Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,171,379 |
C→T |
A240V (GCC→GTC) |
birA → |
biotin‑[acetyl‑CoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,171,379 | 0 | C | T | 100.0%
| 853.3
/ NA
| 234 | A240V (GCC→GTC) | birA | biotin‑[acetyl‑CoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (108/126); total (108/126) |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGCCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATA > NC_000913/4171289‑4171468
|
cAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCa > 1:2037397/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCAt > 2:2482708/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCAt > 1:1984352/1‑93 (MQ=255)
aaTGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCAt > 2:5326399/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATg > 2:2022206/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATg > 2:3114509/1‑93 (MQ=255)
aTGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATg > 1:2934297/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGc > 1:3592584/1‑93 (MQ=255)
gcgcCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCt < 1:3837634/93‑1 (MQ=255)
cgcCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATTAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTa < 1:6144149/93‑1 (MQ=255)
cgcCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTa < 1:5886498/93‑1 (MQ=255)
gcCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTaa < 2:4833541/93‑1 (MQ=255)
gcCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTaa < 2:5174040/93‑1 (MQ=255)
gcCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTaa < 2:5379362/93‑1 (MQ=255)
ccGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAAt < 2:464963/93‑1 (MQ=255)
ccGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAAt > 2:882651/1‑93 (MQ=255)
cGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATa > 2:5858160/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATAc > 1:362574/1‑93 (MQ=255)
tgtTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACg > 2:5620666/1‑93 (MQ=255)
tgtTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACg > 2:3867237/1‑93 (MQ=255)
tgtTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACg < 2:5789215/93‑1 (MQ=255)
ttGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTg > 2:4511172/1‑93 (MQ=255)
gAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGaa < 2:3360983/93‑1 (MQ=255)
agagagTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAAtt > 2:3452834/1‑93 (MQ=255)
gagTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACg < 2:3027556/93‑1 (MQ=255)
tgtCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGtgc < 2:2237712/93‑1 (MQ=255)
gtCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGtgct < 2:5372392/93‑1 (MQ=255)
tCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGtgctg > 1:5452718/1‑93 (MQ=255)
cGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGtgctgc < 1:2903037/93‑1 (MQ=255)
cGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGtgctgc < 1:4038656/93‑1 (MQ=255)
cGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGtgctgc < 2:2057632/93‑1 (MQ=255)
gTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCg > 2:2651776/1‑93 (MQ=255)
aTCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTgg < 1:4239503/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGAGAATTACGTGCTGCGTTgg < 2:6145580/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGaa < 2:60973/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGaa > 1:552226/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAc > 2:1349549/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAc > 2:3600247/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAc < 1:5705852/93‑1 (MQ=255)
aGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAc > 1:4921436/1‑93 (MQ=255)
aGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAc < 2:5055197/93‑1 (MQ=255)
ggggTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAct > 1:172346/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAct > 1:648812/1‑93 (MQ=255)
gTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCtt > 1:4380163/1‑93 (MQ=255)
gTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATCACGTGCTGCGTTGGAACTCtt < 2:4010472/93‑1 (MQ=255)
ggATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCg > 2:1777439/1‑93 (MQ=255)
ggATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCg > 2:1239731/1‑93 (MQ=255)
gATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGa < 2:3192141/93‑1 (MQ=255)
gATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGa > 1:452304/1‑93 (MQ=255)
aTCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGaa < 1:4682173/93‑1 (MQ=255)
aTCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGaa < 1:442618/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAAc < 2:5578307/93‑1 (MQ=255)
cACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACa > 2:2915425/1‑93 (MQ=255)
cACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACa < 1:3332997/93‑1 (MQ=255)
gCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGCACTCTTCGAACaaga > 2:3317010/1‑93 (MQ=255)
gCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACaaga > 2:3808547/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACaagaag < 2:2142691/93‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAgg < 1:5498359/93‑1 (MQ=255)
gCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAgg > 1:3694266/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGa < 1:5794232/93‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGAt < 2:2783960/93‑1 (MQ=255)
aGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGCTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGAt < 1:1302314/93‑1 (MQ=255)
ggAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGAtt > 2:1682805/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGAtt < 2:4342057/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTg < 2:2400563/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTg < 2:2855379/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTg > 1:3515319/1‑93 (MQ=255)
gAAGCGGGGATAAATCTCGATCGTAATAGGTTGGCGGTCATGCTAATTCGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGCATTg > 2:4427195/1‑93 (MQ=255)
ggcgATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCAcc < 1:1922355/90‑1 (MQ=255)
gggATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCt < 1:1376182/93‑1 (MQ=255)
gggATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCt < 1:5267916/93‑1 (MQ=255)
gATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTa < 1:2733051/93‑1 (MQ=255)
aTCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTAt < 2:6051621/93‑1 (MQ=255)
tCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATc < 2:4789310/93‑1 (MQ=255)
tCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATc < 1:710764/93‑1 (MQ=255)
cAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCt < 1:5651718/93‑1 (MQ=255)
aaTCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTg > 2:1902983/1‑93 (MQ=255)
aaTCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTg < 1:4613839/93‑1 (MQ=255)
aTCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGt > 1:776045/1‑93 (MQ=255)
cGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTcgcg > 1:6222668/1‑93 (MQ=255)
cGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTcgcg > 2:1613472/1‑93 (MQ=255)
gATCGTAATACGTGGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCgcgc < 1:5404337/93‑1 (MQ=255)
aTCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCt < 1:1632182/93‑1 (MQ=255)
aTCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCt < 2:2371486/93‑1 (MQ=255)
cGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTgg < 2:3663781/93‑1 (MQ=255)
cGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTgg > 2:3387966/1‑93 (MQ=255)
cGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTgg < 1:866105/93‑1 (MQ=255)
gTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTggg > 1:487829/1‑93 (MQ=255)
gTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTggg > 1:2354308/1‑93 (MQ=255)
aaTACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGaa > 1:4969812/1‑93 (MQ=255)
aTACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGaaa < 1:558190/93‑1 (MQ=255)
tACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGaaaa < 1:4074674/93‑1 (MQ=255)
tACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGaaaa > 1:1009723/1‑93 (MQ=255)
cGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGc < 2:694043/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTg < 1:4264653/93‑1 (MQ=255)
tGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTgg > 1:1862884/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTgg > 2:3004521/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTgg < 2:2335572/93‑1 (MQ=255)
ggcggtCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGa < 2:5936910/93‑1 (MQ=255)
gcggtCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGAt < 1:2486917/93‑1 (MQ=255)
|
CAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGCCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATA > NC_000913/4171289‑4171468
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGCCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATAATT > NC_000913/4171288‑4171471
|
GCAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCA > SRR4302533.2049960/1‑94 (MQ=60)
GCAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCA < SRR4302533.5985704/94‑1 (MQ=60)
GCAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCA < SRR4302533.5516482/94‑1 (MQ=60)
CAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCAT > SRR4302533.2001457/1‑94 (MQ=60)
CAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCAT < SRR4302533.787426/94‑1 (MQ=60)
CAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCAT > SRR4302533.1996492/1‑94 (MQ=60)
AATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATG > SRR4302533.2952238/1‑94 (MQ=60)
AATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATG < SRR4302533.209773/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGC > SRR4302533.3614695/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGC > SRR4302533.5535777/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCT > SRR4302533.718567/1‑94 (MQ=60)
GCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTA < SRR4302533.3861081/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATTAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAA < SRR4302533.6181144/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAA < SRR4302533.5922066/94‑1 (MQ=60)
CGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAA > SRR4302533.2933694/1‑94 (MQ=60)
GCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAAT > SRR4302533.2658674/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTTAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACCCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATAC < SRR4302533.4966940/94‑1 (MQ=60)
CGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATAC > SRR4302533.4061591/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATAC > SRR4302533.364779/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATAC > SRR4302533.3171555/1‑94 (MQ=60)
CGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATAC > SRR4302533.4162626/1‑94 (MQ=60)
AGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTA > SRR4302533.3574825/1‑94 (MQ=60)
AGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTA < SRR4302533.948800/94‑1 (MQ=60)
GAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTAC < SRR4302533.2383035/94‑1 (MQ=60)
GAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTAC > SRR4302533.6061263/1‑94 (MQ=60)
GAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTAC > SRR4302533.634038/1‑94 (MQ=60)
AAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTAC < SRR4302533.4055455/94‑1 (MQ=60)
AGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACG < SRR4302533.4273659/94‑1 (MQ=60)
AGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCCCGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCCTGCTAATACGTGAATTACGTC > SRR4302533.3826609/1‑94 (MQ=60)
AGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTG < SRR4302533.5589394/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGC < SRR4302533.1284807/94‑1 (MQ=60)
GTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGC < SRR4302533.5841643/94‑1 (MQ=60)
TGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCT < SRR4302533.2825831/94‑1 (MQ=60)
TGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCT < SRR4302533.4380848/94‑1 (MQ=60)
TGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCT > SRR4302533.5678038/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTG > SRR4302533.5485562/1‑94 (MQ=60)
CGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCG < SRR4302533.2920867/94‑1 (MQ=60)
CGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCG < SRR4302533.4063230/94‑1 (MQ=60)
CGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCG > SRR4302533.3716292/1‑94 (MQ=60)
GTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGT > SRR4302533.5425403/1‑94 (MQ=60)
TAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTG > SRR4302533.1844214/1‑94 (MQ=60)
AATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGG < SRR4302533.4868104/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGA < SRR4302533.444444/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGA < SRR4302533.4265108/94‑1 (MQ=60)
TCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAA > SRR4302533.555500/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAC > SRR4302533.4951248/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAC > SRR4302533.4335500/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAAC < SRR4302533.5754507/94‑1 (MQ=60)
AGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACT > SRR4302533.3615921/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACT > SRR4302533.173434/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACT < SRR4302533.5740315/94‑1 (MQ=60)
AGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACT > SRR4302533.1950468/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACT > SRR4302533.652638/1‑94 (MQ=60)
AGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGCGCTGCGTTGGAACT > SRR4302533.652637/1‑94 (MQ=60)
GGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTT < SRR4302533.4164296/94‑1 (MQ=60)
GGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTT > SRR4302533.4406608/1‑94 (MQ=60)
TGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGGGTTGGAACTCTTCG < SRR4302533.6070035/94‑1 (MQ=60)
GGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGA > SRR4302533.455013/1‑94 (MQ=60)
GATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAA < SRR4302533.206294/94‑1 (MQ=60)
GATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAA > SRR4302533.4782193/1‑94 (MQ=60)
GATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAA < SRR4302533.172858/94‑1 (MQ=60)
ATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAAC < SRR4302533.445264/94‑1 (MQ=60)
ATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAAC < SRR4302533.4710543/94‑1 (MQ=60)
CACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAA < SRR4302533.3353591/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAG < SRR4302533.1504687/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAG > SRR4302533.551840/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAA > SRR4302533.6228444/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAG < SRR4302533.269198/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGG > SRR4302533.3716958/1‑94 (MQ=60)
GCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGA < SRR4302533.5531523/94‑1 (MQ=60)
CAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGAT < SRR4302533.5829237/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGCTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATT < SRR4302533.1310144/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTG > SRR4302533.4990012/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTG < SRR4302533.4919933/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTG > SRR4302533.3536985/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGC > SRR4302533.4092306/1‑94 (MQ=60)
CGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACC < SRR4302533.1560724/94‑1 (MQ=60)
GGCGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCT < SRR4302533.1934087/94‑1 (MQ=60)
GGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTT < SRR4302533.5299519/94‑1 (MQ=60)
GGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTT < SRR4302533.1384463/94‑1 (MQ=60)
GGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTA < SRR4302533.1978975/94‑1 (MQ=60)
GATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTAT < SRR4302533.2749817/94‑1 (MQ=60)
ATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATC < SRR4302533.4682150/94‑1 (MQ=60)
TCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCT < SRR4302533.714961/94‑1 (MQ=60)
TCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCT < SRR4302533.67303/94‑1 (MQ=60)
CAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTG < SRR4302533.3561634/94‑1 (MQ=60)
CAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTG < SRR4302533.5685876/94‑1 (MQ=60)
AATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGT > SRR4302533.780603/1‑94 (MQ=60)
AATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGT < SRR4302533.4641787/94‑1 (MQ=60)
ATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTC > SRR4302533.4606041/1‑94 (MQ=60)
ATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTC > SRR4302533.1357962/1‑94 (MQ=60)
TCGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCG > SRR4302533.6259962/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGC > SRR4302533.5241287/1‑94 (MQ=60)
GATCGTAATACGTGGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCT < SRR4302533.5436813/94‑1 (MQ=60)
ATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTG > SRR4302533.369469/1‑94 (MQ=60)
ATCGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTG < SRR4302533.1642069/94‑1 (MQ=60)
CGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGG > SRR4302533.2368866/1‑94 (MQ=60)
CGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGG < SRR4302533.871177/94‑1 (MQ=60)
CGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGG < SRR4302533.3447357/94‑1 (MQ=60)
CGTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGG > SRR4302533.490746/1‑94 (MQ=60)
GTAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGA > SRR4302533.1735375/1‑94 (MQ=60)
TAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAA > SRR4302533.4999943/1‑94 (MQ=60)
TAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAA > SRR4302533.5419985/1‑94 (MQ=60)
TAATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAA > SRR4302533.458172/1‑94 (MQ=60)
AATACGTTGGCTGTAATGCTAATACGTGAATGACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAA < SRR4302533.77565/94‑1 (MQ=60)
AATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAA < SRR4302533.5581180/94‑1 (MQ=60)
ATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAA > SRR4302533.1015628/1‑94 (MQ=60)
ATACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAA < SRR4302533.561506/94‑1 (MQ=60)
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TACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAG < SRR4302533.4099480/94‑1 (MQ=60)
TACGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAG < SRR4302533.3188022/94‑1 (MQ=60)
CGTTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCT < SRR4302533.5511940/94‑1 (MQ=60)
TTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGG > SRR4302533.1874244/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGG < SRR4302533.4290338/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGA > SRR4302533.5458574/1‑94 (MQ=60)
TGGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGA < SRR4302533.4470258/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGAT < SRR4302533.574072/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATA < SRR4302533.2502236/94‑1 (MQ=60)
CGGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATAA < SRR4302533.5734675/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATAAT < SRR4302533.4620732/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATAAT > SRR4302533.2289511/1‑94 (MQ=60)
GTCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATAATT < SRR4302533.1417627/94‑1 (MQ=60)
|
GCAATGCGCCGTGTTGAAGAGAGTGTCGTTAATCAGGGGTGGATCACGCTGCAGGAAGCGGGGATCAATCTCGATCGTAATACGTTGGCGGCCATGCTAATACGTGAATTACGTGCTGCGTTGGAACTCTTCGAACAAGAAGGATTGGCACCTTATCTGTCGCGCTGGGAAAAGCTGGATAATT > NC_000913/4171288‑4171471
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
