Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
744 |
338.8 |
17650688 |
97.8% |
17262372 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
878,307 |
A→G |
T115A (ACT→GCT) |
yliI → |
putative dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 878,307 | 0 | A | G | 99.2%
| 845.2
/ ‑2.7
| 250 | T115A (ACT→GCT) | yliI | putative dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (118/130); total (119/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > NC_000913/878217‑878396
|
ctgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGct > 1:1306979/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGct > 1:6861758/1‑93 (MQ=255)
ctgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGct < 2:3220766/93‑1 (MQ=255)
ctgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGct < 1:690719/93‑1 (MQ=255)
tgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctg < 2:4660324/93‑1 (MQ=255)
gctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgc > 2:8348377/1‑93 (MQ=255)
gctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgc > 1:195111/1‑93 (MQ=255)
ctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCAGGATctgct > 1:5997324/1‑93 (MQ=255)
tgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgctg < 2:6040205/93‑1 (MQ=255)
ggACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgctgg > 2:1031321/1‑92 (MQ=255)
ggACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgt < 1:1608517/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTgg < 1:7882156/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGTGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTggg < 2:5369434/93‑1 (MQ=255)
cGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTggg > 1:2688075/1‑93 (MQ=255)
ttgTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt < 2:4443555/91‑1 (MQ=255)
tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt > 2:3868398/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt < 1:4483119/93‑1 (MQ=255)
ttttAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATg < 1:7666672/93‑1 (MQ=255)
ttttAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATg > 1:5313469/1‑93 (MQ=255)
tAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGcc > 1:2944934/1‑93 (MQ=255)
tAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGcc < 2:6980006/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc > 2:5916032/1‑93 (MQ=255)
gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc < 1:4186489/93‑1 (MQ=255)
cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt < 1:864381/93‑1 (MQ=255)
gcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCACAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCtt > 2:4000180/1‑93 (MQ=255)
gcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCta > 1:6694846/1‑92 (MQ=255)
ccTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTa < 1:8185147/93‑1 (MQ=255)
ccTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTa > 1:8802819/1‑93 (MQ=255)
ccTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTa < 2:6349535/93‑1 (MQ=255)
cTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTaa > 1:5813088/1‑93 (MQ=255)
cTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTaa < 2:696975/93‑1 (MQ=255)
cTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTaa > 1:6111067/1‑93 (MQ=255)
taTTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt < 1:3032684/92‑1 (MQ=255)
gATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt < 2:8723503/93‑1 (MQ=255)
gATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt > 2:5171834/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt < 1:2399305/93‑1 (MQ=255)
gATTTTGCTCAGTCACGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt < 2:6675230/93‑1 (MQ=255)
ttttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtga < 2:4180429/93‑1 (MQ=255)
ttggCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgat < 2:6545944/90‑1 (MQ=255)
cTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtc < 2:4864532/93‑1 (MQ=255)
tCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtct > 1:5691317/1‑93 (MQ=255)
tCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtct > 1:5504802/1‑93 (MQ=255)
agcctcGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctct > 2:2375068/4‑93 (MQ=255)
aGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctct > 1:6532551/1‑93 (MQ=255)
ctcGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCaa < 2:2640285/93‑1 (MQ=255)
cgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTg > 1:4244082/1‑93 (MQ=255)
cATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc < 1:2972179/93‑1 (MQ=255)
cATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc > 1:1877582/1‑93 (MQ=255)
cATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc < 1:3293783/93‑1 (MQ=255)
cATCTGGTTAAGGTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGGTATGGGCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc > 2:8079576/1‑93 (MQ=255)
cATCTGGTGAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTTGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc < 2:5520426/93‑1 (MQ=255)
cATCCGGTTATGTTATTCCGAAGTTCGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGAGATGATCTGTCAAAAGTGAc < 2:6875394/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGTCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcc < 1:6009224/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcc < 1:7186545/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcc > 2:2942144/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGACGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAca < 2:129363/93‑2 (MQ=255)
tGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGAc < 2:8202734/93‑1 (MQ=255)
ggTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACt < 2:36576/93‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtt > 2:7894038/1‑93 (MQ=255)
gTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtt > 2:572414/1‑93 (MQ=255)
ttAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtac < 2:8565235/93‑3 (MQ=255)
ttAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTc < 1:184611/93‑1 (MQ=255)
aGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGc > 1:3873971/1‑93 (MQ=255)
gTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCa < 1:248996/93‑1 (MQ=255)
tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc < 1:1138533/93‑1 (MQ=255)
tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc < 2:1678416/93‑1 (MQ=255)
tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc > 1:6547115/1‑93 (MQ=255)
tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTGATTGTAGCTTAAATGAAGATCTCTCATAAGTGACTCACTTCCGCatc > 1:4106459/1‑91 (MQ=255)
aTTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCg > 2:3405555/1‑93 (MQ=255)
aTTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCg > 1:4435476/1‑93 (MQ=255)
ttCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGt > 1:5473476/1‑93 (MQ=255)
ttCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGt > 1:117025/1‑93 (MQ=255)
tCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTc < 2:6116304/93‑1 (MQ=255)
ccGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCt > 2:1598079/1‑93 (MQ=255)
cGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCtt > 2:7808036/1‑93 (MQ=255)
cGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCtt > 1:7396917/1‑93 (MQ=255)
gAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCttt < 2:258728/93‑1 (MQ=255)
aGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCg > 1:3403408/1‑93 (MQ=255)
gTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGc > 1:7593225/1‑93 (MQ=255)
ttGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGcc < 1:320544/93‑1 (MQ=255)
tGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCa < 2:3096057/93‑1 (MQ=255)
cGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGAt < 2:2175168/93‑1 (MQ=255)
cGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGAt < 1:1312294/93‑1 (MQ=255)
cGATGATGGCAAAGCAGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGAt < 1:3167144/93‑1 (MQ=255)
cGATGATAGCAAACCCGAAGCTGCTGTGCGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGCCTTTCGCCAGAt < 2:7324557/93‑1 (MQ=255)
atgatgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGc > 1:8261518/1‑93 (MQ=255)
tgatgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGcc > 1:4830632/1‑93 (MQ=255)
gatgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATTGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCATCGTCTTTCGCCAGATGCCa > 2:5760323/1‑93 (MQ=255)
atgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaa > 2:4294769/1‑93 (MQ=255)
atgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaa > 2:1388364/1‑93 (MQ=255)
tgGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaaa < 1:5789582/93‑1 (MQ=255)
gCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTCATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAAc < 2:4782331/93‑1 (MQ=255)
cAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACt < 1:4380528/93‑1 (MQ=255)
aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGt > 2:1485236/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGt > 2:8474791/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGt > 1:2990856/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTc > 1:8381975/1‑93 (MQ=255)
gCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCt > 2:3949221/1‑93 (MQ=255)
ggAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTAcc > 2:8531954/1‑93 (MQ=255)
ggAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTAcc > 1:6187619/1‑93 (MQ=255)
|
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > NC_000913/878217‑878396
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG > NC_000913/878215‑878398
|
GCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGC > SRR4302541.274977/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT < SRR4302541.5802980/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT > SRR4302541.1319858/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT > SRR4302541.6935078/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT < SRR4302541.4291740/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT < SRR4302541.4827283/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT < SRR4302541.8656046/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGCTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT > SRR4302541.5503982/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTG < SRR4302541.7617351/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTG < SRR4302541.697224/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTG > SRR4302541.5951850/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCAGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTG > SRR4302541.1239863/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGC > SRR4302541.5594283/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGC > SRR4302541.196588/1‑94 (MQ=60)
gacggcCGTGGTTTTAGCGCCTGAGTTGTCTCAGTCTCCCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCT < SRR4302541.7411942/88‑1 (MQ=60)
GCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCAGGATCTGCT > SRR4302541.6058761/1‑94 (MQ=60)
CTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTG > SRR4302541.8832307/1‑94 (MQ=60)
TGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG < SRR4302541.3229013/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG < SRR4302541.8052939/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG < SRR4302541.4513068/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG < SRR4302541.1624506/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGTTTTAGCGACTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG < SRR4302541.7867765/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG > SRR4302541.2490808/1‑94 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG > SRR4302541.2581660/1‑94 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG < SRR4302541.6973868/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGCTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG > SRR4302541.1566752/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGG > SRR4302541.2714771/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGG < SRR4302541.7968795/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGT > SRR4302541.8339029/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTT < SRR4302541.5762976/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTA < SRR4302541.4528304/94‑1 (MQ=60)
GTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATG > SRR4302541.5368164/1‑94 (MQ=60)
GTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATG > SRR4302541.3573289/1‑94 (MQ=60)
TTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGG < SRR4302541.7045215/94‑1 (MQ=60)
TTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGG < SRR4302541.7748232/94‑1 (MQ=60)
TTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGG > SRR4302541.3119509/1‑94 (MQ=60)
TTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGC > SRR4302541.3002779/1‑94 (MQ=60)
TTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGC > SRR4302541.3002778/1‑94 (MQ=60)
TTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGC < SRR4302541.2858851/94‑1 (MQ=60)
TTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCC > SRR4302541.2974545/1‑94 (MQ=60)
TAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCG > SRR4302541.298654/1‑94 (MQ=60)
GCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCT < SRR4302541.1544955/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCT < SRR4302541.4228033/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCT < SRR4302541.5870092/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTT < SRR4302541.872238/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTA > SRR4302541.6764619/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTA > SRR4302541.3153021/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTA > SRR4302541.5839998/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTA > SRR4302541.8896810/1‑94 (MQ=60)
GCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTA < SRR4302541.6316377/94‑1 (MQ=60)
GCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTA > SRR4302541.1824798/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAA > SRR4302541.6173474/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAA < SRR4302541.8274499/94‑1 (MQ=60)
CCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAA > SRR4302541.5872157/1‑94 (MQ=60)
CTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAG < SRR4302541.7685819/94‑1 (MQ=60)
TATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTG < SRR4302541.3063306/94‑1 (MQ=60)
GATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTG < SRR4302541.2422815/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGA > SRR4302541.8320068/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGA < SRR4302541.8541558/94‑1 (MQ=60)
tgtcacagactcggCGCATTTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCTATGATGGCAAAGGCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGA < SRR4302541.7456045/80‑1 (MQ=60)
CTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCT > SRR4302541.5749372/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCT > SRR4302541.5561185/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCT < SRR4302541.671285/94‑1 (MQ=60)
CAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCT > SRR4302541.6599242/1‑94 (MQ=60)
AGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTC > SRR4302541.6269124/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCA < SRR4302541.2952850/94‑1 (MQ=60)
CTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCCAA > SRR4302541.3319276/1‑94 (MQ=60)
CCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTG > SRR4302541.4286452/1‑94 (MQ=60)
CGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGA > SRR4302541.4710595/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAC > SRR4302541.1895636/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAC > SRR4302541.5439922/1‑94 (MQ=60)
GCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAC > SRR4302541.6663488/1‑94 (MQ=60)
CATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACC < SRR4302541.5979623/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACC < SRR4302541.3002131/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACC < SRR4302541.3326930/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACC > SRR4302541.6610774/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGTCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCG < SRR4302541.6070796/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCG > SRR4302541.6865567/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCG < SRR4302541.6070795/94‑1 (MQ=60)
ATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCG < SRR4302541.7263209/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGAC < SRR4302541.495868/94‑1 (MQ=60)
TGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACT < SRR4302541.983035/94‑1 (MQ=60)
TGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACT < SRR4302541.3944459/94‑1 (MQ=60)
TGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACT > SRR4302541.4846230/1‑94 (MQ=60)
GGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTT > SRR4302541.1322077/1‑94 (MQ=60)
GTTAAGTTACTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTC < SRR4302541.6094491/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCC < SRR4302541.7620106/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCC > SRR4302541.8546725/1‑94 (MQ=60)
TTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCC < SRR4302541.185996/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCG < SRR4302541.2712607/94‑1 (MQ=60)
AAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGC > SRR4302541.3912911/1‑94 (MQ=60)
AAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGC < SRR4302541.4346106/94‑1 (MQ=60)
AGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCA < SRR4302541.6933770/94‑1 (MQ=60)
GTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAC < SRR4302541.250986/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACC > SRR4302541.6613997/1‑94 (MQ=60)
TTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACC < SRR4302541.1158044/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACC < SRR4302541.2180394/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTGATTGTAGCTTAAATGAAGATCTCTCATAAGTGACTCACTTCCGCATC > SRR4302541.4147009/1‑94 (MQ=38)
TATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCG < SRR4302541.1149344/94‑1 (MQ=60)
TATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCG < SRR4302541.614378/94‑1 (MQ=60)
TATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCG < SRR4302541.1893474/94‑1 (MQ=60)
TATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCG > SRR4302541.4480055/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGT > SRR4302541.117968/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGT < SRR4302541.5546448/94‑1 (MQ=60)
ATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGT > SRR4302541.5529605/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGT > SRR4302541.8385409/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGT < SRR4302541.7781787/94‑1 (MQ=60)
CCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTT > SRR4302541.7476018/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCG > SRR4302541.3437370/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGC > SRR4302541.2009329/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGC < SRR4302541.4432932/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGC > SRR4302541.3929506/1‑94 (MQ=60)
AGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGC > SRR4302541.7674336/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCC > SRR4302541.3596983/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCA < SRR4302541.323397/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGA > SRR4302541.621835/1‑94 (MQ=60)
CGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATG < SRR4302541.1913879/94‑1 (MQ=60)
CGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATG < SRR4302541.1325214/94‑1 (MQ=60)
CGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATG > SRR4302541.8863451/1‑94 (MQ=60)
CGATGATGGCAAAGCAGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATG < SRR4302541.3199130/94‑1 (MQ=60)
GATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGC > SRR4302541.8351467/1‑94 (MQ=60)
ATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCC > SRR4302541.4879875/1‑94 (MQ=60)
GATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAA < SRR4302541.5714736/94‑1 (MQ=60)
TGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAA < SRR4302541.5848416/94‑1 (MQ=60)
GGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAAC < SRR4302541.7460249/94‑1 (MQ=60)
GCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACT < SRR4302541.3311175/94‑1 (MQ=60)
CAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCATATGCCAAAACTG < SRR4302541.4424301/94‑1 (MQ=60)
CAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTG < SRR4302541.4424300/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGTCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGT < SRR4302541.1873925/94‑1 (MQ=60)
AAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGT > SRR4302541.3021047/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGT > SRR4302541.4229205/1‑94 (MQ=60)
AAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTC > SRR4302541.8472761/1‑94 (MQ=60)
GCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTA > SRR4302541.3060720/1‑94 (MQ=60)
GCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTA < SRR4302541.4250760/94‑1 (MQ=60)
CCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTAC > SRR4302541.3359457/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > SRR4302541.6250842/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC < SRR4302541.4174177/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > SRR4302541.6989836/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCG < SRR4302541.1295925/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG < SRR4302541.4459980/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG < SRR4302541.8770373/94‑1 (MQ=60)
|
GCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG > NC_000913/878215‑878398
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
