Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,973,993 |
T→C |
E96G (GAA→GGA) |
motB ← |
MotB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,973,993 | 0 | T | C | 98.9%
| 597.6
/ NA
| 190 | E96G (GAA→GGA) | motB | MotB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base C (106/81); minor base A (2/0); total (109/81) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCC > NC_000913/1973903‑1974082
|
tCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccc > 1:1599289/1‑93 (MQ=255)
tCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccc > 2:6177960/1‑93 (MQ=255)
aaCTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTcccccc > 1:3662341/1‑93 (MQ=255)
cTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTg < 1:3480657/93‑1 (MQ=255)
cGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGCTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCttt < 1:3614044/93‑1 (MQ=255)
cGAGATCACCCCGCAATTTCCACAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCttt < 2:2949790/93‑1 (MQ=255)
gagaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTg < 2:152224/93‑1 (MQ=255)
gagaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTg < 2:18468/93‑1 (MQ=255)
agaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTgg > 2:4419353/1‑93 (MQ=255)
agaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTgg > 1:4463879/1‑93 (MQ=255)
gaTCCCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTggg < 1:4905932/93‑1 (MQ=255)
gaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTggg > 2:5241354/1‑93 (MQ=255)
gaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTggg > 1:265878/1‑93 (MQ=255)
gaTCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTCGCTTTggg > 2:359153/1‑93 (MQ=255)
tCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGgtg > 1:4362412/1‑93 (MQ=255)
aCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTa > 2:3043946/1‑93 (MQ=255)
ccGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatc < 2:5346088/93‑1 (MQ=255)
ccGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatc < 2:714964/93‑1 (MQ=255)
gCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatcat > 1:2345205/1‑93 (MQ=255)
aaTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAatcatcc > 2:1387184/1‑92 (MQ=255)
aTTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcac < 1:2204453/93‑1 (MQ=255)
tttCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcacc > 1:4642539/1‑93 (MQ=255)
tttCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcacc < 1:2001054/93‑1 (MQ=255)
ttCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCACCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcacca > 2:431681/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac > 1:3829633/1‑93 (MQ=255)
tCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATcaccac > 1:2970098/1‑93 (MQ=255)
gCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgc > 2:6127986/1‑93 (MQ=255)
gCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgc < 1:4032379/93‑1 (MQ=255)
gCAATCGACTTTGCTCCATGCGGTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgc > 2:3446654/1‑93 (MQ=255)
cAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgcc < 1:4352420/93‑1 (MQ=255)
aaTCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgccg < 2:1040925/93‑1 (MQ=255)
aaTCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAccgccg > 1:1360368/1‑93 (MQ=255)
aTCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCgg < 1:2067455/93‑1 (MQ=255)
tCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCggg > 2:5887219/1‑93 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa < 1:652410/93‑1 (MQ=255)
gACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGaa < 1:5085128/93‑1 (MQ=255)
cTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAtt < 1:3565544/93‑1 (MQ=255)
cTTTGCGCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAtt < 1:4970698/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg > 2:2136611/1‑93 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg < 1:5009353/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTAGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTg < 1:3672639/93‑1 (MQ=255)
ttGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTgg < 2:2104291/93‑1 (MQ=255)
gCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGc < 1:1010092/93‑1 (MQ=255)
tCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCtt > 2:3026832/1‑93 (MQ=255)
ccATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCttt > 2:3872923/1‑93 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc < 2:1534363/93‑1 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc < 1:2114829/93‑1 (MQ=255)
cATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTc > 2:5479789/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc > 1:4269485/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc > 2:2569266/1‑93 (MQ=255)
tGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAc < 2:2341544/93‑1 (MQ=255)
gctttttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACt < 2:1248611/90‑1 (MQ=255)
gTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAt > 2:1766979/1‑93 (MQ=255)
gTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAt < 2:5979606/93‑1 (MQ=255)
ttttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGTCTTTCACTAtt < 2:5067635/93‑1 (MQ=255)
ttttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTAtt < 1:84457/93‑1 (MQ=255)
tttttCATCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTa < 1:5489512/93‑1 (MQ=255)
tttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTa < 1:5398870/93‑1 (MQ=255)
ttttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAg < 2:3323372/93‑1 (MQ=255)
tttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGa < 2:6080904/93‑1 (MQ=255)
tttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGa < 1:1566525/93‑1 (MQ=255)
ttCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGATTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCNCCGCCGGGAATTGGGTTTTCACTNTTAgca > 1:1082377/1‑91 (MQ=255)
aGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATg > 1:4121766/1‑93 (MQ=255)
gCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGc > 2:5604854/1‑93 (MQ=255)
ctctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCg > 1:1452997/1‑93 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa > 1:4182512/1‑93 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa < 1:4877860/93‑1 (MQ=255)
tctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCACCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGa > 1:5645331/1‑93 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt > 1:1907004/1‑93 (MQ=255)
ctTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAt < 1:3861701/93‑1 (MQ=255)
ttCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATc > 2:6238682/1‑93 (MQ=255)
tCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcg > 2:667041/1‑93 (MQ=255)
tCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcg > 2:3501491/1‑93 (MQ=255)
cGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgc > 2:3779221/1‑93 (MQ=255)
gATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgcc > 1:571263/1‑93 (MQ=255)
gATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgcc < 2:1611304/93‑1 (MQ=255)
gATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgcc > 1:2736389/1‑93 (MQ=255)
gATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgcc < 1:2492242/93‑1 (MQ=255)
aTGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccg > 2:2223192/1‑93 (MQ=255)
tGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCCCCAACGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccgc > 2:2423816/1‑93 (MQ=255)
tGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATcgccgc > 2:4558130/1‑93 (MQ=255)
ttCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGccc < 1:5944715/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCg > 1:3147318/1‑93 (MQ=255)
cGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGt < 2:2044335/93‑1 (MQ=255)
ctgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAc < 1:4736522/93‑1 (MQ=255)
ctgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAc > 1:440472/1‑93 (MQ=255)
ctgctTATTCACTACCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAc > 2:3142046/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:5291524/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:2873908/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:5898894/1‑93 (MQ=255)
tgctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAcc > 1:6084755/1‑93 (MQ=255)
gctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCg > 2:6288126/1‑93 (MQ=255)
gctTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCg > 2:1506953/1‑93 (MQ=255)
ttATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCa > 1:392152/1‑93 (MQ=255)
tATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAg > 1:577688/1‑93 (MQ=255)
aTTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGt < 1:6177960/93‑1 (MQ=255)
ttCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTc > 2:5386958/1‑93 (MQ=255)
ttCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTc < 2:2637176/93‑1 (MQ=255)
ttCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTc < 2:1120111/93‑1 (MQ=255)
tCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCg < 1:3407215/93‑1 (MQ=255)
|
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCC > NC_000913/1973903‑1974082
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGTG > NC_000913/1973900‑1974086
|
TCTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTC < SRR4302533.5682211/94‑1 (MQ=60)
CTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCC > SRR4302533.709458/1‑94 (MQ=60)
TATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCC > SRR4302533.3049482/1‑94 (MQ=60)
TATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCC > SRR4302533.5244418/1‑94 (MQ=60)
ATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCC > SRR4302533.1608970/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCC > SRR4302533.3684855/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGG > SRR4302533.116620/1‑94 (MQ=60)
CTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGG < SRR4302533.4256144/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGG < SRR4302533.4304964/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGG < SRR4302533.194225/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGG < SRR4302533.3502129/94‑1 (MQ=60)
GGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCT > SRR4302533.4167381/1‑94 (MQ=60)
TCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTT < SRR4302533.3548820/94‑1 (MQ=60)
CGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTG > SRR4302533.2677043/1‑94 (MQ=60)
CGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTG < SRR4302533.4128314/94‑1 (MQ=60)
CGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGCTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTG < SRR4302533.3636281/94‑1 (MQ=60)
GAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGG > SRR4302533.4490876/1‑94 (MQ=60)
AGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGG > SRR4302533.267497/1‑94 (MQ=60)
GATCCCCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGT < SRR4302533.4935657/94‑1 (MQ=60)
ATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTG > SRR4302533.4388744/1‑94 (MQ=60)
TCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGT < SRR4302533.3692281/94‑1 (MQ=60)
CACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTA > SRR4302533.3915485/1‑94 (MQ=60)
ACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAA > SRR4302533.5738780/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA > SRR4302533.5633920/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA > SRR4302533.3668172/1‑94 (MQ=60)
CCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCA < SRR4302533.3754586/94‑1 (MQ=60)
CGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCAT > SRR4302533.2359719/1‑94 (MQ=60)
CAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCA > SRR4302533.3206293/1‑94 (MQ=60)
AATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCAC < SRR4302533.151601/94‑1 (MQ=60)
ATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACC > SRR4302533.4670666/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACC > SRR4302533.1063448/1‑94 (MQ=60)
ATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACC < SRR4302533.2218040/94‑1 (MQ=60)
TTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCA < SRR4302533.2013377/94‑1 (MQ=60)
TTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAC > SRR4302533.2988257/1‑94 (MQ=60)
TTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCAC > SRR4302533.3853046/1‑94 (MQ=60)
TTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTAGCTTTGGGTGTAATCATCACCAC > SRR4302533.3853047/1‑94 (MQ=60)
TCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACC < SRR4302533.5469630/94‑1 (MQ=60)
CCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCG > SRR4302533.6040341/1‑94 (MQ=60)
CGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGC > SRR4302533.5420637/1‑94 (MQ=60)
GCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCC < SRR4302533.4056925/94‑1 (MQ=60)
CAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCG < SRR4302533.4378685/94‑1 (MQ=60)
CAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCG > SRR4302533.1368541/1‑94 (MQ=60)
AATCGTCTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGG < SRR4302533.4386944/94‑1 (MQ=60)
AATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGG > SRR4302533.4409319/1‑94 (MQ=60)
ATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGG < SRR4302533.2080191/94‑1 (MQ=60)
CGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAA > SRR4302533.3461046/1‑94 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT < SRR4302533.5115858/94‑1 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT > SRR4302533.2807853/1‑94 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT < SRR4302533.656262/94‑1 (MQ=60)
GACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAAT > SRR4302533.2091111/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTG < SRR4302533.3587517/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTG < SRR4302533.5000835/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGG < SRR4302533.5039701/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTAGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGG < SRR4302533.3695209/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGC > SRR4302533.871720/1‑94 (MQ=60)
TCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGGT < SRR4302533.5978109/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT < SRR4302533.1015998/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT < SRR4302533.1409570/94‑1 (MQ=60)
GCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCT < SRR4302533.6176449/94‑1 (MQ=60)
CTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTT > SRR4302533.4450441/1‑94 (MQ=60)
TCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTT > SRR4302533.2440277/1‑94 (MQ=60)
TCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTT > SRR4302533.3611783/1‑94 (MQ=60)
CATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCA < SRR4302533.2127873/94‑1 (MQ=60)
ATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCAC > SRR4302533.4295186/1‑94 (MQ=60)
GTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATT < SRR4302533.6321593/94‑1 (MQ=60)
TTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTA < SRR4302533.84998/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCATCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCCCTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG < SRR4302533.5522603/94‑1 (MQ=60)
TTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAG < SRR4302533.5431313/94‑1 (MQ=60)
TTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAA < SRR4302533.1575957/94‑1 (MQ=60)
TTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGATTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCNCCGCCGGGAATTGGGTTTTCACTNTTAGCA > SRR4302533.1088763/1‑94 (MQ=60)
TCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT < SRR4302533.163095/94‑1 (MQ=60)
TCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGAGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAAT > SRR4302533.4879625/1‑94 (MQ=60)
CAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATG > SRR4302533.4146790/1‑94 (MQ=60)
CAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATG < SRR4302533.657205/94‑1 (MQ=60)
GCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCG > SRR4302533.1461762/1‑94 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA < SRR4302533.2928757/94‑1 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA > SRR4302533.4207842/1‑94 (MQ=60)
CTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCACCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGA > SRR4302533.5679460/1‑94 (MQ=60)
TCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAT < SRR4302533.4907412/94‑1 (MQ=60)
TCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGAT > SRR4302533.1918636/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATC < SRR4302533.3885274/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302533.4984990/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302533.2753174/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302533.2310194/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302533.574637/1‑94 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC < SRR4302533.2210527/94‑1 (MQ=60)
CGATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCC > SRR4302533.4935130/1‑94 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG < SRR4302533.4715101/94‑1 (MQ=60)
GATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCG < SRR4302533.2507590/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGC < SRR4302533.504740/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGC > SRR4302533.4643693/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGC > SRR4302533.5775614/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCC > SRR4302533.2052132/1‑94 (MQ=60)
TGTTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCC < SRR4302533.5032558/94‑1 (MQ=60)
TTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCG > SRR4302533.3166670/1‑94 (MQ=60)
TTCGGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCG < SRR4302533.5980665/94‑1 (MQ=60)
GGCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAA > SRR4302533.5874690/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTTATTCACTCCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAAC > SRR4302533.443103/1‑94 (MQ=60)
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CCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGTG > SRR4302533.4962332/1‑94 (MQ=60)
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TCTATCAACTGGTCGAGATCACCCCGCAATTTCCGCAATCGACTTTGCTCCATGCGTTTTTTCAGCTCTTCGATGTTCGGCTGCTTATTCACTTCCCCCTGGCTTTGGGTGTAATCATCACCACCGCCGGGAATTGGGCTTTCACTATTAGAAATGCGATCGCCGCCCGTAACCGCAGTCGCCAGTG > NC_000913/1973900‑1974086
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
