > 2:477496/1‑93 (MQ=255)
tCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGt < 1:818559/93‑1 (MQ=255)
aGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTc < 2:1313556/93‑1 (MQ=255)
aGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTc < 1:3391007/93‑1 (MQ=255)
aGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTc > 1:2071256/1‑93 (MQ=255)
aGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTc < 2:258962/93‑1 (MQ=255)
acaATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCgtg > 2:2326798/1‑93 (MQ=255)
aaTTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGtt > 1:4202256/1‑93 (MQ=255)
aTTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTa > 2:3618899/1‑93 (MQ=255)
ttACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTaa > 1:222549/1‑93 (MQ=255)
aCGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATc < 1:4539646/93‑1 (MQ=255)
aCGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATc < 1:3187476/93‑1 (MQ=255)
aCGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATc > 1:2925057/1‑93 (MQ=255)
cGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATcc > 2:157369/1‑93 (MQ=255)
gAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATccc < 1:1544629/93‑1 (MQ=255)
aaCTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCa < 2:3253707/93‑1 (MQ=255)
aaCTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCa < 2:4472504/93‑1 (MQ=255)
aCTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAg > 1:2650145/1‑93 (MQ=255)
aCTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAg > 1:724800/1‑93 (MQ=255)
ctctTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGc > 1:4522173/1‑93 (MQ=255)
tctTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCt > 2:3010085/1‑93 (MQ=255)
tctTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCt < 2:2220644/93‑1 (MQ=255)
ctTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTc > 1:3455190/1‑93 (MQ=255)
tttATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCa < 2:1982459/93‑1 (MQ=255)
ttattaCACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAg < 2:1282963/93‑1 (MQ=255)
attaCACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGaa > 2:2748798/1‑93 (MQ=255)
attaCACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGaa < 2:2655660/93‑1 (MQ=255)
ttaCACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAAt > 1:2982612/1‑93 (MQ=255)
acacTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATaa < 1:1017974/93‑1 (MQ=255)
acacTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATaa < 2:2366990/93‑1 (MQ=255)
cacTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAAc > 1:4483803/1‑93 (MQ=255)
acTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACt > 2:1799777/1‑93 (MQ=255)
cTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACtt > 1:3952038/1‑93 (MQ=255)
cTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGGTAATCCCAGCTCAGGATAACtt > 2:761875/1‑93 (MQ=255)
tGACTGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCGCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACttt < 2:4266927/93‑1 (MQ=255)
cAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTccc > 1:2299712/1‑93 (MQ=255)
cAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTccc < 1:1650012/93‑1 (MQ=255)
aGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCg > 1:277790/1‑93 (MQ=255)
ggATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCgg > 2:3416868/1‑93 (MQ=255)
gATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGa > 2:3088040/1‑93 (MQ=255)
aTTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGAc > 1:3243632/1‑93 (MQ=255)
aTTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGAc < 1:2734692/93‑1 (MQ=255)
aTTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGAc < 2:282108/93‑1 (MQ=255)
gtttACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACt > 2:4502900/2‑93 (MQ=255)
tttACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTg < 1:3255724/93‑1 (MQ=255)
tACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGc > 1:692920/1‑93 (MQ=255)
aCATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGcc < 2:2361156/93‑1 (MQ=255)
cATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGccc < 1:85186/93‑1 (MQ=255)
tatTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGa > 2:1736414/1‑93 (MQ=255)
tttAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAAc > 1:3936595/1‑93 (MQ=255)
ttAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGaaag > 1:1912347/1‑91 (MQ=255)
aCAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTCATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCAt < 1:3295723/93‑1 (MQ=255)
aCAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCAt > 2:2908736/1‑93 (MQ=255)
cAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATa > 1:620390/1‑93 (MQ=255)
aGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAg < 1:3618575/93‑1 (MQ=255)
aGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAg < 1:3536190/93‑1 (MQ=255)
aGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAg < 1:1400284/93‑1 (MQ=255)
aGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAg < 1:1171420/93‑1 (MQ=255)
gATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGc > 2:4354202/1‑93 (MQ=255)
gATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGc > 1:533299/1‑93 (MQ=255)
gATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGc < 1:3617591/93‑1 (MQ=255)
aTTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCg > 2:2826008/1‑93 (MQ=255)
aTTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCg < 2:2182713/93‑1 (MQ=255)
|
GTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCG > NC_000913/3787816‑3787995
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAA > NC_000913/3787813‑3787999
|
AGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTG < SRR4302535.4039425/94‑1 (MQ=60)
AGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTG > SRR4302535.1929737/1‑94 (MQ=60)
GGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTC < SRR4302535.2775651/94‑1 (MQ=60)
GGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTC < SRR4302535.606093/94‑1 (MQ=60)
GTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCC < SRR4302535.2392128/94‑1 (MQ=60)
GTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCC < SRR4302535.4536462/94‑1 (MQ=60)
GTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCC > SRR4302535.510411/1‑94 (MQ=60)
GAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCA > SRR4302535.558151/1‑94 (MQ=60)
GAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGGCCTCA < SRR4302535.3291636/94‑1 (MQ=60)
AGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAG > SRR4302535.98936/1‑94 (MQ=60)
AGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAG > SRR4302535.2922118/1‑94 (MQ=60)
AGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAG > SRR4302535.2971152/1‑94 (MQ=60)
AGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAG > SRR4302535.2452464/1‑94 (MQ=60)
AGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAG < SRR4302535.1914745/94‑1 (MQ=60)
AGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAG > SRR4302535.1688599/1‑94 (MQ=60)
GAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGA > SRR4302535.1590056/1‑94 (MQ=60)
GAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGA < SRR4302535.3970048/94‑1 (MQ=60)
AGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGAT < SRR4302535.4026522/94‑1 (MQ=60)
AGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGAT < SRR4302535.2322675/94‑1 (MQ=60)
AGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGAT < SRR4302535.2540994/94‑1 (MQ=60)
GATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATA > SRR4302535.277528/1‑94 (MQ=60)
ATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAA > SRR4302535.4375738/1‑94 (MQ=60)
ATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAA < SRR4302535.4331286/94‑1 (MQ=60)
AATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAA > SRR4302535.764639/1‑94 (MQ=60)
ATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAG < SRR4302535.955407/94‑1 (MQ=60)
ATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAG < SRR4302535.828752/94‑1 (MQ=60)
ATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAG < SRR4302535.1559154/94‑1 (MQ=60)
TGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGG > SRR4302535.4209943/1‑94 (MQ=60)
GAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGG < SRR4302535.1482880/94‑1 (MQ=60)
AGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGC > SRR4302535.4305828/1‑94 (MQ=60)
AGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGC > SRR4302535.622639/1‑94 (MQ=60)
AGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGC < SRR4302535.4446567/94‑1 (MQ=60)
GAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCT < SRR4302535.2479196/94‑1 (MQ=60)
GAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCT < SRR4302535.1574811/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTG > SRR4302535.78577/1‑94 (MQ=60)
AGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTG < SRR4302535.4524418/94‑1 (MQ=60)
AGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTG < SRR4302535.548566/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGG > SRR4302535.2788721/1‑94 (MQ=60)
GCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGA > SRR4302535.3568375/1‑94 (MQ=60)
CAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGA > SRR4302535.3258848/1‑94 (MQ=60)
AGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAA > SRR4302535.173231/1‑94 (MQ=60)
CCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAAT < SRR4302535.2926/94‑1 (MQ=60)
CTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATA < SRR4302535.758821/94‑1 (MQ=60)
CTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATA > SRR4302535.2167758/1‑94 (MQ=60)
TATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATAC > SRR4302535.4035034/1‑94 (MQ=60)
TATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATAC < SRR4302535.1347040/94‑1 (MQ=60)
ATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACC < SRR4302535.4106300/94‑1 (MQ=60)
TATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCA < SRR4302535.3416198/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCC > SRR4302535.747650/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCC < SRR4302535.4703244/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCC > SRR4302535.4529578/1‑94 (MQ=60)
GAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCT < SRR4302535.702727/94‑1 (MQ=60)
GAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCT < SRR4302535.4712839/94‑1 (MQ=60)
AGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTT > SRR4302535.1183469/1‑94 (MQ=60)
AGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTT > SRR4302535.4149464/1‑94 (MQ=60)
AGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTT > SRR4302535.576653/1‑94 (MQ=60)
GATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTAGACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATAGCAGCCCTTG > SRR4302535.1859649/1‑94 (MQ=60)
TCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTT < SRR4302535.824304/94‑1 (MQ=60)
CAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTC > SRR4302535.2086183/1‑94 (MQ=60)
CAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTC < SRR4302535.737816/94‑1 (MQ=60)
AGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCG < SRR4302535.3414598/94‑1 (MQ=60)
AGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCACTTGTTCG > SRR4302535.4460332/1‑94 (MQ=60)
GCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGT < SRR4302535.4013546/94‑1 (MQ=60)
CACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTG < SRR4302535.760787/94‑1 (MQ=60)
CACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTG > SRR4302535.1083523/1‑94 (MQ=60)
ACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGT > SRR4302535.699729/1‑94 (MQ=60)
CAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTT > SRR4302535.4231007/1‑94 (MQ=60)
AATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTNACATATTTAACAGANTGNCCTCAGNTAAAAGGNCTnnnntnccnncccnngnnnnnnnna > SRR4302535.4236748/1‑69 (MQ=60)
ATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAA > SRR4302535.2191875/1‑94 (MQ=60)
ATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAA > SRR4302535.224080/1‑94 (MQ=60)
ATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAA > SRR4302535.2734053/1‑94 (MQ=60)
TTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAAT > SRR4302535.2673376/1‑94 (MQ=60)
TACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATC > SRR4302535.2945679/1‑94 (MQ=60)
ACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCC < SRR4302535.4570696/94‑1 (MQ=60)
ACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCC < SRR4302535.3209519/94‑1 (MQ=60)
CGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCAC > SRR4302535.876311/1‑94 (MQ=60)
GAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCA < SRR4302535.1555755/94‑1 (MQ=60)
AACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAG > SRR4302535.2669120/1‑94 (MQ=60)
AACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAG > SRR4302535.729884/1‑94 (MQ=60)
ACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGC > SRR4302535.4553161/1‑94 (MQ=60)
TCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTC < SRR4302535.686415/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTC > SRR4302535.3479206/1‑94 (MQ=60)
CTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCA > SRR4302535.322029/1‑94 (MQ=60)
CTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCA > SRR4302535.407330/1‑94 (MQ=60)
TTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAG < SRR4302535.3325798/94‑1 (MQ=60)
TTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAG < SRR4302535.1390077/94‑1 (MQ=60)
TATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAA < SRR4302535.1762350/94‑1 (MQ=60)
ATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAAT > SRR4302535.3003533/1‑94 (MQ=60)
ATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAAAAT < SRR4302535.3542938/94‑1 (MQ=60)
TTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATA < SRR4302535.161669/94‑1 (MQ=60)
ACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAAC < SRR4302535.2546188/94‑1 (MQ=60)
ACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAAC > SRR4302535.4514581/1‑94 (MQ=60)
ACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAAC > SRR4302535.3114969/1‑94 (MQ=60)
ACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAAC < SRR4302535.1025209/94‑1 (MQ=60)
ACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAAC < SRR4302535.1413144/94‑1 (MQ=60)
CACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACT < SRR4302535.279533/94‑1 (MQ=60)
ACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTT > SRR4302535.3979020/1‑94 (MQ=60)
ACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTT > SRR4302535.3590464/1‑94 (MQ=60)
CTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTT > SRR4302535.2079576/1‑94 (MQ=60)
ACAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCC > SRR4302535.2316166/1‑94 (MQ=60)
CAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCG > SRR4302535.3378858/1‑94 (MQ=60)
CAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCG > SRR4302535.3273523/1‑94 (MQ=60)
CAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCG > SRR4302535.279728/1‑94 (MQ=60)
CAGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCG < SRR4302535.1661943/94‑1 (MQ=60)
AGGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGG > SRR4302535.1346943/1‑94 (MQ=60)
GGATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGA > SRR4302535.2934225/1‑94 (MQ=60)
GATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGAC > SRR4302535.3266164/1‑94 (MQ=60)
GATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGAC < SRR4302535.3297933/94‑1 (MQ=60)
GATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGAC > SRR4302535.4535699/1‑94 (MQ=60)
ATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACT > SRR4302535.677049/1‑94 (MQ=60)
ATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACT > SRR4302535.4568618/1‑94 (MQ=60)
ATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACT < SRR4302535.2924794/94‑1 (MQ=60)
ATTTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACT < SRR4302535.2754204/94‑1 (MQ=60)
ATTTTACATATTGAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACT < SRR4302535.3171185/94‑1 (MQ=60)
TTTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGG < SRR4302535.3278344/94‑1 (MQ=60)
TTACATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGC > SRR4302535.697776/1‑94 (MQ=60)
CATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCG < SRR4302535.85786/94‑1 (MQ=60)
CATATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCG > SRR4302535.4434177/1‑94 (MQ=60)
TATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAA > SRR4302535.4569827/1‑94 (MQ=60)
TATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAA < SRR4302535.4624205/94‑1 (MQ=60)
ATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAAC < SRR4302535.2772434/94‑1 (MQ=60)
ATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAAC > SRR4302535.871154/1‑94 (MQ=60)
ATTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAAC > SRR4302535.3963447/1‑94 (MQ=60)
TTTAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAAAG > SRR4302535.1926128/1‑94 (MQ=60)
TAACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCA > SRR4302535.2061370/1‑94 (MQ=60)
AACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCAT > SRR4302535.3824823/1‑94 (MQ=60)
AACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCAT > SRR4302535.2911345/1‑94 (MQ=60)
ACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTCATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATA < SRR4302535.3318638/94‑1 (MQ=60)
ACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATA > SRR4302535.624703/1‑94 (MQ=60)
ACAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATA > SRR4302535.3515697/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTCCTCAGATAATAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGTCCGTACGCATAG > SRR4302535.2514557/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAG < SRR4302535.397026/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC > SRR4302535.537032/1‑94 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC < SRR4302535.1179783/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC < SRR4302535.3560737/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC < SRR4302535.3643660/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC < SRR4302535.3643661/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC < SRR4302535.1410280/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGC < SRR4302535.1736548/94‑1 (MQ=60)
AGATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCAGAGC > SRR4302535.1691309/1‑94 (MQ=60)
GATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCG < SRR4302535.3642671/94‑1 (MQ=60)
GATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCG > SRR4302535.4452135/1‑94 (MQ=60)
GATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCG > SRR4302535.2304516/1‑94 (MQ=60)
GATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCG < SRR4302535.798058/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGT < SRR4302535.3728234/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGT > SRR4302535.1086640/1‑94 (MQ=60)
TGTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCA < SRR4302535.899022/94‑1 (MQ=60)
GTCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAA > SRR4302535.127089/1‑94 (MQ=60)
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AGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAA > NC_000913/3787813‑3787999
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
