Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,479,655 |
T→C |
C241C (TGT→TGC) |
ynbD → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,479,655 | 0 | T | C | 100.0%
| 586.9
/ NA
| 180 | C241C (TGT→TGC) | ynbD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (94/86); total (94/86) |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC > NC_000913/1479565‑1479744
|
aGCACTTCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTg < 1:2323123/93‑1 (MQ=255)
cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGCTATGCTGGCCa > 2:9270259/1‑93 (MQ=255)
tGCCCTATGTCGTAGGCGCGTGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATAATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCCGGCCAg > 2:3553631/1‑93 (MQ=255)
tGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAg > 2:6885417/1‑93 (MQ=255)
gCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGt > 1:5971806/1‑93 (MQ=255)
cccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGta < 1:2668597/93‑1 (MQ=255)
ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat > 1:6229348/1‑93 (MQ=255)
tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta < 1:367412/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat < 2:6599809/93‑1 (MQ=255)
aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat < 1:9145541/93‑1 (MQ=255)
tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc > 2:4140089/1‑93 (MQ=255)
tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc < 2:4189969/93‑1 (MQ=255)
tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc < 2:4406841/93‑1 (MQ=255)
gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa > 1:1672557/1‑93 (MQ=255)
gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa > 2:1857034/1‑93 (MQ=255)
tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc < 1:5882191/93‑1 (MQ=255)
tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc > 2:6036291/1‑93 (MQ=255)
tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc < 1:4820049/93‑1 (MQ=255)
tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc > 2:7375809/1‑93 (MQ=255)
tggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACt < 1:2838711/92‑1 (MQ=255)
aGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACt > 2:580795/1‑93 (MQ=255)
ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc > 1:5514077/1‑93 (MQ=255)
gcgcGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCa > 2:110870/1‑93 (MQ=255)
cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt < 1:5424630/93‑1 (MQ=255)
gcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa > 1:5225343/1‑93 (MQ=255)
gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt < 1:8855938/93‑1 (MQ=255)
ggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAtt > 1:3754443/1‑93 (MQ=255)
cTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg > 2:3940445/1‑93 (MQ=255)
cGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGcc > 1:4997037/1‑93 (MQ=255)
gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg < 1:10016523/93‑1 (MQ=255)
tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt > 1:9407915/1‑93 (MQ=255)
gCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTg < 1:6400582/93‑1 (MQ=255)
gCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTg > 2:1163767/1‑93 (MQ=255)
aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg < 1:6604487/93‑1 (MQ=255)
aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg < 1:306988/93‑1 (MQ=255)
aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg > 2:7720916/1‑93 (MQ=255)
ttGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGt > 2:1211200/1‑93 (MQ=255)
tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa < 1:7969379/93‑1 (MQ=255)
tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa > 1:8422498/1‑93 (MQ=255)
tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa > 2:2629889/1‑93 (MQ=255)
gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc < 1:3195613/93‑1 (MQ=255)
aTTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACgg > 2:9356472/1‑93 (MQ=255)
ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt > 2:6980307/1‑93 (MQ=255)
ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt < 2:8607563/93‑1 (MQ=255)
ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGCCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACggg > 2:2789058/1‑92 (MQ=255)
gATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTgg < 2:366406/93‑1 (MQ=255)
gATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTgg > 2:9574110/1‑93 (MQ=255)
tGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGc > 1:1539188/1‑93 (MQ=255)
gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt > 2:8895529/1‑93 (MQ=255)
gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt < 1:8787552/93‑1 (MQ=255)
gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGAGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGACGTGGGTACGGTGGGCtt > 1:839941/1‑93 (MQ=255)
aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg < 1:9188272/93‑1 (MQ=255)
aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg < 2:5495135/93‑1 (MQ=255)
gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg < 1:6782774/93‑1 (MQ=255)
aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc > 2:2419755/1‑93 (MQ=255)
tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa < 1:7132528/93‑1 (MQ=255)
tatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt < 1:1060979/92‑1 (MQ=255)
gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt < 1:380222/93‑1 (MQ=255)
gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt > 2:6100466/1‑93 (MQ=255)
atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa > 1:7602905/1‑93 (MQ=255)
tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa > 2:1058972/1‑93 (MQ=255)
tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa > 1:9437399/1‑93 (MQ=255)
tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa < 2:7991267/93‑1 (MQ=255)
tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa < 1:4472862/93‑1 (MQ=255)
atgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaaca < 1:9738123/93‑1 (MQ=255)
tgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa > 2:9881483/1‑93 (MQ=255)
atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTCCTCATAATTGGCAGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca < 2:6369816/93‑1 (MQ=255)
atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca < 1:2043799/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg > 2:2649617/1‑93 (MQ=255)
tCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg < 2:8393373/93‑1 (MQ=255)
cAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAggg < 1:8632912/93‑1 (MQ=255)
aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa > 2:1636320/1‑93 (MQ=255)
aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa < 1:5520029/93‑1 (MQ=255)
ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaga > 1:7052675/1‑91 (MQ=255)
ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaaa > 1:9379059/1‑93 (MQ=255)
ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaaa > 2:7679424/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa > 1:6316653/1‑93 (MQ=255)
aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa < 1:2180800/93‑1 (MQ=255)
ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAgga > 1:6245122/1‑91 (MQ=255)
ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc < 2:7526937/93‑1 (MQ=255)
ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAATGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc < 2:8238459/93‑1 (MQ=255)
ggtCAGTCTGGTTATGCAGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCATGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc < 2:6859656/93‑1 (MQ=255)
gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa < 1:6125880/93‑1 (MQ=255)
gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa > 1:769899/1‑93 (MQ=255)
tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg < 2:4888553/93‑1 (MQ=255)
cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg < 1:1196904/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg > 1:9252453/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg < 2:3102649/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg > 2:7163595/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGTGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa < 2:9674703/93‑1 (MQ=255)
cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa > 2:8984032/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa > 1:1982075/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa < 1:4248044/93‑1 (MQ=255)
tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa > 1:736105/1‑93 (MQ=255)
tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa > 2:448693/1‑93 (MQ=255)
tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa > 1:8971775/1‑93 (MQ=255)
gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt > 2:8207533/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc < 2:7721986/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc < 1:4663682/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc > 2:3420638/1‑93 (MQ=255)
|
AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC > NC_000913/1479565‑1479744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGC > NC_000913/1479562‑1479746
|
AATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGC > SRR4302540.4708351/1‑94 (MQ=60)
AATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGC > SRR4302540.8132291/1‑94 (MQ=60)
AATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGC < SRR4302540.9167223/94‑1 (MQ=60)
ATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCT < SRR4302540.8269346/94‑1 (MQ=60)
ATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCT > SRR4302540.5660864/1‑94 (MQ=60)
ATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCT > SRR4302540.7632960/1‑94 (MQ=60)
AGCACTTCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGG < SRR4302540.2348137/94‑1 (MQ=60)
TGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGT > SRR4302540.6037899/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGT > SRR4302540.2401997/1‑94 (MQ=60)
GCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTA < SRR4302540.9386660/94‑1 (MQ=60)
CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTAT > SRR4302540.4296273/1‑94 (MQ=60)
CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTAT > SRR4302540.6298624/1‑94 (MQ=60)
CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTAT < SRR4302540.2697514/94‑1 (MQ=60)
CCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATT > SRR4302540.10062773/1‑94 (MQ=60)
CCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATT < SRR4302540.2319639/94‑1 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA > SRR4302540.1273481/1‑94 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA > SRR4302540.8044918/1‑94 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA > SRR4302540.6333196/1‑94 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA > SRR4302540.1914202/1‑94 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA > SRR4302540.4891209/1‑94 (MQ=60)
TATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTAT < SRR4302540.9047884/94‑1 (MQ=60)
TATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTAT < SRR4302540.371199/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATC < SRR4302540.9255392/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATC > SRR4302540.2038946/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATC > SRR4302540.276886/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATC < SRR4302540.8798577/94‑1 (MQ=60)
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CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTA > SRR4302540.1690736/1‑94 (MQ=60)
GTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAC > SRR4302540.7193069/1‑94 (MQ=60)
TAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACT < SRR4302540.5947195/94‑1 (MQ=60)
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TAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACT < SRR4302540.4871645/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTC < SRR4302540.2869415/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTC > SRR4302540.5574811/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTC > SRR4302540.5574809/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCGGGCTCGTGCACTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTA > SRR4302540.9514735/1‑94 (MQ=60)
GGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCA < SRR4302540.3030998/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATA < SRR4302540.5484288/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATA > SRR4302540.5282320/1‑94 (MQ=60)
GGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATT > SRR4302540.5919387/1‑94 (MQ=60)
GGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATT < SRR4302540.9323723/94‑1 (MQ=60)
GGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATT < SRR4302540.8958400/94‑1 (MQ=60)
GGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATT > SRR4302540.3795400/1‑94 (MQ=60)
GGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTG < SRR4302540.5496047/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCC > SRR4302540.5051138/1‑94 (MQ=60)
CGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCG > SRR4302540.8222552/1‑94 (MQ=60)
GTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGT > SRR4302540.9519797/1‑94 (MQ=60)
GTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGT > SRR4302540.768986/1‑94 (MQ=60)
GTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGT < SRR4302540.10133118/94‑1 (MQ=60)
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GCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGG < SRR4302540.6471830/94‑1 (MQ=60)
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ATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGT < SRR4302540.6677619/94‑1 (MQ=60)
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TGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAC < SRR4302540.8062244/94‑1 (MQ=60)
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TATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGG > SRR4302540.3136090/1‑94 (MQ=60)
GATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGG < SRR4302540.8942461/94‑1 (MQ=60)
ATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGC > SRR4302540.1556207/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTT < SRR4302540.1613562/94‑1 (MQ=60)
GGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGAGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGACGTGGGTACGGTGGGCTT > SRR4302540.848855/1‑94 (MQ=60)
GAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTG < SRR4302540.1192901/94‑1 (MQ=60)
GAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTG < SRR4302540.8889239/94‑1 (MQ=60)
AGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGG < SRR4302540.9298461/94‑1 (MQ=60)
AGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGGGGGCTTGG > SRR4302540.648524/1‑94 (MQ=60)
GCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGC < SRR4302540.6857779/94‑1 (MQ=60)
AATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCG > SRR4302540.5990742/1‑94 (MQ=60)
TGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAT < SRR4302540.7211983/94‑1 (MQ=60)
TATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA < SRR4302540.1071777/94‑1 (MQ=60)
GATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA > SRR4302540.7688332/1‑94 (MQ=60)
GATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA < SRR4302540.6683939/94‑1 (MQ=60)
GATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA < SRR4302540.384159/94‑1 (MQ=60)
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ATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAA > SRR4302540.3896586/1‑94 (MQ=60)
TGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAAC < SRR4302540.4521373/94‑1 (MQ=60)
ATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAA < SRR4302540.9852447/94‑1 (MQ=60)
TATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACA < SRR4302540.3235028/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAG < SRR4302540.2065814/94‑1 (MQ=60)
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GTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAGA > SRR4302540.7131109/1‑94 (MQ=60)
GTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAA > SRR4302540.9490704/1‑94 (MQ=60)
TATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGA > SRR4302540.6386996/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAT > SRR4302540.6436897/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAT < SRR4302540.2204324/94‑1 (MQ=60)
TGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGga > SRR4302540.6314623/1‑92 (MQ=60)
TGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTC > SRR4302540.6314622/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCA > SRR4302540.778093/1‑94 (MQ=60)
GTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAG < SRR4302540.6194108/94‑1 (MQ=60)
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AGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGG > SRR4302540.7541853/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGG > SRR4302540.4714467/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGG > SRR4302540.9363198/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAA > SRR4302540.2003568/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAA > SRR4302540.9078329/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAA > SRR4302540.7376229/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAA > SRR4302540.743971/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAA < SRR4302540.4294261/94‑1 (MQ=60)
GGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACT < SRR4302540.4636187/94‑1 (MQ=60)
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ATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGCGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCG < SRR4302540.3800416/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGC < SRR4302540.1198376/94‑1 (MQ=60)
|
AATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGC > NC_000913/1479562‑1479746
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
