Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,479,655 |
T→C |
C241C (TGT→TGC) |
ynbD → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,479,655 | 0 | T | C | 100.0%
| 632.1
/ NA
| 194 | C241C (TGT→TGC) | ynbD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (96/98); total (96/98) |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC > NC_000913/1479565‑1479744
|
aGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTg < 1:6167493/93‑1 (MQ=255)
cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa > 1:30162/1‑93 (MQ=255)
cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa < 1:1713072/93‑1 (MQ=255)
cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa < 1:745030/93‑1 (MQ=255)
gCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGt < 2:2309117/93‑1 (MQ=255)
cccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCGGGCCAGta < 2:3843962/93‑1 (MQ=255)
ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat < 2:6213089/93‑1 (MQ=255)
cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt < 1:1893657/93‑1 (MQ=255)
tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta < 1:502283/93‑1 (MQ=255)
tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta > 2:1154689/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat < 1:3146929/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGCGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat > 1:1250416/1‑93 (MQ=255)
tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc > 2:2373860/1‑93 (MQ=255)
tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc > 2:2843075/1‑93 (MQ=255)
tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc > 2:3565949/1‑93 (MQ=255)
cGTAGTCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCt < 1:3308031/93‑1 (MQ=255)
gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCtc > 1:4278309/1‑92 (MQ=255)
gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa > 2:3237072/1‑93 (MQ=255)
tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc > 2:1437564/1‑93 (MQ=255)
tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc > 1:1482401/1‑93 (MQ=255)
ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc > 1:3581745/1‑93 (MQ=255)
cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt < 1:2246565/93‑1 (MQ=255)
cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt < 1:5546904/93‑1 (MQ=255)
gcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGGTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa > 1:4550681/1‑93 (MQ=255)
ggggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATaa < 2:5879942/92‑1 (MQ=255)
gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt > 2:86367/1‑93 (MQ=255)
gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg < 1:5872744/93‑1 (MQ=255)
gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg < 2:3882627/93‑1 (MQ=255)
gtCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg < 1:1371910/92‑1 (MQ=255)
cTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg < 1:5399770/93‑1 (MQ=255)
tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc > 1:1541935/1‑93 (MQ=255)
tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc < 1:4759759/93‑1 (MQ=255)
gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg > 2:4254044/1‑93 (MQ=255)
tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt < 1:5161628/93‑1 (MQ=255)
tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt < 2:1126453/93‑1 (MQ=255)
cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg > 2:337812/1‑93 (MQ=255)
cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg > 2:3168043/1‑93 (MQ=255)
aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg < 2:1356148/93‑1 (MQ=255)
aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg > 1:2499995/1‑93 (MQ=255)
gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc > 2:4423656/1‑93 (MQ=255)
gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc < 2:2561413/93‑1 (MQ=255)
gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc < 2:6048075/93‑1 (MQ=255)
gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc > 2:2649856/1‑93 (MQ=255)
tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACg > 2:1217012/1‑93 (MQ=255)
tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACg > 2:278039/1‑93 (MQ=255)
ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt < 1:4929759/93‑1 (MQ=255)
ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt > 1:764918/1‑93 (MQ=255)
tGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTg < 2:2413413/93‑1 (MQ=255)
aTGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTggg > 1:5492392/1‑93 (MQ=255)
ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt < 1:3741258/93‑1 (MQ=255)
gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt > 1:2626955/1‑93 (MQ=255)
gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt < 2:1099917/93‑1 (MQ=255)
aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg > 1:1914195/1‑93 (MQ=255)
gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg > 1:1069117/1‑93 (MQ=255)
aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc > 1:2781395/1‑93 (MQ=255)
aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc > 2:3994942/1‑93 (MQ=255)
atgatgatgATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGcgcg > 1:3316558/1‑93 (MQ=255)
gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt < 1:2442991/93‑1 (MQ=255)
atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa > 1:71123/1‑93 (MQ=255)
atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa > 1:4128968/1‑93 (MQ=255)
atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa > 2:187667/1‑93 (MQ=255)
gatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaac > 2:2043422/1‑93 (MQ=255)
atgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaaca > 1:2584699/1‑93 (MQ=255)
atgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaaca < 1:3118838/93‑1 (MQ=255)
atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca > 1:816961/1‑93 (MQ=255)
atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca > 1:3520946/1‑93 (MQ=255)
atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca < 2:329773/93‑1 (MQ=255)
ttgaGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGCCTTGGCGCGATAACAACAg < 2:4177512/90‑1 (MQ=255)
ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg < 2:6089674/93‑1 (MQ=255)
tCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg > 2:4053657/1‑93 (MQ=255)
aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa < 2:715361/93‑1 (MQ=255)
gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa > 1:1822986/1‑93 (MQ=255)
gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa < 1:2369430/93‑1 (MQ=255)
ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaaa < 2:5786189/93‑1 (MQ=255)
aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa < 2:4774962/93‑1 (MQ=255)
tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt < 1:2944841/93‑1 (MQ=255)
tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt < 2:5118885/93‑1 (MQ=255)
ggtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATa < 2:5717543/93‑1 (MQ=255)
gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg < 2:2683882/93‑1 (MQ=255)
gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg < 1:3463602/93‑1 (MQ=255)
tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt < 2:1456318/93‑1 (MQ=255)
ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc > 1:4480188/1‑93 (MQ=255)
gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa < 2:4321016/93‑1 (MQ=255)
gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa > 2:5053623/1‑93 (MQ=255)
tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg > 1:567310/1‑93 (MQ=255)
tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg > 2:154260/1‑93 (MQ=255)
cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg < 2:1516296/93‑1 (MQ=255)
cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg < 1:685338/93‑1 (MQ=255)
aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg > 1:5989837/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg > 1:4002395/1‑93 (MQ=255)
aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg < 1:834143/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg > 2:4650719/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg < 1:3844147/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa < 1:4380090/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa > 2:3772381/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa > 1:3783641/1‑93 (MQ=255)
tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa > 1:5496441/1‑93 (MQ=255)
gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt > 2:6109933/1‑93 (MQ=255)
ttATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTa > 1:2015607/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc > 2:5644514/1‑93 (MQ=255)
|
AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC > NC_000913/1479565‑1479744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGC > NC_000913/1479563‑1479746
|
ATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCT < SRR4302533.3954724/94‑1 (MQ=60)
TAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTG < SRR4302533.2391851/94‑1 (MQ=60)
AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGG < SRR4302533.6204570/94‑1 (MQ=60)
GCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGC < SRR4302533.1924188/94‑1 (MQ=60)
GCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGC > SRR4302533.1684905/1‑94 (MQ=60)
ACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCA > SRR4302533.30366/1‑94 (MQ=60)
CTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAG < SRR4302533.1723452/94‑1 (MQ=60)
CTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAG < SRR4302533.4737651/94‑1 (MQ=60)
CTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAG < SRR4302533.749414/94‑1 (MQ=60)
CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATTATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTAT < SRR4302533.1499015/94‑1 (MQ=60)
CCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTAT > SRR4302533.4962596/1‑94 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA < SRR4302533.1905217/94‑1 (MQ=60)
CTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTA < SRR4302533.807274/94‑1 (MQ=60)
TATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTAT < SRR4302533.604543/94‑1 (MQ=60)
TATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTAT < SRR4302533.505268/94‑1 (MQ=60)
TATGCCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGCGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTAT > SRR4302533.1257886/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATC < SRR4302533.4206089/94‑1 (MQ=60)
ATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATC < SRR4302533.3166279/94‑1 (MQ=60)
TGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCG < SRR4302533.1259029/94‑1 (MQ=60)
CGTAGTCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTA < SRR4302533.3328457/94‑1 (MQ=60)
CGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTC > SRR4302533.4304037/1‑94 (MQ=60)
GTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAC > SRR4302533.1491351/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTC > SRR4302533.769353/1‑94 (MQ=60)
AGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTC > SRR4302533.3603808/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGGTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATA > SRR4302533.4578278/1‑94 (MQ=60)
CGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATA < SRR4302533.2260448/94‑1 (MQ=60)
CGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATA < SRR4302533.5580404/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAA < SRR4302533.1945508/94‑1 (MQ=60)
GGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATT > SRR4302533.3512117/1‑94 (MQ=60)
GGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTG > SRR4302533.2990931/1‑94 (MQ=60)
GGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTG < SRR4302533.2826523/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGG < SRR4302533.5908240/94‑1 (MQ=60)
GCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGG < SRR4302533.2422704/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGC < SRR4302533.1380160/94‑1 (MQ=60)
CTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGC > SRR4302533.1551225/1‑94 (MQ=60)
CTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGC < SRR4302533.5432216/94‑1 (MQ=60)
TCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCC < SRR4302533.4788634/94‑1 (MQ=60)
TGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCG < SRR4302533.4331858/94‑1 (MQ=60)
GCGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGT > SRR4302533.2516767/1‑94 (MQ=60)
TGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTG < SRR4302533.5192790/94‑1 (MQ=60)
GCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGG < SRR4302533.1381543/94‑1 (MQ=60)
CATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGG > SRR4302533.2515417/1‑94 (MQ=60)
ATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGT < SRR4302533.3733567/94‑1 (MQ=60)
ATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGT > SRR4302533.3334335/1‑94 (MQ=60)
TGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAC < SRR4302533.2486074/94‑1 (MQ=60)
GTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACG > SRR4302533.3768213/1‑94 (MQ=60)
ATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGT > SRR4302533.2613099/1‑94 (MQ=60)
ATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGT > SRR4302533.769423/1‑94 (MQ=60)
ATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGT > SRR4302533.833769/1‑94 (MQ=60)
TTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTG < SRR4302533.4959612/94‑1 (MQ=60)
GATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGG > SRR4302533.5525520/1‑94 (MQ=60)
TGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCT < SRR4302533.6343661/94‑1 (MQ=60)
GGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTT < SRR4302533.3764201/94‑1 (MQ=60)
GGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTT > SRR4302533.2643070/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTT < SRR4302533.269155/94‑1 (MQ=60)
GAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTG > SRR4302533.1925878/1‑94 (MQ=60)
AGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGG < SRR4302533.5573057/94‑1 (MQ=60)
AGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGG > SRR4302533.1075412/1‑94 (MQ=60)
AGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGG < SRR4302533.1757288/94‑1 (MQ=60)
AGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGG < SRR4302533.4510143/94‑1 (MQ=60)
CTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCG < SRR4302533.3572957/94‑1 (MQ=60)
CTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCG < SRR4302533.3157728/94‑1 (MQ=60)
CTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCG > SRR4302533.4104570/1‑94 (MQ=60)
TAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGC > SRR4302533.2798482/1‑94 (MQ=60)
AATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCG > SRR4302533.3337039/1‑94 (MQ=60)
AATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCG < SRR4302533.5122211/94‑1 (MQ=60)
ATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGgca > SRR4302533.5733562/1‑91 (MQ=60)
GATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA > SRR4302533.4154031/1‑94 (MQ=60)
GATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA < SRR4302533.2458071/94‑1 (MQ=60)
GATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATA > SRR4302533.71581/1‑94 (MQ=60)
ATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAA > SRR4302533.3106447/1‑94 (MQ=60)
GATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACA > SRR4302533.2600591/1‑94 (MQ=60)
ATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAA < SRR4302533.3138018/94‑1 (MQ=60)
ATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAA < SRR4302533.4442056/94‑1 (MQ=60)
GATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACA > SRR4302533.821747/1‑94 (MQ=60)
GATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACA > SRR4302533.3542651/1‑94 (MQ=60)
CAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGA > SRR4302533.2129337/1‑94 (MQ=60)
AGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAA > SRR4302533.1834122/1‑94 (MQ=60)
GTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAA < SRR4302533.2384089/94‑1 (MQ=60)
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TATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGA > SRR4302533.693147/1‑94 (MQ=60)
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TGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATA < SRR4302533.2962854/94‑1 (MQ=60)
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GGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCA < SRR4302533.2289753/94‑1 (MQ=60)
GTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAG > SRR4302533.570667/1‑94 (MQ=60)
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CAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGG > SRR4302533.4026768/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGG > SRR4302533.3871605/1‑94 (MQ=60)
AGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGG < SRR4302533.839031/94‑1 (MQ=60)
AGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGG < SRR4302533.5285494/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGA < SRR4302533.3867625/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAA < SRR4302533.4406535/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAA > SRR4302533.3806809/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAA > SRR4302533.5529593/1‑94 (MQ=60)
CTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAA > SRR4302533.732031/1‑94 (MQ=60)
GGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACT > SRR4302533.3393957/1‑94 (MQ=60)
GTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTA > SRR4302533.2028023/1‑94 (MQ=60)
TTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAC > SRR4302533.544290/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCG > SRR4302533.4500984/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGC > SRR4302533.1214890/1‑94 (MQ=60)
|
ATAGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACCGC > NC_000913/1479563‑1479746
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
