Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1061 |
294.1 |
15065038 |
98.6% |
14854127 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,448,543 |
+C |
intergenic (+48/‑90) |
ytfQ → / → ytfR |
putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,448,542 | 1 | . | C | 99.2%
| 719.9
/ ‑1.6
| 246 | intergenic (+47/‑91) | ytfQ/ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (143/101); total (144/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CG‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448461‑4448623
|
aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg > 2:2707693/1‑93 (MQ=37)
aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg > 1:5184553/1‑93 (MQ=37)
aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg < 1:4296606/93‑1 (MQ=37)
aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg < 2:2781884/93‑1 (MQ=37)
gaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCg > 2:5019078/1‑93 (MQ=37)
aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa > 1:5952261/1‑93 (MQ=37)
aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa > 1:5622992/1‑93 (MQ=37)
aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa < 2:2727869/93‑1 (MQ=37)
ttAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATg < 2:370847/93‑1 (MQ=37)
ttAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATg > 2:1515780/1‑93 (MQ=37)
agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGc < 2:1580558/93‑1 (MQ=37)
agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGc < 1:7123884/93‑1 (MQ=37)
aagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCAc < 1:4012173/93‑1 (MQ=37)
agaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACt > 1:778534/1‑93 (MQ=37)
gaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTg > 2:5325257/1‑93 (MQ=37)
agaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGaa > 1:2645404/1‑93 (MQ=37)
gaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAg > 1:5749213/1‑93 (MQ=37)
aaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGc < 1:4044776/93‑1 (MQ=37)
aaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGc < 1:5722209/93‑1 (MQ=37)
aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc > 2:1955109/1‑93 (MQ=37)
aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 2:6008745/93‑1 (MQ=37)
aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 1:1989271/93‑1 (MQ=37)
aaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCt > 1:6446466/1‑93 (MQ=37)
aaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCt < 2:3959610/93‑1 (MQ=37)
aaTATGGGGTATTGAGGTTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTGGGCGGGAAAGGGCCCT‑‑CGCGCCCCACCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg < 1:2520544/93‑1 (MQ=255)
aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg > 2:3028803/1‑93 (MQ=37)
aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg < 1:2799070/93‑1 (MQ=37)
aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg > 2:1215862/1‑93 (MQ=37)
atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa < 1:1200016/93‑1 (MQ=37)
atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa < 2:3385002/93‑1 (MQ=37)
atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa > 1:5325376/1‑93 (MQ=37)
tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:2885801/1‑93 (MQ=37)
tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt < 2:4289226/93‑1 (MQ=37)
tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 1:4091542/1‑93 (MQ=25)
atGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAGGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATg < 2:323074/93‑1 (MQ=37)
tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:6728920/1‑93 (MQ=25)
tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:7277802/1‑93 (MQ=25)
tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:4555668/1‑93 (MQ=25)
gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa < 1:1139022/93‑1 (MQ=25)
gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCCCC‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa < 1:2940679/93‑1 (MQ=25)
ggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGAc < 1:2881673/93‑1 (MQ=25)
gTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACg > 1:6489060/1‑93 (MQ=25)
tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 2:4598861/1‑93 (MQ=25)
tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:1877079/1‑93 (MQ=25)
tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 2:2588681/1‑93 (MQ=25)
tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:7210117/1‑93 (MQ=25)
aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt < 2:5733596/93‑1 (MQ=25)
aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt > 1:2242021/1‑93 (MQ=25)
tGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTa < 2:2060734/93‑1 (MQ=25)
gAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAc < 1:2715246/93‑1 (MQ=25)
aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc > 1:1687839/1‑93 (MQ=25)
aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc < 1:6565452/93‑1 (MQ=25)
gggTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcg > 1:3063412/1‑93 (MQ=25)
gggTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcg > 2:5859940/1‑93 (MQ=25)
gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCGCTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 2:2392762/1‑93 (MQ=25)
gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 1:4391015/1‑93 (MQ=25)
gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 2:2314919/1‑93 (MQ=25)
gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt < 1:3429580/93‑1 (MQ=25)
tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCCCG‑C‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 1:5086182/1‑93 (MQ=21)
gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 2:4892112/1‑93 (MQ=21)
gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 2:4903233/1‑93 (MQ=21)
ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 2:5692630/93‑1 (MQ=25)
ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 2:4214896/93‑1 (MQ=21)
cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCCCTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg < 1:7447138/93‑1 (MQ=21)
cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:3604922/1‑93 (MQ=21)
tGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGc > 2:1329458/1‑93 (MQ=21)
gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 1:3926248/93‑1 (MQ=21)
gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:4737629/93‑1 (MQ=21)
gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:5188721/93‑1 (MQ=21)
gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc > 2:4624288/1‑93 (MQ=21)
tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 1:1112484/1‑93 (MQ=21)
tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 1:5373845/1‑93 (MQ=21)
gCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTAc > 2:1124695/1‑93 (MQ=21)
ccGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCAGCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACt < 2:3492978/93‑1 (MQ=18)
cGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg > 2:6306460/1‑93 (MQ=21)
cGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg < 2:6179814/93‑1 (MQ=21)
gATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTgg < 1:3513714/93‑1 (MQ=21)
aTTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 1:5746738/1‑93 (MQ=21)
ttCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa > 2:6837837/1‑93 (MQ=21)
ttCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 2:1031376/93‑1 (MQ=21)
ttCGGAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 1:2588004/93‑1 (MQ=18)
tCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAg < 2:7432058/93‑1 (MQ=21)
gTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa < 2:7244894/93‑1 (MQ=21)
gTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa < 1:3192565/93‑1 (MQ=21)
gTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa > 1:380861/1‑93 (MQ=21)
tAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCAc > 2:1285063/1‑93 (MQ=21)
ggCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc < 1:1489832/93‑1 (MQ=21)
ggCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc > 1:6057435/1‑93 (MQ=21)
gCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt < 2:6991389/93‑1 (MQ=21)
gCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt > 1:4579200/1‑93 (MQ=21)
cGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCttt > 2:6339686/1‑93 (MQ=21)
ggATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa < 2:6560443/93‑1 (MQ=21)
gATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac < 2:5131447/93‑1 (MQ=25)
gATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 1:4698327/1‑93 (MQ=21)
gATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 2:3768332/1‑93 (MQ=21)
aTAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTaca < 1:485153/93‑1 (MQ=25)
tAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac < 2:1715684/93‑1 (MQ=25)
tAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac > 2:5318358/1‑93 (MQ=25)
aaGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACAcc < 1:5695083/93‑1 (MQ=25)
aGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCg < 2:6786168/93‑1 (MQ=25)
|
AAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CG‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448461‑4448623
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
