Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,251,414 |
G→A |
A379T (GCA→ACA) |
b1201 → |
putative sensor‑type regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,251,414 | 0 | G | A | 98.8%
| 589.5
/ ‑2.9
| 161 | A379T (GCA→ACA) | b1201 | putative sensor‑type regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (80/78); total (82/79) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.30e-01 |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CGCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTGCAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAA > NC_000913/1251324‑1251503
|
cAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAgg < 1:3356878/93‑1 (MQ=255)
cAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAgg > 1:1831270/1‑93 (MQ=255)
aGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGt > 1:2610237/1‑93 (MQ=255)
gTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTGCAGGTc > 2:2192515/1‑93 (MQ=255)
tAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTcc > 2:3380455/1‑93 (MQ=255)
aGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCt > 2:34419/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCtt > 1:5866/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCtt < 2:4002797/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCtt < 2:4779777/93‑1 (MQ=255)
tttCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTtat < 2:1104704/93‑1 (MQ=255)
ttCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTtata > 1:1258830/1‑93 (MQ=255)
tcctgtcctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTatat > 1:646845/1‑93 (MQ=255)
cctgtcctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATc < 2:5120700/93‑1 (MQ=255)
ctgtcctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCg > 1:1436011/1‑93 (MQ=255)
tgtcctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGc > 1:5319704/1‑93 (MQ=255)
gtcctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGcc > 2:2065092/1‑93 (MQ=255)
ctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTc > 1:866764/1‑93 (MQ=255)
ctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTc > 1:4149628/1‑93 (MQ=255)
ctgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTc < 1:284105/93‑1 (MQ=255)
tgCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCa > 2:786957/1‑93 (MQ=255)
gCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCaa > 2:5859151/1‑93 (MQ=255)
cTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGTAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAAt < 1:5357635/93‑1 (MQ=255)
cTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAAt > 2:2004538/1‑93 (MQ=255)
tttGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAAtt > 1:3231815/1‑93 (MQ=255)
tttGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAAtt < 2:3920125/93‑1 (MQ=255)
ttGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATtg > 1:2528673/1‑93 (MQ=255)
ttGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATtg < 2:1946148/93‑1 (MQ=255)
ggAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAg > 2:3121085/1‑93 (MQ=255)
ggAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAg < 2:451510/93‑1 (MQ=255)
agaagaGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGtt > 2:2683645/1‑93 (MQ=255)
agagGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTtata > 1:1918408/1‑93 (MQ=255)
agagGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTtata < 1:5947534/93‑1 (MQ=255)
gagGGCGTGGGCAAGGCGCTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTatat < 1:911155/93‑1 (MQ=255)
gagGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTatat < 1:4660242/93‑1 (MQ=255)
gagGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTatat < 1:1912005/93‑1 (MQ=255)
agGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATg > 2:5772182/1‑93 (MQ=255)
ggCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGt < 2:4768067/93‑1 (MQ=255)
gCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTg > 2:5252955/1‑93 (MQ=255)
cGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGa < 2:3802752/93‑1 (MQ=255)
gTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAt < 2:4880155/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtg < 2:679742/93‑1 (MQ=255)
gggCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgc < 2:5309047/93‑1 (MQ=255)
gggCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgc < 1:104826/93‑1 (MQ=255)
gCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATACATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgctg < 2:2900711/93‑1 (MQ=255)
cAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgctgc < 1:5723149/93‑1 (MQ=255)
cAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgctgc < 1:2005889/93‑1 (MQ=255)
cAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgctgc < 2:3097091/93‑1 (MQ=255)
cAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGAtgctgc < 2:3031579/93‑1 (MQ=255)
aGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTgcgc < 1:5370770/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCt < 2:3773927/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCt < 2:3773926/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCt < 2:5241979/93‑1 (MQ=255)
ggCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCt < 2:5933193/93‑1 (MQ=255)
gCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTg > 1:2242020/1‑93 (MQ=255)
gCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTg < 1:4023734/93‑1 (MQ=255)
cACTGCTAAGTCAGGCAATTCATCATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTgg < 1:3480357/93‑1 (MQ=255)
cACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTgg < 2:235619/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGc > 1:5784353/1‑93 (MQ=255)
cTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCg > 1:2438771/1‑93 (MQ=255)
gCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGga > 1:390779/1‑93 (MQ=255)
tAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGgaag < 2:5027696/93‑1 (MQ=255)
tAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGgaag > 1:5990158/1‑93 (MQ=255)
tAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGgaag > 1:5535269/1‑93 (MQ=255)
aaGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGgaaga < 1:4601040/93‑1 (MQ=255)
aGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGgaagaa < 2:5692577/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAAt > 2:1107652/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAAtt < 2:1460981/93‑1 (MQ=255)
cAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAAttt > 2:333658/1‑93 (MQ=255)
aGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTa > 1:2146460/1‑93 (MQ=255)
aGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTa < 1:1340582/93‑1 (MQ=255)
aGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTa > 1:4969929/1‑93 (MQ=255)
aGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGGTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTa > 2:5120504/1‑93 (MQ=255)
aaTTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATtgg < 2:4073108/93‑1 (MQ=255)
aaTTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATtgg < 2:1188623/93‑1 (MQ=255)
aTTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATtggt > 1:3222543/1‑93 (MQ=255)
aTTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATtggt < 2:6043221/93‑1 (MQ=255)
ttCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATtggtg > 1:4010035/1‑93 (MQ=255)
tCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATtggtgg < 2:1806709/93‑1 (MQ=255)
aaTGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGAt < 1:275588/93‑1 (MQ=255)
aaTGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGAt > 2:5280823/1‑93 (MQ=255)
aaTGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGAt > 2:4559887/1‑93 (MQ=255)
aaTGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGAt > 1:3639471/1‑93 (MQ=255)
aTGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATc < 2:3220676/93‑1 (MQ=255)
tGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCg > 2:1301546/1‑93 (MQ=255)
tGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCg > 2:2183330/1‑93 (MQ=255)
gAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGc < 2:1062343/93‑1 (MQ=255)
gacgcgagcgTGCTCCAGGACCTTGTCTCGCCGTCTATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGAGGCGCTCGcc < 2:5492905/90‑2 (MQ=255)
aaGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCAc > 2:6129841/1‑93 (MQ=255)
gcgagcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACgg > 1:4500839/1‑93 (MQ=255)
gcgagcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACgg < 2:2965929/93‑1 (MQ=255)
gcgagcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAACTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACgg > 1:3972623/1‑93 (MQ=255)
gagcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGAc > 1:2517206/1‑93 (MQ=255)
gagcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGAc > 2:5473288/1‑93 (MQ=255)
gcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACaa > 2:1421288/1‑93 (MQ=255)
gcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACaa < 2:4678468/93‑1 (MQ=255)
gcgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACaa > 2:2693108/1‑93 (MQ=255)
cgTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAAt > 2:2726678/1‑93 (MQ=255)
tgctacAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGa < 1:3038146/93‑1 (MQ=255)
gctacAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGaa < 1:4996593/93‑1 (MQ=255)
gctacAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGaa > 1:1166235/1‑93 (MQ=255)
|
CGCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTGCAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAA > NC_000913/1251324‑1251503
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCGCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTGCAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAAATG > NC_000913/1251322‑1251507
|
CGCGCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTAC > SRR4302532.2022822/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAG < SRR4302532.2685286/94‑1 (MQ=60)
GCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGG > SRR4302532.4760031/1‑94 (MQ=60)
GCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGG > SRR4302532.1892185/1‑94 (MQ=60)
CAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGT < SRR4302532.2527700/94‑1 (MQ=60)
CAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGT > SRR4302532.3898465/1‑94 (MQ=60)
CAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGT < SRR4302532.3468996/94‑1 (MQ=60)
CAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGT > SRR4302532.2697547/1‑94 (MQ=60)
GTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCC > SRR4302532.411017/1‑94 (MQ=60)
AGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTT > SRR4302532.6110/1‑94 (MQ=60)
AGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTT > SRR4302532.2061036/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTAT > SRR4302532.650516/1‑94 (MQ=60)
TTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATA > SRR4302532.1300958/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATAT < SRR4302532.2121753/94‑1 (MQ=60)
TTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATAT > SRR4302532.669299/1‑94 (MQ=60)
TCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATC > SRR4302532.5992582/1‑94 (MQ=60)
CCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCG > SRR4302532.1484380/1‑94 (MQ=60)
CTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGC > SRR4302532.5503874/1‑94 (MQ=60)
CTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGC > SRR4302532.5621492/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTGCAGGTCCTTATATCGCCGTC > SRR4302532.2355381/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTC > SRR4302532.896488/1‑94 (MQ=60)
CCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTC > SRR4302532.4288836/1‑94 (MQ=60)
CTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCA < SRR4302532.293924/94‑1 (MQ=60)
TGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGTGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAA > SRR4302532.4129124/1‑94 (MQ=60)
TGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAA > SRR4302532.3459839/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGTAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATT < SRR4302532.5543404/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATT > SRR4302532.3339080/1‑94 (MQ=60)
TTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTG > SRR4302532.2613054/1‑94 (MQ=60)
TTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTG < SRR4302532.5307333/94‑1 (MQ=60)
GGANAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGNTACAGGTCCTTATATCGNCGNNAANTGTGAGT > SRR4302532.3347219/1‑94 (MQ=60)
GGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGT < SRR4302532.5524417/94‑1 (MQ=60)
GAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTAT < SRR4302532.3491489/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATA < SRR4302532.1374662/94‑1 (MQ=60)
AAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATA > SRR4302532.1982210/1‑94 (MQ=60)
AGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATAT < SRR4302532.6153307/94‑1 (MQ=60)
GAGGGCGTGGGCAAGGCGCTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATG < SRR4302532.942284/94‑1 (MQ=60)
GAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATG < SRR4302532.994897/94‑1 (MQ=60)
GAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATG < SRR4302532.1975528/94‑1 (MQ=60)
GAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATG < SRR4302532.4819122/94‑1 (MQ=60)
GGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCT < SRR4302532.108443/94‑1 (MQ=60)
CAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCG < SRR4302532.2072784/94‑1 (MQ=60)
CAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCG < SRR4302532.5922492/94‑1 (MQ=60)
AGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCT < SRR4302532.5556867/94‑1 (MQ=60)
GGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTG > SRR4302532.2316426/1‑94 (MQ=60)
GCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGG < SRR4302532.4159332/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTAAGTCAGGCAATTCATCATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGC < SRR4302532.3596926/94‑1 (MQ=60)
CACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGC > SRR4302532.5985529/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCG > SRR4302532.2519862/1‑94 (MQ=60)
CTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGG > SRR4302532.5092940/1‑94 (MQ=60)
TGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGA > SRR4302532.404445/1‑94 (MQ=60)
CTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAG > SRR4302532.5727371/1‑94 (MQ=60)
CTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAG > SRR4302532.6197112/1‑94 (MQ=60)
TAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGA < SRR4302532.2708465/94‑1 (MQ=60)
AAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAA < SRR4302532.4757904/94‑1 (MQ=60)
AGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAAT > SRR4302532.1534032/1‑94 (MQ=60)
CAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTA > SRR4302532.5140314/1‑94 (MQ=60)
CAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTA > SRR4302532.2218186/1‑94 (MQ=60)
AGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTAT < SRR4302532.1385410/94‑1 (MQ=60)
GCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTG < SRR4302532.3232577/94‑1 (MQ=60)
AATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGT > SRR4302532.3329527/1‑94 (MQ=60)
AATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGG > SRR4302532.1962724/1‑94 (MQ=60)
ATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTG > SRR4302532.3047107/1‑94 (MQ=60)
ATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTG > SRR4302532.4145151/1‑94 (MQ=60)
TTCATAATGAAATCGAGCGTGCTACAGGTCCGTATATCGCCGTCAATTGTGAGTGATATGTTGATGCTGCTCTGGCTGAAGAATTTATTGGTGG < SRR4302532.845717/94‑1 (MQ=60)
TAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGAT > SRR4302532.3761591/1‑94 (MQ=60)
TAATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGAT < SRR4302532.6149593/94‑1 (MQ=60)
AATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATC < SRR4302532.285135/94‑1 (MQ=60)
ATGAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCG > SRR4302532.5831121/1‑94 (MQ=60)
GAAAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATACCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCA < SRR4302532.1279628/94‑1 (MQ=60)
AAGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACG > SRR4302532.4583807/1‑94 (MQ=60)
AGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGG > SRR4302532.4654502/1‑94 (MQ=60)
AGCGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAACTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGG > SRR4302532.4106438/1‑94 (MQ=60)
CGAGCGTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGAC > SRR4302532.2601202/1‑94 (MQ=60)
GTGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGA > SRR4302532.4181720/1‑94 (MQ=60)
TGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAA < SRR4302532.3138388/94‑1 (MQ=60)
TGCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAA > SRR4302532.1205189/1‑94 (MQ=60)
GCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAA < SRR4302532.5167857/94‑1 (MQ=60)
GCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAA > SRR4302532.4879461/1‑94 (MQ=60)
GCTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAA > SRR4302532.4573024/1‑94 (MQ=60)
CTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAAA > SRR4302532.3675571/1‑94 (MQ=60)
CTACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAAA > SRR4302532.1894507/1‑94 (MQ=60)
ACAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATAAAAATG < SRR4302532.2707990/94‑1 (MQ=60)
|
CGCGCAGTAGCTTTCCTGTCCTGCTTTGTGGAGAAGAGGGCGTGGGCAAGGCACTGCTAAGTCAGGCAATTCATAATGAAAGCGAGCGTGCTGCAGGTCCTTATATCGCCGTCAATTGTGAGTTATATGGTGATGCTGCGCTGGCGGAAGAATTTATTGGTGGCGATCGCACGGACAATGAAAATG > NC_000913/1251322‑1251507
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
