Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,804,224 |
A→G |
T157T (ACT→ACC) |
rfaG ← |
glucosyltransferase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,804,224 | 0 | A | G | 100.0%
| 512.8
/ NA
| 164 | T157T (ACT→ACC) | rfaG | glucosyltransferase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (89/75); total (89/75) |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTC > NC_000913/3804134‑3804313
|
gCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGt < 1:424134/93‑1 (MQ=255)
gCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGt < 1:100027/93‑1 (MQ=255)
gATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGttt > 1:4033908/1‑93 (MQ=255)
gATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGttt > 1:275852/1‑93 (MQ=255)
aTAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTg > 1:2465825/1‑93 (MQ=255)
aTAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTg > 1:2161159/1‑93 (MQ=255)
tAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGa > 2:1034227/1‑93 (MQ=255)
tAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAAAGTTCAGGTTCGGTTTGa < 1:336344/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATa > 2:2948252/1‑93 (MQ=255)
aTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATaa < 1:4540099/93‑1 (MQ=255)
aTTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATaa > 2:1668988/1‑93 (MQ=255)
tttCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAt > 1:4224995/1‑93 (MQ=255)
tCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGc > 2:2609265/1‑93 (MQ=255)
tCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGc < 2:1745959/93‑1 (MQ=255)
cACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCt < 1:2031540/93‑1 (MQ=255)
cACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCt < 2:4008452/93‑1 (MQ=255)
cGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTc < 1:3236210/93‑1 (MQ=255)
ggCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCt < 1:4441466/93‑1 (MQ=255)
ggCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCt > 1:3380227/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCt < 2:701052/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTg > 1:1635534/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTg > 2:1892432/1‑93 (MQ=255)
cTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTgg > 2:4685066/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGa > 2:4206582/1‑93 (MQ=255)
tGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGa > 1:1434927/1‑93 (MQ=255)
ttGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAAt < 2:3065047/93‑1 (MQ=255)
tGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATc < 2:4650450/93‑1 (MQ=255)
aTTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCg > 2:4332771/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGa > 1:2370607/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGa > 1:530888/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGa > 1:4251454/1‑93 (MQ=255)
gCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGAttt > 2:554488/1‑93 (MQ=255)
cTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTg < 2:966763/93‑1 (MQ=255)
tCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGc > 1:63613/1‑93 (MQ=255)
aCTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCtt > 1:3569481/1‑93 (MQ=255)
aCTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCtt > 2:2034666/1‑93 (MQ=255)
cTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTa > 1:3996426/1‑93 (MQ=255)
tGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAt > 1:4074000/1‑93 (MQ=255)
tGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAt < 2:1369496/93‑1 (MQ=255)
gTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATc < 2:368320/93‑1 (MQ=255)
gTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATc < 2:1215283/93‑1 (MQ=255)
gTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATc < 2:1863434/93‑1 (MQ=255)
aTTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCgg > 2:388228/1‑93 (MQ=255)
cTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGc > 2:436245/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGca > 2:4252871/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGca > 1:4148288/1‑93 (MQ=255)
tGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGATCAGGTTCGGCTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGAATTGCTTATCGGTCAGca > 2:3317374/1‑93 (MQ=255)
tCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatc < 2:187076/93‑1 (MQ=255)
ccGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatca < 1:2996186/93‑1 (MQ=255)
ccGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatca < 1:1649206/93‑1 (MQ=255)
cGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatcat > 1:2543870/1‑93 (MQ=255)
cGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGcatcat < 2:4658343/93‑1 (MQ=255)
ggATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATa > 1:2789720/1‑93 (MQ=255)
ggATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATa < 1:3547384/93‑1 (MQ=255)
ggATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATa > 2:2998318/1‑93 (MQ=255)
ggATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATa < 2:850619/93‑1 (MQ=255)
aTAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAg > 2:3590565/1‑93 (MQ=255)
tAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGt < 2:1705478/93‑1 (MQ=255)
aaTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGttt > 1:2138688/1‑93 (MQ=255)
aTACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtc > 1:1419441/1‑93 (MQ=255)
tACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcg > 1:771751/1‑93 (MQ=255)
aCCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgt < 2:3579077/93‑1 (MQ=255)
aCCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgt < 2:432178/93‑1 (MQ=255)
ccGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgtc < 1:2682035/93‑1 (MQ=255)
cGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgtcg > 2:3458471/1‑93 (MQ=255)
cGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTtcgtcg > 2:2788761/1‑93 (MQ=255)
gaggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAtt < 1:3067599/93‑1 (MQ=255)
gaggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGAtt < 1:1254226/93‑1 (MQ=255)
ggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTa > 2:4389728/1‑93 (MQ=255)
ggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTa > 2:1265452/1‑93 (MQ=255)
ggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTa < 1:2296734/93‑1 (MQ=255)
ggaAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTa > 2:1355715/1‑93 (MQ=255)
gaagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAc > 1:4323607/1‑93 (MQ=255)
gaagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAc > 1:6436/1‑93 (MQ=255)
gaagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAc > 2:1534860/1‑93 (MQ=255)
gaagaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAc > 1:743439/1‑93 (MQ=255)
agaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAccc < 1:4040245/93‑1 (MQ=255)
gaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCt > 1:1348733/1‑93 (MQ=255)
aaaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCt < 1:107190/92‑1 (MQ=255)
aaTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTg > 2:1306666/1‑93 (MQ=255)
aTTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGc < 2:3857541/93‑1 (MQ=255)
tttGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCt > 1:1858397/1‑93 (MQ=255)
gAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGa < 2:1582318/93‑1 (MQ=255)
gAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGa < 2:2323171/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGaaa < 2:2465825/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGaaa > 1:1739194/1‑93 (MQ=255)
aaaCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGaaa < 1:2192135/93‑1 (MQ=255)
aaaCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGaaa > 1:2411465/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAg < 1:3767943/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGt < 2:4342818/93‑1 (MQ=255)
aCGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGt > 2:4133694/1‑93 (MQ=255)
cGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtc < 2:298924/93‑1 (MQ=255)
gttcaggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcg > 2:1524367/1‑93 (MQ=255)
caggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcgctc < 1:1139155/93‑1 (MQ=255)
caggttcggTTTAATAATGCTTCTGGAAATCTGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcgctc < 2:3595502/93‑1 (MQ=255)
ggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcgctcgc > 2:4589578/1‑93 (MQ=255)
ggttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGtcgctcgc > 1:2202940/1‑93 (MQ=255)
gttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTcgctcgct > 2:2915717/1‑93 (MQ=255)
ttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCgctcgctc < 2:2421570/93‑1 (MQ=255)
ttcggTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCgctcgctc > 2:1481484/1‑93 (MQ=255)
|
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTC > NC_000913/3804134‑3804313
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT > NC_000913/3804131‑3804317
|
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCG > SRR4302535.2945219/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCG > SRR4302535.580039/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGG > SRR4302535.558869/1‑94 (MQ=60)
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTT < SRR4302535.100731/94‑1 (MQ=60)
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTT > SRR4302535.2633032/1‑94 (MQ=60)
GCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTT < SRR4302535.427093/94‑1 (MQ=60)
CGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTT > SRR4302535.4061522/1‑94 (MQ=60)
CGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTT > SRR4302535.277775/1‑94 (MQ=60)
GATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTG > SRR4302535.2483602/1‑94 (MQ=60)
GATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTG > SRR4302535.2176673/1‑94 (MQ=60)
GATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTG > SRR4302535.1652124/1‑94 (MQ=60)
TAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAAAGTTCAGGTTCGGTTTGAT < SRR4302535.338670/94‑1 (MQ=60)
AAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATA > SRR4302535.1553902/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAT > SRR4302535.2258086/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAT > SRR4302535.4253903/1‑94 (MQ=60)
ATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAAT < SRR4302535.4571152/94‑1 (MQ=60)
TCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCT < SRR4302535.2203565/94‑1 (MQ=60)
CACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTT < SRR4302535.2046180/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCT < SRR4302535.3258674/94‑1 (MQ=60)
CGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCT > SRR4302535.3403728/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATGCCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG < SRR4302535.1362158/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG > SRR4302535.3468237/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG < SRR4302535.4471918/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG > SRR4302535.770861/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG < SRR4302535.4471919/94‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG > SRR4302535.1647351/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGACCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTG < SRR4302535.4719239/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA > SRR4302535.1809028/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA > SRR4302535.41034/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA < SRR4302535.1337074/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA > SRR4302535.2406956/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA > SRR4302535.221500/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGA > SRR4302535.1445176/1‑94 (MQ=60)
TGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAA > SRR4302535.831732/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCG < SRR4302535.4259519/94‑1 (MQ=60)
ATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGA > SRR4302535.2387627/1‑94 (MQ=60)
ATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGA > SRR4302535.534603/1‑94 (MQ=60)
ATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGA > SRR4302535.4280582/1‑94 (MQ=60)
TTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATT < SRR4302535.1683672/94‑1 (MQ=60)
CTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGC > SRR4302535.64092/1‑94 (MQ=60)
CACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTT > SRR4302535.3594236/1‑94 (MQ=60)
ACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTA > SRR4302535.4023769/1‑94 (MQ=60)
CTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAT > SRR4302535.4101875/1‑94 (MQ=60)
CTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAT < SRR4302535.3139397/94‑1 (MQ=60)
CTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTAT > SRR4302535.632181/1‑94 (MQ=60)
GTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCG > SRR4302535.1145164/1‑94 (MQ=60)
TTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAG > SRR4302535.3033727/1‑94 (MQ=60)
CTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCA > SRR4302535.4176689/1‑94 (MQ=60)
TCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCA < SRR4302535.2727888/94‑1 (MQ=60)
CCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTTCTTATCGGTCAGCTTCAT > SRR4302535.4050842/1‑94 (MQ=60)
CCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCAT < SRR4302535.1661135/94‑1 (MQ=60)
CCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCAT > SRR4302535.1148167/1‑94 (MQ=60)
CCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCAT < SRR4302535.3017192/94‑1 (MQ=60)
CCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCAT > SRR4302535.2562188/1‑94 (MQ=60)
CGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATA > SRR4302535.2809575/1‑94 (MQ=60)
CGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGC‑TATCGGTCAGCATCATAA > SRR4302535.36657/1‑94 (MQ=60)
GGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAA < SRR4302535.3572011/94‑1 (MQ=60)
GGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAA > SRR4302535.4413908/1‑94 (MQ=60)
AAAATGCCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGAGATTTGCTTATCGGCCAGCATCATAAGTT < SRR4302535.945271/94‑1 (MQ=60)
AAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATCAGTTT > SRR4302535.2154091/1‑94 (MQ=60)
AAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTT > SRR4302535.2154090/1‑94 (MQ=60)
AATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTC > SRR4302535.1429578/1‑94 (MQ=60)
ATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCG > SRR4302535.777183/1‑94 (MQ=60)
CCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCG < SRR4302535.2701220/94‑1 (MQ=60)
GATGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTT < SRR4302535.4125344/94‑1 (MQ=60)
GAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTT < SRR4302535.3089031/94‑1 (MQ=60)
GAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTT < SRR4302535.1263197/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAC > SRR4302535.748656/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAC > SRR4302535.6490/1‑94 (MQ=60)
GGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAC < SRR4302535.2313173/94‑1 (MQ=60)
GGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTAC > SRR4302535.4353182/1‑94 (MQ=60)
AAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCT > SRR4302535.3339779/1‑94 (MQ=60)
AGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCT < SRR4302535.3996882/94‑1 (MQ=60)
AGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCT < SRR4302535.4067902/94‑1 (MQ=60)
AGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCT > SRR4302535.1358366/1‑94 (MQ=60)
AAATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTG < SRR4302535.107950/94‑1 (MQ=60)
ATTTGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCT > SRR4302535.1871798/1‑94 (MQ=60)
TGAAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGA > SRR4302535.3589466/1‑94 (MQ=60)
AAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAA > SRR4302535.2428823/1‑94 (MQ=60)
AAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAA > SRR4302535.1751762/1‑94 (MQ=60)
AAAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAA < SRR4302535.4217302/94‑1 (MQ=60)
AAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAG < SRR4302535.2559070/94‑1 (MQ=60)
AAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAG < SRR4302535.4351309/94‑1 (MQ=60)
AAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAG < SRR4302535.2207733/94‑1 (MQ=60)
AAACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAG < SRR4302535.1941042/94‑1 (MQ=60)
AACGTTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGT < SRR4302535.3793956/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCT < SRR4302535.2432128/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCG < SRR4302535.1147274/94‑1 (MQ=60)
AGGTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGC > SRR4302535.2218639/1‑94 (MQ=60)
GTTCGGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTC > SRR4302535.2925612/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT > SRR4302535.3360193/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT < SRR4302535.3760445/94‑1 (MQ=60)
|
CTGGCGATAAATTTCACGGCTGTTTGGGATTTGCTCACTGTATTTTCTGTCCGGATAAATACCGGGAGGAAGAATTTGAAAACGTTCAGGTTCAGTTTGATAATGCTTCTGGAAATCGGCGATTTGCTTATCGGTCAGCATCATAAGTTTCGTCGATTTACCCTGCTCGAAAGTCGCTCGCTCAAAT > NC_000913/3804131‑3804317
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
