Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,779,396 |
C→T |
S494N (AGT→AAT) |
ypjA ← |
putative ATP‑binding component of a transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,779,396 | 0 | C | T | 100.0%
| 705.1
/ NA
| 187 | S494N (AGT→AAT) | ypjA | putative ATP‑binding component of a transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (95/92); total (95/92) |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTA > NC_000913/2779306‑2779485
|
tAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTg > 1:194537/1‑93 (MQ=255)
aaTTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGc > 1:1862948/1‑93 (MQ=255)
aTTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGcc > 2:6256857/1‑93 (MQ=255)
ttAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGccc > 2:286211/1‑93 (MQ=255)
aGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGt < 1:413312/93‑1 (MQ=255)
aGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGt < 1:3367465/93‑1 (MQ=255)
aGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGt > 2:3577412/1‑93 (MQ=255)
gCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGtc < 2:3340070/93‑1 (MQ=255)
gCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGtc > 1:3059282/1‑93 (MQ=255)
ctcccctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGtctc > 2:3375838/1‑93 (MQ=255)
tcccctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTcc > 1:1007283/1‑93 (MQ=255)
tcccctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTcc < 2:4500060/93‑1 (MQ=255)
cccctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCt > 2:2954396/1‑93 (MQ=255)
ccctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTg > 2:3825581/1‑93 (MQ=255)
cctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTgg > 1:3154275/1‑93 (MQ=255)
ctccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGt > 2:1005058/1‑93 (MQ=255)
ccGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTa < 1:4576674/93‑1 (MQ=255)
cGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTaa < 1:5437998/93‑1 (MQ=255)
cGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTaa < 1:2104959/93‑1 (MQ=255)
ggTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTTTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAAc < 2:242532/93‑1 (MQ=255)
gTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAAcc > 2:1154649/1‑93 (MQ=255)
tAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAAccc < 1:2664219/93‑1 (MQ=255)
aaTAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAAcccc > 2:3217162/1‑93 (MQ=255)
aTAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCa > 2:6143600/1‑93 (MQ=255)
agtgaagtgaGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCAtg < 2:600923/93‑1 (MQ=255)
agtgaagtgaGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCAtg < 2:4881751/93‑1 (MQ=255)
gaagtgaGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGc < 1:4482231/93‑1 (MQ=255)
agtgaGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCaa < 2:5813078/93‑1 (MQ=255)
gagagaGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATAc < 1:2314307/93‑1 (MQ=255)
gagagaGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATAc < 1:5199330/93‑1 (MQ=255)
gCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCgg > 1:1039237/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGt > 2:4189356/1‑93 (MQ=255)
cTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGt < 2:2663913/93‑1 (MQ=255)
ttgttgTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGta > 1:3659338/1‑93 (MQ=255)
ttgttgTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGta < 2:1450302/93‑1 (MQ=255)
tgttgtATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGtat > 2:1440407/1‑93 (MQ=255)
tgttgtATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGtat > 1:5062791/1‑93 (MQ=255)
gttgtATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGtata < 1:5480565/93‑1 (MQ=255)
tgtATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGa > 1:4218181/1‑93 (MQ=255)
gtATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGACCGTCTCATGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGAc > 1:3879387/1‑93 (MQ=255)
aTCCTTCGATATCAGTCCCTGCTCCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCCATACCGCCGGAATAGACaa < 2:6164494/93‑1 (MQ=255)
tCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAAt < 2:4783779/93‑1 (MQ=255)
cgttCGAGATCAGTCCCTGCACCAGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATc < 1:2996030/91‑1 (MQ=255)
cTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCa > 2:3891863/1‑93 (MQ=255)
ttCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAg > 1:1371608/1‑93 (MQ=255)
ttCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAg < 1:4376631/93‑1 (MQ=255)
ttCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAg > 1:3308763/1‑93 (MQ=255)
tCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGc < 2:5679485/93‑1 (MQ=255)
tCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGc > 2:69905/1‑93 (MQ=255)
tCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGc < 1:4728723/93‑1 (MQ=255)
gacatCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGa > 2:1621007/4‑93 (MQ=255)
gATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGa < 2:5351790/93‑1 (MQ=255)
gATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGa > 2:1843638/1‑93 (MQ=255)
atatCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAg > 1:2952336/1‑93 (MQ=255)
atatCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAg > 1:5909335/1‑93 (MQ=255)
atatCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAg > 2:4432957/1‑93 (MQ=255)
atCAGTCCCTGCCCCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGcc < 2:4342005/93‑1 (MQ=255)
atCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGcc < 1:4369388/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCt > 1:3445238/1‑93 (MQ=255)
cAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTc < 1:5488793/93‑1 (MQ=255)
gTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACTCCATGTGCAATCCCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCg < 1:3376041/93‑1 (MQ=255)
gTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCg < 2:798268/93‑1 (MQ=255)
gTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCg > 1:3997063/1‑93 (MQ=255)
gTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCg < 2:580234/93‑1 (MQ=255)
gTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCg < 2:2287962/93‑1 (MQ=255)
tCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCgg < 2:936085/93‑1 (MQ=255)
tCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCgg < 1:2941565/93‑1 (MQ=255)
cccTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgc > 1:895980/1‑93 (MQ=255)
ccTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgcg > 1:6262818/1‑93 (MQ=255)
cACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTaa < 2:174428/93‑1 (MQ=255)
cACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTaa < 2:5504928/93‑1 (MQ=255)
cACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTaa < 2:4056046/93‑1 (MQ=255)
aCCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAat > 1:3274757/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAat > 1:1392620/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAat > 1:5774785/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAat < 1:2531252/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAata < 1:6107283/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAata < 2:5183119/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAata < 2:5120951/93‑1 (MQ=255)
cccGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAata > 1:2366483/1‑93 (MQ=255)
ccGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAatat < 2:2929817/93‑1 (MQ=255)
ccGTGTGGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAatat < 2:18618/93‑1 (MQ=255)
cGTGTTGGCACCTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATAtt < 1:4825538/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATtg > 2:3382597/1‑93 (MQ=255)
tgtTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATtgc > 2:5978047/1‑93 (MQ=255)
gtTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGACTCCGGCGCTAATATtgct > 1:2187930/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATtgctg > 2:1327971/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATtgctg > 2:1525779/1‑93 (MQ=255)
gCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCa > 1:6023433/1‑93 (MQ=255)
aaCTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAAt < 1:5967204/93‑1 (MQ=255)
aaCTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAAt < 2:2161314/93‑1 (MQ=255)
aaCTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAAt < 2:2048494/93‑1 (MQ=255)
aaCTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAAt < 1:4982876/93‑1 (MQ=255)
cTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTg > 2:1033246/1‑93 (MQ=255)
cTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTg > 2:1656426/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGc > 1:1602837/1‑93 (MQ=255)
tAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGc > 1:385111/1‑93 (MQ=255)
aaaGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGcc < 1:3915857/93‑1 (MQ=255)
gCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTa > 1:5727996/1‑93 (MQ=255)
gCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTa > 2:34122/1‑93 (MQ=255)
|
TAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTA > NC_000913/2779306‑2779485
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCAT > NC_000913/2779303‑2779489
|
ACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCAT < SRR4302533.1530817/94‑1 (MQ=60)
ATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTG < SRR4302533.4715901/94‑1 (MQ=60)
ATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTG < SRR4302533.3408296/94‑1 (MQ=60)
ATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTG > SRR4302533.195764/1‑94 (MQ=60)
ATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTG < SRR4302533.151366/94‑1 (MQ=60)
TAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGC > SRR4302533.1874309/1‑94 (MQ=60)
AATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCC < SRR4302533.2124728/94‑1 (MQ=60)
ATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCC > SRR4302533.1600982/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCC > SRR4302533.5977483/1‑94 (MQ=60)
TTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCG < SRR4302533.128141/94‑1 (MQ=60)
AGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTC > SRR4302533.3982439/1‑94 (MQ=60)
AGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTC > SRR4302533.3078055/1‑94 (MQ=60)
AGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTC < SRR4302533.3388263/94‑1 (MQ=60)
AGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTC < SRR4302533.415793/94‑1 (MQ=60)
CCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTC > SRR4302533.1645281/1‑94 (MQ=60)
CCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTC > SRR4302533.2038203/1‑94 (MQ=60)
CTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCC > SRR4302533.1013175/1‑94 (MQ=60)
TCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCT < SRR4302533.3574003/94‑1 (MQ=60)
CCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGAATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGGGTGGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTG < SRR4302533.2663205/94‑1 (MQ=60)
CCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGG > SRR4302533.3173667/1‑94 (MQ=60)
CCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGG < SRR4302533.537184/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGT > SRR4302533.3771852/1‑94 (MQ=60)
CCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGT > SRR4302533.6010685/1‑94 (MQ=60)
CCGCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGGTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGT < SRR4302533.2978455/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAA < SRR4302533.5780750/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAA < SRR4302533.4604412/94‑1 (MQ=60)
CGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAAC < SRR4302533.5470752/94‑1 (MQ=60)
CGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAAC < SRR4302533.2117939/94‑1 (MQ=60)
GGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACC > SRR4302533.754697/1‑94 (MQ=60)
GTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCC > SRR4302533.5062092/1‑94 (MQ=60)
TAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCC < SRR4302533.2680573/94‑1 (MQ=60)
ATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCAT < SRR4302533.4325719/94‑1 (MQ=60)
AGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGT > SRR4302533.3326476/1‑94 (MQ=60)
GTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTG < SRR4302533.481527/94‑1 (MQ=60)
GAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCA < SRR4302533.1382182/94‑1 (MQ=60)
GAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCA < SRR4302533.4509373/94‑1 (MQ=60)
GTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATA > SRR4302533.2753060/1‑94 (MQ=60)
GAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACC < SRR4302533.5230678/94‑1 (MQ=60)
GAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACC < SRR4302533.4163376/94‑1 (MQ=60)
GAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACC < SRR4302533.2328644/94‑1 (MQ=60)
GAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCG < SRR4302533.6080662/94‑1 (MQ=60)
AGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGG > SRR4302533.1045346/1‑94 (MQ=60)
CTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTA > SRR4302533.3681836/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTAT > SRR4302533.5093382/1‑94 (MQ=60)
GTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAG < SRR4302533.5513608/94‑1 (MQ=60)
GTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAG < SRR4302533.3095541/94‑1 (MQ=60)
CTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAG > SRR4302533.6274912/1‑94 (MQ=60)
TTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGA > SRR4302533.4243694/1‑94 (MQ=60)
TGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGACCGTCTCATGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGAC > SRR4302533.3903059/1‑94 (MQ=60)
GTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACA < SRR4302533.4956937/94‑1 (MQ=60)
ATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAAT > SRR4302533.2233888/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAAT < SRR4302533.3339225/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATC < SRR4302533.925544/94‑1 (MQ=60)
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CTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAG > SRR4302533.1379855/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAG < SRR4302533.5130319/94‑1 (MQ=60)
CTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAG > SRR4302533.4141475/1‑94 (MQ=60)
CTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAG > SRR4302533.3329192/1‑94 (MQ=60)
TTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGC < SRR4302533.4403053/94‑1 (MQ=60)
TTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGC < SRR4302533.4553840/94‑1 (MQ=60)
TCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCG < SRR4302533.4757391/94‑1 (MQ=60)
GATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAG > SRR4302533.5945033/1‑94 (MQ=60)
GATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAG < SRR4302533.5714581/94‑1 (MQ=60)
GATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAG > SRR4302533.2970389/1‑94 (MQ=60)
CATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAG < SRR4302533.296231/94‑1 (MQ=60)
TATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCC > SRR4302533.3261946/1‑94 (MQ=60)
TATCAGGCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCC < SRR4302533.3434342/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCT < SRR4302533.4395764/94‑1 (MQ=60)
ATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCT > SRR4302533.3466512/1‑94 (MQ=60)
TCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTC > SRR4302533.5484788/1‑94 (MQ=60)
CAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCC < SRR4302533.5521883/94‑1 (MQ=60)
AGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTACCCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCG < SRR4302533.3932854/94‑1 (MQ=60)
AGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCG > SRR4302533.5815663/1‑94 (MQ=60)
AGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCG > SRR4302533.4021402/1‑94 (MQ=60)
GTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACTCCATGTGCAATCCCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGG < SRR4302533.3396888/94‑1 (MQ=60)
TCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGC > SRR4302533.901243/1‑94 (MQ=60)
TCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGC < SRR4302533.2959529/94‑1 (MQ=60)
CCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCG > SRR4302533.6300254/1‑94 (MQ=60)
CCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGC > SRR4302533.2329164/1‑94 (MQ=60)
CTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCT > SRR4302533.3884610/1‑94 (MQ=60)
CTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCT > SRR4302533.1887596/1‑94 (MQ=60)
CACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAAT > SRR4302533.3294974/1‑94 (MQ=60)
CACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAAT > SRR4302533.1401010/1‑94 (MQ=60)
CACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAAT > SRR4302533.5809658/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATA > SRR4302533.2381120/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATA < SRR4302533.2546834/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATAT < SRR4302533.6144157/94‑1 (MQ=60)
CCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATAT > SRR4302533.3030408/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATAT < SRR4302533.4484624/94‑1 (MQ=60)
CGTGTTGGCACCTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTG < SRR4302533.4854780/94‑1 (MQ=60)
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GTTGGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTG < SRR4302533.4656624/94‑1 (MQ=60)
GGCAACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCA > SRR4302533.6059936/1‑94 (MQ=60)
AACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATT < SRR4302533.6003328/94‑1 (MQ=60)
AACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATT < SRR4302533.5013089/94‑1 (MQ=60)
AACTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGCTGAACCCCATGTGCAATCCCGCTGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATT < SRR4302533.6003329/94‑1 (MQ=60)
CTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGC > SRR4302533.1612543/1‑94 (MQ=60)
CTAAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGC > SRR4302533.387435/1‑94 (MQ=60)
AAAGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCG < SRR4302533.3939773/94‑1 (MQ=60)
AGCATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTA > SRR4302533.5762586/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCA > SRR4302533.5762685/1‑94 (MQ=60)
TTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCAT < SRR4302533.3303551/94‑1 (MQ=60)
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ACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCGCTAATATTGCTGCCAATTGCCGTACCAT > NC_000913/2779303‑2779489
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
