Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,219 |
T→C |
V584A (GTT→GCT) |
recQ → |
ATP‑dependent DNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,219 | 0 | T | C | 99.6%
| 802.7
/ ‑5.6
| 248 | V584A (GTT→GCT) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (107/140); total (107/141) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG > NC_000913/4005129‑4005308
|
gccgTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTgg < 2:2248101/93‑1 (MQ=255)
gccgTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTgg > 1:2960521/1‑93 (MQ=255)
cgTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGa < 2:3651219/93‑1 (MQ=255)
gTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGAt < 1:4258319/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATgcg > 1:4544824/1‑93 (MQ=255)
gtggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATgcgc > 2:1361869/1‑93 (MQ=255)
ggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCaa > 1:4893100/1‑93 (MQ=255)
ggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCaa > 2:4570052/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAg < 1:4316784/93‑1 (MQ=255)
tgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGc > 1:2746565/1‑93 (MQ=255)
gtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCt > 2:4893333/1‑93 (MQ=255)
acgacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAc < 1:5490172/93‑1 (MQ=255)
gacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGc > 2:86495/1‑93 (MQ=255)
gacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGc < 1:1658651/93‑1 (MQ=255)
gacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGc > 2:5619233/1‑93 (MQ=255)
acgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCt > 2:1444587/1‑93 (MQ=255)
cgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCtt < 1:1973360/93‑1 (MQ=255)
cgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCtt < 1:4809344/93‑1 (MQ=255)
cgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCtt > 2:1820217/1‑93 (MQ=255)
gCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCttt < 2:668009/93‑1 (MQ=255)
aaCCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCGGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTgg < 2:5923282/93‑1 (MQ=255)
aaCCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTgg > 1:5662317/1‑93 (MQ=255)
ccTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCa > 2:2652952/1‑93 (MQ=255)
ttgattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCaaa < 1:2592554/93‑1 (MQ=255)
ctgattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCaaa < 1:6267550/92‑1 (MQ=255)
tgattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAAc < 1:3424466/93‑1 (MQ=255)
attgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCg < 2:5083776/93‑1 (MQ=255)
attgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCg < 1:1359468/93‑1 (MQ=255)
attgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCg > 2:3986576/1‑93 (MQ=255)
ttgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGt > 1:1078860/1‑93 (MQ=255)
gagaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGttt < 2:6000945/93‑1 (MQ=255)
agaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTa < 2:3859729/93‑1 (MQ=255)
gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAt > 2:2182224/1‑93 (MQ=255)
gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAt > 1:865765/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATgg > 2:372961/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATgg > 1:3679439/1‑93 (MQ=255)
ggCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGgc < 2:150168/93‑1 (MQ=255)
ggCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGgc < 1:5256043/93‑1 (MQ=255)
ggCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGgc < 1:5355309/93‑1 (MQ=255)
gCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGgcg > 1:2305496/1‑93 (MQ=255)
cTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGgcgc < 1:2331660/93‑1 (MQ=255)
tGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCt > 1:5010096/1‑93 (MQ=255)
gAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTg < 1:102429/93‑1 (MQ=255)
aGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTc < 2:5771115/93‑1 (MQ=255)
aGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTc > 1:2681245/1‑93 (MQ=255)
gATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCg > 2:1099845/1‑93 (MQ=255)
tGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTg < 2:3479014/93‑1 (MQ=255)
gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgc > 1:1732177/1‑93 (MQ=255)
ccGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgcg > 1:3644823/1‑93 (MQ=255)
ccGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgcg > 1:5153622/1‑93 (MQ=255)
cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgcgc > 2:5230012/1‑93 (MQ=255)
gATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCa < 1:374786/93‑1 (MQ=255)
gATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCa > 1:6096551/1‑93 (MQ=255)
gATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCa > 1:4611527/1‑93 (MQ=255)
gATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGCTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCa > 2:2570341/1‑93 (MQ=255)
aTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAt < 2:5173511/93‑1 (MQ=255)
aTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAt < 2:3082339/93‑1 (MQ=255)
aTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAt > 1:2099972/1‑93 (MQ=255)
cACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGt > 2:2698453/1‑93 (MQ=255)
cccGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGtt < 1:5915621/92‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGtt < 2:3802132/93‑1 (MQ=255)
cGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGa < 2:177210/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGAt < 1:5950897/93‑1 (MQ=255)
ccAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATg > 1:5589636/1‑93 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGTTTCGTGCGCATGTTGATgg < 2:6134863/93‑1 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATgg > 2:2026501/1‑93 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATgg < 2:772331/93‑1 (MQ=255)
aGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGc > 2:1679975/1‑93 (MQ=255)
aGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGc < 2:3215639/93‑1 (MQ=255)
gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAt < 2:6227095/93‑1 (MQ=255)
aaaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg > 1:3597799/1‑93 (MQ=255)
aaaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg < 1:3825626/93‑1 (MQ=255)
aaaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg > 2:1247679/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGa > 2:2997619/1‑93 (MQ=255)
aaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGa < 1:1409522/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAc < 1:4172243/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAc < 1:1204910/93‑1 (MQ=255)
aTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAc < 2:2116871/93‑1 (MQ=255)
gCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGa < 1:4389122/93‑1 (MQ=255)
gCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGa < 2:159189/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGaa < 1:313440/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGaa < 1:3342613/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCGTGAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGaa < 1:3109217/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAag > 2:2357302/1‑93 (MQ=255)
tCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAag > 2:4270784/1‑93 (MQ=255)
cAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGGGATGACGAaga < 2:4979839/93‑1 (MQ=255)
cAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAaga < 2:408704/93‑1 (MQ=255)
cAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAaga < 1:4698944/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAagag < 2:3567923/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAagag < 1:4045209/93‑1 (MQ=255)
gctttAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagt < 2:1171060/90‑1 (MQ=255)
gCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagt > 2:5599461/1‑93 (MQ=255)
gTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagtag < 2:57628/93‑1 (MQ=255)
tAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTc < 1:4681858/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTca < 2:252625/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTca > 1:5746273/1‑93 (MQ=255)
aCGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 1:1559392/93‑1 (MQ=255)
cGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagc < 2:3144444/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca < 1:243469/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca < 1:4481445/93‑1 (MQ=255)
|
CGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG > NC_000913/4005129‑4005308
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATA > NC_000913/4005127‑4005312
|
CCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCT < SRR4302533.1002340/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTG > SRR4302533.4573912/1‑94 (MQ=60)
CCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTG < SRR4302533.4264195/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTG < SRR4302533.5330065/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGG > SRR4302533.2978619/1‑94 (MQ=60)
GCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGG < SRR4302533.1997321/94‑1 (MQ=60)
CCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGA > SRR4302533.2161851/1‑94 (MQ=60)
CCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGA > SRR4302533.4766996/1‑94 (MQ=60)
CGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGAT > SRR4302533.5216540/1‑94 (MQ=60)
CGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGAT > SRR4302533.4319663/1‑94 (MQ=60)
GTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATG > SRR4302533.5676727/1‑94 (MQ=60)
GTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATG < SRR4302533.4283987/94‑1 (MQ=60)
GTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATG > SRR4302533.1609358/1‑94 (MQ=60)
GTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATG > SRR4302533.2959002/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCG > SRR4302533.4572349/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCG > SRR4302533.4270766/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGC > SRR4302533.6206889/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCA > SRR4302533.5786107/1‑94 (MQ=60)
TGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAA > SRR4302533.4922760/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAG < SRR4302533.4595620/94‑1 (MQ=60)
GGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAG < SRR4302533.1407868/94‑1 (MQ=60)
GTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGC > SRR4302533.2763403/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGC < SRR4302533.4342778/94‑1 (MQ=60)
TGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCT < SRR4302533.1340971/94‑1 (MQ=60)
TGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCT < SRR4302533.660201/94‑1 (MQ=60)
GTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTG < SRR4302533.4516424/94‑1 (MQ=60)
TTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGG > SRR4302533.4947029/1‑94 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCGAGCTGGAAC < SRR4302533.3762808/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302533.1391633/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302533.357856/94‑1 (MQ=60)
ACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACG < SRR4302533.5523268/94‑1 (MQ=60)
CGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGC > SRR4302533.877901/1‑94 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT < SRR4302533.1668684/94‑1 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT < SRR4302533.3417288/94‑1 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT < SRR4302533.3060868/94‑1 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT > SRR4302533.147058/1‑94 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT > SRR4302533.4715061/1‑94 (MQ=60)
CGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTT < SRR4302533.3843968/94‑1 (MQ=60)
CGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTT < SRR4302533.366652/94‑1 (MQ=60)
CGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTT < SRR4302533.4838493/94‑1 (MQ=60)
CGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTT > SRR4302533.4700063/1‑94 (MQ=60)
CGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTT < SRR4302533.1985441/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGG > SRR4302533.5696528/1‑94 (MQ=60)
AACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGC > SRR4302533.781691/1‑94 (MQ=60)
AACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGC > SRR4302533.3151834/1‑94 (MQ=60)
AACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGC < SRR4302533.3288901/94‑1 (MQ=60)
TTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAAC < SRR4302533.2608486/94‑1 (MQ=60)
CTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAAC < SRR4302533.6305001/94‑1 (MQ=60)
TGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACC < SRR4302533.3445622/94‑1 (MQ=60)
GATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCG < SRR4302533.4479732/94‑1 (MQ=60)
ATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGT > SRR4302533.1085219/1‑94 (MQ=60)
ATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGT < SRR4302533.1367639/94‑1 (MQ=60)
TTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTT > SRR4302533.1793364/1‑94 (MQ=60)
TTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTT > SRR4302533.2692118/1‑94 (MQ=60)
TGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTT < SRR4302533.417832/94‑1 (MQ=60)
GAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCATTAACGGCGCTGGGATGGGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTA > SRR4302533.2422976/1‑94 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT < SRR4302533.2444343/94‑1 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT < SRR4302533.5966578/94‑1 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT > SRR4302533.870835/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGG > SRR4302533.3702055/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGC < SRR4302533.2338698/94‑1 (MQ=60)
GGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCG > SRR4302533.2319779/1‑94 (MQ=60)
GGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCG < SRR4302533.5287613/94‑1 (MQ=60)
GGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCG < SRR4302533.5387455/94‑1 (MQ=60)
GTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT < SRR4302533.5255048/94‑1 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT > SRR4302533.5040448/1‑94 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT < SRR4302533.2346097/94‑1 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT > SRR4302533.3843343/1‑94 (MQ=60)
TGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTG > SRR4302533.3684139/1‑94 (MQ=60)
GAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGA > SRR4302533.4675108/1‑94 (MQ=60)
GAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGA < SRR4302533.103067/94‑1 (MQ=60)
AACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGAT > SRR4302533.5050695/1‑94 (MQ=60)
AACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGAT < SRR4302533.5666226/94‑1 (MQ=60)
CAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTC > SRR4302533.2697674/1‑94 (MQ=60)
AGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCG < SRR4302533.1150433/94‑1 (MQ=60)
GATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGT < SRR4302533.171093/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTG < SRR4302533.2463875/94‑1 (MQ=60)
TGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGC > SRR4302533.1742679/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTTGTATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCG < SRR4302533.5429905/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCG < SRR4302533.4123928/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCG > SRR4302533.5184750/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCG > SRR4302533.3667235/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCG > SRR4302533.6117565/1‑94 (MQ=60)
CCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGC > SRR4302533.2303994/1‑94 (MQ=60)
CGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCA > SRR4302533.5413552/1‑94 (MQ=60)
CGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCA > SRR4302533.6133376/1‑94 (MQ=60)
CGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCA > SRR4302533.4639467/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT > SRR4302533.2112925/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT < SRR4302533.377049/94‑1 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT < SRR4302533.2928475/94‑1 (MQ=60)
ATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATG < SRR4302533.1077069/94‑1 (MQ=60)
TCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGT < SRR4302533.5372203/94‑1 (MQ=60)
CACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTT < SRR4302533.3070495/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTG < SRR4302533.5951371/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTG < SRR4302533.3909993/94‑1 (MQ=60)
CGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGAT < SRR4302533.3309817/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATG < SRR4302533.5986892/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATG > SRR4302533.5623404/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGG < SRR4302533.2714810/94‑1 (MQ=60)
AGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCG < SRR4302533.4358226/94‑1 (MQ=60)
GCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGA > SRR4302533.1631540/1‑94 (MQ=60)
GAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATG > SRR4302533.43246/1‑94 (MQ=60)
GAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATG > SRR4302533.3619936/1‑94 (MQ=60)
AAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGA < SRR4302533.3849015/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATTAC < SRR4302533.5992206/94‑1 (MQ=60)
AATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAC < SRR4302533.1418043/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAATCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACG < SRR4302533.4468449/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACG < SRR4302533.1212150/94‑1 (MQ=60)
ATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACG < SRR4302533.4197525/94‑1 (MQ=60)
TGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGA > SRR4302533.481824/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGA > SRR4302533.4864551/1‑94 (MQ=60)
GCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAA < SRR4302533.4415622/94‑1 (MQ=60)
GCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAA < SRR4302533.1205432/94‑1 (MQ=60)
CTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAG < SRR4302533.3363273/94‑1 (MQ=60)
CTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAG < SRR4302533.315356/94‑1 (MQ=60)
CTCAGCGTGAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAG < SRR4302533.3128329/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGA < SRR4302533.5875597/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAG < SRR4302533.4727428/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGT < SRR4302533.4069829/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGT < SRR4302533.3453949/94‑1 (MQ=60)
GCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTA < SRR4302533.1863848/94‑1 (MQ=60)
GCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTA < SRR4302533.5728172/94‑1 (MQ=60)
GCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTA < SRR4302533.2645711/94‑1 (MQ=60)
GTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGT > SRR4302533.552355/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGT < SRR4302533.4929595/94‑1 (MQ=60)
TAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCA > SRR4302533.5780946/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCA < SRR4302533.4710227/94‑1 (MQ=60)
TAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCA > SRR4302533.3685557/1‑94 (MQ=60)
ACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGC < SRR4302533.1568780/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG < SRR4302533.4508555/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG < SRR4302533.244978/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCA > SRR4302533.4263298/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTAGTGCGCATGTTGAAGGCGATGACGAAGAGGAGGCAGCAGCA > SRR4302533.1986613/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGCTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGAGGGCGACGCCGAAGAGGAGTCAGCAGCA > SRR4302533.1986612/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT < SRR4302533.758643/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT > SRR4302533.4151128/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT > SRR4302533.606782/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT > SRR4302533.5437055/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATA > SRR4302533.173144/1‑94 (MQ=60)
CTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATA < SRR4302533.2183233/94‑1 (MQ=60)
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CCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATA > NC_000913/4005127‑4005312
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
