Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,672,424 |
T→C |
L163P (CTC→CCC) |
b1601 → |
putative transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,672,424 | 0 | T | C | 100.0%
| 835.0
/ NA
| 229 | L163P (CTC→CCC) | b1601 | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (123/106); total (123/106) |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > NC_000913/1672334‑1672513
|
gATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGa > 1:1524119/1‑93 (MQ=255)
aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 2:1610057/93‑1 (MQ=255)
tGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAg < 2:398663/93‑1 (MQ=255)
tGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAg > 1:2031849/1‑93 (MQ=255)
tGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAg < 2:6346472/93‑1 (MQ=255)
gACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGt > 1:4482328/1‑93 (MQ=255)
gACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGt > 1:3416249/1‑93 (MQ=255)
aCGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTg > 1:6314850/1‑93 (MQ=255)
cGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGc > 2:33270/1‑93 (MQ=255)
ttGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCca > 1:309668/1‑93 (MQ=255)
tGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCcac > 2:3631658/1‑93 (MQ=255)
gCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCcaca > 2:2879317/1‑93 (MQ=255)
cTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACaa < 2:4976306/93‑1 (MQ=255)
tCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAt < 1:4833104/93‑1 (MQ=255)
cACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAtt < 2:2438069/93‑1 (MQ=255)
cACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAtt < 1:6261724/93‑1 (MQ=255)
cACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAtt < 2:2767224/93‑1 (MQ=255)
cACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAtt < 1:2243614/93‑1 (MQ=255)
cACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAtt > 1:207901/1‑93 (MQ=255)
ccAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGc > 1:2404602/1‑93 (MQ=255)
ccAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGc < 1:3676346/93‑1 (MQ=255)
cAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGcc < 2:6405165/93‑1 (MQ=255)
aaCTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGccc > 2:6512026/1‑93 (MQ=255)
ttATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGa > 2:3817749/1‑93 (MQ=255)
ttATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGa > 1:1826351/1‑93 (MQ=255)
tATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaa > 2:3714109/1‑93 (MQ=255)
aTTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaa > 2:1311252/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa > 1:1933274/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa > 1:4853247/1‑93 (MQ=255)
ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa > 1:1207498/1‑93 (MQ=255)
gACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAtt < 2:3282871/93‑1 (MQ=255)
gACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAtt < 2:3864774/93‑1 (MQ=255)
gcGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAttt < 2:858921/92‑1 (MQ=255)
gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 2:970139/1‑93 (MQ=255)
gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 1:215663/1‑93 (MQ=255)
tATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCaaa < 1:5411671/93‑1 (MQ=255)
aTCTAATGCCATGTCATCGATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAat > 1:2601205/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg > 1:4341850/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg > 2:6088796/1‑93 (MQ=255)
tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg < 1:171225/93‑1 (MQ=255)
cTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatga > 2:1086107/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatt < 2:6268084/93‑2 (MQ=255)
aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 1:2966996/93‑1 (MQ=255)
aTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATgg < 1:4800206/93‑1 (MQ=255)
gCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGgcg > 2:663625/1‑93 (MQ=255)
cATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGcgcg > 1:3368402/1‑93 (MQ=255)
aTGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGt > 2:4727358/1‑93 (MQ=255)
aTGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGt > 1:3795823/1‑93 (MQ=255)
aTGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGt > 1:1859851/1‑93 (MQ=255)
aTGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGt > 1:5966901/1‑93 (MQ=255)
tGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTc < 1:4246178/93‑1 (MQ=255)
tGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTc < 2:5908059/93‑1 (MQ=255)
tGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTc > 1:1401263/1‑93 (MQ=255)
tGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTc > 1:233079/1‑93 (MQ=255)
tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg > 1:5148003/1‑93 (MQ=255)
catcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCgg > 2:1795891/1‑93 (MQ=255)
tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt > 2:4298016/1‑93 (MQ=255)
caATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTg > 1:5637676/1‑93 (MQ=255)
aaTATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGa > 1:1291505/1‑93 (MQ=255)
aaTATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGa < 1:488458/93‑1 (MQ=255)
atTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAgg < 1:5189521/93‑1 (MQ=255)
atTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAgg > 1:4985478/1‑93 (MQ=255)
atTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAgg < 1:4089921/93‑1 (MQ=255)
tttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGAt < 2:492146/93‑1 (MQ=255)
tttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGAt < 2:3054979/93‑1 (MQ=255)
tttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCACGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGAt < 1:3507082/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggc > 1:3892079/1‑93 (MQ=255)
aTTACTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAACATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATgac > 1:573435/1‑91 (MQ=255)
ttGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcg < 1:6140759/93‑1 (MQ=255)
tgctgcTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcgg < 1:5505411/93‑1 (MQ=255)
tgctgcTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcgg > 2:4337029/1‑93 (MQ=255)
gctgctGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcggc < 2:3838615/93‑1 (MQ=255)
gctgctGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcggc > 1:5266039/1‑93 (MQ=255)
ctgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGgcggcg > 2:602364/1‑93 (MQ=255)
tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa < 2:2282660/93‑1 (MQ=255)
gctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGAt > 2:4847787/1‑93 (MQ=255)
tgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGACCGGGTGAACGGATGGAGGCGAGTc > 1:6224257/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCa > 2:5614680/1‑93 (MQ=255)
gACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCa < 1:4945775/93‑1 (MQ=255)
gACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGAGGCGATTCa > 1:3226020/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGTTGATTCaa < 1:6539409/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCaa < 2:4575464/93‑1 (MQ=255)
cGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAAc > 2:466576/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACg > 2:2868268/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCaaggg > 1:1992540/1‑90 (MQ=255)
gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACgg > 2:751701/1‑92 (MQ=255)
gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGt < 2:2150730/93‑1 (MQ=255)
gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGt > 2:1945561/1‑93 (MQ=255)
gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGt < 1:9868/93‑1 (MQ=255)
tGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTg > 1:2173575/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGc > 2:5588799/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGc > 2:1046527/1‑93 (MQ=255)
gTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGAt < 2:2545808/93‑1 (MQ=255)
gTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGAt < 1:4177757/93‑1 (MQ=255)
ttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTg < 1:5926702/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGCCCGAAGGGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGAc < 1:2811913/93‑1 (MQ=255)
tgctgcCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACa < 2:3246158/93‑1 (MQ=255)
tgctgcCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACa < 1:1056203/93‑1 (MQ=255)
ctgccCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGCCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgg > 1:900398/1‑92 (MQ=255)
tgccCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgtg > 1:2556382/1‑93 (MQ=255)
|
CGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > NC_000913/1672334‑1672513
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC > NC_000913/1672331‑1672517
|
CGGCGATGCCGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTCTTGCTGCTGACGGTGCTGTTTCTGCTGCC > SRR4302547.5347745/1‑94 (MQ=60)
CGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCC > SRR4302547.3643355/1‑94 (MQ=60)
GCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCG < SRR4302547.1924829/94‑1 (MQ=60)
TGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGA > SRR4302547.3865355/1‑94 (MQ=60)
CGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGA > SRR4302547.1554460/1‑94 (MQ=60)
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAA < SRR4302547.4896883/94‑1 (MQ=60)
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAA > SRR4302547.5549420/1‑94 (MQ=60)
ATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAG > SRR4302547.2678308/1‑94 (MQ=60)
ATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAG > SRR4302547.2072319/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGT > SRR4302547.4574929/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGT > SRR4302547.3485816/1‑94 (MQ=60)
TGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGT > SRR4302547.539100/1‑94 (MQ=60)
GACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTG > SRR4302547.6446161/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGCAGTGCCA > SRR4302547.4039003/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCA > SRR4302547.2465157/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCA > SRR4302547.315435/1‑94 (MQ=60)
GTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCA > SRR4302547.3538439/1‑94 (MQ=60)
TGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACA < SRR4302547.2490037/94‑1 (MQ=60)
TGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACA > SRR4302547.2274544/1‑94 (MQ=60)
TGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACA > SRR4302547.3554906/1‑94 (MQ=60)
CTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAT > SRR4302547.605866/1‑94 (MQ=60)
CTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAT < SRR4302547.4245505/94‑1 (MQ=60)
TCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATT > SRR4302547.211814/1‑94 (MQ=60)
TCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATT < SRR4302547.4933289/94‑1 (MQ=60)
CACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTG < SRR4302547.2288870/94‑1 (MQ=60)
CACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTG > SRR4302547.1995005/1‑94 (MQ=60)
CACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTG > SRR4302547.4281888/1‑94 (MQ=60)
CACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTG < SRR4302547.6391811/94‑1 (MQ=60)
ACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGC < SRR4302547.1979112/94‑1 (MQ=60)
ACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGC > SRR4302547.1817686/1‑94 (MQ=60)
ACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGC > SRR4302547.2453291/1‑94 (MQ=60)
CCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCC < SRR4302547.3751349/94‑1 (MQ=60)
CCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCC > SRR4302547.2892389/1‑94 (MQ=60)
CCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCC < SRR4302547.2958067/94‑1 (MQ=60)
CAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCC > SRR4302547.184185/1‑94 (MQ=60)
CAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCA < SRR4302547.5792505/94‑1 (MQ=60)
CTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGA > SRR4302547.1862449/1‑94 (MQ=60)
CTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGA > SRR4302547.5055375/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAA > SRR4302547.225340/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAA > SRR4302547.4953802/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAA > SRR4302547.1231871/1‑94 (MQ=60)
ATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAA > SRR4302547.1971609/1‑94 (MQ=60)
TTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAT > SRR4302547.4938436/1‑94 (MQ=60)
TTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAT > SRR4302547.662478/1‑94 (MQ=60)
TGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATT < SRR4302547.1360575/94‑1 (MQ=60)
AGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCA > SRR4302547.219726/1‑94 (MQ=60)
AGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCA > SRR4302547.3874550/1‑94 (MQ=60)
AGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCA > SRR4302547.6064451/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAA < SRR4302547.2624312/94‑1 (MQ=60)
GTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAA < SRR4302547.450568/94‑1 (MQ=60)
TATCTAATGCCATGTCATCGATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAAT > SRR4302547.2653633/1‑94 (MQ=60)
TATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAAT < SRR4302547.992544/94‑1 (MQ=60)
TATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAAT < SRR4302547.5523599/94‑1 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATG > SRR4302547.5697860/1‑94 (MQ=60)
ATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATG > SRR4302547.4431127/1‑94 (MQ=60)
TCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGA < SRR4302547.174360/94‑1 (MQ=60)
CTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGAT < SRR4302547.6337466/94‑1 (MQ=60)
CTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGAT < SRR4302547.1534795/94‑1 (MQ=60)
TAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATG < SRR4302547.3278707/94‑1 (MQ=60)
TAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATG > SRR4302547.6441822/1‑94 (MQ=60)
TAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATG < SRR4302547.2092112/94‑1 (MQ=60)
AATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGG < SRR4302547.4886718/94‑1 (MQ=60)
AATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGG < SRR4302547.1307084/94‑1 (MQ=60)
AATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGG < SRR4302547.3026044/94‑1 (MQ=60)
ATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGC < SRR4302547.4899670/94‑1 (MQ=60)
ATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGC < SRR4302547.2164741/94‑1 (MQ=60)
CCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCG > SRR4302547.3436819/1‑94 (MQ=60)
CATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGT > SRR4302547.6090661/1‑94 (MQ=60)
CATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGT > SRR4302547.3873201/1‑94 (MQ=60)
CATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGT > SRR4302547.1896574/1‑94 (MQ=60)
CATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGT > SRR4302547.3362482/1‑94 (MQ=60)
ATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTC > SRR4302547.1429298/1‑94 (MQ=60)
ATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTC > SRR4302547.2427123/1‑94 (MQ=60)
ATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTC > SRR4302547.237458/1‑94 (MQ=60)
ATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGACCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTC > SRR4302547.2199892/1‑94 (MQ=60)
TGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCC < SRR4302547.5058831/94‑1 (MQ=60)
TGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCC < SRR4302547.4333033/94‑1 (MQ=60)
TGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCC < SRR4302547.1682161/94‑1 (MQ=60)
GTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCG > SRR4302547.5254020/1‑94 (MQ=60)
GTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCG > SRR4302547.1321240/1‑94 (MQ=60)
CATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGT < SRR4302547.6299268/94‑1 (MQ=60)
CATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGT > SRR4302547.2160868/1‑94 (MQ=60)
ATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTT > SRR4302547.5281561/1‑94 (MQ=60)
TCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTG > SRR4302547.5754050/1‑94 (MQ=60)
CAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGA > SRR4302547.1317501/1‑94 (MQ=60)
AATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAA > SRR4302547.6711664/1‑94 (MQ=60)
AATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAA < SRR4302547.497393/94‑1 (MQ=60)
TATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGG > SRR4302547.5088562/1‑94 (MQ=60)
ATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGG < SRR4302547.5355088/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGG < SRR4302547.4173095/94‑1 (MQ=60)
ATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGG < SRR4302547.5296320/94‑1 (MQ=60)
TTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCACGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATG < SRR4302547.3578662/94‑1 (MQ=60)
TATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGC > SRR4302547.3971238/1‑94 (MQ=60)
TATTACTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAACATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGAC > SRR4302547.583728/1‑94 (MQ=60)
tatgctggtgacgggacgggTTATGCTGCCCCAAGAGCCACAATTGCCGGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302547.6578159/74‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302547.501241/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302547.6045804/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302547.4911437/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG > SRR4302547.494350/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG < SRR4302547.1098290/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCG > SRR4302547.5252568/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGG < SRR4302547.6268141/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGG < SRR4302547.3376905/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGC > SRR4302547.4330203/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGC < SRR4302547.5619079/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGC > SRR4302547.5374492/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGC < SRR4302547.6360728/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGA > SRR4302547.3055338/1‑94 (MQ=60)
TGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGAT < SRR4302547.4413614/94‑1 (MQ=60)
TGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGAT < SRR4302547.3480242/94‑1 (MQ=60)
CTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTC > SRR4302547.3877794/1‑94 (MQ=60)
CTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGACCGGGTGAACGGATGGAGGCGAGTC > SRR4302547.6353531/1‑94 (MQ=60)
TGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGAGGCGATTCA > SRR4302547.3290406/1‑94 (MQ=60)
GACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAA < SRR4302547.5048204/94‑1 (MQ=60)
ACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGTTGATTCAAC < SRR4302547.6675488/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACG > SRR4302547.5325731/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAAggg > SRR4302547.2032160/1‑91 (MQ=60)
GGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGT > SRR4302547.203236/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTG < SRR4302547.10052/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTG > SRR4302547.2217087/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTTTGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGC > SRR4302547.1921422/1‑94 (MQ=60)
TGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGC < SRR4302547.6242369/94‑1 (MQ=60)
CTGTTTCTGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGA < SRR4302547.2304239/94‑1 (MQ=60)
TGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGAT < SRR4302547.5704635/94‑1 (MQ=60)
GTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATT > SRR4302547.1884332/1‑94 (MQ=60)
GTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATT < SRR4302547.4262876/94‑1 (MQ=60)
TTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGA < SRR4302547.6049572/94‑1 (MQ=60)
TATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGAC > SRR4302547.3623604/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACA > SRR4302547.6448909/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCCCGAAGGGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACA < SRR4302547.2868169/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCCCGAAGTGGCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGCAGGGATGGGGGCGATTCAACGTGCGATTGACAG > SRR4302547.3523981/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAG < SRR4302547.1077210/94‑1 (MQ=60)
GCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGCCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGG > SRR4302547.917728/1‑94 (MQ=60)
CTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > SRR4302547.2608002/1‑94 (MQ=60)
CTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG < SRR4302547.4959858/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGCTTGACAGTGT > SRR4302547.5835651/1‑94 (MQ=60)
CCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTT < SRR4302547.2763246/94‑1 (MQ=60)
CCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTT > SRR4302547.5480439/1‑94 (MQ=60)
CCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC < SRR4302547.3024758/94‑1 (MQ=60)
CCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC > SRR4302547.1606964/1‑94 (MQ=60)
|
CGGCGATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTGTTTC > NC_000913/1672331‑1672517
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
