Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,426,410 |
T→C |
Q114R (CAG→CGG) |
trs55 ← |
IS5 transposase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,426,410 | 0 | T | C | 100.0%
| 668.4
/ NA
| 207 | Q114R (CAG→CGG) | trs55 | IS5 transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (102/105); total (102/105) |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC > NC_000913/1426321‑1426498
|
cATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATgccgct < 1:6069950/93‑1 (MQ=255)
aTCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTc < 1:2891084/93‑1 (MQ=255)
tCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTTACGGGCCAGTTGATGCCGGTCg > 2:4316020/1‑93 (MQ=255)
tCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCg > 1:3153531/1‑93 (MQ=255)
ccaccaAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGa < 2:4225853/93‑1 (MQ=255)
accaAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGc < 2:1605400/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCTAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAgg > 1:4373012/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAgg > 1:352513/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAgg < 2:5501984/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAgg < 1:690207/93‑1 (MQ=255)
aaGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAggg > 1:732831/1‑92 (MQ=255)
ccTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCgg < 2:1014773/93‑1 (MQ=255)
cTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGa > 1:1941029/1‑93 (MQ=255)
cTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGa > 1:1088338/1‑93 (MQ=255)
tGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGgaa > 2:5384707/1‑93 (MQ=255)
tGGGCCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGaaa < 2:1295638/93‑1 (MQ=255)
gggTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAAAAATTGACGGGCCAGTTGGTTCCGCTCGAGCAGGGGGCGGAAAt > 2:113874/1‑93 (MQ=14)
ggTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAAtt < 2:4565050/93‑1 (MQ=255)
tcatcaTGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCa > 2:1408056/1‑93 (MQ=37)
tcatcaTGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCa > 1:3568695/1‑93 (MQ=37)
tcatcaTGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCa > 1:4164049/1‑93 (MQ=37)
atcatGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCatg > 2:2672941/1‑93 (MQ=255)
tcatGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCatga < 1:5862286/93‑1 (MQ=255)
tcatGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCatga < 2:5147786/93‑1 (MQ=255)
tGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAtgg > 1:2784123/1‑93 (MQ=255)
tGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGAGGCGGAAATTCATGAtgg > 1:2776408/1‑93 (MQ=255)
cGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAtggtgg < 1:5645732/93‑1 (MQ=255)
cGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAtggtgg > 1:5527412/1‑93 (MQ=255)
cGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAtggtgg < 1:5193958/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATggtggt < 1:6268456/93‑1 (MQ=255)
ccTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGgtggtg < 2:655627/93‑1 (MQ=255)
tGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCg > 2:2801502/1‑93 (MQ=255)
gCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGa > 1:3740089/1‑93 (MQ=255)
cTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGAt < 2:3215208/93‑1 (MQ=255)
ttCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATc < 1:4119996/93‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATcc > 2:2003586/1‑93 (MQ=255)
cGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCg < 2:2281826/93‑1 (MQ=255)
cGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCg < 2:234999/93‑1 (MQ=255)
ggCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCgg < 1:5140765/93‑1 (MQ=255)
gccagccaGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGc < 1:3323616/93‑1 (MQ=255)
ccagccagCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCa < 2:3660489/93‑1 (MQ=255)
ccagccagCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCa < 2:1098524/93‑1 (MQ=255)
agccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAgg > 1:3466906/1‑93 (MQ=255)
gccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAggg > 1:2592901/1‑93 (MQ=255)
gccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAggg < 1:962759/93‑1 (MQ=255)
ccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgc < 1:4530714/93‑1 (MQ=255)
ccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgc < 1:628244/93‑1 (MQ=255)
ccagcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgc > 1:3885620/1‑93 (MQ=255)
agcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGgcgc < 1:4820624/93‑1 (MQ=255)
gcGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT‑GTGCGATCCGGCAAGGCGCTa > 1:6181049/1‑93 (MQ=14)
cGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTa > 1:1536575/1‑93 (MQ=255)
gATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTAt < 2:3072580/93‑1 (MQ=255)
gATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTAt < 2:5591247/93‑1 (MQ=255)
aTTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATc < 1:4134166/93‑1 (MQ=255)
aTTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATc < 2:4050407/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAg > 1:389212/1‑93 (MQ=255)
gATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAg > 1:2337255/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAgg < 1:4762807/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAggg > 2:189439/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAggg > 1:1103792/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAggg > 2:1330601/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAggg > 2:4581500/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAggg > 1:5479203/1‑93 (MQ=255)
ggTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGa > 2:6059157/1‑93 (MQ=255)
tCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATa > 2:2178987/1‑93 (MQ=255)
tCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATa > 2:3751488/1‑93 (MQ=255)
tCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATa < 1:1344816/93‑1 (MQ=255)
ttGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAAt > 2:1461612/1‑93 (MQ=255)
tGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATc > 2:5680387/1‑93 (MQ=255)
tGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATc < 2:1694167/93‑1 (MQ=255)
gAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCg < 2:4914800/93‑1 (MQ=255)
aaCAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGGTAATCgg > 1:3117333/1‑93 (MQ=255)
aaCAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCgg > 2:5933543/1‑93 (MQ=255)
aaCAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCgg > 1:3201184/1‑93 (MQ=255)
aCAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCggg < 1:726760/93‑1 (MQ=255)
cAATTGTCGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGc > 2:5237932/1‑93 (MQ=255)
cAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGc > 1:3534295/1‑93 (MQ=255)
aaTTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCa < 2:6221690/93‑1 (MQ=255)
ttGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCaaa < 1:1420879/93‑1 (MQ=255)
tGACGGGCCAGTTTATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAAc < 1:5283471/93‑1 (MQ=255)
gACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACa < 2:2649484/93‑1 (MQ=255)
gACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACa < 1:2387682/93‑1 (MQ=255)
aCGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAg < 2:4970215/93‑1 (MQ=255)
aCGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAg < 2:2565352/93‑1 (MQ=255)
cGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAgg > 2:4201231/1‑93 (MQ=255)
gggCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGgc > 1:1439361/1‑93 (MQ=255)
gggCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGgc > 1:4321157/1‑93 (MQ=255)
gCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGgcgc > 2:785606/1‑93 (MQ=255)
ccAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCa < 2:1055130/93‑1 (MQ=255)
aGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATg < 1:2532174/93‑1 (MQ=255)
aGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATg > 1:5021478/1‑93 (MQ=255)
gTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATgg > 1:1680247/1‑93 (MQ=255)
gTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATgg > 2:3963735/1‑93 (MQ=255)
ttGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGa < 1:2797590/93‑1 (MQ=255)
ttGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGa < 2:2819109/93‑1 (MQ=255)
tGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAg < 2:5626859/93‑1 (MQ=255)
tGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCAGGCAAACAGGAGCATGGAg < 2:6108014/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCTGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAgg < 1:3381470/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAgg < 1:6085648/93‑1 (MQ=255)
gATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAgg > 2:4730646/1‑93 (MQ=255)
|
CATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC > NC_000913/1426321‑1426498
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATT > NC_000913/1426317‑1426502
|
GTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCC < SRR4302533.2960348/94‑1 (MQ=52)
GTGGCATCCACCAAAGTGCCTGGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCC < SRR4302533.5443105/94‑1 (MQ=50)
CATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTC > SRR4302533.2377583/1‑94 (MQ=50)
CATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTC < SRR4302533.4521847/94‑1 (MQ=50)
CATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTC < SRR4302533.6106676/94‑1 (MQ=50)
ATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGTGCCAGTTGATGCCGCTCG > SRR4302533.4383516/1‑94 (MQ=48)
ATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCG < SRR4302533.4192949/94‑1 (MQ=50)
ATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCG < SRR4302533.2908853/94‑1 (MQ=50)
ATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCG > SRR4302533.3172917/1‑94 (MQ=50)
ATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCG > SRR4302533.6335746/1‑94 (MQ=50)
TCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGA < SRR4302533.589088/94‑1 (MQ=50)
CCNCNNNANTGNCNTGGGTNANCATGACGCNTNCTTCGGNCANCCAGCGATTGATGNTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAG < SRR4302533.58393/94‑1 (MQ=60)
CACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGGGC < SRR4302533.6127257/94‑1 (MQ=42)
CCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAG < SRR4302533.5079196/94‑1 (MQ=50)
CAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCTAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGG > SRR4302533.4399410/1‑94 (MQ=46)
CAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGG < SRR4302533.3207970/94‑1 (MQ=48)
CAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGG > SRR4302533.4799148/1‑94 (MQ=48)
CAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGG > SRR4302533.354663/1‑94 (MQ=48)
AAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGT < SRR4302533.694287/94‑1 (MQ=45)
AAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGG > SRR4302533.737141/1‑94 (MQ=45)
CCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGA > SRR4302533.2886164/1‑94 (MQ=38)
CCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGA > SRR4302533.1952866/1‑94 (MQ=38)
CCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGA > SRR4302533.1643836/1‑94 (MQ=38)
CCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGA > SRR4302533.1094748/1‑94 (MQ=38)
CTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGACCAATTGACGGCCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAA < SRR4302533.391385/94‑1 (MQ=35)
GGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATT < SRR4302533.2413467/94‑1 (MQ=30)
GGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTC < SRR4302533.4162122/94‑1 (MQ=28)
GTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCA > SRR4302533.3590690/1‑94 (MQ=25)
GTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCA > SRR4302533.4189277/1‑94 (MQ=25)
ATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGA < SRR4302533.2810045/94‑1 (MQ=25)
TCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGAT < SRR4302533.5897730/94‑1 (MQ=25)
CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCCGGTGGCGGAAATTCAcgctg > SRR4302533.4177775/1‑89 (MQ=25)
CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG > SRR4302533.1110229/1‑94 (MQ=25)
CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG > SRR4302533.1127859/1‑94 (MQ=25)
CATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATG > SRR4302533.5513103/1‑94 (MQ=25)
ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGG > SRR4302533.2801227/1‑94 (MQ=25)
ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGG > SRR4302533.733819/1‑94 (MQ=25)
ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGG > SRR4302533.2793465/1‑94 (MQ=25)
ATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGAGGCGGAAATTCATGATGG > SRR4302533.2793464/1‑94 (MQ=24)
GACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTG < SRR4302533.3985244/94‑1 (MQ=25)
ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG < SRR4302533.6310888/94‑1 (MQ=25)
ACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGG > SRR4302533.5560782/1‑94 (MQ=25)
CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT < SRR4302533.5679864/94‑1 (MQ=25)
CGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGT < SRR4302533.5225287/94‑1 (MQ=25)
GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTG < SRR4302533.777830/94‑1 (MQ=25)
GCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTG < SRR4302533.6305913/94‑1 (MQ=25)
CCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGC < SRR4302533.4564069/94‑1 (MQ=25)
TGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGA > SRR4302533.3763027/1‑94 (MQ=28)
TGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGA > SRR4302533.5087329/1‑94 (MQ=28)
TGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGA > SRR4302533.3480389/1‑94 (MQ=28)
CTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATC < SRR4302533.1434252/94‑1 (MQ=33)
TTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCC < SRR4302533.291255/94‑1 (MQ=35)
TTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCC < SRR4302533.4145015/94‑1 (MQ=35)
GGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGC < SRR4302533.5171835/94‑1 (MQ=38)
GCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCA < SRR4302533.6124913/94‑1 (MQ=38)
GCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCA < SRR4302533.3142211/94‑1 (MQ=38)
GCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCA < SRR4302533.3344142/94‑1 (MQ=38)
CCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAG > SRR4302533.6110791/1‑94 (MQ=40)
CAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGG < SRR4302533.3492787/94‑1 (MQ=43)
CAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGG > SRR4302533.3488302/1‑94 (MQ=43)
CAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGG < SRR4302533.3957865/94‑1 (MQ=43)
AGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCGGGCAGGG > SRR4302533.724966/1‑94 (MQ=39)
AGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGG > SRR4302533.2608835/1‑94 (MQ=45)
GCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGC > SRR4302533.3909325/1‑94 (MQ=48)
GCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGC < SRR4302533.2277888/94‑1 (MQ=48)
GCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGC < SRR4302533.968417/94‑1 (MQ=48)
GCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGC > SRR4302533.4969933/1‑94 (MQ=48)
CCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCG > SRR4302533.5196552/1‑94 (MQ=50)
CCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCG < SRR4302533.631937/94‑1 (MQ=50)
CCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCG < SRR4302533.4558148/94‑1 (MQ=50)
CAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGC > SRR4302533.1409226/1‑94 (MQ=50)
AGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCT < SRR4302533.4849834/94‑1 (MQ=50)
AGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGT‑GTGCGATCCGGCAAGGCGCTA > SRR4302533.6218169/1‑94 (MQ=22)
GCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTA > SRR4302533.1545806/1‑94 (MQ=50)
CGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTAT > SRR4302533.3376010/1‑94 (MQ=50)
ATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCC < SRR4302533.4159259/94‑1 (MQ=50)
TTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCA < SRR4302533.6240884/94‑1 (MQ=50)
TGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAG < SRR4302533.539485/94‑1 (MQ=50)
TGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAG > SRR4302533.391562/1‑94 (MQ=50)
TGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAG > SRR4302533.2351722/1‑94 (MQ=50)
GATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGG > SRR4302533.3328057/1‑94 (MQ=50)
ATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGG < SRR4302533.4791692/94‑1 (MQ=50)
ATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGG > SRR4302533.1110326/1‑94 (MQ=50)
ATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGG < SRR4302533.6026304/94‑1 (MQ=50)
ATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGG > SRR4302533.5512234/1‑94 (MQ=50)
TCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAA < SRR4302533.1352908/94‑1 (MQ=50)
TGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCG > SRR4302533.5296908/1‑94 (MQ=58)
GAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGGTAATCGG > SRR4302533.3136498/1‑94 (MQ=55)
GAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGG > SRR4302533.3220882/1‑94 (MQ=60)
AACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGG > SRR4302533.3549417/1‑94 (MQ=60)
ACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGC > SRR4302533.3556074/1‑94 (MQ=60)
ACAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGC < SRR4302533.731053/94‑1 (MQ=60)
CAATTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCA > SRR4302533.1475301/1‑94 (MQ=60)
TTGACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAAC < SRR4302533.1429474/94‑1 (MQ=60)
TGACGGGCCAGTTTATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACA < SRR4302533.5315124/94‑1 (MQ=55)
GACGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAG < SRR4302533.2402432/94‑1 (MQ=55)
CGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGC > SRR4302533.4347184/1‑94 (MQ=60)
CGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGC < SRR4302533.3324815/94‑1 (MQ=60)
CGGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGC > SRR4302533.1448047/1‑94 (MQ=60)
GGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCG > SRR4302533.1715632/1‑94 (MQ=58)
GGGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCG < SRR4302533.3871676/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGC < SRR4302533.2734004/94‑1 (MQ=60)
GCCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCA < SRR4302533.5575682/94‑1 (MQ=60)
CCAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGCGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCAT > SRR4302533.995683/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATG > SRR4302533.5051890/1‑94 (MQ=60)
CAGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATG > SRR4302533.3672210/1‑94 (MQ=60)
AGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGG < SRR4302533.2547762/94‑1 (MQ=60)
AGTTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGG > SRR4302533.1690425/1‑94 (MQ=60)
TTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAG < SRR4302533.2814795/94‑1 (MQ=60)
TTGATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAG < SRR4302533.4156115/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCTGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC < SRR4302533.3402343/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC < SRR4302533.2513748/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC < SRR4302533.2572239/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC < SRR4302533.6122440/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGC < SRR4302533.3562697/94‑1 (MQ=60)
CCGCTCGAGCAGTGGGCGGAAATTCAGTATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCTATT < SRR4302533.129334/94‑1 (MQ=60)
|
GTGGCATCCACCAAAGTGCCTTGGGTCATCATGACGCCTGCTTCGGCCAGCCAGCGATTGATGGTCTTGAACAATTGACGGGCCAGTTGATGCTGCTCGAGCAGGTGGCGGAAATTCATGATGGTGGTGCGATCCGGCAGGGCGCTATCCAGGGATAATCGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATT > NC_000913/1426317‑1426502
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
