Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,207,023 |
A→G |
D346G (GAC→GGC) |
yehP → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,207,023 | 0 | A | G | 99.5%
| 638.3
/ NA
| 198 | D346G (GAC→GGC) | yehP | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (100/97); minor base T (0/1); total (100/98) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATC > NC_000913/2206933‑2207112
|
tACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGcc > 1:1663575/1‑93 (MQ=255)
aCTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCcg > 2:4090352/1‑93 (MQ=255)
aCTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCcg > 2:5384325/1‑93 (MQ=255)
aCGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGAt > 1:4381480/1‑93 (MQ=255)
cGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATa < 1:1418101/93‑1 (MQ=255)
gCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAc > 1:4554640/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGc > 2:3890320/1‑93 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc > 1:1531433/1‑93 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc < 1:3581848/93‑1 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGccc < 1:2983813/93‑1 (MQ=255)
gTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAg < 2:5266569/93‑1 (MQ=255)
aaaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcg > 2:131876/1‑93 (MQ=255)
aaaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcg < 2:891964/93‑1 (MQ=255)
aaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcgc < 1:6112306/93‑1 (MQ=255)
aaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcgc > 1:4050881/1‑93 (MQ=255)
aaaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGgcgc > 1:5397670/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCt > 2:2923410/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCt > 2:954667/1‑93 (MQ=255)
aGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTgg < 1:5888521/93‑1 (MQ=255)
gtCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAAt < 2:3542997/93‑1 (MQ=255)
tCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATg < 1:1844067/93‑1 (MQ=255)
ccAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGt > 2:5886122/1‑93 (MQ=255)
ccAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGt < 2:1821833/93‑1 (MQ=255)
cAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTc > 2:1644611/1‑93 (MQ=255)
agagCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCg > 1:3735680/1‑93 (MQ=255)
agagCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCg < 2:619741/93‑1 (MQ=255)
agCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGgc < 1:1005323/93‑1 (MQ=255)
gCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCTCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGgcg < 1:2533887/93‑1 (MQ=255)
gCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGgcg > 1:5785744/1‑93 (MQ=255)
cGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACATTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGgcgc < 1:2402162/93‑1 (MQ=255)
ggCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGGGca > 1:1195994/1‑93 (MQ=255)
gCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGcac > 1:5527946/1‑93 (MQ=255)
cATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGcaca > 1:208472/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaaa < 1:3220406/93‑1 (MQ=255)
tCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaaa > 1:3965692/1‑93 (MQ=255)
tCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACaaa < 2:5296630/93‑1 (MQ=255)
cAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAAt < 2:1556281/93‑1 (MQ=255)
aaaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATa > 2:2179388/1‑93 (MQ=255)
aaGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAg > 1:1044709/1‑93 (MQ=255)
aGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgc < 1:4166496/93‑1 (MQ=255)
aGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgc < 2:490111/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgcc < 2:1039596/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgcc < 2:424515/93‑1 (MQ=255)
cTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgccgcc < 2:2038321/93‑1 (MQ=255)
cTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgccgcc < 1:3144853/93‑1 (MQ=255)
cTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAgccgcc < 2:1476979/93‑1 (MQ=255)
tGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCa > 1:2909956/1‑93 (MQ=255)
tGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCa < 1:6166342/93‑1 (MQ=255)
gggACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGTCGCCAt > 2:5111391/1‑93 (MQ=255)
gggACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCAt > 2:315463/1‑93 (MQ=255)
ggACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATg > 2:2541281/1‑93 (MQ=255)
gACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGa < 2:6052814/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGc < 2:3820756/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGc > 2:3675974/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGc < 2:1911945/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGcc < 1:3396304/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGcc > 2:330251/1‑93 (MQ=255)
gCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCg < 2:664754/93‑1 (MQ=255)
cAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCgg < 2:5941955/93‑1 (MQ=255)
cgcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCg < 2:688083/93‑1 (MQ=255)
gcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGa > 2:5354626/1‑93 (MQ=255)
gcTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGa > 2:6129468/1‑93 (MQ=255)
cTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAg > 1:941287/1‑93 (MQ=255)
cTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAg > 2:4292195/1‑93 (MQ=255)
tCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGc > 2:4762340/1‑93 (MQ=255)
tCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGc > 1:5334961/1‑93 (MQ=255)
cGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCt < 1:196414/93‑1 (MQ=255)
cGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCt < 1:793875/93‑1 (MQ=255)
cGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCt < 2:4730874/93‑1 (MQ=255)
gATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTg > 2:521132/1‑93 (MQ=255)
gATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTg > 2:4302397/1‑93 (MQ=255)
aTAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTgg > 1:2260640/1‑93 (MQ=255)
aTAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTgg > 2:5567428/1‑93 (MQ=255)
tAGCACCGCAACACGTTGCTATGGCCGCGATCCGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGc < 1:4705800/93‑1 (MQ=255)
tAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGc < 1:983737/93‑1 (MQ=255)
tAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGc > 2:861198/1‑93 (MQ=255)
tAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGc < 1:6153167/93‑1 (MQ=255)
aGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGca < 2:3454930/93‑1 (MQ=255)
aGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGca > 1:327265/1‑93 (MQ=255)
gCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcat > 2:4026595/1‑93 (MQ=255)
aCCGCAACCCGTTGCTATGGCCGCTATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca < 2:1396173/93‑1 (MQ=255)
aCCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca > 1:3681867/1‑93 (MQ=255)
aCCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatca < 2:2786123/93‑1 (MQ=255)
ccGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGcatcat < 1:3090396/93‑1 (MQ=255)
cGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATg > 1:5917185/1‑93 (MQ=255)
cGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATg < 2:5333496/93‑1 (MQ=255)
acacCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCtt > 1:4679417/1‑93 (MQ=255)
cacCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCttt > 2:5677534/1‑92 (MQ=255)
acCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCtttt > 2:55329/1‑91 (MQ=255)
acCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCtttg > 2:3629155/1‑91 (MQ=255)
acCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGc < 1:5779432/93‑1 (MQ=255)
ccTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCttttg > 2:1611698/1‑90 (MQ=255)
cTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCgg < 1:5286436/93‑1 (MQ=255)
ttGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTTCggg > 1:5013153/1‑92 (MQ=255)
ttGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGga < 1:6260646/93‑1 (MQ=255)
cTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGaa < 1:5622169/93‑1 (MQ=255)
tATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTTCGGGGaaa > 1:1714440/1‑92 (MQ=255)
tATGGCCGCGATACAGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTTTGGAGGAt > 2:3849985/1‑93 (MQ=255)
aTGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATc < 2:5135245/93‑1 (MQ=255)
aTGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATc < 2:4554640/93‑1 (MQ=255)
|
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATC > NC_000913/2206933‑2207112
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTCA > NC_000913/2206931‑2207116
|
ATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGC > SRR4302533.3547873/1‑94 (MQ=60)
ATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGC > SRR4302533.1434156/1‑94 (MQ=60)
TTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCC < SRR4302533.5406760/94‑1 (MQ=60)
TTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCC > SRR4302533.1673630/1‑94 (MQ=60)
TACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCG > SRR4302533.5418931/1‑94 (MQ=60)
CTTACGCATCAGGTGAAAAAGTATGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCG < SRR4302533.3920231/94‑1 (MQ=60)
CTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGTACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCG > SRR4302533.3269831/1‑94 (MQ=60)
GACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGAT > SRR4302533.4407934/1‑94 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC > SRR4302533.4582262/1‑94 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC < SRR4302533.6202054/94‑1 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC < SRR4302533.4234330/94‑1 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC < SRR4302533.5588673/94‑1 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC > SRR4302533.2958045/1‑94 (MQ=60)
CGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATAC < SRR4302533.1426681/94‑1 (MQ=60)
GCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACG < SRR4302533.4137837/94‑1 (MQ=60)
CATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGG > SRR4302533.4070552/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCC < SRR4302533.1093435/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCC > SRR4302533.1540637/1‑94 (MQ=60)
AGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCA < SRR4302533.3002064/94‑1 (MQ=60)
AGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCA < SRR4302533.3603911/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGG < SRR4302533.6024767/94‑1 (MQ=60)
GTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGG > SRR4302533.1333128/1‑94 (MQ=60)
TGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGC > SRR4302533.1539144/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCG > SRR4302533.1612033/1‑94 (MQ=60)
GAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCG > SRR4302533.2669624/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGC > SRR4302533.4075557/1‑94 (MQ=60)
AAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGC > SRR4302533.5430105/1‑94 (MQ=60)
AAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCT < SRR4302533.6149198/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTG < SRR4302533.4661948/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTG > SRR4302533.3197792/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTG < SRR4302533.3124592/94‑1 (MQ=60)
AAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGG > SRR4302533.5925708/1‑94 (MQ=60)
AGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGT < SRR4302533.5924097/94‑1 (MQ=60)
AGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGT < SRR4302533.5815687/94‑1 (MQ=60)
AGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGT < SRR4302533.5885809/94‑1 (MQ=60)
GTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTT < SRR4302533.904347/94‑1 (MQ=60)
TGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAAT < SRR4302533.5525161/94‑1 (MQ=60)
GTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATG > SRR4302533.4724195/1‑94 (MQ=60)
TCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGT < SRR4302533.1855316/94‑1 (MQ=60)
CCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTC > SRR4302533.3559552/1‑94 (MQ=60)
CAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCG > SRR4302533.3758598/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCG > SRR4302533.5820688/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCG > SRR4302533.5693796/1‑94 (MQ=60)
AGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCG < SRR4302533.1011203/94‑1 (MQ=60)
GCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCTCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGC < SRR4302533.2549486/94‑1 (MQ=60)
CGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGGGCA > SRR4302533.1203182/1‑94 (MQ=60)
CGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACATTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCA < SRR4302533.2416997/94‑1 (MQ=60)
GGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCAC > SRR4302533.5561319/1‑94 (MQ=60)
GCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACA > SRR4302533.209792/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAA > SRR4302533.1878589/1‑94 (MQ=60)
ATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAA > SRR4302533.3989852/1‑94 (MQ=60)
TCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACCAAT > SRR4302533.6185610/1‑94 (MQ=60)
TCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAAT < SRR4302533.3240265/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATA < SRR4302533.3979650/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAG > SRR4302533.1050850/1‑94 (MQ=60)
AGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCC < SRR4302533.4191743/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGC > SRR4302533.2242963/1‑94 (MQ=60)
CTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCA < SRR4302533.3164189/94‑1 (MQ=60)
CTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCA > SRR4302533.2927820/1‑94 (MQ=60)
TGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCAT < SRR4302533.6203403/94‑1 (MQ=60)
GGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATG < SRR4302533.2310521/94‑1 (MQ=60)
GGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGACACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGA > SRR4302533.6208218/1‑94 (MQ=60)
GACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGTGCACAAATAGCCGCCATGAC > SRR4302533.4440214/1‑94 (MQ=60)
GGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCG < SRR4302533.3417277/94‑1 (MQ=60)
GCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAG > SRR4302533.946825/1‑94 (MQ=60)
CTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGC > SRR4302533.5366939/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTG < SRR4302533.197654/94‑1 (MQ=60)
CGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTG < SRR4302533.798546/94‑1 (MQ=60)
GATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGG > SRR4302533.2524546/1‑94 (MQ=60)
GATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGG < SRR4302533.3707692/94‑1 (MQ=60)
GATAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGG > SRR4302533.2274624/1‑94 (MQ=60)
CATAGCACCGCAACACCTGGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGG < SRR4302533.529519/94‑1 (MQ=60)
TAGCACCGCAACACGTTGCTATGGCCGCGATCCGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCA < SRR4302533.4734319/94‑1 (MQ=60)
TAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCA > SRR4302533.1676716/1‑94 (MQ=60)
TAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCA < SRR4302533.6190197/94‑1 (MQ=60)
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TAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCA < SRR4302533.989504/94‑1 (MQ=60)
TAGCACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCA > SRR4302533.329255/1‑94 (MQ=60)
CACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCA > SRR4302533.3704491/1‑94 (MQ=60)
CACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCA < SRR4302533.2075142/94‑1 (MQ=60)
ACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCAT < SRR4302533.5506536/94‑1 (MQ=60)
ACCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCAT < SRR4302533.497582/94‑1 (MQ=60)
CCGCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATG < SRR4302533.3109396/94‑1 (MQ=60)
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GCAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGC > SRR4302533.3381297/1‑94 (MQ=60)
CAACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCT > SRR4302533.970830/1‑94 (MQ=60)
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AACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTT > SRR4302533.4707778/1‑94 (MQ=60)
AACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTT > SRR4302533.714854/1‑94 (MQ=60)
ACACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTG < SRR4302533.3693030/94‑1 (MQ=60)
CACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTCGATAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTCC > SRR4302533.4952103/1‑94 (MQ=60)
ACCTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCG < SRR4302533.5814337/94‑1 (MQ=60)
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CTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTtcggg > SRR4302533.5043527/1‑89 (MQ=60)
CTTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGA < SRR4302533.5318100/94‑1 (MQ=60)
TTGCTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAG < SRR4302533.6298076/94‑1 (MQ=60)
CTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTtcggggaaa > SRR4302533.1724834/1‑85 (MQ=60)
CTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAAT < SRR4302533.5129041/94‑1 (MQ=60)
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CTATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAAT < SRR4302533.5656151/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCTCGATACGGCCCAGGCGCTGTTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCT < SRR4302533.839115/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCT < SRR4302533.1002328/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGCCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTT < SRR4302533.5210142/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTttgggggaatttt > SRR4302533.2806049/1‑81 (MQ=60)
GGCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGAATCATGGCTTtagggggattatg > SRR4302533.4707746/1‑81 (MQ=60)
GCCCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTC < SRR4302533.5060508/94‑1 (MQ=60)
GCCGCGATACGGCCCAGCCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTCA < SRR4302533.3944118/94‑1 (MQ=60)
|
ATTACTGACGCATCAGGTGAAAAAGTGTGTCCAGAGCGGCATCAAAGTGCTGGGACTGGCAGCGCTCGATAGCACCGCAACACCTTGCTATGACCGCGATACGGCCCAGGCGCTGGTTAATGTCGGCGCACAAATAGCCGCCATGACGCCGGGCGAGCTGGCATCATGGCTTGCGGAGAATCTTCA > NC_000913/2206931‑2207116
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
