Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,772,146 |
C→T |
L270F (CTT→TTT) |
yfjW → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,772,146 | 0 | C | T | 93.6%
| 1570.2
/ 47.0
| 481 | L270F (CTT→TTT) | yfjW | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (16/15); new base T (211/239); total (227/254) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.82e-01 |
Only 100 of 497 total aligned reads displayed.
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGA > NC_000913/2772056‑2772237
|
atatatAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGttt < 1:983802/93‑1 (MQ=255)
atatatAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGttt > 1:6820568/1‑93 (MQ=255)
atatatAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGttt > 1:8148703/1‑93 (MQ=255)
tatataATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTg > 1:7937198/1‑93 (MQ=255)
atataATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGa < 2:4360615/93‑1 (MQ=255)
atataATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGa < 2:9038543/93‑1 (MQ=255)
tataATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGAt < 2:7672703/93‑1 (MQ=255)
ataATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATg > 2:2830982/1‑93 (MQ=255)
ataATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATg < 2:1628453/93‑1 (MQ=255)
taATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGc < 2:8120843/93‑1 (MQ=255)
taATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGc > 1:5948560/1‑93 (MQ=255)
taATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGc > 1:4729682/1‑93 (MQ=255)
aaTGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCt > 2:2549465/1‑93 (MQ=255)
aTGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTa < 2:7087537/93‑1 (MQ=255)
tGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTaa < 1:6642069/93‑1 (MQ=255)
gATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTaaa < 1:156812/93‑1 (MQ=255)
gATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTaaa < 2:3416036/93‑1 (MQ=255)
gATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTaaa > 2:4016924/1‑93 (MQ=255)
aTACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTaaaa > 1:5859606/1‑93 (MQ=255)
tACACAGTGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTaaaaa < 1:4829520/93‑1 (MQ=255)
acaGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATc > 1:4483965/1‑93 (MQ=255)
caGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCt > 2:5320331/1‑93 (MQ=255)
gggTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTTTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCGAGAGTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCttt > 1:142977/1‑93 (MQ=255)
gggTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCttt > 1:6968969/1‑93 (MQ=255)
ggTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCtttt < 2:7461833/93‑1 (MQ=255)
gTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTc < 2:9532379/93‑1 (MQ=255)
gTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTc < 1:3915516/93‑1 (MQ=255)
tttAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCt < 2:1006328/93‑1 (MQ=255)
tttAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCt > 2:6307848/1‑93 (MQ=255)
tttAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCt < 1:198712/93‑1 (MQ=255)
ttAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTg > 1:827956/1‑93 (MQ=255)
tAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGa < 1:3279374/93‑1 (MQ=255)
aaGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGaa < 2:3871854/93‑1 (MQ=255)
aaGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGaa > 2:9136904/1‑93 (MQ=255)
aGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAAt > 2:8267612/1‑93 (MQ=255)
ggtgCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTa > 2:8793166/1‑93 (MQ=255)
gtgCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTGCTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaa > 1:1839275/1‑93 (MQ=255)
gtgCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaa < 1:7358484/93‑1 (MQ=255)
tgCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaaa < 1:7820538/93‑1 (MQ=255)
tgCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaaa > 2:3318322/1‑93 (MQ=255)
cTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaaaaa < 2:5685189/93‑1 (MQ=255)
cTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaaaaa > 2:4621532/1‑93 (MQ=255)
cTGATATTTATATTATCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaaaaa < 1:1625860/93‑1 (MQ=255)
tGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTaaaaaa < 2:9613391/93‑1 (MQ=255)
gATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAg > 2:6767545/1‑93 (MQ=255)
atatTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGc < 2:4670113/93‑1 (MQ=255)
atatTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGc > 1:878744/1‑93 (MQ=255)
tatTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCt < 2:8697866/93‑1 (MQ=255)
atTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTa < 1:9403401/93‑1 (MQ=255)
atTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTa < 1:3453818/93‑1 (MQ=255)
atTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTa < 2:7957682/93‑1 (MQ=255)
atTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTa < 1:1004818/93‑1 (MQ=255)
atTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGT‑AAAAAGCTAg < 2:1557862/93‑1 (MQ=255)
tttATATTGTCTCCTGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAg < 1:7665861/93‑1 (MQ=255)
tttATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAACAAAGCTAg > 1:4102050/1‑93 (MQ=255)
tttATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAg < 1:3504582/93‑1 (MQ=255)
tttATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAg > 2:1427439/1‑93 (MQ=255)
ttATATTGTCTCCGGTTGTTATGGCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGa < 2:5499556/93‑1 (MQ=255)
tataTTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGaa < 2:7441557/93‑1 (MQ=255)
atatTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGaaa > 1:2448080/1‑93 (MQ=255)
tatTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAAt > 2:2054219/1‑93 (MQ=255)
gTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATcaca < 1:6187536/93‑1 (MQ=255)
gTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATcaca > 2:9369192/1‑93 (MQ=255)
tctcCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATcacac > 1:8522192/1‑93 (MQ=255)
tctcCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATcacac < 2:7257764/93‑1 (MQ=255)
tctcCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATcacac > 1:4956454/1‑93 (MQ=255)
tcCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAg > 1:2759699/1‑93 (MQ=255)
ccGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGa > 2:7774607/1‑93 (MQ=255)
ggTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGaaa < 1:989770/93‑1 (MQ=255)
gttATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTc > 1:7197821/1‑93 (MQ=255)
ttATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTcc > 1:5703676/1‑93 (MQ=255)
ttATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTcc < 2:6670753/93‑1 (MQ=255)
tATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCa < 2:2313092/93‑1 (MQ=255)
aTGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCaa < 1:5147183/93‑1 (MQ=255)
aTGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCaa < 1:258971/93‑1 (MQ=255)
aTGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCaa < 2:1924195/93‑1 (MQ=255)
tGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAat > 1:171793/1‑93 (MQ=255)
cccTTCTAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTCATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAatga < 1:8745749/93‑1 (MQ=255)
cccTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAatga < 1:9449403/93‑1 (MQ=255)
cccTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAatga < 2:3646376/93‑1 (MQ=255)
cTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAatgatg < 1:5547821/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATgg < 2:2973472/93‑1 (MQ=255)
ttCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATgg < 1:7470128/93‑1 (MQ=255)
tCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATggg > 2:697670/1‑93 (MQ=255)
tCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATggg < 2:5840366/93‑1 (MQ=255)
ccAGATTTACTTCGCGATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATgggg > 2:6426434/1‑93 (MQ=255)
ccAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATgggg > 1:2993645/1‑93 (MQ=255)
ccAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATgggg > 2:5132729/1‑93 (MQ=255)
gATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTc > 2:6127038/1‑93 (MQ=255)
tACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATAc > 1:4371393/1‑93 (MQ=255)
aCTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACa > 2:7534636/1‑93 (MQ=255)
cGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGt < 2:8871374/93‑1 (MQ=255)
cAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGa < 2:4750434/93‑1 (MQ=255)
cAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGa > 2:8414130/1‑93 (MQ=255)
aaTGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGaa < 1:9019312/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGaa < 1:9553323/93‑1 (MQ=255)
aTGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAAt > 1:6387661/1‑93 (MQ=255)
tGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATc > 2:4964767/1‑93 (MQ=255)
aCCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGc > 1:123143/1‑93 (MQ=255)
gCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCtga > 2:9901278/1‑93 (MQ=255)
|
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGA > NC_000913/2772056‑2772237
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 261 total aligned reads displayed.
TTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATG > NC_000913/2772053‑2772239
|
TTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGT < SRR4302540.41731/94‑1 (MQ=60)
TTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGC < SRR4302540.1427158/94‑1 (MQ=60)
TGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTT < SRR4302540.3427394/94‑1 (MQ=60)
TGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTT > SRR4302540.6827763/1‑94 (MQ=60)
TGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTT < SRR4302540.1637838/94‑1 (MQ=60)
GATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTT > SRR4302540.6896073/1‑94 (MQ=60)
GATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTT < SRR4302540.3741302/94‑1 (MQ=60)
GATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTT < SRR4302540.7187365/94‑1 (MQ=60)
GATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTT > SRR4302540.8243297/1‑94 (MQ=60)
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTG > SRR4302540.5310868/1‑94 (MQ=60)
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTG < SRR4302540.5142808/94‑1 (MQ=60)
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTG < SRR4302540.6289211/94‑1 (MQ=60)
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTG > SRR4302540.881607/1‑94 (MQ=60)
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTG > SRR4302540.722226/1‑94 (MQ=60)
ATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTG > SRR4302540.8029702/1‑94 (MQ=60)
TATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGA > SRR4302540.6929647/1‑94 (MQ=60)
ATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTTTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGAT < SRR4302540.6304853/94‑1 (MQ=60)
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ATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAA > SRR4302540.5738837/1‑94 (MQ=60)
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TATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATC < SRR4302540.6171039/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCA > SRR4302540.6820743/1‑94 (MQ=60)
TGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACA > SRR4302540.2006742/1‑94 (MQ=60)
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GTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACAC > SRR4302540.5010016/1‑94 (MQ=60)
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CCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAA > SRR4302540.7296783/1‑94 (MQ=60)
CCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAA > SRR4302540.3496772/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAAC < SRR4302540.5798581/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAAC < SRR4302540.5798580/94‑1 (MQ=60)
GGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAAC < SRR4302540.2730361/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACT > SRR4302540.2355524/1‑94 (MQ=60)
TTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTT < SRR4302540.4357485/94‑1 (MQ=60)
TTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTT > SRR4302540.3179106/1‑94 (MQ=60)
TGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTC > SRR4302540.8518492/1‑94 (MQ=60)
GTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCC < SRR4302540.9516454/94‑1 (MQ=60)
GTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCC > SRR4302540.5766477/1‑94 (MQ=60)
GTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCC > SRR4302540.104121/1‑94 (MQ=60)
TTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAACAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCA > SRR4302540.8217037/1‑94 (MQ=60)
TTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCA > SRR4302540.6666219/1‑94 (MQ=60)
ATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAAT < SRR4302540.5202953/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAAT < SRR4302540.261489/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAAT > SRR4302540.173512/1‑94 (MQ=60)
ATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAAT < SRR4302540.6820282/94‑1 (MQ=60)
ATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAAT > SRR4302540.8025880/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATG < SRR4302540.7918851/94‑1 (MQ=60)
TGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATG < SRR4302540.407186/94‑1 (MQ=60)
TGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATG < SRR4302540.407187/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGA < SRR4302540.2848247/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGA > SRR4302540.5958211/1‑94 (MQ=60)
GCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT < SRR4302540.8847245/94‑1 (MQ=60)
CCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT > SRR4302540.2494512/1‑94 (MQ=60)
CCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT < SRR4302540.2001025/94‑1 (MQ=60)
CCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT < SRR4302540.9561573/94‑1 (MQ=60)
CCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTGGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGAT < SRR4302540.9561572/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATG < SRR4302540.2623093/94‑1 (MQ=60)
CCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATG > SRR4302540.5152346/1‑94 (MQ=60)
CTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGG < SRR4302540.5608939/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGG > SRR4302540.4801130/1‑94 (MQ=60)
CTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGG > SRR4302540.138843/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGG < SRR4302540.7553469/94‑1 (MQ=60)
TTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGG > SRR4302540.3648620/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGATTTACGTCTCAATGTACCGTTGGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAAGCACACAGAACCTTCCAATGATGGG < SRR4302540.7553471/94‑1 (MQ=60)
TCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGG < SRR4302540.2152043/94‑1 (MQ=60)
TCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGG > SRR4302540.3026647/1‑94 (MQ=60)
TCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAAACTTATCTGAATGTAAAAAAGCAAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGG < SRR4302540.9026882/94‑1 (MQ=60)
CCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGT > SRR4302540.1510080/1‑94 (MQ=60)
CCAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGT > SRR4302540.1510382/1‑94 (MQ=60)
CAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTT > SRR4302540.4127078/1‑94 (MQ=60)
CAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTT > SRR4302540.3382122/1‑94 (MQ=60)
CAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTT < SRR4302540.5000528/94‑1 (MQ=60)
CAGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTT > SRR4302540.9953195/1‑94 (MQ=60)
AGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTC > SRR4302540.5851744/1‑94 (MQ=60)
AGATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTC < SRR4302540.9705665/94‑1 (MQ=60)
ATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCAT > SRR4302540.997664/1‑94 (MQ=60)
ATTTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCAT > SRR4302540.8006454/1‑94 (MQ=60)
TTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATAC > SRR4302540.4418878/1‑94 (MQ=60)
TTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATAC > SRR4302540.9885263/1‑94 (MQ=60)
TTACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATAC < SRR4302540.8846356/94‑1 (MQ=60)
TACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACA > SRR4302540.1976966/1‑94 (MQ=60)
ACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAA > SRR4302540.2290686/1‑94 (MQ=60)
ACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAA < SRR4302540.6575780/94‑1 (MQ=60)
ACTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAA > SRR4302540.8315240/1‑94 (MQ=60)
CTTCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAG < SRR4302540.2575445/94‑1 (MQ=60)
TCGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGGTCATACAAGGT > SRR4302540.1485124/1‑94 (MQ=60)
CGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTG < SRR4302540.1008738/94‑1 (MQ=60)
CGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTG > SRR4302540.9613504/1‑94 (MQ=60)
CGCAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTG > SRR4302540.4353630/1‑94 (MQ=60)
CAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAA > SRR4302540.8867215/1‑94 (MQ=60)
CAATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAA < SRR4302540.5728651/94‑1 (MQ=60)
AATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAAT < SRR4302540.9127536/94‑1 (MQ=60)
AATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAAT < SRR4302540.9666317/94‑1 (MQ=60)
AATGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAAT > SRR4302540.6458770/1‑94 (MQ=60)
TGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCC > SRR4302540.4490992/1‑94 (MQ=60)
TGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCC < SRR4302540.6474350/94‑1 (MQ=60)
TGTACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCC > SRR4302540.4740587/1‑94 (MQ=60)
TACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGC < SRR4302540.1276059/94‑1 (MQ=60)
TACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGC > SRR4302540.124455/1‑94 (MQ=60)
ACCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCT < SRR4302540.7056463/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTG > SRR4302540.4011241/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTG < SRR4302540.8655486/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGA > SRR4302540.8439855/1‑94 (MQ=60)
GTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGAT < SRR4302540.7364535/94‑1 (MQ=60)
GTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGAT < SRR4302540.2284428/94‑1 (MQ=60)
GTTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGAT < SRR4302540.5323621/94‑1 (MQ=60)
TTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATG > SRR4302540.4950778/1‑94 (MQ=60)
TTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATG < SRR4302540.8530132/94‑1 (MQ=60)
|
TTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATG > NC_000913/2772053‑2772239
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
