Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
878,307 |
A→G |
T115A (ACT→GCT) |
yliI → |
putative dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 878,307 | 0 | A | G | 100.0%
| 620.7
/ NA
| 181 | T115A (ACT→GCT) | yliI | putative dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (76/105); total (76/105) |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
TGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > NC_000913/878218‑878396
|
tgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctg > 1:5126739/1‑93 (MQ=255)
gctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgc < 1:1530962/93‑1 (MQ=255)
gctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgc < 2:5574600/93‑1 (MQ=255)
ctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAgctgct > 2:4198154/1‑93 (MQ=255)
tgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgctg > 2:3051939/1‑93 (MQ=255)
tgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgctg > 1:2160567/1‑93 (MQ=255)
ggACGTGGTTTTAGCTCCTGATTGTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgt < 2:2221532/93‑1 (MQ=255)
gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg > 1:5975958/1‑93 (MQ=255)
gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg < 1:2656837/93‑1 (MQ=255)
gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg < 1:5456742/93‑1 (MQ=255)
gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg < 1:219581/93‑1 (MQ=255)
gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg < 2:4783182/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGTTTTAGCGCGTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTgg < 1:531144/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTgg > 2:150451/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt > 1:2839005/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt > 1:767762/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGGTAAGTTATTCCGAAGCTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt > 1:5630470/1‑93 (MQ=255)
gTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTAt < 1:682944/93‑1 (MQ=255)
gTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTAt < 1:989537/93‑1 (MQ=255)
tttAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATgg < 1:2524913/93‑1 (MQ=255)
tAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGcc < 2:3981460/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc < 1:6362793/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc < 1:3096391/93‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc > 2:1138502/1‑93 (MQ=255)
cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt < 2:6436394/93‑1 (MQ=255)
cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt > 2:6114660/1‑93 (MQ=255)
cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt < 2:701329/93‑1 (MQ=255)
gcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCtt > 1:4983469/1‑93 (MQ=255)
cTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTaa > 1:4059798/1‑93 (MQ=255)
tGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAg > 1:5518727/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt < 2:5661932/93‑1 (MQ=255)
aTTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtg > 2:384479/1‑93 (MQ=255)
aTTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtg < 1:5014708/93‑1 (MQ=255)
ttttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtga < 1:1802395/93‑1 (MQ=255)
ttttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtga < 2:463830/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgat < 1:1618214/93‑1 (MQ=255)
tttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgat < 2:2061482/93‑1 (MQ=255)
ttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatg < 2:833537/93‑1 (MQ=255)
ttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatg < 1:2408915/93‑1 (MQ=255)
ttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatg < 2:5927624/93‑1 (MQ=255)
tGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatga > 2:907701/1‑93 (MQ=255)
tGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatga < 2:2367135/93‑1 (MQ=255)
gCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTgatgat > 2:5104323/1‑93 (MQ=255)
cTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGGGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtc < 1:2967634/93‑1 (MQ=255)
cAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctc < 1:1994420/93‑1 (MQ=255)
gTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctctc < 2:3713975/93‑1 (MQ=255)
gTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctctc > 2:2404102/1‑93 (MQ=255)
gccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAg > 1:4209748/1‑93 (MQ=255)
gccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAg < 1:3539914/93‑1 (MQ=255)
ccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGt > 1:3454129/1‑93 (MQ=255)
ccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGt < 1:4848177/93‑1 (MQ=255)
gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa < 1:3298932/93‑1 (MQ=255)
gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa < 2:2463452/93‑1 (MQ=255)
gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa < 2:4996994/93‑1 (MQ=255)
gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa < 1:3722015/93‑1 (MQ=255)
ccATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGTTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa < 1:1007869/92‑1 (MQ=255)
cATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc < 2:3851027/93‑1 (MQ=255)
aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcg > 2:1368064/1‑92 (MQ=255)
aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcc > 2:618570/1‑93 (MQ=255)
tCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCg > 2:2110311/1‑93 (MQ=255)
cTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTTCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGa < 1:3146409/93‑1 (MQ=255)
tGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGAc < 1:4509980/93‑1 (MQ=255)
ggTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACt < 2:4332926/93‑1 (MQ=255)
ggTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACt < 2:1427293/93‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtt < 1:4415631/93‑1 (MQ=255)
gTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtt > 1:2489241/1‑93 (MQ=255)
ttAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTc < 1:6447238/93‑1 (MQ=255)
ttAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTc < 2:4034581/93‑1 (MQ=255)
tAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTcc < 2:5787777/93‑1 (MQ=255)
tAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTcc < 1:2105993/93‑1 (MQ=255)
aaGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCg > 2:2073176/1‑93 (MQ=255)
tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc < 2:3589873/93‑1 (MQ=255)
tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc > 1:1361148/1‑93 (MQ=255)
ccGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCt < 2:6304249/93‑1 (MQ=255)
cGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCtt > 1:5945870/1‑93 (MQ=255)
cGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCtt < 1:5977452/93‑1 (MQ=255)
gAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCttt < 1:3795284/93‑1 (MQ=255)
ttGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGcc > 1:3936579/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCa < 2:5769221/93‑1 (MQ=255)
ggCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAg > 2:2965350/1‑93 (MQ=255)
ggCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAg > 1:625985/1‑93 (MQ=255)
gCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGa < 1:1030688/93‑1 (MQ=255)
gCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGa < 2:5447839/93‑1 (MQ=255)
cGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGAt < 2:667117/93‑1 (MQ=255)
gatgatGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATg < 2:5357776/93‑1 (MQ=255)
gatgatGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATg > 2:5907391/1‑93 (MQ=255)
atgatgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGc < 1:782578/93‑1 (MQ=255)
atgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaa > 1:5114368/1‑93 (MQ=255)
ggCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaaaa < 1:3239418/93‑1 (MQ=255)
ggCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCAGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTATTTCGCCAGATGCCaaaa > 2:349744/1‑93 (MQ=255)
gCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAAc < 2:1874892/93‑1 (MQ=255)
cAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACt > 1:2343340/1‑93 (MQ=255)
aaaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTg > 2:379035/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGt > 1:2252954/1‑93 (MQ=255)
aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGGGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATCCCAAAACTGt > 2:3158945/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTc > 2:5610271/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTc < 1:3216354/93‑1 (MQ=255)
aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGAACGGTCTTTCGGCCGCTGCCCAAACTGTc > 2:5163005/1‑93 (MQ=255)
ccGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTa < 1:986957/93‑1 (MQ=255)
ggAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTAcc > 2:4834257/1‑93 (MQ=255)
|
TGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > NC_000913/878218‑878396
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGGCA > NC_000913/878214‑878400
|
GGCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAG < SRR4302534.395090/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAG < SRR4302534.427338/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGC < SRR4302534.3126888/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCT < SRR4302534.1235646/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTG > SRR4302534.5265155/1‑94 (MQ=60)
GCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCT < SRR4302534.1571132/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTG > SRR4302534.665203/1‑94 (MQ=60)
CTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTG > SRR4302534.3452596/1‑94 (MQ=60)
CTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTG > SRR4302534.55515/1‑94 (MQ=60)
CTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTG > SRR4302534.2217627/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTGGTTTTAGCGCGTGATTCTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCAAAGTTGGTGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG < SRR4302534.3612619/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTG > SRR4302534.6138266/1‑94 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG < SRR4302534.2727078/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG < SRR4302534.5603785/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGG < SRR4302534.225340/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGTTTTAGCGCGTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGG < SRR4302534.544334/94‑1 (MQ=60)
GTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTT > SRR4302534.2913596/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTT > SRR4302534.786848/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGGTAAGTTATTCCGAAGCTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTT > SRR4302534.5782861/1‑94 (MQ=60)
TGTTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATAATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTA < SRR4302534.5850478/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTAT < SRR4302534.252953/94‑1 (MQ=60)
GTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATG < SRR4302534.1014854/94‑1 (MQ=60)
GTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATG < SRR4302534.699620/94‑1 (MQ=60)
TTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGC < SRR4302534.2591919/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCT < SRR4302534.3177844/94‑1 (MQ=60)
GCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCT < SRR4302534.6534604/94‑1 (MQ=60)
CGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTT > SRR4302534.5118336/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAA > SRR4302534.6373440/1‑94 (MQ=60)
CCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTAA > SRR4302534.4168691/1‑94 (MQ=60)
CTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAG > SRR4302534.5667637/1‑94 (MQ=60)
CTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAG < SRR4302534.317687/94‑1 (MQ=60)
CTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTAAG < SRR4302534.3837043/94‑1 (MQ=60)
TGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGT < SRR4302534.5143371/94‑1 (MQ=60)
TGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCAGGAGGTGCTGTGGGTTATGGTCGCTTAAGT > SRR4302534.1448761/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGA > SRR4302534.2266421/1‑94 (MQ=60)
ATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGA < SRR4302534.5150229/94‑1 (MQ=60)
TTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGAT < SRR4302534.1849199/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATG < SRR4302534.1660435/94‑1 (MQ=60)
TTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGA < SRR4302534.3237723/94‑1 (MQ=60)
TTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGA < SRR4302534.2472949/94‑1 (MQ=60)
TTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGA < SRR4302534.2842034/94‑1 (MQ=60)
CTCGGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCT < SRR4302534.3309291/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGGGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCT < SRR4302534.3045349/94‑1 (MQ=60)
CTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCT > SRR4302534.1690001/1‑94 (MQ=60)
CAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCT < SRR4302534.2046658/94‑1 (MQ=60)
CAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCT > SRR4302534.4549975/1‑94 (MQ=60)
AGACTCGCCTCATGTGGTTGAGTAATTCCGAAGTTGGCGATGATGCCAAGTCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGCCCGCTTAAGTGATAATCTCTC < SRR4302534.2305505/94‑1 (MQ=36)
CTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAA < SRR4302534.5231976/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAG > SRR4302534.4323333/1‑94 (MQ=60)
GCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGT > SRR4302534.3546978/1‑94 (MQ=60)
GCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGT < SRR4302534.3635144/94‑1 (MQ=60)
CCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTG < SRR4302534.4979704/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAC < SRR4302534.3386971/94‑1 (MQ=60)
GCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAC < SRR4302534.3822056/94‑1 (MQ=60)
CCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGTTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAC < SRR4302534.1033750/94‑1 (MQ=60)
CATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTTGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGTTTATGGCCGCTTAGGTGATGATCTCTCAAAAGTGACC < SRR4302534.2218797/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTTCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGAC < SRR4302534.3229164/94‑1 (MQ=60)
CTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGAC > SRR4302534.4923827/1‑94 (MQ=60)
TGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACT < SRR4302534.4632108/94‑1 (MQ=60)
TGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACT > SRR4302534.888378/1‑94 (MQ=60)
GGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTT > SRR4302534.2555365/1‑94 (MQ=60)
GTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTC < SRR4302534.4534828/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCC < SRR4302534.750886/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCC < SRR4302534.6620980/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCC < SRR4302534.504312/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCG < SRR4302534.2161318/94‑1 (MQ=60)
TAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGAAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAACGACTTCCG > SRR4302534.6588233/1‑94 (MQ=60)
AGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGTCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCA < SRR4302534.6114767/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACC < SRR4302534.2158051/94‑1 (MQ=60)
TTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACC > SRR4302534.1397024/1‑94 (MQ=60)
TATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCG < SRR4302534.2990072/94‑1 (MQ=60)
TATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCG > SRR4302534.2373932/1‑94 (MQ=60)
ATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGT < SRR4302534.1659371/94‑1 (MQ=60)
TTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTC > SRR4302534.315005/1‑94 (MQ=60)
TTCCGAAGTTGGCGATGATGGAAAAGCCGGAGCTCCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTC < SRR4302534.5643982/94‑1 (MQ=60)
TTCCGAAGTTGGCAATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGATTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTC < SRR4302534.4401232/94‑1 (MQ=60)
TCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCT > SRR4302534.5354804/1‑94 (MQ=60)
CCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTT > SRR4302534.6107310/1‑94 (MQ=60)
CGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTT < SRR4302534.6139796/94‑1 (MQ=60)
GAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTGTTTC > SRR4302534.2461524/1‑94 (MQ=60)
GAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTC < SRR4302534.3897188/94‑1 (MQ=60)
AGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGC < SRR4302534.5747915/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCC > SRR4302534.4042026/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCC > SRR4302534.4042027/1‑94 (MQ=60)
TTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCA < SRR4302534.1244577/94‑1 (MQ=60)
TGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAG > SRR4302534.641169/1‑94 (MQ=60)
GCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGAT < SRR4302534.1057247/94‑1 (MQ=60)
ATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCC < SRR4302534.802099/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCA < SRR4302534.2559138/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCA > SRR4302534.791485/1‑94 (MQ=60)
GATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAA > SRR4302534.5252392/1‑94 (MQ=60)
ATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTCAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAA < SRR4302534.3955959/94‑1 (MQ=60)
GGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAAC < SRR4302534.3325601/94‑1 (MQ=60)
GCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACT > SRR4302534.2405527/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTG > SRR4302534.2007202/1‑94 (MQ=60)
CAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTG > SRR4302534.6436413/1‑94 (MQ=60)
AAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGT > SRR4302534.2312675/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCT < SRR4302534.3301722/94‑1 (MQ=60)
CCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTAC < SRR4302534.1012181/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC > SRR4302534.3787588/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCG > SRR4302534.2355261/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG > SRR4302534.308787/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG < SRR4302534.2566028/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGG < SRR4302534.5271514/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGGC > SRR4302534.3802142/1‑94 (MQ=60)
AGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGGC > SRR4302534.5981716/1‑94 (MQ=60)
GCTGCTGTGTGTTATGCCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAACTGACCGTCTTCCGCACCTGCTTCCGCCAGACGCCAAAACTGTCTACCGGCA < SRR4302534.457945/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGGCA > SRR4302534.3480662/1‑94 (MQ=60)
|
GGCCTGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACCGGCA > NC_000913/878214‑878400
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
