Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
689,228 |
T→C |
S293G (AGC→GGC) |
lnt ← |
apolipoprotein N‑acyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 689,228 | 0 | T | C | 100.0%
| 695.3
/ NA
| 216 | S293G (AGC→GGC) | lnt | apolipoprotein N‑acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (112/104); total (112/104) |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAA > NC_000913/689138‑689317
|
cACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCAc > 2:1543961/1‑93 (MQ=255)
aCCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCAcc > 1:2948887/1‑93 (MQ=255)
ccTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCt > 2:6246199/1‑93 (MQ=255)
ccTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCt > 2:1179358/1‑93 (MQ=255)
cTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCtt > 1:3724199/1‑93 (MQ=255)
cTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCtt < 1:3128348/93‑1 (MQ=255)
cTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCtt < 1:4315111/93‑1 (MQ=255)
tttACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCttt > 2:4027349/1‑93 (MQ=255)
tttACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCttt > 2:304295/1‑93 (MQ=255)
ttACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTa > 2:4682333/1‑93 (MQ=255)
ccAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCAc < 1:555333/93‑1 (MQ=255)
cAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACg > 2:2694454/1‑93 (MQ=255)
gCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCa > 1:6243812/1‑93 (MQ=255)
gCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCa > 1:5648320/1‑93 (MQ=255)
gCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCa > 1:1364736/1‑93 (MQ=255)
gTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAAc < 1:509200/93‑1 (MQ=255)
gTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAAc < 1:3877895/93‑1 (MQ=255)
gTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAAc < 2:894364/93‑1 (MQ=255)
tgatgGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCAc < 2:3060199/93‑1 (MQ=255)
gatgGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCAcc > 2:2488857/1‑93 (MQ=255)
atgGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTCAGACGCGCGTCGACCATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCg > 1:1920409/1‑93 (MQ=255)
tgGTGTTGTAGGTATCGTAGCTGTTTTGCTTATTGATACCCGCGTCGACAATCCCGGTTGCCAGCGAGCCTCCTTTATCACGCAACTCACCGt < 1:5799054/93‑1 (MQ=255)
tgGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGt > 2:3160264/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGTAGGTATCGTAGCGGGTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCATcc > 2:1613360/1‑93 (MQ=255)
gttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAg > 1:2580596/1‑93 (MQ=255)
gttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAg > 1:47471/1‑93 (MQ=255)
gttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAg < 2:4823816/93‑1 (MQ=255)
ttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCact > 2:4934890/1‑91 (MQ=255)
ttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGt < 2:607045/93‑1 (MQ=255)
tAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCt > 1:3511282/1‑93 (MQ=255)
tAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCt > 1:3075490/1‑93 (MQ=255)
gTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTACCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTg > 2:1937045/1‑93 (MQ=255)
tATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGa < 2:5646055/93‑1 (MQ=255)
tATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGa > 1:4401921/1‑93 (MQ=255)
aTCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAg > 2:3793250/1‑93 (MQ=255)
tCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAgg < 1:67038/93‑1 (MQ=255)
tCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAgg < 2:289626/93‑1 (MQ=255)
tCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAgg < 2:549710/93‑1 (MQ=255)
gTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGaa < 2:5810335/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAAc < 2:5967098/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAAc > 1:6181980/1‑93 (MQ=255)
tAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAAc > 1:2892279/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGt < 1:3186788/93‑1 (MQ=255)
ggTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGtt < 1:1746021/93‑1 (MQ=255)
gTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTg > 2:172549/1‑93 (MQ=255)
gTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTg > 1:5182892/1‑93 (MQ=255)
gTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTg > 2:5468256/1‑93 (MQ=255)
ttCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGc < 2:1351853/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCt < 2:2295793/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCt < 2:34061/93‑1 (MQ=255)
tGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGa > 2:5904732/1‑93 (MQ=255)
tGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGa > 2:167774/1‑93 (MQ=255)
tGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGa < 1:4948746/93‑1 (MQ=255)
cTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGAtt > 1:4154605/1‑93 (MQ=255)
ttATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTa > 1:3094828/1‑93 (MQ=255)
tATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTaa > 1:4522278/1‑93 (MQ=255)
gaCGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCa < 1:2117729/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGa < 1:5885317/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGa > 2:6266346/1‑93 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGa < 2:4122726/93‑1 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGa < 1:4734539/93‑1 (MQ=255)
gcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGAt < 1:2162506/93‑1 (MQ=255)
cgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCgg < 2:5313584/93‑1 (MQ=255)
gTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGt < 1:5488415/93‑1 (MQ=255)
tCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGtt > 2:5653291/1‑93 (MQ=255)
tCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGtt > 1:6023665/1‑93 (MQ=255)
cGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTa < 2:1915979/93‑1 (MQ=255)
cGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTa < 1:816220/93‑1 (MQ=255)
cGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTa < 2:445726/93‑1 (MQ=255)
cGACAAGCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACGCGCCGTCCAGTGCTGTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTa < 1:4596719/93‑1 (MQ=255)
gACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTAt > 1:3962077/1‑93 (MQ=255)
aCAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATc < 1:1628650/93‑1 (MQ=255)
aCAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATc < 2:4340917/93‑1 (MQ=255)
aaTCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGc < 1:1452692/93‑1 (MQ=255)
aaTCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGc < 2:3911021/93‑1 (MQ=255)
aaTCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGGTGCTGATTAATTTCCAGATCGGGTATCGc > 2:708348/1‑93 (MQ=255)
tCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTTCAGATCTGTTATCGCCg > 2:4601681/1‑93 (MQ=255)
tCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCg > 2:5591749/1‑93 (MQ=255)
tCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCg > 2:6174277/1‑93 (MQ=255)
cccGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGa > 2:4392922/1‑93 (MQ=255)
cccGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGa < 1:2259214/93‑1 (MQ=255)
cccGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGa < 2:2628484/93‑1 (MQ=255)
cccGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGa < 2:2351412/93‑1 (MQ=255)
ccGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGAc > 2:5233737/1‑93 (MQ=255)
ggTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTc < 2:3701757/93‑1 (MQ=255)
gTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTcc > 1:2411743/1‑93 (MQ=255)
gTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTca > 1:5864100/1‑92 (MQ=255)
ttACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCg < 1:1312806/93‑1 (MQ=255)
ttACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCg < 2:2228655/93‑1 (MQ=255)
aCCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGc > 2:5631635/1‑93 (MQ=255)
ccAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGcc > 2:2060488/1‑93 (MQ=255)
cAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCa > 1:5411319/1‑93 (MQ=255)
aGCGAGCCACCTTTATCGCGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAg > 1:3595805/1‑93 (MQ=255)
gCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGa > 1:6099638/1‑93 (MQ=255)
gAGCCACCTTTATCACGCAACTCCCCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATa > 1:4567375/1‑93 (MQ=255)
gAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATa > 1:2706218/1‑93 (MQ=255)
gAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATa < 1:3357581/93‑1 (MQ=255)
aGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATaa < 1:593953/93‑1 (MQ=255)
aGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATaa > 1:5235554/1‑93 (MQ=255)
aGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATaa < 1:4065176/93‑1 (MQ=255)
|
CACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAA > NC_000913/689138‑689317
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCA > NC_000913/689135‑689320
|
GCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCC > SRR4302533.5529087/1‑94 (MQ=60)
GCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCC < SRR4302533.4765695/94‑1 (MQ=60)
CGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCA > SRR4302533.1497217/1‑94 (MQ=60)
CGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTGGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCA < SRR4302533.2379259/94‑1 (MQ=60)
GCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCAC > SRR4302533.4104488/1‑94 (MQ=60)
CCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCAC < SRR4302533.4495990/94‑1 (MQ=60)
CACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACC > SRR4302533.2966923/1‑94 (MQ=60)
ACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCT > SRR4302533.6114704/1‑94 (MQ=60)
ACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGCCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCT > SRR4302533.4763482/1‑94 (MQ=60)
CCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTT > SRR4302533.3747048/1‑94 (MQ=60)
CTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTT < SRR4302533.4341092/94‑1 (MQ=60)
CTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTT < SRR4302533.3147580/94‑1 (MQ=60)
TTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTAT < SRR4302533.422406/94‑1 (MQ=60)
TACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATC < SRR4302533.784292/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCAC > SRR4302533.5932316/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCAC > SRR4302533.4530420/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACG > SRR4302533.3057153/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACG < SRR4302533.558625/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGC < SRR4302533.4044810/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCA > SRR4302533.5682467/1‑94 (MQ=60)
AGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCA > SRR4302533.1372936/1‑94 (MQ=60)
AGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCA > SRR4302533.6281187/1‑94 (MQ=60)
GTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACT < SRR4302533.512225/94‑1 (MQ=60)
GTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACT < SRR4302533.3901562/94‑1 (MQ=60)
GTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACT < SRR4302533.2415910/94‑1 (MQ=60)
GTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACT > SRR4302533.188420/1‑94 (MQ=60)
TGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTC > SRR4302533.1783193/1‑94 (MQ=60)
GATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCA < SRR4302533.4701723/94‑1 (MQ=60)
GATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCA > SRR4302533.2165149/1‑94 (MQ=60)
GATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCG < SRR4302533.5667674/94‑1 (MQ=60)
GATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTCAGACGCGCGTCGACCATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCG > SRR4302533.1932132/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGC > SRR4302533.2821477/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTTGTAGGTATCGTAGCTGTTTTGCTTATTGATACCCGCGTCGACAATCCCGGTTGCCAGCGAGCCTCCTTTATCACGCAACTCACCGTC < SRR4302533.5834089/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTC < SRR4302533.5554797/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAG > SRR4302533.2596475/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAG > SRR4302533.5518210/1‑94 (MQ=60)
TGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAG > SRR4302533.47799/1‑94 (MQ=60)
GTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGT < SRR4302533.5921540/94‑1 (MQ=60)
TTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTG > SRR4302533.4407643/1‑94 (MQ=60)
TTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTG < SRR4302533.3142351/94‑1 (MQ=60)
TGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGC < SRR4302533.5173413/94‑1 (MQ=60)
GTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCT > SRR4302533.3094366/1‑94 (MQ=60)
GTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCT > SRR4302533.3532925/1‑94 (MQ=60)
AGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTT < SRR4302533.2611292/94‑1 (MQ=60)
GTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGA > SRR4302533.4428500/1‑94 (MQ=60)
TCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGA < SRR4302533.67474/94‑1 (MQ=60)
TCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGA > SRR4302533.3765212/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAA > SRR4302533.6204779/1‑94 (MQ=60)
CGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAA > SRR4302533.5918480/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAAC > SRR4302533.6219101/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAAC > SRR4302533.2910058/1‑94 (MQ=60)
TAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACG > SRR4302533.1525413/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTT > SRR4302533.4639261/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTT < SRR4302533.3206393/94‑1 (MQ=60)
CGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTT < SRR4302533.2372101/94‑1 (MQ=60)
GGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTG > SRR4302533.5214185/1‑94 (MQ=60)
GGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTG < SRR4302533.1756641/94‑1 (MQ=60)
TGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGAT < SRR4302533.4978712/94‑1 (MQ=60)
TGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGAT < SRR4302533.3097651/94‑1 (MQ=60)
GCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATT < SRR4302533.5226127/94‑1 (MQ=60)
GCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATT > SRR4302533.4179781/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTA > SRR4302533.6255063/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTA > SRR4302533.3113854/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTA > SRR4302533.2189722/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTA > SRR4302533.5340758/1‑94 (MQ=60)
TTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAA > SRR4302533.5653112/1‑94 (MQ=60)
TTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAA > SRR4302533.3587346/1‑94 (MQ=60)
TTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAA > SRR4302533.4549656/1‑94 (MQ=60)
TTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAA < SRR4302533.1641652/94‑1 (MQ=60)
AGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCA > SRR4302533.2573096/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCA > SRR4302533.3154818/1‑94 (MQ=60)
AGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCA < SRR4302533.3803702/94‑1 (MQ=60)
AGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCA > SRR4302533.5696656/1‑94 (MQ=60)
GACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAG < SRR4302533.2130791/94‑1 (MQ=60)
ACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGA > SRR4302533.3487666/1‑94 (MQ=60)
ACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGA > SRR4302533.1429719/1‑94 (MQ=60)
CGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGAT < SRR4302533.4763241/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGAT < SRR4302533.5072054/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGAT < SRR4302533.5920880/94‑1 (MQ=60)
CGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGAT > SRR4302533.5159263/1‑94 (MQ=60)
GCGCGTCGGCAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAATGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCtagacg > SRR4302533.3481632/1‑88 (MQ=60)
GCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATC < SRR4302533.2175812/94‑1 (MQ=60)
GCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATC < SRR4302533.6282385/94‑1 (MQ=60)
CGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCG > SRR4302533.4968883/1‑94 (MQ=60)
CGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCG > SRR4302533.1364040/1‑94 (MQ=60)
GTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTT < SRR4302533.5521503/94‑1 (MQ=60)
GTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTT > SRR4302533.6060169/1‑94 (MQ=60)
CGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTAT < SRR4302533.821004/94‑1 (MQ=60)
CGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTAT > SRR4302533.3986216/1‑94 (MQ=60)
CGACAAGCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACGCGCCGTCCAGTGCTGTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTAT < SRR4302533.4624565/94‑1 (MQ=60)
GACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATC < SRR4302533.4390849/94‑1 (MQ=60)
ACAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCG < SRR4302533.1638515/94‑1 (MQ=60)
CAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGC < SRR4302533.6268861/94‑1 (MQ=60)
CAATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGC > SRR4302533.2984487/1‑94 (MQ=60)
AATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCC < SRR4302533.3220868/94‑1 (MQ=60)
AATCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCC < SRR4302533.1461457/94‑1 (MQ=60)
TCCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGA > SRR4302533.6037959/1‑94 (MQ=60)
CCCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGAC < SRR4302533.2273191/94‑1 (MQ=60)
CCGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACT < SRR4302533.2126973/94‑1 (MQ=60)
CGGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTC > SRR4302533.4623328/1‑94 (MQ=60)
GGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCC > SRR4302533.2426639/1‑94 (MQ=60)
GGTTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCA > SRR4302533.5899554/1‑94 (MQ=60)
TTACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGG < SRR4302533.1320684/94‑1 (MQ=60)
TACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGC > SRR4302533.5890481/1‑94 (MQ=60)
ACCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCC < SRR4302533.3647557/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCA > SRR4302533.5443854/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCA < SRR4302533.3969934/94‑1 (MQ=60)
CAGCGAGCCACCTTTATCGCGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAG > SRR4302533.3617927/1‑94 (MQ=60)
AGCGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGA > SRR4302533.6136475/1‑94 (MQ=60)
CGAGCCACCTTTATCACGCAACTCCCCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATA > SRR4302533.4595062/1‑94 (MQ=60)
CGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATA < SRR4302533.2926080/94‑1 (MQ=60)
CGAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATA > SRR4302533.2722818/1‑94 (MQ=60)
GAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAA < SRR4302533.4583441/94‑1 (MQ=60)
GAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAA > SRR4302533.5267034/1‑94 (MQ=60)
GAGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAA < SRR4302533.3378329/94‑1 (MQ=60)
GAGCCACCATTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAA < SRR4302533.3236011/94‑1 (MQ=60)
AGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAAT < SRR4302533.597456/94‑1 (MQ=60)
AGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAAT < SRR4302533.4089920/94‑1 (MQ=60)
AGCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAAT > SRR4302533.4626707/1‑94 (MQ=60)
GCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATC < SRR4302533.6090403/94‑1 (MQ=60)
GCCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATC < SRR4302533.1283309/94‑1 (MQ=60)
CCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCA > SRR4302533.2098102/1‑94 (MQ=60)
CCACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCA > SRR4302533.876134/1‑94 (MQ=60)
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GCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCA > NC_000913/689135‑689320
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
