Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,758,261 |
T→C |
E96G (GAA→GGA) |
b1680 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,758,261 | 0 | T | C | 99.4%
| 550.8
/ NA
| 173 | E96G (GAA→GGA) | b1680 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (91/81); minor base G (1/0); total (92/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
TTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTTCTCG > NC_000913/1758171‑1758350
|
ttAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGAtccctccc < 2:3895784/93‑1 (MQ=255)
tAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCcg > 2:2154049/1‑93 (MQ=255)
aGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCcgt < 1:3112203/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCcgtcg > 1:4246852/1‑93 (MQ=255)
gtggtgCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCcgtcgt > 1:4015440/1‑93 (MQ=255)
gtgCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGcc < 1:4565181/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCcgc > 1:3404331/1‑93 (MQ=255)
cTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCcgcg > 2:5791593/1‑93 (MQ=255)
tCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGTCCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCgg < 2:4004914/93‑1 (MQ=255)
tCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCgg > 2:1034716/1‑93 (MQ=255)
tCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCgg > 1:4982776/1‑93 (MQ=255)
ccATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGa < 1:2801344/93‑1 (MQ=255)
ccATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGa > 2:5002652/1‑93 (MQ=255)
ccATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCGGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGa > 1:3378882/1‑93 (MQ=255)
tCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGa > 2:1610265/1‑93 (MQ=255)
tgactgaTGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCTCGGACGAac > 2:2862550/1‑93 (MQ=255)
gactgaTGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAaca < 2:187873/93‑1 (MQ=255)
ctgaTGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACAcc < 2:969170/93‑1 (MQ=255)
tgatgatgaTGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCa < 1:4229391/93‑1 (MQ=255)
gatgatgatGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAg < 1:5472060/93‑1 (MQ=255)
gatgatgatGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAg > 1:476406/1‑93 (MQ=255)
gatgatgatGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAg > 1:4284824/1‑93 (MQ=255)
atgatgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTGCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGc > 1:1046278/1‑93 (MQ=255)
atgatgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGc > 2:809859/1‑93 (MQ=255)
tgatgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGct > 2:2666271/1‑93 (MQ=255)
gatgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGctc < 1:5638488/93‑1 (MQ=255)
gatgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGctc < 1:3256614/93‑1 (MQ=255)
gatgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGctc > 2:4352080/1‑93 (MQ=255)
atgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGctct > 1:864855/1‑93 (MQ=255)
tgatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAGCACCCGCTCtt > 2:3306498/1‑93 (MQ=255)
gatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTc < 1:2589513/93‑1 (MQ=255)
gatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTc < 2:4047648/93‑1 (MQ=255)
gatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTc > 1:5392388/1‑93 (MQ=255)
gatgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTc < 2:1320285/93‑1 (MQ=255)
atgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTcc > 1:3911368/1‑93 (MQ=255)
atgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTcc < 2:288460/93‑1 (MQ=255)
tgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTccg < 1:3884678/93‑1 (MQ=255)
tgTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTccg > 1:3725788/1‑93 (MQ=255)
aTCTCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACGCCAGCTCTTCCGCCGa < 2:6282082/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGaa > 2:494246/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGaa < 2:1103016/93‑1 (MQ=255)
tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGaa > 2:1504282/1‑93 (MQ=255)
tCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGaa < 1:5917623/93‑1 (MQ=255)
cgcccgccCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAAc > 2:2657017/1‑93 (MQ=255)
gcccgcccGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACg < 2:4211388/93‑1 (MQ=255)
ccgcccgcACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACggg > 2:3154457/1‑93 (MQ=255)
ccgcccgcACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACggg < 1:1613455/93‑1 (MQ=255)
cgcccgcACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGc < 2:5364497/93‑1 (MQ=255)
gcccgcACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCa < 2:3934933/93‑1 (MQ=255)
gcACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATtaa < 2:5221848/93‑1 (MQ=255)
gcACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATtaa < 2:4717123/93‑1 (MQ=255)
cACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATtaat > 1:2458828/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATtaata < 1:4726443/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATtaata > 2:4890156/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATtaata < 2:1713849/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATaaa > 1:6235566/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATaaa > 1:1345753/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATaaa > 1:5075061/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAAc > 2:2623906/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAAc < 2:3049851/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAAc < 1:3057614/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACa < 1:1534526/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACa < 2:2767824/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACa < 1:3319269/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACa < 2:3375413/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGATCACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAgaga > 2:2313321/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGa > 1:3229878/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGa < 1:3133178/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGa < 2:5687643/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGAt < 2:2425064/93‑1 (MQ=255)
tGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATg > 2:1741239/1‑93 (MQ=255)
cccAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGccc < 1:1712353/93‑1 (MQ=255)
cacAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGccc < 1:5324331/91‑1 (MQ=255)
ccAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCg > 1:2979362/1‑93 (MQ=255)
cAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGc < 1:2687231/93‑1 (MQ=255)
gCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCtt < 2:5825441/93‑1 (MQ=255)
gCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCtt > 2:921144/1‑93 (MQ=255)
cTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTg > 1:3499510/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTgc < 2:4632752/93‑1 (MQ=255)
tATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTgc > 1:6233338/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTgc > 2:3808034/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTgc > 2:6076007/1‑93 (MQ=255)
tATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTgc < 1:3776034/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTgcgc < 1:2124314/93‑1 (MQ=255)
tGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCa > 1:250969/1‑93 (MQ=255)
gCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACg < 1:5200499/93‑1 (MQ=255)
gACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGtt < 2:1808917/93‑1 (MQ=255)
gACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGtt > 1:2380994/1‑93 (MQ=255)
acgaGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTtc < 1:3239338/90‑1 (MQ=255)
cAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTtctc < 1:5536162/93‑1 (MQ=255)
aGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTcc < 2:3674201/93‑1 (MQ=255)
gATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCa < 2:6196535/93‑1 (MQ=255)
gATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCa > 2:67335/1‑93 (MQ=255)
tGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCAttt > 1:1092596/1‑93 (MQ=255)
gATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCAtttt > 2:425900/1‑93 (MQ=255)
aTCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTtc < 1:1771012/93‑1 (MQ=255)
aTCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGCTCTCCAttttt > 1:3317419/1‑92 (MQ=255)
tccctcccGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGGTCTTACGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCAtttttt > 2:4475849/1‑91 (MQ=255)
tccctcccGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTtct > 2:6218210/1‑93 (MQ=255)
ccTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTTCTCg < 1:4518496/93‑1 (MQ=255)
|
TTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTTCTCG > NC_000913/1758171‑1758350
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTTCTCGGTCG > NC_000913/1758169‑1758354
|
TGTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCC > SRR4302533.5719244/1‑94 (MQ=60)
TGTTAGCGTGGTGCGCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCC < SRR4302533.1505770/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTTCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCC < SRR4302533.919083/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCC < SRR4302533.1596292/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCC < SRR4302533.2971047/94‑1 (MQ=60)
GTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCC < SRR4302533.1872621/94‑1 (MQ=60)
AGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTC > SRR4302533.4570419/1‑94 (MQ=60)
AGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTC < SRR4302533.3131339/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCG > SRR4302533.4272486/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGT > SRR4302533.4039890/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGT > SRR4302533.4731550/1‑94 (MQ=60)
GTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCG > SRR4302533.3957741/1‑94 (MQ=60)
GTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCG < SRR4302533.4592857/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGC > SRR4302533.3425353/1‑94 (MQ=60)
GCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCG > SRR4302533.5396721/1‑94 (MQ=60)
CTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGG > SRR4302533.5012988/1‑94 (MQ=60)
TCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCGGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGA > SRR4302533.3399740/1‑94 (MQ=60)
CCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGAC < SRR4302533.2818577/94‑1 (MQ=60)
CGTCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACG < SRR4302533.3465200/94‑1 (MQ=60)
TCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAA > SRR4302533.1643385/1‑94 (MQ=60)
CTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAAC > SRR4302533.6219892/1‑94 (MQ=60)
ACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACC > SRR4302533.3193156/1‑94 (MQ=60)
ACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACC > SRR4302533.5865807/1‑94 (MQ=60)
ACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACA > SRR4302533.2018051/1‑94 (MQ=60)
CTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCA > SRR4302533.2291520/1‑94 (MQ=60)
CTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCA > SRR4302533.5065876/1‑94 (MQ=60)
TGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAG > SRR4302533.2788587/1‑94 (MQ=60)
TGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAG < SRR4302533.4254960/94‑1 (MQ=60)
TGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAG > SRR4302533.4310571/1‑94 (MQ=60)
TGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAG > SRR4302533.479250/1‑94 (MQ=60)
GATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTGCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGC > SRR4302533.1052426/1‑94 (MQ=60)
GATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGC < SRR4302533.5505036/94‑1 (MQ=60)
ATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCT > SRR4302533.1617116/1‑94 (MQ=60)
ATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCT > SRR4302533.3894726/1‑94 (MQ=60)
TGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTC > SRR4302533.853236/1‑94 (MQ=60)
TGAGGATGTCATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTC < SRR4302533.2674312/94‑1 (MQ=60)
GATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCT < SRR4302533.5672578/94‑1 (MQ=60)
GATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCT > SRR4302533.869920/1‑94 (MQ=60)
GATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCT < SRR4302533.3276698/94‑1 (MQ=60)
TGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTC > SRR4302533.5424786/1‑94 (MQ=60)
GATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCC < SRR4302533.2605427/94‑1 (MQ=60)
GATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCC > SRR4302533.3935255/1‑94 (MQ=60)
GATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCC < SRR4302533.530703/94‑1 (MQ=60)
ATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCG > SRR4302533.3748646/1‑94 (MQ=60)
TGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGC < SRR4302533.3908379/94‑1 (MQ=60)
TATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGA > SRR4302533.4860578/1‑94 (MQ=60)
TCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAAC < SRR4302533.5953385/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACG < SRR4302533.1473541/94‑1 (MQ=60)
GCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGGCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGG > SRR4302533.3717596/1‑94 (MQ=60)
CCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGTACGGGC < SRR4302533.991427/94‑1 (MQ=60)
CCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGC < SRR4302533.3261649/94‑1 (MQ=60)
CCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGC < SRR4302533.1623234/94‑1 (MQ=60)
CGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAA < SRR4302533.3257370/94‑1 (MQ=60)
GCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAAT < SRR4302533.4444826/94‑1 (MQ=60)
GCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAAT > SRR4302533.2474000/1‑94 (MQ=60)
CACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATA < SRR4302533.1278188/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAA < SRR4302533.4755098/94‑1 (MQ=60)
CGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAA > SRR4302533.6272909/1‑94 (MQ=60)
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CGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAA > SRR4302533.5105739/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACA > SRR4302533.3909602/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACA < SRR4302533.3076371/94‑1 (MQ=60)
TGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAG < SRR4302533.3339772/94‑1 (MQ=60)
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TGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAG > SRR4302533.5559507/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGC > SRR4302533.301021/1‑94 (MQ=60)
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GTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGAT < SRR4302533.3152439/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGAT < SRR4302533.2510790/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATG > SRR4302533.5162562/1‑94 (MQ=60)
CCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCG < SRR4302533.1722729/94‑1 (MQ=60)
CCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCG > SRR4302533.2997593/1‑94 (MQ=60)
CACAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCG < SRR4302533.5356240/94‑1 (MQ=60)
CAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCT < SRR4302533.2703706/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTGGCGACCAGATGGATCCCTCCCGTCGTGCCTCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTT < SRR4302533.4029979/94‑1 (MQ=60)
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GCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTG < SRR4302533.428739/94‑1 (MQ=60)
CTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGC > SRR4302533.6270661/1‑94 (MQ=60)
CTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGC < SRR4302533.3334821/94‑1 (MQ=60)
CTATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGC > SRR4302533.3141695/1‑94 (MQ=60)
TATTGGCGACCAGATTGATCCCTCTCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCG < SRR4302533.334469/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCG < SRR4302533.3799179/94‑1 (MQ=60)
TATTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCG < SRR4302533.247149/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGACCAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCA > SRR4302533.252516/1‑94 (MQ=60)
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ACGAGATTGATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCT < SRR4302533.3259301/94‑1 (MQ=60)
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ATCCCTCCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTTCT < SRR4302533.1781793/94‑1 (MQ=60)
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TGTTAGCGTGGTGCTCCATCTGACTGATGATGATGTTATCGCCCGCCCGCACGTTGCTGTTGCCCCAGCTATTGGCGACCAGATTGATCCCTTCCGTCGTGCCGCGGACGAACACCAGCTCTTCCGCCGAACGGGCATTAATAAACAGCGATGCCCGCTTGCGCACGTTCTCCATTTTCTCGGTCG > NC_000913/1758169‑1758354
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
