Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,531,428 |
C→T |
intergenic (‑76/‑1155) |
yjhQ ← / → yjhR |
hypothetical protein/putative frameshift suppressor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,531,428 | 0 | C | T | 99.0%
| 735.9
/ ‑4.0
| 210 | intergenic (‑76/‑1155) | yjhQ/yjhR | hypothetical protein/putative frameshift suppressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (95/112); total (97/113) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.20e-01 |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GTGGTGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGCCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTA > NC_000913/4531338‑4531516
|
gtggtgTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCa > 2:3934704/1‑93 (MQ=255)
gtggtgTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCa > 2:195176/1‑93 (MQ=255)
ggtgTACTGTCATAGAACCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCAtt < 2:301338/93‑1 (MQ=255)
ggtgTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCAtt < 1:815893/93‑1 (MQ=255)
gtACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGAc > 1:1070086/1‑93 (MQ=255)
gtACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGAc < 1:423162/93‑1 (MQ=255)
gtACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGAc < 1:3041790/93‑1 (MQ=255)
gtACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGAc < 1:447820/93‑1 (MQ=255)
aCTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACgg < 2:1271575/93‑1 (MQ=255)
aCTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACgg < 1:2414742/93‑1 (MQ=255)
aCTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACgg > 2:3239158/1‑93 (MQ=255)
cTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGa > 2:3339782/1‑93 (MQ=255)
tGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGAc > 1:3423789/1‑93 (MQ=255)
tCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACtt < 1:2462826/93‑1 (MQ=255)
tCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACtt < 2:3641725/93‑1 (MQ=255)
cATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTg > 1:4519979/1‑93 (MQ=255)
aTAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGa > 1:3827996/1‑93 (MQ=255)
aTAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGa > 2:1437743/1‑93 (MQ=255)
tAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGAt < 1:4330158/93‑1 (MQ=255)
tAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGAt < 1:32202/93‑1 (MQ=255)
tAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGAt > 1:279078/1‑93 (MQ=255)
gAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATaa < 1:3311673/93‑1 (MQ=255)
aacctctCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAg < 2:1873765/90‑1 (MQ=255)
aacctctCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAg < 2:1136296/90‑1 (MQ=255)
aaCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGt > 1:2623768/1‑93 (MQ=255)
aaCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGt > 2:1333651/1‑93 (MQ=255)
aaCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGt > 2:1043666/1‑93 (MQ=255)
aaCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGt < 1:3780744/93‑1 (MQ=255)
aaCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAAGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGt > 2:4165095/1‑93 (MQ=255)
aCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGtt > 1:4245093/1‑93 (MQ=255)
aCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGtt < 1:3944557/93‑1 (MQ=255)
aCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGtt > 1:3483603/1‑93 (MQ=255)
aCTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGtt < 1:1872184/93‑1 (MQ=255)
ctctCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGttt < 2:600716/93‑1 (MQ=255)
ctctCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGttt < 2:1170898/93‑1 (MQ=255)
ctcCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGttttt > 1:2721732/1‑93 (MQ=255)
ccTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTg < 2:3737600/93‑1 (MQ=255)
ccTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTg > 1:177001/1‑93 (MQ=255)
cTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTgg > 1:1171538/1‑93 (MQ=255)
ttAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGt < 2:2030213/93‑1 (MQ=255)
ttAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGt < 1:3350013/93‑1 (MQ=255)
tAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGtt < 2:2932265/93‑1 (MQ=255)
tAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGtt < 2:3463541/93‑1 (MQ=255)
gCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGtttt < 1:2075154/93‑1 (MQ=255)
cGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTg > 2:2965726/1‑93 (MQ=255)
gATTATCGAGCTGAGCGCGATCTTTATTCAGCTGGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGa < 2:639726/93‑1 (MQ=255)
gATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTgt > 1:3148516/1‑92 (MQ=255)
aTTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAg > 2:728586/1‑93 (MQ=255)
ttATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGt < 2:1583120/93‑1 (MQ=255)
aTCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATGGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGttt < 1:913281/93‑1 (MQ=255)
aTCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGttt < 2:2044498/93‑1 (MQ=255)
aTCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGttt > 2:1559496/1‑93 (MQ=255)
tCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGtttt > 2:4368621/1‑93 (MQ=255)
tCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGtttt < 2:4195081/93‑1 (MQ=255)
tCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGtttt < 2:1918283/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGtttttt < 1:595394/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGtttttt < 1:438091/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGtttttt > 1:393841/1‑93 (MQ=255)
gCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGa > 2:3221541/1‑93 (MQ=255)
cTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGaa < 1:2802185/93‑1 (MQ=255)
cTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGaa < 2:1280140/93‑1 (MQ=255)
cTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGaa < 1:3299062/93‑1 (MQ=255)
gAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGa < 2:2383272/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGAc < 1:163467/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGAc < 2:3090762/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGAc < 1:2359141/93‑1 (MQ=255)
aGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGCCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGAc < 2:3493372/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACg < 2:575028/93‑1 (MQ=255)
gcgAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGc > 2:931900/1‑93 (MQ=255)
cgAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCg < 1:1123499/93‑1 (MQ=255)
cgAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCg < 2:2396363/93‑1 (MQ=255)
aaCTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAg > 1:3890951/1‑93 (MQ=255)
aaCTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAg > 1:1504852/1‑93 (MQ=255)
aaCTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAg > 2:406240/1‑93 (MQ=255)
cTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCg < 2:2213493/93‑1 (MQ=255)
tttATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGt > 1:13617/1‑93 (MQ=255)
ttATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTg < 2:337992/93‑1 (MQ=255)
ttATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTg < 1:4075997/93‑1 (MQ=255)
tATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGc < 2:1805864/93‑1 (MQ=255)
tATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGc < 2:4468925/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCa < 2:3830247/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAg > 2:4595943/1‑93 (MQ=255)
tCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGt < 1:3811793/93‑1 (MQ=255)
tCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTc < 2:915745/93‑1 (MQ=255)
tggtgTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGgcagca > 2:2673010/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAAc > 2:1751743/1‑93 (MQ=255)
ttGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGc < 2:1299514/93‑1 (MQ=255)
ttCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCtt > 2:2647370/1‑93 (MQ=255)
ttCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCtt > 2:3161368/1‑93 (MQ=255)
tCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTc < 1:2287528/93‑1 (MQ=255)
gATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTcgc > 1:2497767/1‑93 (MQ=255)
gATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTcgc < 2:2809920/93‑1 (MQ=255)
gATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTcgc > 2:681638/1‑93 (MQ=255)
aTAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTcgcg > 1:3568539/1‑93 (MQ=255)
gggCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCt > 1:4054416/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTg > 1:2473302/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGt > 2:2555308/1‑93 (MQ=255)
gCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGt < 1:975061/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGt < 1:2101341/93‑1 (MQ=255)
gCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGt > 2:247410/1‑93 (MQ=255)
|
GTGGTGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGCCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTA > NC_000913/4531338‑4531516
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGTGGTGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGCCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGCAT > NC_000913/4531337‑4531520
|
AGTGGTGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCA > SRR4302535.385287/1‑94 (MQ=60)
GGTGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTG < SRR4302535.821613/94‑1 (MQ=60)
TGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGAC > SRR4302535.1077693/1‑94 (MQ=60)
GTACTGTCATAGAAACTGTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACG < SRR4302535.2942572/94‑1 (MQ=60)
GTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACG < SRR4302535.426116/94‑1 (MQ=60)
GTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACG > SRR4302535.3920681/1‑94 (MQ=60)
GTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACG < SRR4302535.450957/94‑1 (MQ=60)
GTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACG < SRR4302535.3063102/94‑1 (MQ=60)
ACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGA < SRR4302535.4091309/94‑1 (MQ=60)
ACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGA < SRR4302535.2432126/94‑1 (MQ=60)
CTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGAC > SRR4302535.3447600/1‑94 (MQ=60)
TGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACT > SRR4302535.800752/1‑94 (MQ=60)
TGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACT < SRR4302535.157829/94‑1 (MQ=60)
TCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTG > SRR4302535.4550958/1‑94 (MQ=60)
TCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTG < SRR4302535.2480582/94‑1 (MQ=60)
CATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGA > SRR4302535.3854401/1‑94 (MQ=60)
CATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTAATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGA > SRR4302535.3320531/1‑94 (MQ=60)
ATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGAT > SRR4302535.281024/1‑94 (MQ=60)
ATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGAT < SRR4302535.2103887/94‑1 (MQ=60)
TAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATA < SRR4302535.4359772/94‑1 (MQ=60)
TAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATA < SRR4302535.32451/94‑1 (MQ=60)
GAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAG < SRR4302535.3334718/94‑1 (MQ=60)
AAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGT > SRR4302535.3488766/1‑94 (MQ=60)
AAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGT > SRR4302535.2642571/1‑94 (MQ=60)
AAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGT > SRR4302535.2506022/1‑94 (MQ=60)
AACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTT < SRR4302535.4595651/94‑1 (MQ=60)
AACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTT > SRR4302535.3507790/1‑94 (MQ=60)
AACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTT < SRR4302535.3806837/94‑1 (MQ=60)
AACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTT > SRR4302535.4274154/1‑94 (MQ=60)
AACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTT > SRR4302535.913091/1‑94 (MQ=60)
ACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTT < SRR4302535.1885673/94‑1 (MQ=60)
ACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTT > SRR4302535.1805205/1‑94 (MQ=60)
ACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTT < SRR4302535.3971492/94‑1 (MQ=60)
TCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTT > SRR4302535.2741175/1‑94 (MQ=60)
TCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTG > SRR4302535.178230/1‑94 (MQ=60)
CCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGG > SRR4302535.1179902/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGT < SRR4302535.281968/94‑1 (MQ=60)
CTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGT < SRR4302535.1134029/94‑1 (MQ=60)
TTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTT < SRR4302535.171485/94‑1 (MQ=60)
TTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTT < SRR4302535.3373348/94‑1 (MQ=60)
TAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTT < SRR4302535.2581212/94‑1 (MQ=60)
TAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTT < SRR4302535.4276195/94‑1 (MQ=60)
AGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTT < SRR4302535.2791782/94‑1 (MQ=60)
GCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTG < SRR4302535.4271220/94‑1 (MQ=60)
GCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTG < SRR4302535.2090102/94‑1 (MQ=60)
CGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGT > SRR4302535.3170406/1‑94 (MQ=60)
CGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGA < SRR4302535.4102613/94‑1 (MQ=60)
GATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAG < SRR4302535.3193286/94‑1 (MQ=60)
TTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTT > SRR4302535.24837/1‑94 (MQ=60)
ATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATGGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTT < SRR4302535.919772/94‑1 (MQ=60)
ATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTT < SRR4302535.4391166/94‑1 (MQ=60)
CGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTT > SRR4302535.3230206/1‑94 (MQ=60)
CGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTT > SRR4302535.396589/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTG < SRR4302535.599566/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTG < SRR4302535.441156/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTG < SRR4302535.3825096/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTCGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTG < SRR4302535.3329162/94‑1 (MQ=60)
AGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGA < SRR4302535.2058614/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAG < SRR4302535.243245/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAG < SRR4302535.3322007/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAG < SRR4302535.3586851/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAG < SRR4302535.2822115/94‑1 (MQ=60)
AGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACG < SRR4302535.2376070/94‑1 (MQ=60)
AGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACG < SRR4302535.164608/94‑1 (MQ=60)
CGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGC > SRR4302535.3903454/1‑94 (MQ=60)
GCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCG < SRR4302535.2491720/94‑1 (MQ=60)
CGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGA < SRR4302535.1131516/94‑1 (MQ=60)
CGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGA > SRR4302535.364067/1‑94 (MQ=60)
GAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAG > SRR4302535.1515672/1‑94 (MQ=60)
GAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAG > SRR4302535.3917631/1‑94 (MQ=60)
CTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGT > SRR4302535.13717/1‑94 (MQ=60)
TTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGC < SRR4302535.4103886/94‑1 (MQ=60)
TTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGC > SRR4302535.3651946/1‑94 (MQ=60)
TCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTC < SRR4302535.3838094/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTC < SRR4302535.521675/94‑1 (MQ=60)
CAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCG > SRR4302535.2242272/1‑94 (MQ=60)
GCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGT < SRR4302535.447460/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTC > SRR4302535.3966729/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCA < SRR4302535.1102974/94‑1 (MQ=60)
TGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAG > SRR4302535.4067894/1‑94 (MQ=60)
TGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAG < SRR4302535.339982/94‑1 (MQ=60)
TGTTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTCACGCCGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCcacac > SRR4302535.2372768/1‑89 (MQ=60)
TTGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCC > SRR4302535.3142161/1‑94 (MQ=60)
TGATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCC > SRR4302535.1929344/1‑94 (MQ=60)
GATTCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCT < SRR4302535.3353991/94‑1 (MQ=60)
TCGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCG < SRR4302535.2303869/94‑1 (MQ=60)
CGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGC > SRR4302535.2515786/1‑94 (MQ=60)
CGATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGC > SRR4302535.2395758/1‑94 (MQ=60)
GATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCG > SRR4302535.4109126/1‑94 (MQ=60)
GATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCG > SRR4302535.3593283/1‑94 (MQ=60)
ATAGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGG > SRR4302535.965229/1‑94 (MQ=60)
AGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCT < SRR4302535.2647528/94‑1 (MQ=60)
AGGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCT > SRR4302535.4082177/1‑94 (MQ=60)
AGGACTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCT < SRR4302535.4518181/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTG > SRR4302535.2491142/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTA < SRR4302535.2116494/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTA > SRR4302535.1467578/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTA < SRR4302535.981984/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAG < SRR4302535.1247480/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGC > SRR4302535.457617/1‑94 (MQ=60)
TGGTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGC > SRR4302535.629392/1‑94 (MQ=60)
GTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGCAT < SRR4302535.2955368/94‑1 (MQ=60)
GTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGCAT < SRR4302535.3010741/94‑1 (MQ=60)
GTCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGCAT > SRR4302535.4361750/1‑94 (MQ=60)
|
AGTGGTGTACTGTCATAGAAACTCTCCTTAGCGATTATCGAGCTGAGCGCGAACTTTATTCAGCTCGGTGGTGTTGATTCGATAGGGCTGGCCATTGACGGACTTGATAAGTTTTTTGGTTTTGAGTTTTTTGAAGACGGCGAGCGTGCAGTCGGTCAGCAACAGCCCTTCGCGGCTGTAGCAT > NC_000913/4531337‑4531520
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
