Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
521 |
238.2 |
12299412 |
96.0% |
11807435 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,672,424 |
T→C |
L163P (CTC→CCC) |
b1601 → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,672,424 | 0 | T | C | 98.7%
| 797.0
/ ‑0.5
| 226 | L163P (CTC→CCC) | b1601 | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base C (125/98); total (127/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.15e-01 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > NC_000913/1672335‑1672513
|
aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 2:846823/93‑1 (MQ=255)
aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa > 1:5088824/1‑93 (MQ=255)
aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa > 2:39855/1‑93 (MQ=255)
aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 1:2258789/93‑1 (MQ=255)
aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTAGCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 2:5938957/93‑1 (MQ=255)
tGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAg > 2:1836776/1‑93 (MQ=255)
gTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGcc > 1:2986618/1‑93 (MQ=255)
tGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCcac < 1:3187658/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCcaca > 2:1453882/1‑93 (MQ=255)
cTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACaa < 1:3438051/93‑1 (MQ=255)
tCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAt > 1:2345763/1‑93 (MQ=255)
cAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGcc > 2:1974486/1‑93 (MQ=255)
aaCTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGccc > 1:2855917/1‑93 (MQ=255)
tATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaa > 2:111850/1‑93 (MQ=255)
tATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACAGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaa > 1:2385714/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa > 1:5841923/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa < 1:2318666/93‑1 (MQ=255)
tGACGCAGTTATCTAATTCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt > 2:4647190/1‑93 (MQ=255)
tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt < 1:5144815/93‑1 (MQ=255)
tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt < 2:244871/93‑1 (MQ=255)
tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt < 1:1557783/93‑1 (MQ=255)
cGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTc < 2:3151773/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa > 1:6090253/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa < 2:4916234/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa > 2:5298011/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa > 2:1497345/1‑93 (MQ=255)
cAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAg < 2:5820017/93‑1 (MQ=255)
aGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGc > 2:3122573/1‑93 (MQ=255)
gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 1:416129/1‑93 (MQ=255)
gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 2:501257/1‑93 (MQ=255)
gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 1:1443950/1‑93 (MQ=255)
ttATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACTATTGCCCGGAAAATTTCAGCaa > 1:3756502/1‑93 (MQ=255)
tATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCaaa < 1:4361846/93‑1 (MQ=255)
atttAATGCCATGTCATCCATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAACTTCAGCcaaa > 1:4558549/4‑92 (MQ=255)
aTCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAat < 1:6110368/93‑1 (MQ=255)
aTCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAat > 2:6102406/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg > 1:1122142/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg > 1:2894075/1‑93 (MQ=255)
cTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatga < 2:1718379/93‑1 (MQ=255)
cTAATGCCACGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatga > 1:3870492/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 1:2193635/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 2:2391135/93‑1 (MQ=255)
aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 2:715296/93‑1 (MQ=255)
aTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATgg < 1:637456/93‑1 (MQ=255)
aTGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGACACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGt > 1:838317/1‑93 (MQ=255)
tGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTc < 2:2282589/93‑1 (MQ=255)
gTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTcc < 1:4666428/93‑1 (MQ=255)
gTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTcc < 2:4069993/93‑1 (MQ=255)
tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg > 2:3333655/1‑93 (MQ=255)
tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg > 1:1650486/1‑93 (MQ=255)
tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCGGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg < 1:5815715/93‑1 (MQ=255)
atcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGt < 1:5404475/93‑1 (MQ=255)
tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt < 2:1347698/93‑1 (MQ=255)
tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt > 1:4023114/1‑93 (MQ=255)
tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt < 2:5873340/93‑1 (MQ=255)
caATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTg > 1:4448933/1‑93 (MQ=255)
caATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTg > 2:3271539/1‑93 (MQ=255)
atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa > 1:1215043/1‑93 (MQ=255)
atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa < 2:440465/93‑1 (MQ=255)
atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa < 1:1855844/93‑1 (MQ=255)
atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa < 1:5243014/93‑1 (MQ=255)
tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:925599/1‑93 (MQ=255)
tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:4195072/1‑93 (MQ=255)
tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:2805718/1‑93 (MQ=255)
tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:4673685/1‑93 (MQ=255)
atTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAgg > 1:3331710/1‑93 (MQ=255)
tttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCGGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAggg > 2:455774/1‑93 (MQ=255)
tttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAggg > 1:4820034/1‑93 (MQ=255)
ttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGa > 2:2977676/1‑93 (MQ=255)
ttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGa > 1:678144/1‑93 (MQ=255)
ttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATg < 1:3635906/93‑1 (MQ=255)
tATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATgg > 2:4409010/1‑93 (MQ=255)
tATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATgg < 1:92324/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggc > 1:4862287/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcg > 1:1314967/1‑93 (MQ=255)
gctgctGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcggc > 2:1265416/1‑93 (MQ=255)
tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 2:2198502/1‑93 (MQ=255)
tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 2:3474099/1‑93 (MQ=255)
tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 2:1151608/1‑93 (MQ=255)
tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 1:3724736/1‑93 (MQ=255)
ctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGAtt < 1:4247384/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCaa < 1:1456653/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACg < 2:6149442/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGt > 2:3622036/1‑93 (MQ=255)
tGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTg > 1:4992629/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGc < 1:1042513/93‑1 (MQ=255)
gCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGc < 1:3467371/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCg < 1:3053612/93‑1 (MQ=255)
cTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGAGGGCGGCGATTCAACGTGCg > 2:3439582/1‑93 (MQ=255)
tGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGa > 1:5879197/1‑93 (MQ=255)
tGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGa > 2:5163074/1‑93 (MQ=255)
gTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGAt > 2:5376341/1‑93 (MQ=255)
tttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGGGCGAtt > 2:1396044/1‑93 (MQ=255)
ttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTg > 1:5646014/1‑93 (MQ=255)
ttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTg < 1:3494893/93‑1 (MQ=255)
tATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGa < 1:2059041/93‑1 (MQ=255)
tATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGa > 1:5691950/1‑93 (MQ=255)
tATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGa < 2:2528714/93‑1 (MQ=255)
gctgccCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAg < 1:2665571/93‑1 (MQ=255)
tgccCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgtg > 1:5304928/1‑93 (MQ=255)
|
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > NC_000913/1672335‑1672513
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC > NC_000913/1672331‑1672517
|
CGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCC > SRR4302532.1787952/1‑94 (MQ=60)
GGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCC < SRR4302532.5426422/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCAC > SRR4302532.5634883/1‑94 (MQ=60)
CGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGA > SRR4302532.41820/1‑94 (MQ=60)
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGGCCGAA > SRR4302532.2423527/1‑94 (MQ=60)
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAA > SRR4302532.5263802/1‑94 (MQ=60)
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAA > SRR4302532.883447/1‑94 (MQ=60)
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGGGCTGTTTATGCTGCCCGAA > SRR4302532.382143/1‑94 (MQ=60)
ATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAG < SRR4302532.2333747/94‑1 (MQ=60)
TGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGT < SRR4302532.5428161/94‑1 (MQ=60)
GACGTTGCTCGCCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTG < SRR4302532.2044322/94‑1 (MQ=60)
GACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTG < SRR4302532.5331674/94‑1 (MQ=60)
ACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGC > SRR4302532.3056883/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCC > SRR4302532.2372586/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCC > SRR4302532.3085360/1‑94 (MQ=60)
TTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCAC < SRR4302532.3234623/94‑1 (MQ=60)
TGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACA < SRR4302532.3293489/94‑1 (MQ=60)
CTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAT > SRR4302532.4047017/1‑94 (MQ=60)
CTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAT < SRR4302532.3553246/94‑1 (MQ=60)
CTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAT > SRR4302532.2423982/1‑94 (MQ=60)
CAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCC > SRR4302532.2951414/1‑94 (MQ=60)
CAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCC > SRR4302532.3727054/1‑94 (MQ=60)
AACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCG > SRR4302532.725460/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGA > SRR4302532.4549425/1‑94 (MQ=60)
TTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACAGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAA > SRR4302532.2465181/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAA > SRR4302532.6044679/1‑94 (MQ=60)
TTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAT < SRR4302532.2395844/94‑1 (MQ=60)
TGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATT < SRR4302532.5321804/94‑1 (MQ=60)
TGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATT < SRR4302532.1610456/94‑1 (MQ=60)
TGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATT < SRR4302532.3905502/94‑1 (MQ=60)
GACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTT > SRR4302532.1278575/1‑94 (MQ=60)
ACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTC < SRR4302532.2685780/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCA > SRR4302532.6300513/1‑94 (MQ=60)
CGCAATTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCA < SRR4302532.4944092/94‑1 (MQ=60)
AGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CA > SRR4302532.430586/1‑94 (MQ=60)
AGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CA > SRR4302532.1492650/1‑94 (MQ=60)
AGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CA > SRR4302532.5014527/1‑94 (MQ=60)
AGTTATCTAATCCCATGTCATCAATATTTTTATTGATGCTGACGGTGCTGTTTATGCTACCCGAAGCGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CA > SRR4302532.430585/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACTATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAA > SRR4302532.3882875/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAA > SRR4302532.5874368/1‑94 (MQ=60)
TATTTAATGCCATGTCATCCATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAACTTCAGCCAAA > SRR4302532.4714063/1‑94 (MQ=60)
TATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAAT < SRR4302532.4509681/94‑1 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATG > SRR4302532.2450298/1‑94 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATG < SRR4302532.2449789/94‑1 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATG < SRR4302532.6321275/94‑1 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATG > SRR4302532.2990716/1‑94 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATG > SRR4302532.1159608/1‑94 (MQ=60)
TCTAATGCCACGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGA > SRR4302532.4001100/1‑94 (MQ=60)
CTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAATTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGAT > SRR4302532.6000226/1‑94 (MQ=60)
CTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGAT < SRR4302532.1634398/94‑1 (MQ=60)
CTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGAT < SRR4302532.3378884/94‑1 (MQ=60)
CTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGAT > SRR4302532.3500275/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATG < SRR4302532.6035580/94‑1 (MQ=60)
TAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATG > SRR4302532.1304380/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATG < SRR4302532.6350002/94‑1 (MQ=60)
AATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGG < SRR4302532.2266717/94‑1 (MQ=60)
AATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGG < SRR4302532.2986381/94‑1 (MQ=60)
ATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGC > SRR4302532.531261/1‑94 (MQ=60)
ATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGC < SRR4302532.659669/94‑1 (MQ=60)
ATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGC < SRR4302532.659668/94‑1 (MQ=60)
TGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCG > SRR4302532.3091720/1‑94 (MQ=60)
CCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGTTGGCGCG < SRR4302532.6260065/94‑1 (MQ=60)
CATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGACACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGT > SRR4302532.867076/1‑94 (MQ=60)
CATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGATTATGCTGCCCGAAGTGTCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGT > SRR4302532.2932672/1‑94 (MQ=60)
ATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTC > SRR4302532.369060/1‑94 (MQ=60)
GTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATTATGGCGCGTCCG > SRR4302532.3867820/1‑94 (MQ=60)
GTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCG > SRR4302532.1706410/1‑94 (MQ=60)
GTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCG < SRR4302532.4825527/94‑1 (MQ=60)
TCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCGGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGG < SRR4302532.6017730/94‑1 (MQ=60)
CATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGT > SRR4302532.693364/1‑94 (MQ=60)
ATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTT < SRR4302532.2283823/94‑1 (MQ=60)
ATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTT > SRR4302532.5133618/1‑94 (MQ=60)
ATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTT > SRR4302532.4158695/1‑94 (MQ=60)
ATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTT < SRR4302532.5591729/94‑1 (MQ=60)
TCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTG > SRR4302532.4600552/1‑94 (MQ=60)
AATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAA > SRR4302532.1255711/1‑94 (MQ=60)
AATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAA > SRR4302532.4815249/1‑94 (MQ=60)
AATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAA < SRR4302532.3144482/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAG > SRR4302532.6078561/1‑94 (MQ=60)
ATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAG < SRR4302532.5423763/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAG < SRR4302532.1917386/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAG < SRR4302532.3608238/94‑1 (MQ=60)
TATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGG > SRR4302532.3442821/1‑94 (MQ=60)
TATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGGGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGG > SRR4302532.4391139/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGG > SRR4302532.4985980/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGA < SRR4302532.1574562/94‑1 (MQ=60)
TTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGA > SRR4302532.701465/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGA > SRR4302532.3530709/1‑94 (MQ=60)
TTTTATTGCTGCTGACGGTTCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGAT < SRR4302532.6318944/94‑1 (MQ=60)
TTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATG > SRR4302532.5245577/1‑94 (MQ=60)
TTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGG < SRR4302532.4543564/94‑1 (MQ=60)
TTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGG < SRR4302532.3757886/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGG > SRR4302532.1883295/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGC > SRR4302532.5029539/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGC < SRR4302532.95544/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302532.6169052/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG > SRR4302532.5918123/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302532.15836/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG > SRR4302532.4348915/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302532.1499642/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG > SRR4302532.1358933/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGG > SRR4302532.1987270/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGACGGGGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGG > SRR4302532.1987269/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGA > SRR4302532.3849816/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTC > SRR4302532.3980879/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTC < SRR4302532.4390092/94‑1 (MQ=60)
TGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCA > SRR4302532.1151109/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTACCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAAC < SRR4302532.5391087/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAAC < SRR4302532.1505766/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACG < SRR4302532.221725/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACG < SRR4302532.2310403/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGTTTATGTTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATTATTGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGG > SRR4302532.5689174/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTG > SRR4302532.5704552/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTG > SRR4302532.5163748/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGC > SRR4302532.468611/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCG < SRR4302532.3583499/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCG < SRR4302532.1077667/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGA > SRR4302532.6082858/1‑94 (MQ=60)
CTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGA < SRR4302532.3154428/94‑1 (MQ=60)
TGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGAT > SRR4302532.1225593/1‑94 (MQ=60)
GTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGCAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATT > SRR4302532.2975384/1‑94 (MQ=60)
GTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATT < SRR4302532.3573673/94‑1 (MQ=60)
TTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTG > SRR4302532.5842380/1‑94 (MQ=60)
TTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGA < SRR4302532.3611982/94‑1 (MQ=60)
TTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGA > SRR4302532.5890558/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGAC > SRR4302532.5060028/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGAC < SRR4302532.2127621/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACA < SRR4302532.1371511/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAG < SRR4302532.4938933/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGT < SRR4302532.2755040/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGT < SRR4302532.5514624/94‑1 (MQ=60)
CTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > SRR4302532.5488319/1‑94 (MQ=60)
TGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGT > SRR4302532.579530/1‑94 (MQ=60)
CCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGCCAGTGTTT > SRR4302532.1856447/1‑94 (MQ=60)
CCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTT > SRR4302532.5868509/1‑94 (MQ=60)
CCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTT < SRR4302532.946632/94‑1 (MQ=60)
CCGAAATGCCACAATTGCCCTGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGGGCGACCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC < SRR4302532.5554244/94‑1 (MQ=60)
|
CGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAG‑CAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC > NC_000913/1672331‑1672517
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
