Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
884 |
257.2 |
12958910 |
96.9% |
12557183 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,210,786 |
A→G |
intergenic (+384/+117) |
mcrA → / ← ycgW |
McrA/hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,210,786 | 0 | A | G | 100.0%
| 651.1
/ NA
| 188 | intergenic (+384/+117) | mcrA/ycgW | McrA/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (76/112); total (76/112) |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAG > NC_000913/1210696‑1210874
|
gcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGatcgtc < 1:2585233/93‑1 (MQ=255)
caatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGAtcgtcg > 1:2985981/1‑93 (MQ=255)
atcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGaa < 2:3592660/93‑1 (MQ=255)
atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACa > 2:2005092/1‑93 (MQ=255)
atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACa < 1:4629507/93‑1 (MQ=255)
atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACa < 1:5969577/93‑1 (MQ=255)
tGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACAt < 1:1030391/93‑1 (MQ=255)
cAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTa > 2:4090915/1‑93 (MQ=255)
cAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTa > 2:5544750/1‑93 (MQ=255)
cAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTa < 1:3803767/93‑1 (MQ=255)
cAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTa > 1:1564359/1‑93 (MQ=255)
aaGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATTGTCGAAAACATGTaa < 1:2335172/93‑1 (MQ=255)
aGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAt > 2:3825940/1‑93 (MQ=255)
gACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtc < 2:2181974/93‑1 (MQ=255)
aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtct > 1:3515473/1‑93 (MQ=255)
ccGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtctc < 1:4214477/93‑1 (MQ=255)
cGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtctct > 2:3309428/1‑93 (MQ=255)
gTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtctctc < 2:3711780/93‑1 (MQ=255)
gTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAAtctctc < 1:1269872/93‑1 (MQ=255)
aaCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCa > 1:3437968/1‑93 (MQ=255)
aaCTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCa < 1:4191756/93‑1 (MQ=255)
ttATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAtgt < 1:6412853/93‑1 (MQ=255)
aTGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATgtgt > 2:531600/1‑93 (MQ=255)
aTGACTTCGAACGTCTGATGCAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATgtgt < 2:3793144/93‑1 (MQ=255)
gACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTa < 1:5605635/93‑1 (MQ=255)
gACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTa > 2:185354/1‑93 (MQ=255)
aCTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaa > 1:2434266/1‑93 (MQ=255)
cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaaa < 2:4117433/93‑1 (MQ=255)
cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTaaa < 2:4929306/93‑1 (MQ=255)
ttCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAat > 1:3715916/1‑93 (MQ=255)
cGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTTGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAatat > 2:4395271/1‑93 (MQ=255)
cGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAatat < 1:1056321/93‑1 (MQ=255)
gAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATAtt > 2:3057769/1‑93 (MQ=255)
cGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGaa > 1:5099077/1‑93 (MQ=255)
tCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAAc < 2:3935393/93‑1 (MQ=255)
tGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACgg > 1:4341379/1‑93 (MQ=255)
tGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACgg > 2:3482387/1‑93 (MQ=255)
gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGACAACATGTAATCTCTCCATGTGCTAAATAATGAAACgcg > 2:5609595/1‑91 (MQ=21)
gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACggg > 2:4741559/1‑93 (MQ=255)
gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACggg > 2:29746/1‑93 (MQ=255)
gATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACggg > 1:1386858/1‑93 (MQ=255)
aTGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACgggg > 1:684807/1‑92 (MQ=255)
aTGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGc < 2:6202171/93‑1 (MQ=255)
aTGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGc < 1:4939513/93‑1 (MQ=255)
ggAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGTAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGt < 2:3450372/93‑1 (MQ=255)
ggAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGt < 2:6367195/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGta > 1:2182704/1‑93 (MQ=255)
gAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGta < 1:2206150/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGta < 2:5173990/93‑1 (MQ=255)
gAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGta < 2:4426872/93‑1 (MQ=255)
aaGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtat > 2:1913819/1‑93 (MQ=255)
aGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata > 2:893359/1‑93 (MQ=255)
aGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGtata < 1:3965463/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATaa < 1:5836078/93‑1 (MQ=255)
gcgcTAAGCGGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAac < 1:5754012/93‑1 (MQ=255)
cgcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAaca < 1:1755603/93‑1 (MQ=255)
gcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAacac > 1:581920/1‑93 (MQ=255)
gcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAacac < 2:2776785/93‑1 (MQ=255)
cTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACg > 2:6406145/1‑93 (MQ=255)
cTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACg > 2:4011214/1‑93 (MQ=255)
tAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGc > 1:1311304/1‑93 (MQ=255)
aaGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGcc > 2:4549040/1‑93 (MQ=255)
aaGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGcc < 1:3324424/93‑1 (MQ=255)
aaGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGcc < 1:2352628/93‑1 (MQ=255)
aGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGccc > 2:141192/1‑93 (MQ=255)
aGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGccc > 1:4495/1‑93 (MQ=255)
ctgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgt > 2:4776227/1‑93 (MQ=255)
ctgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgt > 2:2922317/1‑93 (MQ=255)
tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgtt < 2:5455300/93‑1 (MQ=255)
tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgtt < 2:1751289/93‑1 (MQ=255)
cgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCGCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgtt < 1:4732976/92‑1 (MQ=255)
gctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttg < 2:468088/93‑1 (MQ=255)
ctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgt < 2:2151216/93‑1 (MQ=255)
tgAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgtt < 1:6479145/93‑1 (MQ=255)
tgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgtt < 2:5889500/93‑1 (MQ=255)
tgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgtt > 1:5892824/1‑93 (MQ=255)
tgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgtt < 2:67601/93‑1 (MQ=255)
gAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt < 2:2803037/93‑1 (MQ=255)
aaaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGtttt < 1:922200/93‑1 (MQ=255)
aaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTttta < 2:2638313/93‑1 (MQ=255)
tGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttatt < 2:5221458/93‑1 (MQ=255)
gTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttattt < 1:1817754/93‑1 (MQ=255)
ttCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttattta < 1:2926695/93‑1 (MQ=255)
cAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtg < 2:165094/93‑1 (MQ=255)
agagTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt > 1:5253649/1‑93 (MQ=255)
agagTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgt < 2:230983/93‑1 (MQ=255)
gTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGa < 2:1544398/93‑1 (MQ=255)
tttGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGat > 1:5185227/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGata < 2:5386719/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtatt < 1:4584620/93‑1 (MQ=255)
ggTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtatt < 1:1870364/93‑1 (MQ=255)
gTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAtatta < 2:240625/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt < 1:3043772/93‑1 (MQ=255)
aaGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATAttatta > 1:2034646/1‑93 (MQ=255)
aGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTaa > 2:374878/1‑93 (MQ=255)
gCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAAt < 2:4898426/93‑1 (MQ=255)
cGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATa < 1:4262333/93‑1 (MQ=255)
cGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATa < 1:253255/93‑1 (MQ=255)
cGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATa < 1:5292834/93‑1 (MQ=255)
cGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATa > 1:6160098/1‑93 (MQ=255)
|
GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAG > NC_000913/1210696‑1210874
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATAT > NC_000913/1210693‑1210879
|
GGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCG > SRR4302534.1598767/1‑94 (MQ=60)
GGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCG < SRR4302534.5573426/94‑1 (MQ=60)
CGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTC < SRR4302534.5337771/94‑1 (MQ=60)
CGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTC < SRR4302534.1434654/94‑1 (MQ=60)
CGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTC < SRR4302534.1589644/94‑1 (MQ=60)
GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCG > SRR4302534.3064077/1‑94 (MQ=60)
GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCG < SRR4302534.5205018/94‑1 (MQ=60)
GCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCG < SRR4302534.2653667/94‑1 (MQ=60)
CAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGA > SRR4302534.1956949/1‑94 (MQ=60)
AATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAA > SRR4302534.4483669/1‑94 (MQ=60)
TCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAA < SRR4302534.6113760/94‑1 (MQ=60)
AATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACA > SRR4302534.2602167/1‑94 (MQ=60)
ATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGCAAACAT > SRR4302534.133988/1‑94 (MQ=60)
ATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACAT < SRR4302534.4083323/94‑1 (MQ=60)
ATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACAT < SRR4302534.4755135/94‑1 (MQ=60)
ATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACAC < SRR4302534.6131708/94‑1 (MQ=60)
TGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATG < SRR4302534.1056939/94‑1 (MQ=60)
GCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGT < SRR4302534.5662592/94‑1 (MQ=60)
CCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTA < SRR4302534.2099908/94‑1 (MQ=60)
CCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTA > SRR4302534.1605301/1‑94 (MQ=60)
CCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTA < SRR4302534.69019/94‑1 (MQ=60)
CAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAA < SRR4302534.3905906/94‑1 (MQ=60)
AAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATTGTCGAAAACATGTAAT < SRR4302534.2397117/94‑1 (MQ=60)
AGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCCTCGCACACATGTAATC > SRR4302534.2995615/1‑94 (MQ=60)
GACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCT > SRR4302534.3610029/1‑94 (MQ=60)
CCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCT < SRR4302534.4328150/94‑1 (MQ=60)
GTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCC < SRR4302534.1303323/94‑1 (MQ=60)
GTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCC > SRR4302534.4847655/1‑94 (MQ=60)
GTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCC < SRR4302534.6260813/94‑1 (MQ=60)
TAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCA > SRR4302534.3530360/1‑94 (MQ=60)
TAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCA > SRR4302534.2433051/1‑94 (MQ=60)
AACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCAT < SRR4302534.4305002/94‑1 (MQ=60)
CTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGT < SRR4302534.4724974/94‑1 (MQ=60)
TTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTG < SRR4302534.6585887/94‑1 (MQ=60)
ATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTT < SRR4302534.3307979/94‑1 (MQ=60)
TGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTA > SRR4302534.658021/1‑94 (MQ=60)
GACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAA > SRR4302534.2498966/1‑94 (MQ=60)
GACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAA < SRR4302534.5757254/94‑1 (MQ=60)
CTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAAT > SRR4302534.3815825/1‑94 (MQ=60)
CGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATT < SRR4302534.1083669/94‑1 (MQ=60)
GAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTG < SRR4302534.817305/94‑1 (MQ=60)
GAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTG > SRR4302534.2243914/1‑94 (MQ=60)
AACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGA > SRR4302534.5877254/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAA > SRR4302534.3586913/1‑94 (MQ=60)
ACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAA > SRR4302534.5236706/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGG > SRR4302534.4458671/1‑94 (MQ=60)
TGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGG > SRR4302534.1423356/1‑94 (MQ=60)
GATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGG > SRR4302534.701535/1‑94 (MQ=60)
GATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGC < SRR4302534.3480073/94‑1 (MQ=60)
ATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCG < SRR4302534.5073353/94‑1 (MQ=60)
GGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTA > SRR4302534.2240403/1‑94 (MQ=60)
GAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTAT < SRR4302534.4042559/94‑1 (MQ=60)
GAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTAT < SRR4302534.2264552/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAA < SRR4302534.4071614/94‑1 (MQ=60)
AGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAA < SRR4302534.2275816/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAAC < SRR4302534.5994518/94‑1 (MQ=60)
GCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACA < SRR4302534.1563991/94‑1 (MQ=60)
GCGCTAAGCGGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACA < SRR4302534.5910067/94‑1 (MQ=60)
CGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACAC > SRR4302534.1905575/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACAC < SRR4302534.1801192/94‑1 (MQ=60)
CGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACAC > SRR4302534.596164/1‑94 (MQ=60)
CTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGC > SRR4302534.1345880/1‑94 (MQ=60)
CTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGC > SRR4302534.1682122/1‑94 (MQ=60)
AAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCC > SRR4302534.4619/1‑94 (MQ=60)
AAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCC < SRR4302534.2415065/94‑1 (MQ=60)
AAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCC < SRR4302534.3413326/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGT < SRR4302534.4369426/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCGCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTT < SRR4302534.5383727/94‑1 (MQ=60)
TGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTG < SRR4302534.2412706/94‑1 (MQ=60)
CGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCGCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTG < SRR4302534.4861494/94‑1 (MQ=60)
CTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTT > SRR4302534.6052833/1‑94 (MQ=60)
TGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTT < SRR4302534.6653773/94‑1 (MQ=60)
AAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTT > SRR4302534.3687027/1‑94 (MQ=60)
AAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTA < SRR4302534.945686/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATT < SRR4302534.4317988/94‑1 (MQ=60)
GTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTA < SRR4302534.1864981/94‑1 (MQ=60)
TTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAT < SRR4302534.3095501/94‑1 (MQ=60)
TTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAT > SRR4302534.5986905/1‑94 (MQ=60)
TTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAT < SRR4302534.3003540/94‑1 (MQ=60)
TCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATG < SRR4302534.1117411/94‑1 (MQ=60)
TCAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATG < SRR4302534.4707146/94‑1 (MQ=60)
CAGAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGT > SRR4302534.5395617/1‑94 (MQ=60)
GAGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGG < SRR4302534.4994614/94‑1 (MQ=60)
AGTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGA > SRR4302534.5425422/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGAT > SRR4302534.5324990/1‑94 (MQ=60)
TTTGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATA > SRR4302534.1397412/1‑94 (MQ=60)
TGGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATT < SRR4302534.3843504/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTA < SRR4302534.4709018/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTA < SRR4302534.1919027/94‑1 (MQ=60)
GGTGAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTA < SRR4302534.3004909/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTA > SRR4302534.2087852/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTA < SRR4302534.1826057/94‑1 (MQ=60)
GAAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTA < SRR4302534.3123607/94‑1 (MQ=60)
AAGCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAA > SRR4302534.5309566/1‑94 (MQ=60)
GCGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATA > SRR4302534.6327648/1‑94 (MQ=60)
CGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAG < SRR4302534.5435709/94‑1 (MQ=60)
CGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAG < SRR4302534.4377453/94‑1 (MQ=60)
CGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAG < SRR4302534.259853/94‑1 (MQ=60)
CGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAG < SRR4302534.5919403/94‑1 (MQ=60)
CGATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAACAG < SRR4302534.6541563/94‑1 (MQ=60)
ATCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCA > SRR4302534.2675906/1‑94 (MQ=60)
TCGTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCAT < SRR4302534.4599882/94‑1 (MQ=60)
GTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATAT < SRR4302534.6336471/94‑1 (MQ=60)
GTCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATAT < SRR4302534.3221289/94‑1 (MQ=60)
|
GGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATAT > NC_000913/1210693‑1210879
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
