Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,892,514 |
T→C |
intergenic (+58/+62) |
b1810 → / ← b1811 |
hypothetical protein/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,892,514 | 0 | T | C | 100.0%
| 697.6
/ NA
| 216 | intergenic (+58/+62) | b1810/b1811 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (121/95); total (121/95) |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC > NC_000913/1892424‑1892603
|
tatatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGccc < 1:918113/93‑1 (MQ=255)
atatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCt < 1:5219082/93‑1 (MQ=255)
atatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCt < 2:3786245/93‑1 (MQ=255)
tatGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCtt > 1:4615624/1‑93 (MQ=255)
atGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCttt < 1:1313197/93‑1 (MQ=255)
atGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCttt < 1:4333067/93‑1 (MQ=255)
atGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCttt < 2:612335/93‑1 (MQ=255)
atGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCttt < 2:4486741/93‑1 (MQ=255)
cAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtc > 2:2936511/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtctc > 2:3984730/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtctc > 2:6276691/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtctc > 2:1655191/1‑93 (MQ=255)
ggAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTtctc > 2:1984830/1‑93 (MQ=255)
aaCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAAt < 2:5137378/93‑1 (MQ=255)
aCTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATc < 1:2808435/93‑1 (MQ=255)
aaaGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAAt < 2:3614333/93‑1 (MQ=255)
aaaGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAAt < 1:3527791/93‑1 (MQ=255)
aaGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATg > 1:1171003/1‑93 (MQ=255)
aaGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATg < 1:6229663/93‑1 (MQ=255)
aaGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATg < 2:1001095/93‑1 (MQ=255)
aGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGa < 1:5368588/93‑1 (MQ=255)
gCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGat > 1:2615781/1‑93 (MQ=255)
gCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGat < 1:4131554/93‑1 (MQ=255)
cACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatc < 1:1981418/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatcat < 1:788135/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatcat < 2:17822/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatcatc < 1:4065124/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGatcatc > 2:666764/1‑93 (MQ=255)
gTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCgg > 2:5290269/1‑93 (MQ=255)
gTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCgg < 1:1288297/93‑1 (MQ=255)
gTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCgg > 1:4020933/1‑93 (MQ=255)
tCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCggt > 2:3055039/1‑92 (MQ=255)
tCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGc > 1:3217922/1‑93 (MQ=255)
tCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGc > 2:5568745/1‑93 (MQ=255)
cTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCt > 2:266320/1‑93 (MQ=255)
tGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCtt > 1:5777062/1‑93 (MQ=255)
gAGTTAAATTTATATCAGCATAACTGGGTCAGGACGCTTTTAATTACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATTGGCTTc > 2:919950/1‑93 (MQ=255)
gAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTc < 2:3224647/93‑1 (MQ=255)
aGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCt > 1:955225/1‑93 (MQ=255)
gTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCta < 2:5881911/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAAc > 2:4169607/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAAc < 2:4446388/93‑1 (MQ=255)
tttATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGa < 2:5026835/93‑1 (MQ=255)
tttATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGa > 2:897224/1‑93 (MQ=255)
ttATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGaa > 1:4402610/1‑93 (MQ=255)
tataTCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGaaa < 2:2447695/93‑1 (MQ=255)
atatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAt > 1:1362499/1‑93 (MQ=255)
tatCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATc < 2:2038072/93‑1 (MQ=255)
atCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCg > 2:134005/1‑93 (MQ=255)
tCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGa > 2:4129644/1‑93 (MQ=255)
tCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGa < 2:5017091/93‑1 (MQ=255)
aGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATa < 1:220230/93‑1 (MQ=255)
gCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATAc < 2:3487841/93‑1 (MQ=255)
gCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATAGATAc > 1:2854395/1‑93 (MQ=255)
cATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACg > 1:4660228/1‑93 (MQ=255)
cATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACg < 1:4841980/93‑1 (MQ=255)
tAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGa < 2:3572622/93‑1 (MQ=255)
aaaTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGAt < 1:1547045/93‑1 (MQ=255)
aaTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGAtt > 2:78294/1‑93 (MQ=255)
aaTGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGAtt > 2:488316/1‑93 (MQ=255)
tGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAg > 2:2534003/1‑93 (MQ=255)
tGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAg > 2:6021470/1‑93 (MQ=255)
tGGGTCAGGACGATTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAg > 1:4975415/1‑93 (MQ=255)
ggTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtg < 2:2837850/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgt > 1:3435092/1‑93 (MQ=255)
gTCAGAACGCTTTTAATCACATATAACAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgt < 1:671547/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgtg < 2:4808689/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgtgt < 1:4531840/93‑1 (MQ=255)
cAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAgtgtgt > 1:4364169/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTa > 1:4769092/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTa < 1:3264475/93‑1 (MQ=255)
ggACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTa > 2:3171394/1‑93 (MQ=255)
ggACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATAGATACGGATTAGTGTGTTa > 2:4600689/1‑93 (MQ=255)
ggACGATTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTa > 2:5532774/1‑93 (MQ=255)
gACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTAc > 1:395000/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTc < 2:5777062/93‑1 (MQ=255)
cGCTTTTAATCACATAAGAACAGCGCCCTTTTTCACCCACTCTAATGAACATCGGATTCAATAACAAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTc < 1:6307740/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCg < 2:4110080/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCg < 1:2696906/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCg > 2:4279222/1‑93 (MQ=255)
cTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGt < 2:367242/93‑1 (MQ=255)
ttttAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGtt > 1:2024989/1‑92 (MQ=255)
ttttAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTc > 1:5672875/1‑93 (MQ=255)
ttAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCtt > 1:839120/1‑93 (MQ=255)
tAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTc < 1:367845/93‑1 (MQ=255)
aaTCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCa < 2:1989413/93‑1 (MQ=255)
aTCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCAt > 1:5967370/1‑93 (MQ=255)
aTCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCAt > 2:5325042/1‑93 (MQ=255)
tCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATc > 2:4209703/1‑93 (MQ=255)
tCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATc > 2:75462/1‑93 (MQ=255)
tCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATc > 2:26030/1‑93 (MQ=255)
cacaTATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATcc < 2:4919666/93‑1 (MQ=255)
acaTATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCt > 2:3858107/1‑93 (MQ=255)
atatAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCa > 1:4464309/1‑93 (MQ=255)
atatAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCa > 1:2272808/1‑93 (MQ=255)
atatAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCa > 1:2409403/1‑93 (MQ=255)
tataAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCaa > 2:4158721/1‑93 (MQ=255)
tataAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCaa < 1:4247537/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAc < 2:1210590/93‑1 (MQ=255)
aaGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAcgcg > 1:173183/1‑93 (MQ=255)
|
TATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCC > NC_000913/1892424‑1892603
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > NC_000913/1892421‑1892607
|
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACTTATAAAAAGCGC > SRR4302533.3151282/1‑94 (MQ=60)
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGC < SRR4302533.2202766/94‑1 (MQ=60)
CATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCC > SRR4302533.2955875/1‑94 (MQ=60)
TATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCT < SRR4302533.923507/94‑1 (MQ=60)
ATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTT < SRR4302533.5250494/94‑1 (MQ=60)
ATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTT > SRR4302533.4643576/1‑94 (MQ=60)
ATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTT < SRR4302533.455700/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTT < SRR4302533.4359174/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTT < SRR4302533.1321078/94‑1 (MQ=60)
ATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTT < SRR4302533.1321077/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTT < SRR4302533.667138/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTT > SRR4302533.6112731/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTT < SRR4302533.1312230/94‑1 (MQ=60)
GCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTC < SRR4302533.456459/94‑1 (MQ=60)
GCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTC > SRR4302533.5620237/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCT > SRR4302533.408371/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCT < SRR4302533.4400913/94‑1 (MQ=60)
CAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCT < SRR4302533.2048088/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302533.4841617/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302533.5828799/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTC > SRR4302533.4188171/1‑94 (MQ=60)
AGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAA > SRR4302533.1654203/1‑94 (MQ=60)
AACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATC > SRR4302533.896127/1‑94 (MQ=60)
AACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATC < SRR4302533.4909922/94‑1 (MQ=60)
ACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCA < SRR4302533.2825717/94‑1 (MQ=60)
AAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTCTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAAT < SRR4302533.6296829/94‑1 (MQ=60)
AAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATG > SRR4302533.1178033/1‑94 (MQ=60)
AAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATG < SRR4302533.3549535/94‑1 (MQ=60)
AAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATG < SRR4302533.1609507/94‑1 (MQ=60)
AAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGA < SRR4302533.6266976/94‑1 (MQ=60)
AGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGAT > SRR4302533.2631837/1‑94 (MQ=60)
AGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGAT < SRR4302533.5400838/94‑1 (MQ=60)
AGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACACATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGAT > SRR4302533.410298/1‑94 (MQ=60)
GCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATC < SRR4302533.4156631/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCA < SRR4302533.1993546/94‑1 (MQ=60)
CACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCA > SRR4302533.523407/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCAT > SRR4302533.1194066/1‑94 (MQ=60)
ACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCAT > SRR4302533.2856869/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATC > SRR4302533.265538/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATC < SRR4302533.792766/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCG < SRR4302533.4089868/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCG < SRR4302533.4676750/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGG > SRR4302533.4045419/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGG > SRR4302533.2953107/1‑94 (MQ=60)
GTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGC < SRR4302533.1296050/94‑1 (MQ=60)
GTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGC > SRR4302533.3237764/1‑94 (MQ=60)
TCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCT < SRR4302533.4315216/94‑1 (MQ=60)
TCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCT < SRR4302533.2823971/94‑1 (MQ=60)
CTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTT > SRR4302533.5811954/1‑94 (MQ=60)
TGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTC > SRR4302533.6184808/1‑94 (MQ=60)
GAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCT < SRR4302533.926188/94‑1 (MQ=60)
GAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCT > SRR4302533.960833/1‑94 (MQ=60)
GTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTAT < SRR4302533.2420602/94‑1 (MQ=60)
AATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACG > SRR4302533.1924117/1‑94 (MQ=60)
AATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACG < SRR4302533.3244955/94‑1 (MQ=60)
TTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAA > SRR4302533.1389488/1‑94 (MQ=60)
TTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAA > SRR4302533.4429190/1‑94 (MQ=60)
TATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAAT > SRR4302533.1370685/1‑94 (MQ=60)
ATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATC < SRR4302533.4356604/94‑1 (MQ=60)
TATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCG < SRR4302533.3732664/94‑1 (MQ=60)
TCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGAT < SRR4302533.5781085/94‑1 (MQ=60)
AGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATAC < SRR4302533.221606/94‑1 (MQ=60)
AGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATAGATAC > SRR4302533.2871959/1‑94 (MQ=60)
GCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACG > SRR4302533.4688470/1‑94 (MQ=60)
CATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGG < SRR4302533.4871325/94‑1 (MQ=60)
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ATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGA > SRR4302533.4573665/1‑94 (MQ=60)
AAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATT > SRR4302533.2264829/1‑94 (MQ=60)
AAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATT < SRR4302533.1556368/94‑1 (MQ=60)
AAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATT > SRR4302533.4707253/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTCAGGACGATTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAG > SRR4302533.5005581/1‑94 (MQ=60)
GGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTG < SRR4302533.816785/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGT > SRR4302533.3456312/1‑94 (MQ=60)
GTCAGAACGCTTTTAATCACATATAACAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTG < SRR4302533.675513/94‑1 (MQ=60)
TCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGT > SRR4302533.4390513/1‑94 (MQ=60)
CAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTT < SRR4302533.4559281/94‑1 (MQ=60)
AGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTA > SRR4302533.4797998/1‑94 (MQ=60)
GGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTAC < SRR4302533.3284612/94‑1 (MQ=60)
GGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTAC > SRR4302533.397395/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACT < SRR4302533.2571267/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACT < SRR4302533.5180759/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATAGATACGGATTAGTGTGTTACTC > SRR4302533.3993022/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTTAATCACATAAGAACAGCGCCCTTTTTCACCCACTCTAATGAACATCGGATTCAATAACAAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCG < SRR4302533.6345569/94‑1 (MQ=23)
GCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGT > SRR4302533.736944/1‑94 (MQ=60)
GCTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGT < SRR4302533.2713431/94‑1 (MQ=60)
CTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTT > SRR4302533.2037491/1‑94 (MQ=60)
CTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTC > SRR4302533.3823748/1‑94 (MQ=60)
CTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTC > SRR4302533.2976022/1‑94 (MQ=60)
CTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTC > SRR4302533.5707136/1‑94 (MQ=60)
CTTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTC < SRR4302533.4387495/94‑1 (MQ=60)
TTTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCT < SRR4302533.200127/94‑1 (MQ=60)
TTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGTTCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTT < SRR4302533.3632367/94‑1 (MQ=60)
TTTAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTT > SRR4302533.844033/1‑94 (MQ=60)
TAATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCA < SRR4302533.3347158/94‑1 (MQ=60)
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AATCACATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCAT > SRR4302533.6003495/1‑94 (MQ=60)
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CATATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCA > SRR4302533.2424285/1‑94 (MQ=60)
TATAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAA < SRR4302533.4273173/94‑1 (MQ=60)
TAAAAAGCGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAAC > SRR4302533.5291344/1‑94 (MQ=60)
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CGCCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCAC > SRR4302533.3022889/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > SRR4302533.675555/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > SRR4302533.892398/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > SRR4302533.1785231/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > SRR4302533.1823110/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > SRR4302533.2655882/1‑94 (MQ=60)
|
ACATATATGCAGGAAGAACTAAAAGCACTGGTCTGAGTTAAATTTATATCAGCATAAATGGGTCAGGACGCTTTTAATCACATATAAAAAGCGTCCTTTTTCTCACAATCAAATGATCATCGGCTTCTATAACGAAATCGATACGGATTAGTGTGTTACTCGTCTTCATCCTCAAAACGCGCCACGA > NC_000913/1892421‑1892607
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
