Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,838,055 |
Δ1 bp |
coding (509/1458 nt) |
ascF → |
PTS system enzyme IIBC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,838,055 | 0 | G | . | 99.6%
| 1027.7
/ ‑3.3
| 225 | coding (509/1458 nt) | ascF | PTS system enzyme IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (107/117); minor base A (1/0); total (108/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > NC_000913/2837969‑2838142
|
aaaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCaa > 2:299974/1‑93 (MQ=255)
aaaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCaaa < 1:3923057/93‑1 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt > 2:6177570/1‑93 (MQ=255)
aaGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAt < 2:4545684/93‑1 (MQ=255)
aGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAtt > 2:445012/1‑93 (MQ=255)
aGGATCGCAGACCTTACCCATTCTGATTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAtt < 2:5811565/93‑1 (MQ=255)
aTCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaa < 1:889845/93‑1 (MQ=255)
tCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTaaa > 2:646154/1‑93 (MQ=255)
cGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCa < 1:200287/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa < 2:5956025/93‑1 (MQ=255)
gACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCaa > 2:4022762/1‑93 (MQ=255)
aCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAat < 2:2789203/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata > 1:4329596/1‑93 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:3850271/93‑1 (MQ=255)
ccTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAata < 2:3118153/93‑1 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 1:825379/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 2:53116/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 2:2327754/1‑93 (MQ=255)
cTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAatat > 2:850529/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:5156375/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 1:2743108/93‑1 (MQ=255)
ttAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCATGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg > 1:3380738/1‑93 (MQ=255)
ttAACCATGCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATg < 2:4726800/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc < 2:698334/93‑1 (MQ=255)
aaCCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTc > 1:1828796/1‑93 (MQ=255)
ccATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGc > 1:4018944/1‑93 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt < 1:3884705/93‑1 (MQ=255)
cATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCt > 2:4856221/1‑93 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg < 1:986304/93‑1 (MQ=255)
aTTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTg < 2:3504252/93‑1 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg > 1:2540006/1‑93 (MQ=255)
ttCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTgg < 2:4194793/93‑1 (MQ=255)
tccgAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGc > 2:2121938/4‑93 (MQ=255)
tCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCCTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGc > 1:714759/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 1:520099/1‑93 (MQ=255)
tGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGa > 1:4796980/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt > 1:2709729/1‑93 (MQ=255)
aaTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAtt > 1:2587263/1‑93 (MQ=255)
aTGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTg > 1:235655/1‑93 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa < 2:5875925/93‑1 (MQ=255)
tgATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa < 2:3162488/93‑1 (MQ=255)
ggATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCTTGCCGCTGATGGTCGCGGCTTCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCa > 2:2093732/2‑93 (MQ=255)
tGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgc > 1:1322070/1‑93 (MQ=255)
ggTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATcgcg < 2:2206746/93‑1 (MQ=255)
gTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCgg < 2:874237/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGgtg < 2:626537/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGtgtg > 2:2814413/1‑93 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc > 1:5896522/1‑93 (MQ=255)
gTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGc > 2:2833325/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt < 1:654599/93‑1 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt > 2:3474649/1‑93 (MQ=255)
tGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCt < 1:4848150/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTg > 2:3315373/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGt > 2:3705888/1‑93 (MQ=255)
ttcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTa > 2:6126929/1‑93 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc > 2:1173559/1‑93 (MQ=255)
tcttcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTAc < 1:4171290/93‑1 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc < 1:3474649/93‑1 (MQ=255)
tcttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATc < 2:5561020/93‑1 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc > 1:3189608/1‑93 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc > 1:6120808/1‑93 (MQ=255)
cttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATcc > 2:3608667/1‑93 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg > 2:443406/1‑93 (MQ=255)
ttcCTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCg < 1:6265601/93‑1 (MQ=255)
ccTGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAg > 1:5651278/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGtt < 2:5734049/93‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTa > 1:5544623/1‑93 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt > 2:6247308/1‑93 (MQ=255)
gCTGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCAGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAt > 2:5094162/1‑93 (MQ=255)
tGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 1:5748027/93‑1 (MQ=255)
tGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 2:5199132/93‑1 (MQ=255)
tGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 2:1763020/93‑1 (MQ=255)
tGATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTg < 2:82070/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGa > 1:6056176/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa > 2:577277/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGaa > 2:240830/1‑93 (MQ=255)
ggTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt > 1:4548843/1‑93 (MQ=255)
ggTCGCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACt > 1:4056827/1‑93 (MQ=255)
cgcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAt < 1:5453306/89‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg > 2:182845/4‑93 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 1:3787022/90‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 1:3070088/90‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 1:4280883/90‑1 (MQ=255)
gcggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATg < 1:5395434/90‑1 (MQ=255)
cggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATgg < 1:5014/91‑1 (MQ=255)
cggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATgg < 1:1188435/91‑1 (MQ=255)
cggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATgg < 1:623165/91‑1 (MQ=255)
cggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATgg < 1:1010791/91‑1 (MQ=255)
ggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGc < 1:412316/92‑1 (MQ=255)
ggcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGc < 2:1938899/92‑1 (MQ=255)
gcATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCg < 2:1300316/93‑1 (MQ=255)
cATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGa > 1:3524591/1‑93 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa > 2:4669903/1‑93 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa < 1:2060609/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa < 2:3036047/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa > 1:5786584/1‑93 (MQ=255)
tCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGaaa < 2:3401614/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAg < 1:3565830/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAg < 1:1150491/93‑1 (MQ=255)
tGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGc < 1:2265892/93‑1 (MQ=255)
|
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC > NC_000913/2837969‑2838142
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > NC_000913/2837965‑2838148
|
TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CAT < SRR4302533.4760295/94‑1 (MQ=60)
AAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAA > SRR4302533.2838921/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT > SRR4302533.5567494/1‑94 (MQ=60)
AAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAAT < SRR4302533.3947010/94‑1 (MQ=60)
AGGATCGCCGTCCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTCGGG‑GCATCTGCCGC‑CATCAAATTT < SRR4302533.1535671/94‑1 (MQ=60)
GGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTA > SRR4302533.274669/1‑94 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA > SRR4302533.1923724/1‑94 (MQ=60)
GATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAA < SRR4302533.1264942/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAA < SRR4302533.895071/94‑1 (MQ=60)
CGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTTGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAAC > SRR4302533.6277215/1‑94 (MQ=60)
CCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCA < SRR4302533.3183636/94‑1 (MQ=60)
CGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAA < SRR4302533.201557/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302533.486148/94‑1 (MQ=60)
GACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAAT < SRR4302533.2054543/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302533.4554842/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA > SRR4302533.4355680/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA > SRR4302533.4086819/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA < SRR4302533.3996799/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATA > SRR4302533.731218/1‑94 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302533.830223/1‑94 (MQ=60)
CCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATAT > SRR4302533.801023/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302533.2588852/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302533.2574257/1‑94 (MQ=60)
CTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCATGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATG > SRR4302533.3401608/1‑94 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302533.5187509/94‑1 (MQ=60)
TTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGT < SRR4302533.2759926/94‑1 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC > SRR4302533.1839962/1‑94 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302533.649294/94‑1 (MQ=60)
TAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTC < SRR4302533.4308599/94‑1 (MQ=60)
ACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGC > SRR4302533.4043416/1‑94 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG < SRR4302533.3908406/94‑1 (MQ=60)
CATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTG > SRR4302533.3056576/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG < SRR4302533.992076/94‑1 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG > SRR4302533.4881605/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGG > SRR4302533.2555641/1‑94 (MQ=60)
TTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCCTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGC > SRR4302533.718977/1‑94 (MQ=60)
TCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCG > SRR4302533.5831277/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA > SRR4302533.523187/1‑94 (MQ=60)
CTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGA > SRR4302533.4826037/1‑94 (MQ=60)
TGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGAT > SRR4302533.4224242/1‑94 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT > SRR4302533.2726359/1‑94 (MQ=60)
GAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATT > SRR4302533.2603169/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302533.237106/1‑94 (MQ=60)
AATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTG > SRR4302533.6084894/1‑94 (MQ=60)
ATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGC < SRR4302533.629820/94‑1 (MQ=60)
TGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCC > SRR4302533.3832095/1‑94 (MQ=60)
GTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCA > SRR4302533.229660/1‑94 (MQ=60)
GATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATC > SRR4302533.4770970/1‑94 (MQ=60)
GATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATC < SRR4302533.3436816/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302533.5195394/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCG < SRR4302533.5698730/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATCTCGCTCGCGATTGCCATCG > SRR4302533.3725585/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGC > SRR4302533.1330003/1‑94 (MQ=60)
GGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGT < SRR4302533.393345/94‑1 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTG > SRR4302533.4153897/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTG < SRR4302533.1659127/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGCTTTCTTCTCCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT < SRR4302533.2503930/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGT > SRR4302533.5455205/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGC > SRR4302533.5932129/1‑94 (MQ=60)
GTTCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCT < SRR4302533.3501836/94‑1 (MQ=60)
GTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCT > SRR4302533.5462637/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTG < SRR4302533.658464/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTG < SRR4302533.3221025/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTG < SRR4302533.4877531/94‑1 (MQ=60)
GCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGG > SRR4302533.1093182/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGT < SRR4302533.5753359/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACA < SRR4302533.4196567/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACA < SRR4302533.3559212/94‑1 (MQ=60)
TCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACA > SRR4302533.2235675/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATC > SRR4302533.6044534/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGGGTGCTGGTACATC > SRR4302533.5182619/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302533.3496088/94‑1 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC > SRR4302533.6157717/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC > SRR4302533.3209227/1‑94 (MQ=60)
TCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCC < SRR4302533.2683441/94‑1 (MQ=60)
CTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCG > SRR4302533.5621883/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGA < SRR4302533.6303044/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAG > SRR4302533.5685436/1‑94 (MQ=60)
TCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAG < SRR4302533.4060593/94‑1 (MQ=60)
TCCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAG < SRR4302533.222087/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGT > SRR4302533.6185427/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT > SRR4302533.1172266/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTT > SRR4302533.4159186/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302533.5791124/94‑1 (MQ=60)
GCCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTT < SRR4302533.669025/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTA > SRR4302533.5578112/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT < SRR4302533.3493837/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTAT > SRR4302533.4746355/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTG < SRR4302533.139310/94‑1 (MQ=60)
TGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA > SRR4302533.5126826/1‑94 (MQ=60)
TGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA > SRR4302533.6092849/1‑94 (MQ=60)
TGATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGA < SRR4302533.5782703/94‑1 (MQ=60)
ATGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAAC > SRR4302533.6118615/1‑94 (MQ=60)
TGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT > SRR4302533.4081523/1‑94 (MQ=60)
TGGTC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACT > SRR4302533.4576428/1‑94 (MQ=60)
TC‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGAT < SRR4302533.682397/94‑1 (MQ=60)
C‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302533.3988297/94‑1 (MQ=60)
C‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302533.910730/94‑1 (MQ=60)
C‑GCGGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATG < SRR4302533.5486153/94‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302533.4306619/91‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302533.5427855/91‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302533.3810210/91‑1 (MQ=60)
gcgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGG < SRR4302533.3088936/91‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC > SRR4302533.850845/3‑94 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.1195570/92‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.626825/92‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.1016704/92‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.5268930/92‑1 (MQ=60)
cgGCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGC < SRR4302533.5062/92‑1 (MQ=60)
G‑GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCG < SRR4302533.414791/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGA > SRR4302533.3546313/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA > SRR4302533.5821538/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAA > SRR4302533.3782230/1‑94 (MQ=60)
TCTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAG < SRR4302533.2073316/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302533.1157382/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGC < SRR4302533.3587807/94‑1 (MQ=60)
TGCCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCG < SRR4302533.2279910/94‑1 (MQ=60)
CCGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGC > SRR4302533.2446821/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC > SRR4302533.344558/1‑94 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC < SRR4302533.217439/94‑1 (MQ=60)
CGC‑CATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCC < SRR4302533.6135756/94‑1 (MQ=60)
CCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > SRR4302533.4152010/1‑94 (MQ=60)
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TGACAAAAGGATCGCCGACCTTAACCATTCTGAATGTGATTGGTGACGGTGCTTTCTTCTTCCTGCCGCTGATGGTC‑GC‑GCATCTGCCGCGCATCAAATTTAAAACCAATATGTCGCTGGCGATTGCCATCGCGGGTGTGCTGGTACATCCGAGTTTTATTGAACTGATGGCGAAAGCGGCCCA > NC_000913/2837965‑2838148
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
