Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 884 | 257.2 | 12958910 | 96.9% | 12557183 | 93.0 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,545,666 | A→G | D81G (GAC→GGC) D81G (GAC→GGC) |
b4525 → fdnG → |
hypothetical protein formate dehydrogenase‑N, nitrate‑inducible, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,545,666 | 0 | A | G | 99.5% | 677.2 / ‑4.6 | 203 | D81G (GAC→GGC) D81G (GAC→GGC) | b4525 fdnG | hypothetical protein formate dehydrogenase‑N, nitrate‑inducible, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (106/96); total (106/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
CATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACC > NC_000913/1545576‑1545755 | caTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGcc < 1:195589/93‑1 (MQ=255)caTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGcc > 2:5744721/1‑93 (MQ=255)caTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGcc > 2:4264371/1‑93 (MQ=255) aTACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGccc > 1:2071862/1‑93 (MQ=255) tACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCg < 1:5264720/93‑1 (MQ=255) aCTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCgg < 2:5171359/93‑1 (MQ=255) cTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGa < 2:2868112/93‑1 (MQ=255) cTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGa > 1:4180653/1‑93 (MQ=255) tGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGat < 1:3626756/93‑1 (MQ=255) gTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGatc > 1:3223012/1‑93 (MQ=255) gTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGatc > 2:3085216/1‑93 (MQ=255) ttCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGatca > 2:4441579/1‑93 (MQ=255) ccGTAGGTTTCGCGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGatcctc < 1:3938405/93‑1 (MQ=255) ccGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGatcatc > 1:6326166/1‑93 (MQ=255) cGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATcc > 1:6051822/1‑93 (MQ=255) cGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATcc < 2:3034069/93‑1 (MQ=255) gTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCg > 2:5276541/1‑93 (MQ=255) aGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGt < 1:3538113/93‑1 (MQ=255) tGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGc < 1:1787517/93‑1 (MQ=255) ggCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCgtg > 1:977934/1‑93 (MQ=255) gCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCgtgg < 1:6126636/93‑1 (MQ=255) gCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCgtgg < 1:146121/93‑1 (MQ=255) cTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCgtggt < 1:1046204/93‑1 (MQ=255) tATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCgtggtg < 1:5375759/93‑1 (MQ=255) aTTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCgtggtgg > 2:6202931/1‑92 (MQ=255) aTTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTgc > 1:2282773/1‑93 (MQ=255) ttGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTgcg > 2:741642/1‑93 (MQ=255) tGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTgcgc < 1:2686774/93‑1 (MQ=255) gATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCt < 2:2277912/93‑1 (MQ=255) gTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCtgtg > 1:3268322/1‑93 (MQ=255) tataGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGc < 1:2610806/93‑1 (MQ=255) tataGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGc < 2:366661/93‑1 (MQ=255) tataGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGc > 1:6333187/1‑93 (MQ=255) tataGCCGGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGc < 1:2534408/93‑1 (MQ=255) ataGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGcc < 2:2937546/93‑1 (MQ=255) taGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGccc > 2:31060/1‑93 (MQ=255) gCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGa > 1:4224196/1‑93 (MQ=255) ccTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGaa < 2:5706886/93‑1 (MQ=255) cTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGaaa < 2:4981029/93‑1 (MQ=255) cTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGaaa > 2:2806407/1‑93 (MQ=255) cTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGaaa > 2:4168064/1‑93 (MQ=255) tGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAg > 1:2483579/1‑93 (MQ=255) ggTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAggg < 1:4728451/93‑1 (MQ=255) ggTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAggg < 1:3081595/93‑1 (MQ=255) ggTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAggg < 2:6377414/93‑1 (MQ=255) gTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAgggg < 1:2867802/93‑1 (MQ=255) tGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGc < 1:299411/93‑1 (MQ=255) tGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGc < 2:4907487/93‑1 (MQ=255) tGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGc < 2:5504991/93‑1 (MQ=255) gATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGcc > 2:1221061/1‑93 (MQ=255) gATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCCGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGcc < 2:3445210/93‑1 (MQ=255) aTGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCg > 1:2775086/1‑93 (MQ=255) ggCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGt < 1:1058530/93‑1 (MQ=255) gcgcAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGtt < 2:6033520/93‑1 (MQ=255) cgcAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGttt > 1:4825032/1‑93 (MQ=255) cgcAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGttt > 1:2374879/1‑93 (MQ=255) cAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGc < 2:711442/93‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGc > 1:2354403/1‑93 (MQ=255) cAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGc < 1:129782/93‑1 (MQ=255) aaaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGTTGCGCTGTGCCCGAAAGGTGACGGTTTGcg > 2:1569781/1‑92 (MQ=255) aaaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTg > 2:2579386/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTgg > 1:4413249/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTgg < 1:1673241/93‑1 (MQ=255) aaaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGATTGCTgg > 2:828745/1‑93 (MQ=255) aaaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGa < 2:3316969/93‑1 (MQ=255) aaCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGAt > 2:2508413/1‑93 (MQ=255) aCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGAtt > 2:5815374/1‑93 (MQ=255) aCGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGAtt > 2:3856219/1‑93 (MQ=255) gCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCCAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTAc < 2:201302/93‑1 (MQ=255) ccAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACg > 2:1158725/1‑93 (MQ=255) cAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGt < 2:505609/93‑1 (MQ=255) cAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGt > 1:4938654/1‑93 (MQ=255) gagaAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCa < 2:5569740/93‑1 (MQ=255) gaAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAAc > 2:101241/1‑93 (MQ=255) gaAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAAc > 1:4329132/1‑93 (MQ=255) aaGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACa < 2:5400510/93‑1 (MQ=255) aGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAg < 2:3408770/93‑1 (MQ=255) aGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAg > 1:5920101/1‑93 (MQ=255) aTTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGaa > 2:4003465/1‑93 (MQ=255) aTTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGaa > 2:2683454/1‑93 (MQ=255) tATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAAc > 2:4822155/1‑93 (MQ=255) tATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAAc < 2:2633366/93‑1 (MQ=255) aTCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAAcc > 2:5850056/1‑93 (MQ=255) aTCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAAcc > 2:271583/1‑93 (MQ=255) aTCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAAcc > 2:1702221/1‑93 (MQ=255) gcacaTTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCg < 2:4592903/92‑1 (MQ=255) cacaTTGAAGGTGGCCCGGTTCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGt < 2:1205562/93‑1 (MQ=255) cacaTTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGt > 1:5399299/1‑93 (MQ=255) acaTTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTc < 1:3365787/93‑1 (MQ=255) acaTTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTc < 2:1814298/93‑1 (MQ=255) acaTTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTc < 1:5649851/93‑1 (MQ=255) caTTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCACGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCt < 1:5183871/93‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTgc < 2:1937540/93‑1 (MQ=255) gatggTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCTCGAAAGGGGCCGGGTTGCTGGAGTACGACTACAGTGAAAACCGTCTgcgc > 2:6477766/4‑93 (MQ=255) gAAGGTGGCCCTGAGCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTgcgc < 1:1395504/93‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTgcgc > 1:5856425/1‑93 (MQ=255) gAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTgcgc < 2:2352705/93‑1 (MQ=255) aaGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCt > 2:3609601/1‑93 (MQ=255) ggTGGCCCGGATCCTCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGTATTACGTCAACAGTGAAAGCCGTCTGCGCTAc < 1:77540/93‑1 (MQ=255) ggTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTAc < 1:453983/93‑1 (MQ=255) | CATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACC > NC_000913/1545576‑1545755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACCCG > NC_000913/1545573‑1545757 | GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGG < SRR4302534.2598407/94‑1 (MQ=60)GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGG > SRR4302534.2715757/1‑94 (MQ=60)GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGG < SRR4302534.5023855/94‑1 (MQ=60)GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGG > SRR4302534.4985053/1‑94 (MQ=60)GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGG < SRR4302534.4553162/94‑1 (MQ=60) CACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGC > SRR4302534.266154/1‑94 (MQ=60) CACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGC > SRR4302534.2947608/1‑94 (MQ=60) ACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCC > SRR4302534.6082767/1‑94 (MQ=60) ACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCC > SRR4302534.1989030/1‑94 (MQ=60) ACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCC < SRR4302534.6401577/94‑1 (MQ=60) CATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCC > SRR4302534.4067220/1‑94 (MQ=60) CATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCC < SRR4302534.200711/94‑1 (MQ=60) CATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCC > SRR4302534.2126066/1‑94 (MQ=60) TACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGG < SRR4302534.5406947/94‑1 (MQ=60) ACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGA > SRR4302534.4293612/1‑94 (MQ=60) TGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATC < SRR4302534.3724240/94‑1 (MQ=60) TGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATC < SRR4302534.3379058/94‑1 (MQ=60) TGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATC > SRR4302534.3308604/1‑94 (MQ=60) TCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATC > SRR4302534.346843/1‑94 (MQ=60) TCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATC > SRR4302534.6497075/1‑94 (MQ=60) CCGTAGGTTTCGCGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCCTCC < SRR4302534.4043888/94‑1 (MQ=60) CCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCC > SRR4302534.6216391/1‑94 (MQ=60) CGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGGTGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGGCCGGATCATACG > SRR4302534.3329450/1‑94 (MQ=60) GTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGG < SRR4302534.433231/94‑1 (MQ=60) TAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGT > SRR4302534.2709248/1‑94 (MQ=60) AGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTA > SRR4302534.2554630/1‑94 (MQ=60) AGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTA < SRR4302534.3633291/94‑1 (MQ=60) TGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCC < SRR4302534.1833925/94‑1 (MQ=60) TGCGGGCTATTAATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCC < SRR4302534.2677794/94‑1 (MQ=60) GCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAAAGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCG > SRR4302534.2103180/1‑94 (MQ=60) CGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGT > SRR4302534.6573395/1‑94 (MQ=60) GGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTG < SRR4302534.3325370/94‑1 (MQ=60) GGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTG > SRR4302534.1002891/1‑94 (MQ=60) GGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGG < SRR4302534.1137756/94‑1 (MQ=60) GCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGT < SRR4302534.6293274/94‑1 (MQ=60) GCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGT < SRR4302534.149925/94‑1 (MQ=60) CTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTG < SRR4302534.1073244/94‑1 (MQ=60) TATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGC < SRR4302534.5520609/94‑1 (MQ=60) TATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGC > SRR4302534.2343346/1‑94 (MQ=60) ATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCG > SRR4302534.1433416/1‑94 (MQ=60) TGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCT < SRR4302534.2757778/94‑1 (MQ=60) TGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTG > SRR4302534.5670360/1‑94 (MQ=60) TGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTG > SRR4302534.3355380/1‑94 (MQ=60) GTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGC > SRR4302534.6504280/1‑94 (MQ=60) TATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCC < SRR4302534.2679885/94‑1 (MQ=60) TATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCC > SRR4302534.4882824/1‑94 (MQ=60) TATAGCCGGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCC < SRR4302534.2601678/94‑1 (MQ=60) ATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCC < SRR4302534.1532805/94‑1 (MQ=60) AGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGA > SRR4302534.4338058/1‑94 (MQ=60) GCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAA > SRR4302534.1735679/1‑94 (MQ=60) CTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAG > SRR4302534.2549539/1‑94 (MQ=60) CTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTAGCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCTGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAG < SRR4302534.6385498/94‑1 (MQ=60) GGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGG < SRR4302534.5525335/94‑1 (MQ=60) GGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGG < SRR4302534.4856862/94‑1 (MQ=60) GGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGG < SRR4302534.3162561/94‑1 (MQ=60) GTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGC < SRR4302534.2943112/94‑1 (MQ=60) TGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCC > SRR4302534.3071793/1‑94 (MQ=60) TGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCC < SRR4302534.307143/94‑1 (MQ=60) TGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCC < SRR4302534.4321820/94‑1 (MQ=60) TGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCC < SRR4302534.4450037/94‑1 (MQ=60) TGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCC < SRR4302534.455255/94‑1 (MQ=60) GATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCG > SRR4302534.2848104/1‑94 (MQ=60) GGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTT < SRR4302534.6501039/94‑1 (MQ=60) GGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTT < SRR4302534.1085951/94‑1 (MQ=60) GCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTT < SRR4302534.3115262/94‑1 (MQ=60) GCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTT > SRR4302534.2437947/1‑94 (MQ=60) GCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTT > SRR4302534.4955974/1‑94 (MQ=60) GCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGC > SRR4302534.2416884/1‑94 (MQ=60) CAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCT < SRR4302534.5083932/94‑1 (MQ=60) CAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCT < SRR4302534.133212/94‑1 (MQ=60) AAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTG < SRR4302534.2775248/94‑1 (MQ=60) AAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGG > SRR4302534.4532378/1‑94 (MQ=60) AAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGA < SRR4302534.1716779/94‑1 (MQ=60) AAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGGGGTCCGTATCATTTGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAActggcaggtttgctgat > SRR4302534.387893/1‑77 (MQ=58) AACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATT < SRR4302534.5374493/94‑1 (MQ=60) AACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATT > SRR4302534.2912042/1‑94 (MQ=60) ACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTA < SRR4302534.252530/94‑1 (MQ=60) ACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTA > SRR4302534.5115341/1‑94 (MQ=60) GCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACG < SRR4302534.4958823/94‑1 (MQ=60) GCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACG < SRR4302534.3938698/94‑1 (MQ=60) GCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACG > SRR4302534.2407113/1‑94 (MQ=60) 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SRR4302534.1432225/94‑1 (MQ=60) AAGGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTA > SRR4302534.2242442/1‑94 (MQ=60) GGTGGCCCGGATCCTCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGTATTACGTCAACAGTGAAAGCCGTCTGCGCTACC < SRR4302534.79641/94‑1 (MQ=60) GGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACC > SRR4302534.5850711/1‑94 (MQ=60) GGTGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACC < SRR4302534.465478/94‑1 (MQ=60) TGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACCCG < SRR4302534.4559602/94‑1 (MQ=60) TGGCCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACCCG > SRR4302534.6627172/1‑94 (MQ=60) | GCACATACTGTTCCGTAGGTTGCGGGCTATTGATGTATAGCCTGGGTGATGGCGCAAAAAACGCCAGAGAAGCGATTTATCACATTGAAGGTGACCCGGATCATCCGGTAAGCCGTGGTGCGCTGTGCCCGAAAGGGGCCGGTTTGCTGGATTACGTCAACAGTGAAAACCGTCTGCGCTACCCG > NC_000913/1545573‑1545757 |
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |